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ペーパー一枚の報告に向けて、その4

1地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/02(日) 04:45:36
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2在原業平:2018/09/02(日) 04:47:36
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

3小野小町:2018/09/02(日) 05:03:30
お気に入りは変化なしよ。DORAさんが辻本の悪事を糾弾されているわね。

4ヘーゲル:2018/09/02(日) 05:08:16
本題頼むぜ。

5カール・ヤスパース:2018/09/02(日) 05:09:01
本題、何でしたっけ?

6デラ・ストリート:2018/09/02(日) 05:10:58
<TRUSeq.のTs.Markerさんのブログのマップ>からね。

7ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 06:13:08
Ts.Markerさんのは表示に工夫が必要なんだよなあ。まずは公開データの整理を先にしたら?

8デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:14:59
Tru-Seq
①SSR1171556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
②SSR1171557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
③SSR1171558 若山  Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
④SSR1171559 若山  Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
⑤SSR1171560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SSR1171561 若山  Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SSR1171565 若山  FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SSR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑨SSR1171570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑩SSR1171571 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑪SSR1171572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑫SSR1171573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv

9デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:15:38
⑬SSR1171574 若山  Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑭SSR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑮SSR1171576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑯SSR1171577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑰SSR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑱SSR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑲SSR1171580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑳SSR1171581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
㉑SSR1171585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
㉒SSR1171586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
㉓SSR1171590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
㉔SSR1171591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

10デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:16:58
ChIP-Seq

①SSR1171553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
②SSR1171554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
③SSR1171555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
④SSR1171562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
⑤SSR1171563 若山  Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
⑥SSR1171564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
⑦SSR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑧SSR1171568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
⑨SSR1171569 若山  FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

11デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:17:43
⑩SSR1171582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
⑪SSR1171583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑫SSR1171584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑬SSR1171587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑭SSR1171588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑮SSR1171589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑯SSR1171592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
⑰SSR1171593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
⑱SSR1171594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

12デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:26:28
SMARTer-Seq

①SSR1171570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
②SSR1171571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
③SSR1171572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
④SSR1171573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑤SSR1171574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SSR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SSR1171576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑧SSR1171577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑨SSR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
⑩SSR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

13デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:28:20
念のためSSRはSRRと読み替えてね。直すの面倒で。

14ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 06:31:12
578,579がかぶってる。訂正だ。

15デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:32:10
Tru-Seq
①SSR1171556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
②SSR1171557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
③SSR1171558 若山  Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
④SSR1171559 若山  Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
⑤SSR1171560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SSR1171561 若山  Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SSR1171565 若山  FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SSR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑨SSR1171570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑩SSR1171571 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑪SSR1171572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑫SSR1171573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv

16デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:34:18
⑬SSR1171574 若山  Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑭SSR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑮SSR1171576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑯SSR1171577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑰SSR1171580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑱SSR1171581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑲SSR1171585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑳SSR1171586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
㉑SSR1171590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
㉒SSR1171591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

17ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 06:36:46
待て待て。まだかぶってる。もう一度やり直し。壁は広い。

18小野小町:2018/09/02(日) 06:40:00
SMARTer分を分けてなかったからね。

19デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:43:03
Tru-Seq
①SRR1171556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
②SRR1171557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
③SRR1171558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
④SRR1171559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
⑤SRR1171560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

20デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:45:57
⑨SRR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑩SRR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑪SRR1171580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑫SRR1171581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑬SRR1171585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑭SRR1171586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑮SRR1171590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
⑯SRR1171591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

21デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:48:18
ChIP-Seq
①SRR1171553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
②SRR1171554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
③SRR1171555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
④SRR1171562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
⑤SRR1171563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑧SRR1171568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
⑨SRR1171569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

22デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:49:55
⑩SRR1171582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
⑪SRR1171583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑫SRR1171584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑬SRR1171587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑭SRR1171588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑮SRR1171589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑯SRR1171592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
⑰SRR1171593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
⑱SRR1171594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

23デラ・ストリート:2018/09/02(日) 06:52:17
SMARTer-Seq
①SRR1171570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
②SRR1171571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
③SRR1171572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
④SRR1171573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑤SRR1171574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑧SRR1171577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑨SRR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
⑩SRR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

24ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 06:59:45
ヒヤッホー。SRRも直したぞう。桂チームはSMARTer-Seqは解析してないね。
Ts.Markerさんは574,578を解析している。ついでに578はBowtie2とTophat2kの
両方で確認しているね。

