ペーパー一枚の報告に向けて、その3 - 1534541215

1：地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう：2018/08/18(土) 06:26:55: 😭　😃　😵　😒　😣　😝　😍　😆　😔　😳　😡　😱　👿　💀　👹　🐝　🌅　👰　
👩　👦　👧　🙍　🙋　🙅　👮　👪　👫　🙇　🙈　🙊　🐰　😸　🐜　💪　👍　👎　
👉　👊　👋　🙏　🙌　👏　👣　👅　💋　🐦　👻　⛅　💩　🌠　💚　💜　💙　💏　
💞　💓　💖　💕　🎼　🎻　🎷　🎺　🎹　🎥　🎶　🎵　🎧　🔊　📞　🔫　🚓　🍸　
☕　🍰　🍶　🍻　📡　🔑　🌈　📖　🆖　⏫　⏬　❎　🆘　🅿　🆗　⏪　🔙　🔜　
💸　💐　🚨　📠　🏣　🏢　🚢　🏦　🏭　⛵　🚇　⚾　⚽　🏈　🎿　🎆　🍀　🏊
♨　🎲　🎌　🎳　🎢　🌁　🌟　💢　📹　📺　📱　💻　📷　💊　⏰　⌛　🗻　🗾　
🗽　☔　🍓　🍌　🌛　🍒　🍮　🌀　🔓　🔥　🔰　🎴　✨　💦　❄　💨　🎐　💉　🍷　
❗　💡　🚧　🎏　🕖　🕚　⛔　🌃　🔔　🔎
☀　✈　✂　✒　✌　♠　☺　㊙　🈴　㊗　🈶　🈚　▶　▶　↩
2：在原業平：2018/08/18(土) 06:31:19: モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。
3：小野小町：2018/08/18(土) 06:34:05: お気に入りはDORAさんの政治ネタよ。強力な情報発信力ね。既存メディアは
再編されざるを得ないわね。
4：在原業平：2018/08/18(土) 06:41:30: ただネットに進出すればいいというものではないからね。アカヒはネットでも
工作情報を垂れ流しているけど、ネットの住人には反論の手段があるからね。
今迄のマスコミ手法のままではその嘘をぼろぼろに暴かれて惨めにその知性の
無さを暴露される。倒産は間近だ。ネットではコンテンツの内容の濃さが信用の
バロメーターになるんで、アカヒの間抜けでは生き残れない。
5：小野小町：2018/08/18(土) 06:47:01: どこに潜りこんだところで、内容がアッポは変わらないから、すぐに見つかって
いずれ殺されるのね。同じ記者でも会社から自由になって書く内容が事実信念に
基づいていれば生まれ変われるのがネットでもあるのね。誰が誰かなんて何の
意味もない場所ね。ネット民は自分で事実を確認しないと信じないんで、その作業を
通して適者生存が決まってくるのね。今のところ、虎の門ニューズ、チャンネル桜は
信用度が高いかな。
6：在原業平：2018/08/18(土) 06:55:05: 保守層には認知度が高いかな。右寄りの話題自体に偏向はあるけど、
情報が客観的なんだな。こう思うというのは無い。こうだと言う事実に関して
信用度が高い。左寄りにこの姿勢の報道は無いからね。いつも嘘をついてる。
思うばっかりで、根拠がない。なんでこうなったのかな。やっぱり浅間山荘かな。
抒情詩ばっかりだ。
7：小野小町：2018/08/18(土) 07:00:28: 余りにリベラルをやっつけすぎたのが、今や安倍首相が企業に賃上げ要求するという
野党の機能不全に象徴されてるのかしらね。野党というより組合よね。
敗戦後の信念のある人々はいなくなって、組織の上で貴族社会を作ってるうちに
外国の工作機関が潜入したという典型的な腐敗の末路ね。
8：ふふふ：2018/08/18(土) 07:04:12: 高度成長して油断しているんだよ。人品のレベルが下がっているの。
外敵が侵入してくるからすぐわかるでしょ。チャンコロとチョンを
プチ殺せばいいんだ。そう決意すると腐敗は一掃される。
9：鉄：2018/08/18(土) 07:05:02: そっかあ。
10：小野小町：2018/08/18(土) 07:12:12: NHKとか朝日新聞はチョン、チャンコロの工作機関なのね。労組と政治を通して
既に工作されてしまってるからつぶすのが手っ取り早いのね。不要よね。なんで
日本人の受信料で日本の悪口をばらまかせなきゃなんないの。
11：在原業平：2018/08/18(土) 07:15:16: 相手の金を使ってやるのが工作じゃないか。パチンコの資金も同じさ。
そもそも分かって許容してやってたものじゃないか。だれだって知ってるよ。
太平楽もその辺にしとけよってことさ。援助してやっても豚は豚だ。
人間にはならん。殺して食えばいいんだ。
12：シャーロック・ホームズ：2018/08/18(土) 07:16:56: とうとう日本人を本気にさせてしまったな。
13：ドクター・ワトソン：2018/08/18(土) 07:18:20: なんか、先に米国が本気になったみたいだぜ。太平洋を半分だなんてエッラソウに
豚が。
14：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 07:26:01: 9条の改正、自衛隊の反撃権の明文化、非核三原則の見直しと、米国との核シェアリング、
そして国防予算の倍増、金融緩和と消費税の減税とセットになりそうだね。まあ、
対中経済制裁は彼らの軍事力を弱めるためにかなり長く発動される予定だから、
日本も国内の景気対策を予定しているね。
