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STAP問題の全解に向けて、その19

857在原業平:2018/03/11(日) 09:37:19
そう。それはTSさんがデータを追加してくれたおかげでAグループとB-1グループとの
母系の違いという証明問題に置き換えられた。
Aグループ
FLS3(129/SvX1♀xB6♂)
129/GFP ES(不明)
CTS1(129/SvX1♀xB6♂)
AC129(129/SvX1♀x129/SvX1♂)
129B6F1G2(B6♀x129/Sv+Ter♂)リシピエントがBDF1なのでミトコンドリアはB6
FES2(129/SvX1♀xB6♂)
B-1グループ
129B6F1G1(B6♀x129/Sv+Ter♂)リシピエントがBDF1なのでミトコンドリアはB6
FES1(129/SvX1♀xB6♂)

858小野小町:2018/03/11(日) 09:40:58
129B6F1G1,2は実際には雌雄が違っていてB6♀x129/Sv+Ter♂なのね。そして細胞質は基本B6なのね。
そしてヘテロプラスミーがあったとしてもB6♀なので違いがでない。アルイミオウジさんが既に
書いてることね。

859在原業平:2018/03/11(日) 09:44:46
あ、129/GFP ESは分析事実としては不明じゃないね。勘違いした。訂正。
<Aグループ>
FLS3(129/SvX1♀xB6♂)
129/GFP ES(129/SvX1♀xB6♂)
CTS1(129/SvX1♀xB6♂)
AC129(129/SvX1♀x129/SvX1♂)
129B6F1G2(B6♀x129/Sv+Ter♂)リシピエントがBDF1なのでミトコンドリアはB6
FES2(129/SvX1♀xB6♂)
<B-1グループ>
129B6F1G1(B6♀x129/Sv+Ter♂)リシピエントがBDF1なのでミトコンドリアはB6
FES1(129/SvX1♀xB6♂)

860小野小町:2018/03/11(日) 09:51:06
私たちはFLSはntESだと主張しているんで、FLS3(129/SvX1♀xB6♂)のリシピエントは
ICRだと推測しているのね。で、そこにAが無いかと探し多結果、それは無く、NODに
あったんだけど、NODは免疫不全マウスなので、核移植のリシピエントに使うことは
考えにくいし、それとこのAの問題自体がヘテロプラスミーであるかどうかも確定的で
無いというところでペンディングされているわけね。

861在原業平:2018/03/11(日) 09:57:26
そういうことだ。そしてそこにJISAIさんが新たな疑義を持ち込まれたので整理してみた結果は
母系の違いではないということだけは明確になったよね。s@aoim
129とBがある。それとntES-Gは分析されていて中身は(B6♀x129/Sv+Ter♂)と分かっている。
JISAIさんはそこに勘違いがあるね。
さて、それでは彼が指摘した疑義だ。
>>
このパターンの違い(特に右端)の、FLS3・129GFPES・CTSの類似性と、FES1との違いは、その母系統が違うことを意味しているように思えるんですが、どうでしょうか。

862在原業平:2018/03/11(日) 09:59:30
s@aoim129とBがある。→どちらにも129とB6がある。

863小野小町:2018/03/11(日) 10:02:09
なるほど、あなたが出世した結果、JISAIさんの疑義にNoと答えられるようになったと。

864在原業平:2018/03/11(日) 10:34:29
小町ちゃん、僕は出世しなくてもNoと答えられるじゃないか。ここまでの整理に
新しい知識は必要ない。そうではなくて僕が831さんに感化された結果、分かったことは
あのグラフのパターンは基本的にはリードの張り付いた数なんで、裏返すと分析された
RNAがDNAの並びのどこで沢山発現したかを意味している。無論エクソンの無いところでは
RNAはスプライシングされてリードは基本的には存在しない。でもこれはミトコンドリア
なのでイントロンが無いんでびっしり重なっている。

865小野小町:2018/03/11(日) 10:36:31
ふむ、ふむ、次世代シークエンサーデータ解析の基礎知識@AJACS前橋、は工事中だったので
近くにあった仲里さんの人工遺伝子を注射したのね。

866在原業平:2018/03/11(日) 10:40:05
そうなんだ。それで僕は馬から鹿に出世した。その結果僕は、JISAIさんの疑義は
ではなぜ4グループのパターンが異なっているのかという疑義に置き換えられなければ
ならないということが分かったのだ。

