レス数が900を超えています。1000を超えると投稿できなくなるよ。

スタップ紀行5

440：デラ・ストリート：2018/12/17(月) 08:21:35: 一つ飛ばして以下よ。
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（３）
Article Fig.2c は、2012 年 4 月に投稿論文原稿図として現れているが、それ以前に小保方氏は計 3 セット（2011 年 10 月 27 日 1 セット、同 11 月 17 日に 2 セット）、 GRAS に DNA 配列解析を依頼していることが判明した。そのサンプル名には bisulfiteとあること、また 11 月 17 日の 2 セット分についてはそれぞれ「oct4」、「nanog」との記述もあることから、これはメチル化 DNA 解析であったと判断した。「oct4」については 96 クローンのシークエンスが行われ、作図に利用可能な高精度配列情報は 74 クローン分であった。しかし、この 74 クローン分のデータを用いて Fig.2c の Oct4 プロモーターの図を作図することは不可能であった。例えば Fig.2c では 11 か所中メチル化部位が 1 か所以下のクローンが 18 クローンあったことを示すが、シークエンス結果でこのようなパターンを有したクローンは 3 クローンのみであった。アライメントできなかった低品質配列クローンを含めても、この図を作ることは不可能であったと考えられた。また、「nanog」については 96 クローン中 40 クローンが作図に使用可能と考えられたが、これらを用いても Fig,2c に示された Nanog プロモーターの結果は得られない。Fig.2c には 100%メチル化クローンが 15 クローン存在するが、シークエンス結果でこのようなクローンは最大で 7 クローンしか存在しなかった。アライメントできなかった低品質配列クローンを含めても、この図を作ることは不可能であった。

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