15：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 07:29:39: まあ、不要になったらまた戦闘意思を緩めて世界の雰囲気をなおしたらいいんだわ。
相手がのぼせ上ってるんだからね。言って分からん奴はボッコボコにして教えて
やるしかないわよね。
16：ヘーゲル：2018/08/18(土) 07:35:50: 本題、頼むぜ。俺たちはショウモナイ問題を趣味で考えてんの。政治の話は
一人一人がよく考えて、国民投票に臨めばいいんだ。
17：カール・ヤスパース：2018/08/18(土) 07:37:24: 本題、何でしたっけ?
憲法改正の国民投票って初めてだね。わくわくするな。
18：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 07:39:26: あら、ドイツでは何度も改正してるじゃないの。なんか日本人になり切ってる?
>>
STAP細胞はES細胞由来というのは、同じES細胞、もしくはそれを培養した細胞株ということである。SNPはマウスで約300万個あると言われている。その中のSNPが細胞株の培養によってどのくらい変異するかというと、調査委員会の調査したSTAP幹細胞FLS3とES細胞129/GFP ES（FLS3を培養したもの）では、近縁率（一致率）が99.95%であった（詳細はここをクリック）。つまり、培養により変異したSNPは、SNP１万個に対して5個である。
19：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 07:41:08: 300万個のうちの1万個に5個というのは1500個だね。
20：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 07:42:26: そうね。
>>
マウスの染色体は性染色体の他、１番～19番まである。このため、ざっくり言うと６番染色体のSNP分布図は約15万個のSNPを色分けしたモザイク画ということになる。ここで培養変異で型が変わるのは、そのうちわずか75個である。しかも、この変異はランダムに起こると考えられる。このため、同一細胞由来であれば、培養による変異はSNP分布図には表れず、その違いが分からないことになる。違いがあれば細胞株が違うということである。②は129B6F1 ES1と同時期につくられたES細胞であるが、受精卵ES細胞なので、①と③とは別の細胞株であり、そのため①、③とは別パターンとなっているのである。
21：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 07:49:05: 約15万個というのは300万個を20で割った数値だね。そんなにざっくりやらなくても19で
割ると15.8万個だ。一本について79個ということになる。染色体は皆同じ長さではないんで
細かく出しても意味がないということね。大事なことは染色体1本について新たなSNPs増加が
15万個の中に75個均等にばらまかれるから、表に出でいるような大きな差にはならないと
言ってるんだね。つまりこのSNPkS分布のわずかな差はわずかながらも培養過程での
追加SNPs発生によるものではなく、最初から株が違うのだといってるんでしょ。
22：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 07:50:38: SNPkS→SNPs
23：一言居士：2018/08/18(土) 07:52:54: 和モガさんは三つの株の作製順序に関して、以前、培養期間の長さの累計値に
比例しているということに気づかず、勘違いしたまま間違えたけど、ここでは
この論理は正しいよね。
24：閲覧者：2018/08/18(土) 07:58:30: 和モガさんがここで比較しているのは以下だ。

①AC129-1(=129B6F1ES-1)
②129B6F1ES-6
③STAP ChIP lysate

①≠②≠③だと言ってて、グラフの違いが何かグラフ作成ソフト上の
問題でない限りは、正しいね。
25：シャーロック・ホームズ：2018/08/18(土) 08:07:38: まず③に関してはBCA報告はこのGRASに提出された時のマウス背景に関する記述内容を
何も示していないね。
>>
To gain sufficient sequen-cing coverage, we re-sequenced the genomic DNA prepared from the STAP cell lysate used for ChIP-seq (Extended Data Fig. 1a). We con-firmed that this STAP cell sample shared all the genomic character-istics described above for 129B6F1 ES1 (Extended Data Fig. 2c),indicating that the STAP cell sample used for ChIP-seq was derivedfrom 129B6F1 ES1 cells.