867デラ・ストリート:2018/03/11(日) 10:44:54
はい、TSさんのつぶやきよ。
>>
@ts_marker
48 分前

ESからESマウスを作成するとミトコンドリアはどうなる。

>>
@ts_marker
3月9日

mergeするとカバレージ倍増。
でも、まだカバレージが少ないところもある。

868ペリー・メイスン:2018/03/11(日) 10:49:10
アルイミオウジ氏もデータを見せてくれていてここにはICRのミトコンドリアも
あるけど他のと全く違うね。

869小野小町:2018/03/11(日) 10:51:40
上でグループ分けしたものの大半は129が母親よね。だから似てる。でもntES-Gは
B6なのよね。これが他と比較してICRほどには違って無くて、ICRに対して言うなら
同じと言っていいほどだわね。

870:2018/03/11(日) 11:00:08
俺たち悪党が真っ先に考えるのは太田さんのntES-Gは論文もラベルも129B6F1で
本当は中身もB6♀x129/Sv+Ter♂ではなくて、論文の通りに129/Sv+Ter♀xB6♂
だったんじゃないかということだな。ただ桂報告は雌雄を間違えた振りをして
こちらは調査対象ではなくFESが問題なのだと誘導した。

871ふふふ:2018/03/11(日) 11:07:05
鉄、それは無いんだぜ。このntES-Gは雄だつたんだが、そのX染色体が
B6だと言うことがBCA報告にの中で証明されているんだ。論文によれば
使われたリシピエント卵はBDF1で、だから細胞質内の母系である
ミトコンドリアDNAはB6なんだ。いずれにせよntES-Gを調査対象から外して
FESに誘導するための嘘ではない。

872デラ・ストリート:2018/03/11(日) 11:10:14
はい、アルイミオウジさんのつぶやきよ。
>>
阿塁未央児
‏@aruimiouji
3月9日

JISAIさんの発見について、余り望みはないと批判的に書こうと思ったけれど、止めた!。
原因は分からない。
正直……相当難しいとは思う。
只、マウスを長年見て来ているようなNGS解析の専門家に聞いてみるのは面白いかもしれない。
と言うよりも、最低、一度は聞いてみるべきだと思う。
但し、>>

873デラ・ストリート:2018/03/11(日) 11:11:24
>>
かなりの本格的な専門家に限る。
中途半端な専門家でも駄目だと思う。
素人が少し考えただけでは無理!。
カバレッジトラックの右端の形状の差異に着目したようです。

874在原業平:2018/03/11(日) 11:17:47
この形状の差が何かということはまずはB6のミトコンドリアDNAの同じ図が欲しいよね。
129は大昔B6がコンタミしたという曰くつきのストレーンだからね。
基本的には後ろの方のカバレッジの山が高いのはそれだけタンパク質合成活性が
高いということよね。それがどういう違いから発生するのか?

875小野小町:2018/03/11(日) 11:22:33
JISAIさんは母系のマウスストレーンの違いと疑義されたけど、それはB6を
見て見ないと分からないということね。でも、ntESとFESがAとBに分かれてしまってるので
原因が母系の違いであるのか否かは懐疑的ということね。

876在原業平:2018/03/11(日) 11:27:18
どうだ、小町ちゃん。男子三日会わざれば刮目して見よ。
僕の出世を褒め称えよ。

877小野小町:2018/03/11(日) 11:30:01
ま、専門的に言えば、馬が鹿になっただけのことだわね。
ランチ!

youtube.com/watch?v=e3feuBjodyM

878イェイ:2018/03/11(日) 11:30:44
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🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🏊 ♨ 🎲 🎌 🎳 
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🍷 ❗ 💡 ☀ ✈ ✂ ✒ ✌ 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨

879在原業平:2018/03/11(日) 16:53:11
小町ちゃん、ジンライムね。

880ヘーゲル:2018/03/11(日) 16:54:27
本題頼むぜ。

881カール・ヤスパース:2018/03/11(日) 16:55:04
本題、何でしたっけ?

882デラ・ストリート:2018/03/11(日) 16:55:50
あら、何だったかしら?

