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STAP問題の全解に向けて、その23

701小野小町:2018/05/02(水) 11:59:55
Ooboeさんの小保方出勤簿が明らかにしたキメラ成功後の小保方さんの行動と
若山さんがそれをどう受け取ったのかの検討ね。

702デラ・ストリート:2018/05/02(水) 12:14:01
今はその前に公開データベースに提出されたデータの元となった細胞株の
出所について検討している途中よ。
そして最もTSマーカーを発現しているFI-SCはTSではないということまで分かったのよ。
そしてこの細胞が明瞭に発現しているTSマーカーは、実証事実だということを
TSさんが「やっぱりね」で示しているんですわ。
FI-SCを作る時若山さんはGOFで作った記憶はないと証言したんだけど、ではF1の
方の背景は何であったかの深い調査はされてないのよね。

703ペリー・メイスン:2018/05/02(水) 12:16:56
またしてもレトリックでね。GFPがどちらに入っているのかをはっきり言わない。
>>
若山氏と小保方氏への書面調査により、FI幹細胞CTS1は、若山氏が渡したCAG-GFPを有する129X1とB6Nを掛け合わせて誕生したF1マウスを材料に小保方氏が作製したSTAP細胞 から、若山氏が2012年5月に樹立したもの(5月21日に作製開始してより5月28日樹立完了)であることが判明した。

704Ooboe:2018/05/02(水) 12:19:41
👰小町さん、コメントありがとう

あの資料は、Lさんなど、専門家のため
時間がかかる解析になるとの判断で
パートナが最優先しましたので
私達素人はちんぷんかんぷん、ね

705在原業平:2018/05/02(水) 12:43:03
<若山氏と小保方氏への書面調査により>意見が一致したことだけ書いてるんだね。
<CAG-GFPを有する129X1とB6Nを掛け合わせて誕生したF1マウス>というのは、若山さんは
持ち出しリストで129/B6と書いている。小保方さんは論文も公開データもB6/129だね。
矛盾を放置している。しかも<5月21日に作製開始してより5月28日樹立完了>としていながら、
細胞リストには<5/25樹立開始>として恬として恥じない。

706:2018/05/02(水) 12:44:56
民間企業の上司だったらこんなダメ社員は張り倒すんじゃないの。

707ふふふ:2018/05/02(水) 12:48:44
まあ、戦後すぐじゃないんだから張り倒すと訴えられるんでそんなことはしないだろうけど、
クズの仕事を放置してたらライバルに負けて市場から追い出されるからな。全員がオママンマの
食い上げになる。戦後も今も何も変わってない市場競争原理だ。役所はつぶれないと思って
こういう具合に腐っていくんだけど、国家の場合は他国に蹂躙されることに繋がっていくな。

708Ooboe:2018/05/02(水) 12:54:22
👰小町さん、分身さん達の
ntES仮説が岐路にさしかかっているって?

それが、笹井先生と小保方さんのjaki検証に
よって、とありますが

そのjaki検証って、そんなに重要な検証だったん
ですか?私にはよくわからないわ

学さんがレター論文の実験項目をUpしていた
スレに意味わからなかったけど
jakiのことがありましたね

709Ooboe:2018/05/02(水) 12:55:06
👰小町さん、分身さん達の
ntES仮説が岐路にさしかかっているって?

それが、笹井先生と小保方さんのjaki検証に
よって、とありますが

そのjaki検証って、そんなに重要な検証だったん
ですか?私にはよくわからないわ

学さんがレター論文の実験項目をUpしていた
スレに意味わからなかったけど
jakiのことがありましたね

710小野小町:2018/05/02(水) 12:56:42
Ooboeさん、根本さんがそのデータの出し方は理研のごまかしだとおっしゃってるわね。
私たちもいい加減この桂報告のひどさに対しては調査のやり直し請求しないといけないかな。
出た当初は内容がちんぷんかんぷんだということもあって、ずいぶん詳しく検証しているんだと
感心してたけど、少しずつ分かってくるに従ってひどい調査だと気付いたわね。
問題はなぜ桂報告はこんなに隠そうとしているのかということよね。私たちはこの責任の
大半が理研の論文発表の仕方にあって、その下心に特許もあったんで、理研自身が疚しくて
誰が何をしたかという調査の基本を無視したのが原因だと思ってるわ。

711在原業平:2018/05/02(水) 13:00:55
そこは動かないだろうね。一つには笹井さんが自決してしまった。これって論文捏造事件で
処理できないような問題だ。ことが大きくなりすぎて、誰か個人の不正をやり玉に挙げると
すべての責任がその個人に負わされてしまう。そもそも捏造論文って記者がその鼻にマイクを
突きつけて終わる程度の悪事に過ぎない。

