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解析関係

19MRT:2007/05/13(日) 20:09:51
気分転換がてらに小ネタを一つ

MRIで出たResultを3D脳イメージに貼り付ける方法
(こんな感じの→ttp://brainimaging.waisman.wisc.edu/~oakes/20000906_173700_3dbr.jpg)

元々はMriCroでもできる機能だったのですが,
なんかバグとやらで現在はできるとかできないとか...?

そこでMricronという上位ソフトを使います.
ソフト自体は以下のフォルダにおいておきます
\\Ppspc2\common\Social_Brain
mricrond.zipというファイルを展開してインストールすれば使用できます.

さて件の展開の方法です.

①構造画像を読み込む
*「file」→「OpenTemplate」→「ch2bet.nii.gz」を選択するとMNI仕様の構造画像が読み出せます.
この画像はSPMのsingle_sub_T1.niiと同形でかつ解像度も高く,頭蓋を外してあります.
 ちなみに頭蓋つきは「ch2.nii.gz」で呼び出せます.

②構造画像に機能画像を貼り付ける
 *「Overlay」の「Add」を選択し,対応するイメージファイル(spmTやcon_image)を選択します.

③3DのRender画像を表示する
 *「Window」の「Render」を選択

④Render画像をカットする
 *開いたRender用Windowの「Backgrund」の「Cut」を選択する

⑤Cut位置を決める
 *X,Y,Z座標上での切り取り範囲を数字で入力する
 *「ShowCut」にチェックを入れておくと分かりよいです.

⑥切り取った画像を保存する
 *「File」の「Save as bitmap」を選択する

以上で3Dの構造画像に機能画像を貼り付けた絵ができるはずです


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