883小野小町:2018/03/11(日) 16:59:47
デラさん、お願いよ。昨晩のおかず何だったか思い出せない人ばかりなんだから。
あなただけが頼りよ。しっかりしてね。
若山さんの記者会見で、放医研は一体何を調べたから、巡り巡って遠藤さんが
アクロシンでっせと言い出すことになるのかという論理の筋道の話しだわ。

884業務連絡:2018/03/11(日) 23:13:57
 WGSのロングリードにはbwaが推奨らしいが何故Tophat(Bowtie)を使うの?
結果はほぼ同じようですが。

885自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/03/12(月) 00:37:03
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

886 地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/03/12(月) 08:04:59
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887在原業平:2018/03/12(月) 08:05:55
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

888小野小町:2018/03/12(月) 08:07:59
お気に入りは特段何もなしよ。

889在原業平:2018/03/12(月) 08:11:03
いろいろとIGVの見方に関してヒントを出してもらってるみたいだけど、なんだか
馬の耳に念仏だね。へへへ。

890小野小町:2018/03/12(月) 08:13:59
1100歳にもなって今更生物学者になって食べて行こうというんじゃないから
ほんとは、こっちが勉強するより、勉強の終わっている人たちに端的に
答えを教えてもらいたいのよねえ。JISAIさんの疑義はどういうことなのかと。

891在原業平:2018/03/12(月) 08:20:00
TSさんの<mergeするとカバレージ倍増。>というのは以下の説明だね。
>>
Merged BAM File
A set of BAM files can now be loaded merged into a single track. If each file contains different Sample or Read Group tags, as specified in the SAM/BAM file format, then the merged track can be sorted by these to differentiate the origins of reads to these files within a single track.
Create a text file containing a list of the BAM files you want to load, listed by either file path or URL. IGV will load all the BAM files as a single track.
This file must be in plain text format with .txt extension. Rich text format will cause an error.
For older versions of IGV, be sure there is not an extra line at the bottom of the list. This causes an error.
If IGV gives an error "Error loading.... Cannot find reader for alignment file" see here.
Required Extension: .bam.list

892小野小町:2018/03/12(月) 08:31:08
アルイミオウジさんによると泥縄では無理ということだわね。JISAIさん自身の
答えを待ちましょう。
それよりも、今根本さんのところと学さんのところで129GFPESに関して対立した
意見が出てるわよね。

893在原業平:2018/03/12(月) 08:34:07
コメント欄だろ。和モガさんが3/13が楽しみと書いてる問題だよね。明日だよ。
ひょっとしてペコリさんが早刷りを読んで何か書いてないかとチェックしたけど
まだだね。

894小野小町:2018/03/12(月) 08:35:23
学さんのところのは以下だわ。
>>
参考:ttps://www.nikkei.com/article/DGXMZO82193330R20C15A1000000/

・大田氏はチューブに「129B6F1 GFP FES-1」と書き、その他に性別、凍結日、継代回数を書いていた
・小保方氏のフリーザーから見つかったそのチューブは、ラベルが「129/GFP ES」と書き直されていた

チューブのラベルを書き直した人は、この細胞の正体を隠す必要があった、ということでしょう。悪意のある第三者が小保方氏のフリーザーにES細胞を置くのであれば、細胞の正体を隠す必要はありません。むしろ、明らかにした方が目的を達成しやすいはずです。
日経サイエンスには、「129/GFP ES」と書き直した人は、大田氏のラベルを見てアクロシンが入っていることに気が付かなかったのではないかと書かれてます。少なくとも若山研の研究員ではないということは言えると思います。

何度も指摘されている内容ですが、この部分を理解していれば、清香氏が129/GFP ESを作成したなどという荒唐無稽な事は考えられないはずです。
2018/3/12(月) 午前 2:18[ tai***** ]返信する

895在原業平:2018/03/12(月) 08:38:09
根本さんのところのは以下だ。
>>
2ch情報が事実として前提されていることに違和感があるので。
小保方氏を陥れる為のフェイク情報を流している関係者がいることは確実ですが、2ch発信の斜め巻きラベルの情報もそのひとつではないでしょうか。

「Sの字が傾いてるのはオボの特徴。斜め巻きのラベルは嫁の特徴。」

この情報は2015/01/31に2chに書き込まれたものですが、日経サイエンスに129/GFP ESの写真が載っていたのを受けてのものでした。この情報を書いた人物は、石川智久氏に虚偽情報を与えて刑事告発をさせた人物の可能性が高いような気がしています。そして、この2ch情報も実はフェイクで、実際には例えば「Sの字が傾いてるのは嫁の特徴。斜め巻きのラベルは大田博士の特徴。」だったとしたら。
2018/3/11(日) 午後 0:11 [ tai*o*no* ] 返信する