712孤舟:2018/05/02(水) 13:05:40
その裏側には官僚の不祥事もあるんだけど、そういう段階の問題じゃないんだよな。
初めに大々的に宣伝してしまったというだけで社会に与えた影響が大きすぎて、
反動もその分強くなる。そこを苦慮したということでしょ。この程度の論文不正って
そこらにごろごろしてて、所詮無視されて打ち捨てられていくだけなんだよな。

713ペリー・メイスン:2018/05/02(水) 13:11:00
我々は理研が隠した事柄を暴き出してこの事件の真相を全解明したいだけだ。
結論をペーパー一枚にまとめて便所の壁に書きつけてやるんだ。世間の目を
舐めるなよと。

714デラ・ストリート:2018/05/02(水) 13:13:49
今、その自負の鼻っ柱っがへし折られそうになってるのね。ntES論危うし。

715小野小町:2018/05/02(水) 13:25:49
Ooboeさん、JAKiの実験はレター論文のFigure2-j,kとExtended Data Figure5だわ。
レター論文は
*ttp://www.nature.com/articles/nature12969
で見れる。
本文と本文図表は今有料になって見れないけど、Extended Data Figure5は下の方に
下がっていくとあるからクリックして開いてみるとしいいわ。

716デラ・ストリート:2018/05/02(水) 14:01:40
JAKというのは酵素蛋白よ。ウィキ。
>>
ーヌスキナーゼ(英: Janus kinase、またはヤヌスキナーゼとも)は、非受容体型チロシンキナーゼの1つである。一般にJAKやJakと略される。Jakは、機能や遺伝子の位置の違いからJak1、Jak2、Jak3、Tyk2に分けられ、それらの多くは細胞増殖、生存、発達そして分化に関与しており、特に免疫細胞や血球系細胞において重要な役割を果たしている。シグナル伝達はSTATを介して伝えられる。

JAKインヒビターは 関節リウマチのお薬ね。
>>
今回、承認されたトファシチニブは、細胞内に存在するチロシンキナーゼの一種「ヤヌスキナーゼ」(JAK)を阻害することで炎症を抑制する新機序のRA治療薬で、ヤヌスキナーゼ阻害薬(JAK阻害薬)と呼ばれている。

717小野小町:2018/05/02(水) 14:11:23
Extended Data Figure5-aはGOFのESとGOFのFI-SCを使った実験よ。それぞれの
左右はJAKiの有無ね。OMがJAKi抜きよ。オミッションの略じゃないかと思うわ。
下の段はOct4-GFPの蛍光を見ている。ESはJAKiを加えたら蛍光が消える。つまり
死滅しているのよ。対してFI-SCの方はJAKiの有無に関わらずOct4-GFP蛍光して
いるでしょ。これはFI-SCがESではないという証明実験なの。たぶん笹井さん
自慢の証明じゃないかしらね。
Figure2-j,kの方は見れないでしょうけど、各種多能性マーカーとTSマーカーに
関してJAKi有無下での発現量を数値化したグラフよ。FI-SCはESではないという証明なの。

718在原業平:2018/05/02(水) 14:13:21
ESではないということは無論常識的にはntESでもないということです。

719ドクター・ワトソン:2018/05/02(水) 14:19:35
若山さん曰く、GOFのFI-SCは作られていない。ならば、この実験はFI-SCだと
偽ってTSを入れないと作れない図だ。でもその場合はGOFでTSを作らないと
いけないが、小保方さんは作れない。するとやはり本物かというと、
図を適当にいろんな写真を組み合わせて作ることはできるんだね。

720シャーロック・ホームズ:2018/05/02(水) 14:27:20
GOFのFI-SCは作られていたのかいなかったのか。とても重要なところで、若山さんは
奇妙にも作った記憶がないと言っている。作ってないとは言ってない。そして
公開データにはGOFのFI-SCが登録されているんだが、またもどうしたことか、
小保方さんはこれをC57BL/6x129/Svと書いて提出したことになっている。

721小野小町:2018/05/02(水) 14:34:11
公共データベースって実験で使われた細胞を後進達のために記録しておくものよね。
JAKiでの実験のみならず培養でFI-SCになっていく過程でOct4-GFP蛍光を失っていく
写真をとるのにもGOF由来のFI-SCを使っているんだから、必ずこの分を登録している
はずなのよね。そして現にCD1が少し混じっているにせよ、GOF背景の細胞が
あることは間違いなくて、でもそこにはC57BL/6x129/Svと書かれているのね。