25一言居士:2018/09/02(日) 07:01:39
ここから整理と表示が難しいね。まずはSTAP細胞から行こうよ。公開データの
STAP細胞だけを集めてよ。

26ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 07:05:30
いや、まだだめだ。また578、579がのこっちゃってる。デラ頼むよ。

27区切りつけてやろう。:2018/09/02(日) 07:06:10
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28デラ・ストリート:2018/09/02(日) 07:07:37
Tru-Seq
①SRR1171556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
②SRR1171557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
③SRR1171558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
④SRR1171559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
⑤SRR1171560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

29デラ・ストリート:2018/09/02(日) 07:09:04
⑨SRR1171580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑩SRR1171581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑪SRR1171585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑫SRR1171586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑬SRR1171590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
⑭SRR1171591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

30デラ・ストリート:2018/09/02(日) 07:09:43
ChIP-Seq
①SRR1171553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
②SRR1171554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
③SRR1171555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
④SRR1171562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
⑤SRR1171563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑧SRR1171568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
⑨SRR1171569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

31デラ・ストリート:2018/09/02(日) 07:10:29
⑩SRR1171582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
⑪SRR1171583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑫SRR1171584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑬SRR1171587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑭SRR1171588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑮SRR1171589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑯SRR1171592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
⑰SRR1171593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
⑱SRR1171594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

32デラ・ストリート:2018/09/02(日) 07:11:07
SMARTer-Seq
①SRR1171570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
②SRR1171571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
③SRR1171572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
④SRR1171573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑤SRR1171574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑦SRR1171576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑧SRR1171577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
⑨SRR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
⑩SRR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

33ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 07:16:52
いいだろう。STAPだけ集めると以下だね。
>>
Tru-Seq
⑨SRR1171580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑩SRR1171581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ChIP-Seq
⑩SRR1171582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
⑪SRR1171583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
⑫SRR1171584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
SMARTer-Seq
⑨SRR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
⑩SRR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv


⑨SRR1171578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
⑩SRR1171579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

34ペリー・メイスン:2018/09/02(日) 07:18:03
下はダブりだ。削除ね。

35一言居士:2018/09/02(日) 07:29:00
理研はSMARTer-Seqの578,579は解析してない。
Ts.Markerさんの解析したのは580、581、583、578だ。

36閲覧者:2018/09/02(日) 07:36:20
Letter Figure 4-bにマーカー分類があるね。Ts.Markerさんは主に
Pluripotency marker genesとTrophoblast marker genesを調べている。
>>
Pluripotency marker genes
①Oct4
②Nanog
③Sox2
Trophoblast marker genes
①Cdx2
②Eomes
③Itga7

37一言居士:2018/09/02(日) 07:55:42
まずデータベースのSTAP細胞に関して桂調査は未調査のSMARTer-Seq分を除いて、
すべて「僕のマウス」背景であると言ってる。その言い方は
①マウスの背景は<129xB6-CAGヘテロ>なるF1であると述べている。
②その上でこれらは129B6F1 ES1であると述べている。
129B6F1 ES1はCAGホモであることが分かっているので、従って<129xB6-CAGヘテロ>なる
F1マウスのGFPはホモであると、持って回った論証をしている。GFPがヘテロか
ホモかは直接調べればわかることであるが、129B6F1 ES1の解析結果としてついでに
ホモだという叙述の仕方である。無論BCA報告で明らかなように、129B6F1 ES6は
遺伝子全解析されているが、1の方は全解析はされていない。そして結論も
<ほぼ同一である>とされ断定はされていない。
&nbsp;

38閲覧者:2018/09/02(日) 08:14:17
昨日までの検証でそういうことだったね。で、いよいよTs.Markerさんの検証だけど
Oct4 Nanog Sox2 Cdx2 Eomes Itga7の並びで〇×とム表示しよう。ムは未調査だ。
>>
580 × × × × × × RNASeq 僕のマウス
580 〇 △ △ × × × RNASeq 僕のマウス<強引に並べてみました分>
581 ム ム ム ム ム ム RNASeq 僕のマウス<お試しSox21分>
583 〇 〇 〇 〇 〇 〇 ChIPSeq 僕のマウス
578 〇 〇 〇 × × × SMARTer 背景不明