896在原業平:2018/03/12(月) 08:39:06
続きだ。
>>
この2ch情報は、129/GFP ESの文字の特徴に小保方氏のクセが出ているとして、小保方氏が「知らない」と言い所有者不明とされた129/GFP ESは、実際には小保方氏が自分でラベルしておきながらそれを知らないと言って嘘をついていると指摘するものです。この書き込みはそれを言うための情報です。小保方氏を陥れる為に「オボの特徴」を捏造した可能性があると思います。そこに何故か「嫁の特徴」まで加えているので余計に怪しさ倍増です。
そしてこの仮説に立てば、現在矛盾するように見えているものの矛盾がなくなりますし、日記の記述もそのまま素直に受け取って良いと思います。
2018/3/11(日) 午後 0:13 [ tai*o*no* ] 返信する

897シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 08:41:48
まずはこの問題を最初に調べたのは桂報告書なんだからそれを見せておくれよ。

898デラ・ストリート:2018/03/12(月) 08:43:23
ここね。
>>
ES 細胞混入のもう 1 つの謎は、ES 細胞 FES1 がどのようにして STAP 細胞研究時の CDB 若山研に存在したかである。ES 細胞 FES1 は 2005 年に当時の CDB 若山研メンバー によって樹立されたが、その後、研究に使わず、2010 年 3 月(CDB 若山研で STAP 研究 が始まる前)に転出した時に ES 細胞 FES1 の凍結保存試料を全部持ち出して CDB 若山 研には残さなかったとされている。当時の CDB 若山研メンバーへの質問状と聞き取り 調査、および関係者の実験ノートの調査でも、当該メンバー以外に ES 細胞 FES1 を使 用した者は見つからなかった。 しかし、CDB 若山研が終了した後に小保方研のフリーザーに残っていた「129/GFP ES」 と書かれた試料が見つかった。この試料はゲノム解析により ES 細胞 FES1 とほぼ同一であることが判明したが、この試料については、調査委員会の質問に対し、小保方氏、 若山氏をはじめ、CDB 若山研メンバーは全く知らないという回答であった。したがっ て、ES 細胞 FES1 がどのようにして STAP 細胞等の作製時に混入したのかは、謎のまま 残った。

899ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 08:47:04
謎のまま残ったって、なんて無責任な奴なんだろうな。
まあ、桂報告のいい加減さはとりあえず置いておいて、ここで事実確認を
しておきたいな。<2005 年に当時の CDB 若山研メンバー><というのは無論
大田さんのことだね。

900シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 08:50:34
そうね。既に知られていることだ。<転出した時に ES 細胞 FES1 の凍結保存
試料を全部持ち出して CDB 若山 研には残さなかったとされている。>というのは
曖昧な書き方で、<されてる>って何だ。誰かの伝言でも聞いたのかね。井戸端会議かい。

901ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 08:54:27
いや、僕は以前からこの報告書をまとめた人間の国語力に対して基本的な
疑いを抱いている。よほど出来の悪い頭の持ち主であるか、さもなければ
嘘をつこうとしている人間かのどちらかだと思ってる。
しかし、いずれにせよ、その後ろに<当時の CDB 若山研メンバーへの質問状と
聞き取り 調査、および関係者の実験ノートの調査でも、当該メンバー以外に
ES 細胞 FES1 を使 用した者は見つからなかった。 >とあるよね。
従って、<されてる>というのは常識的に判断すれば、太田さんの実験ノートに
あると言う意味だ。

902シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:00:16
<当該メンバー>だけが<FES1 を使 用した>と証言し、<実験ノートの調査>でも
そこに記されていたと。そしてその他の人々は作られたことも知らず、使ったことも
ないと。だから証拠能力の弱さを勘案して<されている>と書いているのだと考えるのが
常識的判断だと、君は言うんだな、ワトソン。

903ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 09:06:49
常識的にはな。でも具体的に若山さんも太田さんのFES1,2を知らなかったとは書いてないよな。
アクロシンが出た時にこの太田さんの受精卵ES2株とntES4株が対象になったと言うが、若山さんは
記者会見でうっかりしてたが太田さんが129B6でESを作っていることを知ってたよな。すると若山さんは
知ってたんでしょ。すると他のメンバーは君が今言ったように作られたことも知らず、ということは無いのだ。
あれと思って原文を注意深く読むと、そこには<使 用した者は見つからなかった。>と書かれている。

904シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:09:41
では、<転出した時に ES 細胞 FES1 の凍結保存試料を全部持ち出して
CDB 若山 研には残さなかったとされている。>の<されている>の意味は?

905ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 09:11:47
太田さんが<全部>持ち出したと言ってるが、使われた以上<全部>ではなかったはずだという意味だ。

906シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:16:27
では<されている>の意味は、太田さんがそう言っているというだけの意味だね。
桂報告は太田さんが全部持ち出したと言っているにも関わらずFESがつかわれたと
いう結論との間にある矛盾に関して、太田さんの記憶違いだと思っているから、
<されている>という言葉を使ったんだね。ではそんなに不思議だっんだから、その
大田さんの細胞は何年間もどこに保管されていたかも調べたんだろうね。

907ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 09:19:12
保管場所は若山研の‐80℃フリーザーもしくは液体窒素保管器、もしくは
別の独立した液体窒素管理室の保管器の中だ。

908シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:28:15
誰が出し入れの記録をしているのかね。

909ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 09:33:21
分からないが、噂では奥さんと聞いている。又サンプルに液体窒素保管分が
あったことはOoboeさん資料に書かれている。ただ、これらの出し入れ記録のみならず
大田さんのFES1の作製時実験ノート部分も公表されてないので、法廷証拠としてなら
この細胞は存在自体が信用されないレベルとなる。

910シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:35:10
論文には書かれていないのかね?

911ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 09:41:03
受精卵ESであるFES1,2は論文には使われていない。日経に太田さんが答えたところによると
目的もなく作ってただ保管してただけで、かつ論文に使われた129Terで作ったと
記憶してたと<されている>くふふ。

912シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 09:44:33
論文のESはntES-G1だね。背景は129B6だね。ラベルにもそう書かれていた。
ところが桂チームが分析したら中身はB6129だったんだね。驚天動地の筈が
それはスルーされたんだったね。

913迷子の女の子:2018/03/12(月) 09:46:12
バカ、カバ、チンドン屋。お前の母ちゃん出ぇぇぇ臍。

914翻訳機:2018/03/12(月) 09:47:53
フール、ヒッポ、、サイエンス、捏造チェリーは出eee臍.

915在原業平:2018/03/12(月) 09:48:50
川上さん!

916川上のぼる:2018/03/12(月) 09:49:51
腰痛で釣りに行けんから退屈じゃぁぁぁっ!

917小野小町:2018/03/12(月) 09:56:00
要するに、FES1,2は実験ノートに書かれている筈だけど桂報告はそれを開示していない。
そしてFES1,2がTerであったかどうかは、あったとしても実験ノートには書かれていないはずなのね。
なぜなら、太田さんは記憶で話しているからよね。実験ノートにあったらちゃんと指摘できるわよね。

918在原業平:2018/03/12(月) 09:59:13
ntESに関しては4株提出しているとチンドン屋は、いや、もとい、日経サイエンスは
書いているんだけど、桂チームが分析したのはラベルが129B6なのに中身がB6129のもの
だけなんだね。李コリの二つが何か分からないね。

919在原業平:2018/03/12(月) 10:00:18
李コリ→残り

920ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 10:30:15
残りは129B6系統でない岡部マウスとのF1ESではないかな。論文にある。裏返すと
大田さんは最初岡部マウスと聞かされて関連全部を山梨若山研に提出したのかも
知れないね。そこのところのやり取りはOoboeさんとパートナー氏が今調べている
ところだね。太田さんはごく初期は共犯でない可能性がある。ただ、後の
若山さんから主張されていることに口裏を合わせている可能性はあって、
弟子筋だから止むを得ないところは有ろうけど共犯が怪しいね。

921シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 10:32:23
2008年論文と特許提出書類にあるマウスラインの雌雄が違うなんてありえないことだからね。
本当は嘘だと言わなきゃいけないよね。ただ、今では黙秘してしまったね。

922小野小町:2018/03/12(月) 10:35:14
まあ、そこのところはもう私たちは追い詰めてしまってるからね。論文とラベルに
無い中身が入っているサンプルを受け取っていながら、それをスルーして同時に
提出されているものの中身が正しいなんて誰が信じるのよ。まあ、あの頃は混乱が
激しかったからね。スルーしたことはともかくとして、今気づいていながらFES1の
証拠能力があるなんて前提は通らないわね。

923シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 10:38:21
まあ、だからそれはともかくとしてという話だろ。あちこちのコメント欄で
対立している主張は小保方さんの日記に暴露された事実に関するものだ。
小保方さんが犯人ならこの話をわざわざ蒸し返してくる理由はないからね。