722デラ・ストリート:2018/05/02(水) 14:41:58
小保方さんが理研に公共データベース用にデータを提出したのは2013/11/5だ。
これを理研がDDBJに登録したのがあのいわくつきの2014/2/13だわ。CDB内で暗躍した
人間が一人いるわね。登録した人誰かしらね。

723ペリー・メイスン:2018/05/02(水) 14:46:44
これこそ事故コンタミじゃないかな。ピペットの先についていたやつ的な。
というのも、このGOF由来FI-SCらしきものに小保方さんがCD1のTSを混ぜる
理由がない。これこそ、TSさんの「やっぱりね」を見ればわかる。
こんなに完ぺきにTSマーカーがでているのに細工の必要がないね。

724在原業平:2018/05/02(水) 14:59:32
僕は一応論文の論旨に従って今考察しているからね。TSさんの調べた範囲では
TSもFI-SCも弱くOct4-GFPを発現しているんだよね。だからFigure2-aでは強く
発現していたOct4-GFPがFI-SCにコンバートされていくに従って蛍光が弱まる。
それに対してJAKiの実験では弱々しくではあれOct4-GFPを発現しているという
状態からFI-SCのOct4-GFPの蛍光に変化がないという証明法になっている。
僅かですらもともとFI-SCにOct4-GFP蛍光がなかったら検証できないね。
このあたり証明法自体にとても曖昧なものがあると感じている。

725小野小町:2018/05/02(水) 15:00:46
笹井さんも丹羽さんもそれを感じなかったのかしらね。普段の自分たちの研究にも
疑義がおよぶ問題よね。

726在原業平:2018/05/02(水) 15:04:03
小保方さんのこの手法の曖昧さはティシュー論文からずっと続いているものだ。
いずれそこに戻って検討するけどね。ただ、丹羽さんの論文は一度読んだけど
とても緻密な証明法だよ。笹井さんや丹羽さんは当然小保方さんと違ってシニアだからね。
自分たちの研究では決してそうでないんだよ。ところが今回の論文ではそういうところを
全部スルーしている。その原因は分かり切ってるんだよ。

727シャーロック・ホームズ:2018/05/02(水) 15:06:38
キメラは出来ていて、胎盤の免染スライドはGFPをとらえている。

728ふむ:2018/05/02(水) 15:15:34
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729自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/05/03(木) 01:56:37
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

730イェイ:2018/05/03(木) 06:03:29
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731在原業平:2018/05/03(木) 06:29:17
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

732小野小町:2018/05/03(木) 06:31:26
お気に入りは変化なしよ。DORAさんが相変わらずね。抱き着き作戦を笑ってるわね。

733在原業平:2018/05/03(木) 06:34:34
まあ、大規模総攻撃の焼け跡の復興に日本は金を出すと言ってるだけだ。もっとも
ピョンヤンは張りぼてのディズニーランドだからな。大した金もかからない。

734ヘーゲル:2018/05/03(木) 06:35:31
本題頼むぜ。

735カール・ヤスパース:2018/05/03(木) 06:36:22
本題、何でしたっけ?

736デラ・ストリート:2018/05/03(木) 06:38:05
GOFのFI-SCはあったのか?

737シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 06:40:30

>>
SRR1171565 若山  FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
SRR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
SRR1171568 若山  FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
SRR1171569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

738シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 06:41:33
あ、しまった。送ってしまったな。上二つがそうじゃないのかと問いたかったの。

739ドクター・ワトソン:2018/05/03(木) 06:44:31
ここで言えているのは使われたマウス背景がGOFだということだけだな。それが
FI-SCなのか、ESなのかは、まだわからない。

740小野小町:2018/05/03(木) 07:32:12
分からないというのは、まずこれがJAKiの実験に使われた株なのかどうかの
由来が分かってない。竹市さんの言ってる通りよね。いくら分析しても、それが
そもそもどこから来た細胞なのかを確定させないと何の結論も得られないわけね。
加うるにそもそもJAKiの検証が実際に行われたのかの調査もないのね。というよりね
桂報告は怠慢にも調査せずにGOF由来FI-SCは無かったのではないかと、疑義を
切り上げてしまったのね。無かったらJAKiの検査を行った、あるいは行わせたと
言っている小保方さんと笹井さんは捏造者よね。ところが桂報告は捏造とは
認められないと言った。アホかというのはもうさんざん言ったから言わないわ。

