他の方法では、Matlabでスクリプトを書くというのがあるとおもいます
EPI画像をひたすらFlipするだけのがどこかにあると思いますので
それを改変してみてはいかがでしょうか？
ありました、"spm_flip.m"です
###########################################
function spm_flip
% FORMAT spm_flip
% flips images from right to left
%___________________________________________________________________________
% get images
%---------------------------------------------------------------------------
P = spm_get(Inf,'*.img',{'select images for flipping'});
% flip
%---------------------------------------------------------------------------
spm_progress_bar('Init',length(P),'flipping','');
for i = 1:length(P)
[p,f,e,v] = fileparts(P{i});
Vi = spm_vol(P{i});
Vo = Vi;
Vo.fname = fullfile(p,['f' f e]);
Vo.descrip = [Vo.descrip ' - flipped'];
Vo = spm_imcalc(Vi,Vo,'flipud(i1)');
% progress
%-------------------------------------------------------------------
spm_progress_bar('Set',i);
end
spm_progress_bar('Clear')
#############################################################
Failed 'DICOM Import'
エラー: ==> zeros
メモリが足りません.HELP MEMORYとタイプしてオプションを確認してください
In file "X:\Matlab\spm8\spm_dicom_convert.m" (v3307), function "write_volume" at line 564.
In file "X:\Matlab\spm8\spm_dicom_convert.m" (v3307), function "convert_standard" at line 222.
In file "X:\Matlab\spm8\spm_dicom_convert.m" (v3307), function "spm_dicom_convert" at line 52.
In file "X:\Matlab\spm8\config\spm_run_dicom.m" (v2094), function "spm_run_dicom" at line 32.
The following modules did not run:
Failed: DICOM Import
ただすでにMRTさんのおっしゃるように「i1，i2に対応するResultを一度，SPM上で
表示 and Saveしたもの（同じ閾値）をMRIcronでoverlay」して、overlapを確認
してる（Transparency on other overlaysでAdditiveにして色が変わっていると
ころがある）のですが、ImCalcの出力と同じになりません。なぞです。。
SPM8に関する質問をさせていただきたいと思います。
現在、Windows7でSPM8を立ち上げようとしているのですが、下記のエラーメッセージが出て立ち上がりません。
何が原因かおわかりの方がいらっしゃいましたら教えていただけると大変助かります。
どうぞよろしくお願いします。ちなみにSPM5は同じ環境でも問題なく立ち上がりました。
＜エラーメッセージ＞
>> spm fmri
Error using spm_check_installation>check_basic (line 86)
There appears to be some problem with the installation.
The original spm8.zip distribution should be installed
and the updates installed on top of this. If in doubt,
consult your local network administrator.
Error in spm_check_installation (line 25)
check_basic;
Error in spm (line 330)
spm_check_installation('basic');
ちなみに問題のソースコードは
%-Ensure that the original release - as well as the updates - was installed
%--------------------------------------------------------------------------
if ~exist(fullfile(d,'@nifti','create.m'),'file') % File that should not have changed
if isunix
error(sprintf([...
'There appears to be some problem with the installation.\n'...
'The original spm8.zip distribution should be installed\n'...
'and the updates installed on top of this. Unix commands\n'...
'to do this are:\n'...
' unzip spm8.zip\n'...
' unzip -o spm8_updates_r????.zip -d spm8']));
else
error(sprintf([...
'There appears to be some problem with the installation.\n'...
'The original spm8.zip distribution should be installed\n'...
'and the updates installed on top of this.']));
end
end
ちなみに今月はじめにKIさんやHSTRさんからアドバイスを頂いた後にいろいろ試してみました。
HDDをWD My Passport Slim 2TB (USB3.0接続）からWD My Passport Pro 4TB（RAID 0)（Thunderbolt接続）にして、
同じプログラムを走らせてみたら、予想に反して遅くなってしまいました。一概に比較は難しいとは思いますが。