924小野小町:2018/03/12(月) 10:43:55
いよいよ、張り付けた桂報告書の後半部分ね。
>>
しかし、CDB 若山研が終了した後に小保方研のフリーザーに残っていた「129/GFP ES」 と書かれた試料が見つかった。この試料はゲノム解析により ES 細胞 FES1 とほぼ同一であることが判明したが、この試料については、調査委員会の質問に対し、小保方氏、 若山氏をはじめ、CDB 若山研メンバーは全く知らないという回答であった。

925ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 10:47:11
僕はこの文章の書き手の<国語力に対して基本的な疑いを抱いている。よほど出来の悪い頭の持ち主であるか、さもなければ
嘘をつこうとしている人間かのどちらかだ>と述べたよね。
小町さん、<この試料について>の、<調査委員会の質問>は何でしょうかね。

926小野小町:2018/03/12(月) 10:51:08
国語力を問われているという前提だと、分からないわね。何通りかの問い方があるでしょうね。
ただ、理研が国民を騙そうとしているとは普通は考えないから、普通に読めば、
<小保方研のフリーザーに残っていた「129/GFP ES」>の存在自体が何であるかを知っているかと
問うた答えが、全員知らないと解すんじゃないの。 強調はこの細胞の存在だわ。

927ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 10:59:23
でも小町さん。問いの前に書かれていることがある。

928小野小町:2018/03/12(月) 11:01:20
そうね。以下でしょ。
>>
しかし、CDB 若山研が終了した後に小保方研のフリーザーに残っていた「129/GFP ES」 と書かれた試料が見つかった。この試料はゲノム解析により ES 細胞 FES1 とほぼ同一であることが判明したが、この試料については、調査委員会の質問に対し、

この質問だと129/GFPESがFES1と一致したということに対して、その理由を知ってるかという意味も含んだ問いになってるわね。

929デラ・ストリート:2018/03/12(月) 11:32:49
② クライオチューブ/詳細不明 計45本 Obokata RNA CTS→ESlikeもESと記載
  マイクロチューブ/FLS-○他、詳細不明 計31本      FLS→129ESと書いていた
93番  129      1本
94番  129ES     1本
95番  129/GFPES   2本
102番 GOF ES    1本 ■■由来→小保方
103番  ES+/- 2本       +/-:FLSがheteroだと判明していたので+/-と書いた可能性あり
104番  TS P4    1本       丹羽研由来
109番  129 GFP+/- 1 8 本       FLSのことだろう(小保方) 自分で作成
110番  GLS P3 2013.5.11 3本     1回起こしてP3となったもの。
111番  129 GFP+/- 2 1本       FLSのことだろう(小保方)
112番  TS-5      1本       コントロール
113番  FLS     2本       4番? 4番ばかり使っていた(4番は感じ悪いので自分で使用)
114番  129 F1 GFP+/- 2   1本     FLSから。他人から受け取った記憶は今のところない・・・
115番  129B6F1GFP ES-6   1本     由来不明
117番  129B6 ICSI P4 ES1 3/17/05 1本 全く分からない
132番  ntES-BDF1GFP5 12cm2 06/22/08 1本 不明

930ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 11:36:29
ちょっと見にくいが既に木星リストは皆見てる。小保方さんは95番の129/GFP ESに
関してその存在を知らないとは言ってないよね。それどころか、<FLS→129ESと書いていた >のなら
<94番  129ES     1本>は明らかにな小保方さんはFLSだと言ってることになる。

931シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 11:47:34
そこから類推すると、以下は小保方さんにとってはラベル表記上のFLSの異名だということになるな。
>>
93番  129        1本
94番  129ES       1本
95番  129/GFPES     2本
103番  ES+/-      2本       +/-:FLSがheteroだと判明していたので+/-と書いた可能性あり
109番  129 GFP+/- 1    8本       FLSのことだろう(小保方) 自分で作成
111番  129 GFP+/- 2    1本       FLSのことだろう(小保方)
113番  FLS       2本       4番? 4番ばかり使っていた(4番は感じ悪いので自分で使用)
114番  129 F1 GFP+/- 2  1本       FLSから。他人から受け取った記憶は今のところない・・・

932デラ・ストリート:2018/03/12(月) 11:54:33
残りは以下ね。
>>
102番  GOF ES             1本 ■■由来→小保方
104番  TS P4            1本 丹羽研由来
110番  GLS P3 2013.5.11      3本 1回起こしてP3となったもの。
112番  TS-5              1本 コントロール
115番  129B6F1GFP ES-6        1本 由来不明
117番  129B6 ICSI P4 ES1 3/17/05   1本 全く分からない
132番  ntES-BDF1GFP5 12cm2 06/22/08 1本 不明

933シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 12:10:14
<95番  129/GFPES     2本>に対して小保方さんは由来不明、もしくは不明と
答えていない。にも拘わらず、桂報告は<調査委員会の質問に対し、小保方氏、
若山氏をはじめ、CDB 若山研メンバーは全く知らないという回答であった。>としたので
一般国民側に混乱が起きたんだね。木星リストの聞き書きは桂調査チームの
質問より先に行われているはずだね。そして桂チームは自分たちの問いの形が
どうであったかを明らかにしていない。

934ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 12:11:49
そういうことだな。そこで今日のコメント欄の意見の検証だね。まずアンチ側から行こうか。

935デラ・ストリート:2018/03/12(月) 12:13:10
ここからかしら。
>>
参考:ttps://www.nikkei.com/article/DGXMZO82193330R20C15A1000000/

・大田氏はチューブに「129B6F1 GFP FES-1」と書き、その他に性別、凍結日、継代回数を書いていた
・小保方氏のフリーザーから見つかったそのチューブは、ラベルが「129/GFP ES」と書き直されていた

936シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 12:20:40
参考は日経サイエンスで皆承知していることだからいいね。

①大田氏はチューブに「129B6F1 GFP FES-1」と書き、その他に性別、凍結日、継代回数を書いていた
②小保方氏のフリーザーから見つかったそのチューブは、ラベルが「129/GFP ES」と書き直されていた

①は日経サイエンスが太田さんに聞くよりないだろうと思われる書き方でそう書いてることだけど、肝心の
大田さんはOoboeさんのパートナー氏が確認したら、日経サイエンスの記事は読んでないと答えた。又この件に関しては
大学より緘口令が出ていて答えられないとした。
又②に関しては<ラベルが「129/GFP ES」と書き直されていた>ということを言った人は誰も居ないし、
証拠も無論出ていないので、この人がそう推測したと言う事だと思われるね。可能性としてはあり得ることだから
辞十デハ無いという確認だけしていれば推測するのに別に問題ではないね。

937シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 12:22:00
辞十デハ無い→事実ではない

938小野小町:2018/03/12(月) 12:26:29
この人は<95番  129/GFPES     2本>はもともと<129B6F1 GFP FES-1>と書かれていたと言ってるのね。無論もう一本には
<129B6F1 GFP FES-2>と書かれていたという意味でしょうね。
>>
チューブのラベルを書き直した人は、この細胞の正体を隠す必要があった、ということでしょう。悪意のある第三者が小保方氏のフリーザーにES細胞を置くのであれば、細胞の正体を隠す必要はありません。むしろ、明らかにした方が目的を達成しやすいはずです。
日経サイエンスには、「129/GFP ES」と書き直した人は、大田氏のラベルを見てアクロシンが入っていることに気が付かなかったのではないかと書かれてます。少なくとも若山研の研究員ではないということは言えると思います。

939ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 12:36:20
この人は事実確認が疎かなんだね。桂報告書には*6に正式名称が書かれている。
その2本は
①129B6GFP1 FES♂
②129B6GFP2 FES♂
と書かれていた。ラベルなのか説明書きなのかは分からないけどね。というのも
日経サイエンスには確かにこの人が書いているように
<大田氏はチューブに「129B6F1 GFP FES-1」と書き、その他に性別、凍結日、継代回数を書いていた> と
あるね。でも正確にはチューブにではなく<ラベルには>だ。

940シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 12:39:39
対して、桂報告はラベルなのか添付説明書なのかを書いてない。つまり、CDBの
解析チームの分析した細胞が太田さんが送ったものその物かどうかが分かってないんだよな。
大田さんは「129B6F1 GFP FES-1」と書いたと言ってる。しかし、桂報告は129B6GFP1 FES♂と
書かれていたと受け取り得る書き方をしているんだ。

941小野小町:2018/03/12(月) 12:41:46
そこを今Ooboeさん達が物のやり取りの確認から再調査しているところなのよね。

942シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 12:53:07
何しろ、桂報告の*6の注にはntESも正式名称とやらが書かれている。
③129B6F1G1
④129B6F1G2
これが正式名称だと桂報告は言ってるんだよ。中身は雌雄が違っていたのに。
論文にはG2というのは出て来ないんだぜ。

943ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 12:55:35
G1からG20までの別の論文はあるけどな。マウス背景が違うよね。