741:2018/05/03(木) 07:33:12
言わないと言って、また言ったね、姉御。よほど腹に据えかねるんだな。

742ふふふ:2018/05/03(木) 07:36:11
こんな奴らが公務に携わってるなんて嘆かわしいんだろ。
日本は民間でもってるという言も強ち嘘でもないのかな、どんな世界でも
真摯に仕事に向き合ってる人はいるはずだけどなあ。情けないな。

743名無しさん:2018/05/03(木) 07:44:50
735名無しゲノムのクローンさん2018/05/03(木) 07:11:59.06ID:8Rb9B28f0
>>729
何にもしてないどころか、むしろ小保方、STAP勢に致命的な打撃を与えられてる。
アホなOoboeは事情を考えずにホムペの画像の件を覆そうと必死になってるけど、アレやったから小保方、三木の嘘や誤魔化しなどがバレてしまって自爆したんだよ。
もうバカにして笑ってるんじゃないかな、訴えると言ってた人は。

744デラ・ストリート:2018/05/03(木) 07:46:20
笹井さん達が何をしたかについてはOoboeさんが桃子の本を思い出させてくれたのね。
>>
私(笹井)と小保方氏においては、二つの点での挑戦をした。
3)すでに、体内に存在していた幹細胞ではなく新しく初期化された幹細胞であることの証明
4)Stapという現象が、アーティファクト(実験の手違いや、他の現象の見間違えなど)でないというダメ押し。
>>
書き方は私が細かくご指導しましたが、論文の筋のアイデアはあくまで彼女自身のものです。
>>
④は細かいことはいめいめありますが、大きな例でいえば、胎盤への分化能があることを見いだし、証明したことです。これはES細胞などのコンタミ(*混入)では絶対にあり得ず、STAPが極めて独自の現象であることを如実にしめしました。

745:2018/05/03(木) 07:48:09
>>743

早く死ねよ。トンチンカン間抜け野郎。糞チョンが。

746小野小町:2018/05/03(木) 07:49:35
<胎盤への分化能があることを見いだし、証明したことです。>というのは重要な証言よね。

747在原業平:2018/05/03(木) 07:53:51
<④は細かいことはいろいろろありますが>の部分は上の<4)Stapという現象が、
アーティファクト(実験の手違いや、他の現象の見間違えなど)でないという
ダメ押し。>を受けている。ここまでは若山さんの実験結果の検証をしたと言ってる。
でもその先で、<大きな例でいえば、胎盤への分化能があることを見いだし、
証明したことです。>と続いている。<胎盤への分化能があることを見いだし>たのは
自分たちであると言ってるんだね。

748大野晋:2018/05/03(木) 08:00:21
これは胎盤貢献発見の功績を自分たちに引き寄せているのではないんだな。それは
<4)Stapという現象が、アーティファクト(実験の手違いや、他の現象の見間違え
など)でないというダメ押し。>ということをまず押さえて、若山さんが胎盤に
寄与しているのではないかと小保方さんに渡した試料を笹井さんたちが検証した結果、
若山さんの予測通りであったことを自分たちが実証したと言ってるんだな。つまり、
厳密な意味での発見者は自分たちだと言ってるが、この実験を主導した若山さんの
最大功績を否定してるのでは無論ないね。そけが<ダメ押し>という言葉に現れている。

749丸谷才一:2018/05/03(木) 08:05:59
日本語読めない奴らが最近増えましたからねえ。驢馬向けの解説も必要
なんですね。センセ。日本人の驢馬なのか、単なる外国人工作員なのかは知らないが。
でも、そのことは若山さんが関さんに自分はFI-SCのああいう実験はしていない
と言ったことや、レター論文を読んで、自分にはわからない論文になっていたという
証言を裏づけていますな。

750ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 08:29:10
若山さんは小保方さんを山梨に連れて行きたかった。だからFI-SCの課題を与えて
その論文化を頼む形で縁を繋ごうとしていたんだろ、我々の推理では。そこに
理研が割り込んできて、その課題を笹井さんが主導して実行してしまったんだな。
若山さんは小保方さんの関心を引き付けるために試料を渡している。笹井さんは
小保方さんを通してその試料の由来を知り、そしてそれを分析して何かということを
突き止めてしまった。小保方さんが笹井さんに知らせていた情報は
①このFI-SCからはキメラができている。(木星リスト-30℃の14番〜17番、Fifure2-f,g、Ext.-1)
②このFI-SCからはGFP侵入胎盤ができている。(木星リスト₋30℃の14番:若山研■■氏、Ext.1-b,c、Ext.2)
③このFI-SCからはテラトーマができている。(木星リスト₋30℃の20番)
で、生資料はこの3つの情報とともに笹井さんと丹羽さんの見るところとなった。

