解析関係

53：MRT：2010/07/05(月) 19:25:05: Realignに関する質問です．

６sessionの実験で３session目に一回，被験者を出して休ませ，
もう一度，入れ直した場合，脳の位置が多少ずれますよね　ｄ(・・　）

この場合に６回分を貫通させてRealignかけた方が良いのか？
というのが質問です．

個人的には３回分ずつにRealignをかけて一旦，Normalizeし，
その後にもう一度６回分まとめてRealignかけ直した方が
良いような気がするのだけど, どうでしょう？

理由は下記の通りです．

Realignの手順としては，
先ず，Sessionごとの１枚目の画像でSession間のRealignをかけ，
その後にSession内の画像でRealignをし，
１段階目のSession間パラメーターを加味してHeaderを書き直していたと記憶しています

で，この１段階目の処理の時にSesion間で画像の質が違いすぎる，
例えば，スライス１枚分ずれてしまうと
剛体変換をベースにしたRealign処理が上手くいかないのではないかと感じました

そこで，間にNoramlize処理をかませて非剛体変換を経由し，
形状を似せてから合わせた方から２度目のRealignをした方が合いやすいのではないかと考えました．

もちろんRealign処理の過程でSmoothingされてしまうので（Defaultで5mm），
２回目のRealign処理時にはSmootingパラメーターを0ｍｍに変更する必要があるかと思いますが　ｄ(・・；）

実験中に一度，被験者を出すことって
たまにありますが皆さんどのように処理しています？

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