944小野小町:2018/03/12(月) 12:57:07
大田さんから受け取ってから若山さんが何をしたか分からないわね。

945デラ・ストリート:2018/03/12(月) 13:07:18
このアンチ側コメントの人は小保方さんが太田さんの<「129B6F1 GFP FES-1」と書き、
その他に性別、凍結日、継代回数を書いていた>とされているサンプルをどこかで見つけて
GFPが何であるかを確認せずに捏造に使ったのだと推測しているのね。まあ、小保方さんが
桂報告の言うところのESによる捏造犯だったら、GOFマウスに対してはGFFESを使い、129B6に
対しては129B6F1 GFP FES-1の情報で、少なくともOct4-GFPではないからCAGだろうと、
アクロシン入りでしかもヘテロだということも知らずにエイヤッとコンタミさせたのだと
思っているのね。それは桂報告が出た時からある推測よね。

946小野小町:2018/03/12(月) 13:09:57
この人の言いたいことは、小保方さんが129/GFPESを盗んだんだから、それが静香女史のものであるなんてことは無いということね。
>>
何度も指摘されている内容ですが、この部分を理解していれば、清香氏が129/GFP ESを作成したなどという荒唐無稽な事は考えられないはずです。

947在原業平:2018/03/12(月) 13:13:45
この人は所謂周回遅れなんだね。<この部分を理解>してない人がこの界隈に
居ると思ってるんだね。
桂報告が何を意味するか。犯人は不明とされているが、その論旨の通りなら
小保方さんが犯人だと皆が理解している。
その上でこれまで桂報告の矛盾の指摘が積み上げられてきているんだけど、
それは全く知らないんだね。

948ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 13:21:55
静香女史は自分の細胞が盗まれたと石川さんに言った。
石川さんは動画で129/GFPESのある辺りを指差した。
これは別々の事であり得るからね。静香女史は盗まれたと言ったんだよ。そこは動かない。
それは細胞がどれを意味しているかに関係ない。静香氏は小保方さんが自分の
細胞を盗んだと言ってんだ。ここは重要で、それは私の置忘れと言ったのじゃない。
しかも、実際どれであれ、あれらが小保方さんのボックスにひとりでに移動する
訳はない。小保方さんが盗んだか、盗んだと思わせるために意図的に入れられたものだ。
これだけで既に大問題だね。小保方さんが犯人なら、今、誰も何も言わないのにどうして
そんなことを蒸し返してくるのだ。

949小野小町:2018/03/12(月) 13:23:28
和モガさんは明日が楽しみと言ってるのね。

950デラ・ストリート:2018/03/12(月) 13:28:57
擁護のコメントはどうなの。
>>
「Sの字が傾いてるのはオボの特徴。斜め巻きのラベルは嫁の特徴。」
この情報は2015/01/31に2chに書き込まれたものですが、日経サイエンスに129/GFP ESの写真が載っていたのを受けてのものでした。この情報を書いた人物は、石川智久氏に虚偽情報を与えて刑事告発をさせた人物の可能性が高いような気がしています。そして、この2ch情報も実はフェイクで、実際には例えば「Sの字が傾いてるのは嫁の特徴。斜め巻きのラベルは大田博士の特徴。」だったとしたら。

951シャーロック・ホームズ:2018/03/12(月) 13:31:02
2015/01/31に2chに書き込まれたということだけが事実で他は内容も含めて
根拠の示されていない主張や推測だね。

952ドクター・ワトソン:2018/03/12(月) 13:33:09
この人もアンチの人と同様に小保方さんが知らないといったことに関してもう一段の懐疑を示してないね。
>>
この2ch情報は、129/GFP ESの文字の特徴に小保方氏のクセが出ているとして、小保方氏が「知らない」と言い所有者不明とされた129/GFP ESは、実際には小保方氏が自分でラベルしておきながらそれを知らないと言って嘘をついていると指摘するものです。

953小野小町:2018/03/12(月) 13:35:07
<「知らない」>と<所有者不明>は同義でない可能性に関する考察が抜けているのね。

954在原業平:2018/03/12(月) 13:37:21
小保方さんは129/GFPESをFLSだと思っていて自分のものだと考えているけど
その中身がFES1であったことに関して問われて知らないと答えた可能性について
誰も確認してない。

955小野小町:2018/03/12(月) 13:41:06
ま、明日が楽しみ、ということで。んじゃ。
youtube.com/watch?v=jpC7NU3qyDc
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956イェイ:2018/04/04(水) 11:36:21
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