751ドクター・ワトソン:2018/05/03(木) 08:32:44
笹井さんと、丹羽さんはこの細胞が何かということに関して答えを知った上で、
その確認実験を行ったんだね。キメラとテラトーマができてるというすさまじい
事実が彼らを圧倒している。そしてそれを信じ込んだまま、確認実験を行ったのが
JAKiでの検証なんだが、その検証方法は随分不確実な方法だったね。

752ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 08:37:52
若山さんを信じ込んでるからね。この共同研究の経緯は彼らは知らない。それどころか
笹井さんはリジェクトされた3誌論文すら読んでないんだから、無論、博論も、ティシュー論文も
読んでない。若山さんが小保方さんに渡した生飼料と小保方さんが若山さんから聞いていた
その試料の由来をもとに論文を書いたんだ。こんな論文って普通ないだろうな。

753小野小町:2018/05/03(木) 08:45:07
若山さんが小保方さんの細胞をもらって様々に試行錯誤した結果の論文として
若山さんが書くのが当たり前の論文だわね。小保方さんは幹細胞を作れない。
作れない人が筆頭著者で、試料を渡されて、小保方さんからまた聞きした由来情報
だけでレター論文という報告を書いたのが責任著者のひとりである笹井さんなのね。
若山さんが、8月に責任著者を降りたいと言ったときに、説得される代わりに
出した条件が笹井さんも責任著者に加わってくれという依頼で、手記にはその経緯に関して
若山さんは論文を書いた人が責任著者になるべきだと小保方さんに語ったというわね。

754在原業平:2018/05/03(木) 08:48:45
若山さんは小保方さんに論文を書いてくれと頼んだ。無論山梨に連れて行きたいんだから
自分の弟子にしたがっている心情だ。当然教育目的もあって課題を渡している。
笹井さんに論文化してくれと頼んだわけではない。ここに一つの断絶があるね。

755シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 08:53:23
オホホポエムを思い出すね。これを書き込んだのは若山さんに極度に近い
内部者だよな。

756ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 08:55:04
そのあたりは世の苦労人たちの直感で一目のところだな。

757小野小町:2018/05/03(木) 09:00:07
笹井さんも、丹羽さんもこのJAKiの検証が不完全だということは内心分かってるわよね。
自分たちが論文を書くときは一から全部自分たちで実験する。どこから来たのか
分からないような試料を使って実験はしない。でも、彼らは小保方さんのメンターなのよね。
彼女を育てるというのが仕事なので、彼女の代わりに自分たちで実験するのではないわね。

758デラ・ストリート:2018/05/03(木) 09:02:35
彼らが小保方さんに何と言ってたのかは手記にうかがわれるところね。
>>
>>
ただし、次世代シーケンサーの解析に用いられたサンプルは、笹井研に居た時に提出したものと、笹井研から提出されたものが混在してしまっていた。若山研での実験の大半は、若山先生が用意してくれた特殊なかけ合わせのマウスで行っていたが、若山研の引っ越しの後、私にそれらのマウスは残されていなかったので、シーケンス解析に用いるマウスの系統を揃えることなどができなかった。リバイスの際の話し合いにおいては、今回の次世代シーケンサーの解析は解析としては浅い解析であり、細胞の性質の傾向を見るだけに過ぎない。次の研究できちんとマウスの系統等を揃えられた際に、より深く解析して細胞の性質を吟味し、特異的なマーカーなどを探求しようということになった。(127P)

759小野小町:2018/05/03(木) 09:05:38
<今回の次世代シーケンサーの解析は解析としては浅い解析であり、細胞の
性質の傾向を見るだけに過ぎない。次の研究できちんとマウスの系統等を
揃えられた際に、より深く解析して細胞の性質を吟味し、特異的なマーカー
などを探求しようということになった。>というところに、ちゃんと彼らが
指導していることが表れているわね。

760在原業平:2018/05/03(木) 09:20:11
若山さんは胎盤に貢献しているかもしれないと言って胎盤と胎児とつながっている試料を渡した。
ついでにESのも渡したし、TSの胎盤も渡したと言ってるね。
これを笹井さんと丹羽さんが検証してるよね。特に胎盤は丹羽さんの最大の関心事だった。

761ドクター・ワトソン:2018/05/03(木) 09:24:40
胎盤のグラススライドって木星リストの14番の20枚だよな?
若山研■■氏作製だな。李氏ではないね。野老さんが作ってくれたのか、
それとも学生の寺下さんかな?

762シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 09:26:58
文字数は二文字なんだね。下に文字があるのを墨入れしているんだから、そこは
間違いないね。ただ日本人の名前は二字姓ばかりだから、李ではないという以上のことは
言えないね。

763ドクター・ワトソン:2018/05/03(木) 09:32:29
手記によれば若山さんから指示を受けたのは小保方さんで試料を渡されたのも彼女だ。
野老さんは遺伝子解析に詳しいという理由で小保方さんが相談していた人だから
グラススライドを作るという作業を頼めるとしたら学生で仲のよかった寺下さんか
テクニカル・スタッフかな。男性社会で男子学生には頼みづらいんだろ。

764シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 09:41:49
小保方さんは博士とは言え、客員だからね。テクニカルスタッフは正式の理研の
職員だ。特に坂出さんはかなり年上だから、頼めるとしたら、山中さんか寺下さんかな。

765:2018/05/03(木) 09:42:45
山中さんって感想さんかい?

766ふふふ:2018/05/03(木) 09:43:22
そうなのか? 知らんぞ。

767シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 09:50:48
スライドを作る作業って初心の内に身に着けておかないといけない仕事なんじゃないの。
手が空いてたら寺下さんに頼むかな。
15,16番の羊膜のと17番は小保方さんが作ったんだね。
固定液の中にあるのはSTAP細胞の胎盤だね。どこにあるのかは知らないが。

768デラ・ストリート:2018/05/03(木) 09:55:28
で、笹井さん達の立場に立ってみると、以下が前提になっているのね。
>>
①このFI-SCからはキメラができている。(木星リスト-30℃の14番〜17番、Fifure2-f,g、Ext.-1)
②このFI-SCからはGFP侵入胎盤ができている。(木星リスト₋30℃の14番:若山研■■氏、Ext.1-b,c、Ext.2)
③このFI-SCからはテラトーマができている。(木星リスト₋30℃の20番)

769ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 10:01:05
②の胎盤の切片を丹羽さんが確認しているんだよな。ただし、確認したのが
これであるのかどうかは今一つはっきりしない。可能性としては
1.STAP細胞キメラの胎盤
2.FI幹細胞のキメラの胎盤
3.129B6背景のTSのキメラ胎盤
の三つの中のどれかか、どれとどれか、どれもだな。

770シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 10:18:37
まず、胎盤が光るという話になったのは手記によれば2011年の最初の
キメラ成功実験時ではない。2012年に入ってからだ。(99P)
従って、Extended Data Figure 1-aはb,cとセットになっている限りにおいて
2011/12/28の4Nキメラではありえない。

771デラ・ストリート:2018/05/03(木) 10:20:35
>>
4)Letter Extended Data Fig.1a について 
2N キメラの写真ではなく、Article Extended Data Fig.7d と同じ 4N キメラ胎児胚 の写真の疑いがある点(論文撤回理由 2)(これについては、2014 年 5 月 10 日に著者か ら報告、5 月 21 日に報道されている)  この写真で胚の一部を胎盤と誤同定している可能性がある点
(調査結果)
4N キメラ胚であることは、マウス胚撮影に用いた PC に残存する写真(2011 年 11 月 28 日撮影)と若山氏の実験ノートから確認できた。論文の図の説明には 2 つの矢印があっ て、胎盤と卵黄嚢とされているが、専門家の意見によれば 2 つとも卵黄嚢である可能性 が高い。
(評価)
2N キメラか 4N キメラかは、論文の重要な論点とは考えられず、過失による可能性が高 いと判断した。STAP 細胞の胎盤への寄与は、Letter の論点として重要であり、研究の価 値を高めるために強引に胎盤と断定した可能性があるが、調査により得られた証拠に基 づき認定する限り、研究不正とは認められない。なお、図の説明にある「B6GFP×129/Sv」 は、最初にメス、その後でオスの遺伝的背景を書く通常の表記法では「129/Sv×B6GFP」 が正しいが、不注意による間違いと思われる。

772小野小町:2018/05/03(木) 10:28:58
そこは報告書の21Pね。雌雄表記の間違いはそう教えた人が居ないと書きようがないんだけどねえ。
29Pには幹細胞の話だけど以下のようにあるわね。印象操作になってるわね。
>>
3)STAP幹細胞FLSのGFP挿入パターンがホモではなくヘテロであったことを著者が認識し ていながら、その実験の不整合の原因を確認しなかった疑いについて (なお、論文に書かれているB6GFP×129/Svや129/Sv×B6GFP等の表記は、実際にマウスの 交配を行った若山氏によれば、間違いとのことである。)

773在原業平:2018/05/03(木) 10:31:09
<実際にマウスの 交配を行った若山氏によれば>と書かれているんだから、小保方さんに聞いたら
違う答えだったのかい?