39一言居士:2018/09/02(日) 08:37:21
我々はヴィユワーの見方がよくわからないから間違っていたら指摘してもらうとして、
580に二つあるのはTs.Markerさんが二種類載せてて力点は例のSox21に置かれた分だ。
△は弱い発現に見えるもの。無論ど素人の判断だ。単純に見比べてるだけ。583は
Pluripotency marker genesとTrophoblast marker genesの両方が出でいる分だが、
これのinput分が584になる。そしてその584と129B6F1 ES1が同じだと言ってることになる。
>>
3.STAP細胞由来ChIP-Seq(input)サンプルはES細胞129B6F1 ES1とほぼ同一である。

40閲覧者:2018/09/02(日) 08:45:51
STAP細胞にはTrophoblast marker genesが発現しているけど、ここのTs.Markerさんの
分析はESもFI-SCも並んでいて、発現程度はESと変わらない。これは論文のLetterはFigure4-bに
出でいるものと全く同じ結果だ。で、それはともかくとして、<STAP細胞由来ChIP-Seq(input)
サンプルはES細胞129B6F1 ES1とほぼ同一である。>と言ってる以上、それを並べてみるべきだと
思うのだが、彼らは129B6F1 ES1と同じだと言うばかりで、データベースの
ES細胞を分析していない。これはどういうことか。

41一言居士:2018/09/02(日) 08:54:14
最初にこのデータベースのESは何時の時点でGRASに提出されたものかという問題がある。
桂報告はFI-SCとTSに関しては2013年1月と6月に提出され直しているということを言うばかりで、
他の細胞に関しては明言を避けている。で、常識的にはESは2012年の8月に提出されている分だと
しておいて、ではこのデータベースのESは当然であるが、若山さんが胎盤の比較のための
コントロールとして作ったと言われている「僕のマウス」ESの中のどれかということになる。
これを分析して584と比較すればいいはずなのに、それがなされて居ずに、ただデータ開示の無い
129B6F1 ES1というのみである。

42在原業平:2018/09/02(日) 08:58:57
まあ、そこまでは昨日検討した結果だね。で、TS.MarkerさんはESも調べているんだよね。
まずはデータベースのESを集めようか。

43デラ・ストリート:2018/09/02(日) 09:03:15
Tru-Seq
⑤SRR1171560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ChIP-Seq
④SRR1171562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
⑤SRR1171563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
SMARTer-Seq
⑤SRR1171574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
⑥SRR1171575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv

44一言居士:2018/09/02(日) 09:12:59
Ts.Markerさんの調べたのは560,563,574だね。563はChIP-Seqだから小保方さんが
Letter Figure4-bに使ったものだ。
>>
560 〇 〇 〇 × × × Tru-Seq 背景不明
563 〇 〇 〇 △ 〇 〇 ChIP-Seq 背景不明
574 〇 〇 〇 × × × SMARTer 背景不明

45閲覧者:2018/09/02(日) 09:18:53
桂報告はsTAP細胞の背景をすべて「僕のマウス」としているが、Ts.Markerさんの解析では
ChIPSeq分とRNASeq(Tru-Seq)分とは違う遺伝子発現パターンで、むしろRNASeq(Tru-Seq)と
SMARTer分が同じようにででいる。ESも同様の傾向が出ていて、STAP細胞が2種類あるのと
対応してES細胞にも2種類ありそうだね。

46在原業平:2018/09/02(日) 09:26:53
桂チームがデータベースのESの解析をしなかったのには裏が有りそうだね。
解析自体はTs.Marker さんは自分のパソコンでやってるからとても時間がかかるけど、
研究所は大容量のコンピューターだからね。すぐに出せるものだね。

47小野小町:2018/09/02(日) 09:28:45
結果はすべて持っているということね。都合の悪いものは隠してるわけね。

48在原業平:2018/09/02(日) 09:31:37
STAP細胞が2種類あるかも知れないこと以上に、ES細胞に2種類あるのは大問題だね。
そんな話は一度も出ていない。

49小野小町:2018/09/02(日) 09:50:59
ちと休憩ね。今日は昼から講演を聞きに行かないと。

youtube.com/watch?v=h7Z5gqmNOSg

50イェイ:2018/09/02(日) 09:51:53
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51名無しさん:2018/09/02(日) 19:49:43
786 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/02(日) 13:47:59.70 ID:S81kkLnp0
ティーブレークの主張はやっぱりおかしい。
小保方は「ハーバードで実験した分は出せない」と言っているだけで、理研で実験した分は調査に提出する義務があった。
本人も、4,5冊あるという実験ノートのうち手元にあったという2冊を提出している。
調査委員会は、8か月で4ページは少なすぎると言っているから、
当然8か月間なら8か月間の実験に見合うだけの記録があるはずという前提があった。