26：ドクター・ワトソン：2018/08/18(土) 08:14:55: SNPsの一致率から見て、この溶解液のマウス背景は129/B6かB6/129だったと
言うことくらいは分かるが、どちらかは分からないよね。これは小保方さんが
公共データベースに登録したものだったらB6/129と書かれていた筈のもので、
①でも②でも無いはずなんだけどね。そんなものをどうしてここで比較しているのかが
分からないよね。背景がどう書かれていたかも調べないで何をやってるのかな。
27：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 08:39:50: もっと重要なことは8月のGRAS提出資料は若山さんの実験方針に従って調査されているものだということで、
後に笹井さんが論文としてまとめるときに若山さんの意図通りにこれが使われているのではないかもしれない
ということね。間に小保方さんの記憶が挟まって、笹井さんに伝えられている。
28：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 08:41:51: これらみっっは違う株だということはいいよね。和モガさんとはこのあたりから我々の推理と違ってくるよね。
29：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 08:43:40: ここね。
>>
①のSTAP幹細胞、AC129-1が樹立されたのは2012年8月13日である。③は2012年夏にSTAP細胞をGRAS（CDB ゲノム資源解析ユニット）に持ち込んだときのDNAを解析したものである。この③が①と違うということは、小保方氏がSTAP細胞としてGRASに持ち込んだ細胞株は、混入したとされるES細胞、129B6F1　ES1ではなかったことになる。それは、CAG-GFPを持つ129マウスとCAG-GFPを持つB6マウスの別の仔マウスから作られた別の細胞株であり、それはSTAP細胞だったと考えられるのである。そして、このSTAP細胞はES細胞のように培養できないので、解析で使われただけで、そこからSTAP幹細胞は作られていなかったということである。
30：一言居士：2018/08/18(土) 08:58:55: <AC129-1が樹立されたのは2012年8月13日である。>は間違いだよ。樹立開始が8/13だ。
そして、<③は2012年夏にSTAP細胞をGRAS（CDB ゲノム資源解析ユニット）に持ち込んだ
ときのDNAを解析したものである。も、正確には2012年の8月だと推測されるよね。
>>
（ｄ） STAP 幹細胞 AC129 は、129B6F1 マウスから作製された受精卵 ES 細胞に由来する
（調査結果）
STAP 幹細胞株樹立に遺伝的背景が及ぼす影響を調べる実験が、若山氏により 2012 年夏から秋にかけて行われ、2012 年 9 月 4 日に STAP 幹細胞 AC129-1 および AC129-2 が樹立された。若山氏が交配した 129/Sv-CAG-GFP マウス(CAG-GFP 遺伝子が第 18 染色体に挿入されたホモ接合体)由来の脾臓 CD45 陽性細胞を材料とし、小保方氏が STAP 細胞を作製し、それを用いて若山氏が STAP 幹細胞として AC129 を樹立した。
>>
31：閲覧者：2018/08/18(土) 09:13:20: ここは以前もTs.Markerブログで検討したけど紛らわしいところだったよな。
AC129の樹立は2012/9/4だ。樹立開始が8/13だから3日毎としてして7回の
植え継ぎでできたと凍結したんだね。この分のSTAP細胞はまず、できるか
どうか分かってないんでしょ。これをいきなり培養誘導したのかな。
もしそうならSTAP細胞が出来たらすぐに培養することになるんだから7日前に
STAP細胞が作られていることになる。8/6に129/Svの子マウスを渡されている
ことになる。白毛だ。
32：小野小町：2018/08/18(土) 09:15:26: キメラ胚を作るやり方だったらどうなるの。これは私たちのntES論で行くとして。
33：一言居士：2018/08/18(土) 09:25:40: 小保方さんのSTAP細胞ができるまでに7日、それをクローン胚に入れて、クローンを作るのには
20日、並行してntES化するのに5日だね。7/31に129/Svマウスの子マウスを渡されて、8/6には
STAP化される。そこからクローン胚に入れるのに2日で2安定させて、8/8から5日で取り出して
ntESにする。ここは培養期間はおかないで、そのままキメラ胚に入れたとして、8/13だ。