774デラ・ストリート:2018/05/03(木) 10:37:56
ここにあるわ。遠藤さんが訝ったところだけど、彼には先生がそう言ってることを事情も分からないあの時期に
否定することができたか否かということに関する考察が抜けてるわね。視野が狭いのよね。この人の資質なのか
結論ありきなのかはともなくとして。
>>
このうち論文(Fig.2など)に使用されたFI幹細胞CTS1(Call TS-1)に対して理研が ゲノム解析を実施した結果、論文に記載されたOct4-GFPの挿入は確認できず、代わりに Acr-GFP/CAG-GFP遺伝子が挿入されていることが判明した。またFI幹細胞CTS1のゲノム配 列パターンは、それ以前に作製されていたES細胞FES1(2005年にAcr-GFP/CAG-GFPマウス より樹立)とSTAP幹細胞FLS3(2012年1月28日〜同年2月2日にAcr-GFP/CAG-GFPマウスよ り樹立)と完全に一致することが判明した。 なお小保方氏への書面調査で、小保方氏はSTAP細胞を作製する際に若山氏から渡され たマウスの遺伝的背景を把握していなかったこと、また、若山氏から(Oct4-GFPを有す る)GOFマウスを渡されたものと思っていたことが明らかになった。

775小野小町:2018/05/03(木) 10:42:06
<小保方氏はSTAP細胞を作製する際に若山氏から渡され たマウスの遺伝的背景を
把握していなかった>ら、論文書けないでしょと訝ったのね。だったら他の可能性を
考えるものよね。
>>
There are more things in heaven and earth, Horatio,than are dreamt of in your philosophy.

776ハムレット:2018/05/03(木) 10:43:55
小町ちゃん、僕のセリフ盗まないで。出番がなくなるから。

777オフィリア:2018/05/03(木) 10:46:16
桂調査も気づいているのね。こういうのってこういうギルド社会の常識なんでしょ。
身につまされて分かるんじゃないの。私たちは別の世界で生きてるからそんなことは
ないけど。

778ハムレット:2018/05/03(木) 10:51:42
どの世界でも多かれ少なかれあることだよ。わざわざ人と争う原因を作る必要もないからね。
どうでもいいことはごもっともですと言って損もない。とくにこの業界は狭いんでしょ。
研究室というのは小さな世界で、それがたくさん集まって学会になってる。一般社会より
ずっと閉鎖的だということくらいはわかるね。親分がカラスを白いと言ったら白いんだ。
信頼関係なんでそれが崩れるともう成立しない社会だ。小保方さんは追い出されたから桎梏が
なくなって手記を書いたんだ。桂調査の時期には親分子分の関係だ。そもそも好きで
弟子入りしているという基本だからね。

779在原業平:2018/05/03(木) 10:55:40
いろんな配慮をしながら世間をなだめようとしている桂報告のご苦労はともかくとして
我々は事件の真相を解明しようとしている。キメラもテラトーマもできてる。
なぜできたのかを追い求めておくれな。

780デラ・ストリート:2018/05/03(木) 10:57:46
いずれにせよ、以下は2012年以降のものだわね。それを丹羽さんが見た。
>>
1.STAP細胞キメラの胎盤
2.FI幹細胞のキメラの胎盤
3.129B6背景のTSのキメラ胎盤

781ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 11:08:12
①自然発生マウスの胚は胎児と胎盤の両方になる。無論胎盤は母親側からも作られる。
②ES細胞は胎盤には貢献しない。従って胎盤になっているのはホスト胚の栄養膜細胞だ。
③ES細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。
④ES細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤もホスト胚の栄養膜細胞だ。
⑤TS細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とリシピエントのTS細胞の両方で、胎児はリシピエントだ。
⑥TS細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とリシピエントのTS細胞の両方で、胎児はリシピエントだ。
⑦STAP幹細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。
⑧STAP幹細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。

782小野小町:2018/05/03(木) 11:11:57
STAP細胞とFI幹細胞だとどうなるの?
原則、STAP細胞は①の自然発生マウスと同じで、FI幹細胞はTS細胞と同じなんでしょ。

783在原業平:2018/05/03(木) 11:14:58
自然発生マウスと同じではないよ。幹細胞なんだからインジェクションしてキメラにする。
そのときにリシピエントの栄養膜と一体となって胎盤貢献するということだからね。
自然発生マウスはインジェクションはしていない。別のところからは何も入っていないんだ。

784小野小町:2018/05/03(木) 11:16:26
クローンは?

785在原業平:2018/05/03(木) 11:20:20
クローンはキメラではないからね。リシピエント卵の核を抜いて体細胞核を
インジェクトする。体細胞核が分裂して胚盤胞になる。栄養膜も体細胞が分裂して
栄養膜になったものだ。リシピエントの栄養膜なんて核を拭いて捨ててるんだから
存在していない。

786小野小町:2018/05/03(木) 11:22:47
丹羽さんはいずれかの胎盤の染色スライドを顕微鏡下で見て、TSのGFPの入り方と
明らかに違うとおっしゃったのね。

787デラ・ストリート:2018/05/03(木) 11:25:35
いずれかって、この中のどれかね。
>>
1.STAP細胞キメラの胎盤
2.FI幹細胞のキメラの胎盤
3.129B6背景のTSのキメラ胎盤

788ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 11:29:50
TSはGFPのあるホスト由来とそれの無いリシピエント由来の胎盤がキメラになるよね。無論母親側から差作られてくる部分は別だよ。
>>
⑤TS細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とリシピエントのTS細胞の両方で、胎児はリシピエントだ。
⑥TS細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とリシピエントのTS細胞の両方で、胎児はリシピエントだ。

789デラ・ストリート:2018/05/03(木) 11:31:41
2のFI幹細胞のキメラの胎盤はTSと同じ関係だわね。すると丹羽さんはそれを見たのではない。
ということになると、1.STAP細胞キメラの胎盤ということになる。

790小野小町:2018/05/03(木) 11:34:33
小保方さんが記者に丹羽さんが見た胎盤切片はどこにあるのかと問われて
木星リストのFI-SCの胎盤切片を言わずに固定液の中にあると答えたことと
整合してくるのね。

791ドクター・ワトソン:2018/05/03(木) 11:37:06
では、丹羽さんが胎盤組織にしっかりとインテグレイトしていてその入り方は
TSと違うと言ったGFPの入り方はどんなものだったんだい?

792シャーロック・ホームズ:2018/05/03(木) 11:39:41
素人が考えても仮にクローンだったらGFPの入ってる量が違うと分かるね。

793ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 11:42:56
僕はちょっと用語を間違えたぞ。訂正。
>>
①自然発生マウスの胚は胎児と胎盤の両方になる。無論胎盤は母親側からも作られる。
②ES細胞は胎盤には貢献しない。従って胎盤になっているのはホスト胚の栄養膜細胞だ。
③ES細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。
④ES細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤もホスト胚の栄養膜細胞だ。
⑤TS細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とドナーのTS細胞の両方で、胎児はホストだ。
⑥TS細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚とドナーのTS細胞の両方で、胎児はホストだ。
⑦STAP幹細胞で4Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。
⑧STAP幹細胞で2Nキメラを作った時にできている胎盤はホスト胚の栄養膜細胞だ。

794孤舟:2018/05/03(木) 11:43:31
阿久悠から電話だ。

795イェイ:2018/05/03(木) 11:44:14
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796イェイ:2018/05/03(木) 12:47:33
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797在原業平:2018/05/03(木) 12:48:43
左手。

798ペリー・メイスン:2018/05/03(木) 12:52:35
そうだな。桂調査はどうして木星リストの₋30℃フリーザーの14番:若山研■■氏の
20枚を調べなかったのかという疑問だろ?

799小野小町:2018/05/03(木) 13:00:36
F1-SCの胎盤切片20枚ね。寺下さんが作ったらしいものね。
これは胎盤にGFPがインテグレイドしている筈のものね。もし偽物だったら
TSで作るより無いものだわ。TSはGOFマウス由来のものと、コントロールTSである
129B6のCAGヘテロ由来のもの、そして丹羽研作成のCD1由来のTSしかない。因みに
因みにCD1由来TSというのは丹羽研で作られたというのは桂報告にも書いてあったわね。
>>
これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。 (26P)

800在原業平:2018/05/03(木) 13:03:43
木星リスト14番は若山研でのものだからね。
①GOFマウス由来
②129B6のCAGヘテロ由来
のどちらかしかない。
もしこれがB6129であったら、若山さんの嘘がばれる。しかも、FI-SCが本当に
胎盤寄与したことが証明される。


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