34：シャーロック・ホームズ：2018/08/18(土) 09:31:40: ところが、これは所詮作られていないんだよな。129/Svの幹細胞は存在していない。
代わりに129B6のAC129なるサンプルが残されている。そしてこれは後の結果として
129B6F1ES-1だとされた。若山さんが保持していたコントロールESで理研には無かった
分だね。和モガさんだけでなく我々も指摘している。小保方さんが捨てたのでなければ
FLS-T1,T2も含めて若山さんのマッチポンプ捏造を疑うのがまず最初の調査でなければ
いけないよね。
35：ドクター・ワトソン：2018/08/18(土) 09:41:01: 問題は論文に小保方さんが129/SvのSTAP細胞を作ったとしているところだね。
そして小保方さんはそのGFPをローザと記憶し、かつキメラも作られたとしている。
129/Svは白毛だからね。リシピエントとしては黒を使って2Nで確認することに
なるのかな。それともGFP蛍光確認だけかな。いずれにせよ、キメラを作っていたら
ちゃんと覚えている筈だ。若山さんは作ってないと言ってる。和モガさんはこういう
ところをちゃんと考えて欲しいね。どちらかが嘘をついている。どちらかが
犯人で、第三者ということはないでしょ。
36：小野小町：2018/08/18(土) 09:46:12: 私たちのntES論では小保方さんは犯人じゃないから、当然キメラは作られていたのでないと
いないわね。小保方さんは白毛のマウスを渡されている。彼女はそれを覚えているから
そのキメラが有るはずだと思っているんで、仮に実際には若山さんが幹細胞だけしか
作らなかったとしてすら、白毛のマウスは渡されているということよね。その幹細胞か
キメラか、どちらかは絶対に無いといけない。どうしてないかと考えると、小保方さんが
コントロールESで捏造したか、若山さんが証拠を捨てたかしかないのよね。そして私たちは
小保方さんは犯人でないと考えているのだから、当然若山さんが捨てたか、彼自身が
コントロールESで捏造したとしか考えられないわね。
37：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 09:49:20: そこに 2 of 2　のキメラの謎があるのね。これって、AC129と一致しているのよね。
でもこれはF1だった。
38：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 09:52:32: AC129は白毛の背景だったはずで、小保方さんはそれを2 of 2のキメラと同時に
作られた幹細胞だと思っていたようだね。彼女はこのキメラを見たのかな。それとも
出来たと言われただけなのかな。
39：デラ・ストリート：2018/08/18(土) 09:59:29: 白毛のキメラがあったかどうかは重大問題ね。ただ、取り敢えず、幹細胞に関して
和モガさんは私たちとは反対に考えてるわよね。
>>
129B6F1　ES1がAC129-1と同じになるのは、129B6F1　ES1がAC129-1を培養して逆に作られているからである。
40：ペリー・メイスン：2018/08/18(土) 10:08:00: それだと、FLS-T1,T2もAC129で作られていることになってしまうね。作製順は
①129B6F1ES-1
②AC129-1,2
③FLS-T1,T2
だからね。①が作られ、②が作られ、③を②で捏造した後に、①の中身を捨てて
②を詰めたということになる。③は僕のマウスから作られていることになってるんでしょ。
そこに129/Svから作られていることになってる②で捏造するというのは考えられないよね。
41：一言居士：2018/08/18(土) 10:11:32: そこは我々の推理通り①で捏造されていて、若山さんが小保方さんの姓にして
逃げるための準備をしたのだと考えるのが自然じゃないかな。FLS-T1,T2はいよいよ
論文が書き上げられそうになっている情報を受けて念を入れてるんじゃないかな。
42：閲覧者：2018/08/18(土) 10:22:54: 木星リストにACTSというのがあって、どうもこの件に関しては二つの実験が
あってもう片方が隠されている臭いんだよな。129のローザでのFI幹細胞実験が
があってキメラもつくられているのではないか。この時期まだSTAP幹細胞の
実験を行っていたとも考えにくいよね。CTS-11～13は7/9樹立開始だ。そのあとに
STAP幹細胞をまた作ってみるというのも変だ。AC129は本当に129/Svから作られていたんだけど
中身を129B6F1ES-1に後から入れ替えてないか。そしてAC129こそMTA事後締結のときに
そっと戻されている細胞の可能性もあったよな。