博論はハーバードで実験しているからそちらに帰属しているのはわかるけど、STAP研究は理研で実験しているからね。

それに小保方の重大な問題は、十分な内容の実験ノートがあるのに提出できないのではなく、実験記録そのものがほとんどなかったことにある。

52:2018/09/02(日) 20:00:21
ハヨ死ね。

53名無しさん:2018/09/02(日) 20:03:05
根本さんのところを追い出されているんだな。そのくせここでも別スレを立てて自分で
論じるだけの思考内容もない。

54名無しさん:2018/09/02(日) 21:10:03
791 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/02(日) 20:50:50.90 ID:e6hcwlfud
そりゃね。特許の関係等で対外的に公開したくないものはあるだろうさ。だけどハーバードとの共同研究だから理研の調査委員会にデータや実験ノートを出せないということはあり得ないのね。共同研究者同士にそれらを隠すなんてあり得ないから。
792 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/02(日) 20:55:47.96 ID:e6hcwlfud
また、理研で行った実験のデータや実験ノートは、研究費を理研が負担しているから理研の帰属だよ。そしてオボが問題なのは、本来職場のCPで管理されているべきのデータを私物のCPで管理していたことと、私物だからという理由でそれらのデータを提出そなかったことなのね。
793 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/02(日) 20:59:24.05 ID:e6hcwlfud
共同研究者あるいは共同研究機関同士でデータを共有しなかったら共同研究なんて成り立たないもの。

55自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/03(月) 04:13:19
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

56名無しさん:2018/09/03(月) 05:12:04
誰もお前みたいな馬鹿は相手にしない。早く死ねばいいんだ。間抜け。

57地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/03(月) 05:21:33
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👉 👊 👋 🙏 🙌 👏 👣 👅 💋 🐦 👻 ⛅ 💩 🌠 💚 💜 💙 💏 
💞 💓 💖 💕 🎼 🎻 🎷 🎺 🎹 🎥 🎶 🎵 🎧 🔊 📞 🔫 🚓 🍸 
☕ 🍰 🍶 🍻 📡 🔑 🌈 📖 🆖 ⏫ ⏬ ❎ 🆘 🅿 🆗 ⏪ 🔙 🔜 
💸 💐 🚨 📠 🏣 🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🎆 🍀 🏊
♨ 🎲 🎌 🎳 🎢 🌁 🌟 💢 📹 📺 📱 💻 📷 💊 ⏰ ⌛ 🗻 🗾 
🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

58在原業平:2018/09/03(月) 05:23:49
モーニン、小町ちゃん、コーヒーね。

59小野小町:2018/09/03(月) 05:27:43
お気に入りは変化なしよ。学さんのところで桃子と松崎の関係に関して私たちの書いたことが
話題に上がってるわ。

60在原業平:2018/09/03(月) 06:27:32
我々は推論しているんではないよ。桃子本に書かれていることが事実であった場合に
演繹できる論理的帰結を書いている。事実からの演繹結論だ。桃子の書いた事実の
結論として、ボックスの写真は松崎研究室から出ている、まだ小保方さんの聞き取りの
書き込まれていないサンプルリストも松崎解析チームのところから出ていると書いてるんだ。
224Pに自己点検委員会の報告原稿の違法流出の現場が書き込まれている。犯人は桃子が
写真を撮るのを許可した後、別の作業を始めている。喫茶店ではない。自分の普段
仕事をしている場所だ。原稿を持っている人々は限られている。いずれ逮捕させなければならないね。
これは刑事犯だからね。無論、小保方さんの実験ノート二冊分のコピーを流出させた
犯人も逮捕されなければならない。理研から出ていることは間違いないんでね。

61小野小町:2018/09/03(月) 06:34:56
194Pに笹井さんの記者会見の日にCDBの行く末について語った人は松崎ではないわね。
ただ、桃子を利用して流れをつくろうとしている人みたいね。
302Pの3誌投稿論文と査読文等を桃子に渡したのは若山さん、もしくは奥さんね。
小保方さん以外に日本で他に持っている人は居ないんわね。桃子はそれが
コンフィデンシャルドキュメントだと知らずに業界にばらまいて意見を求めているのよね。
慶応の吉村さんがネットに出回っているのを驚いたと称して、更にばらまいたわね。

62在原業平:2018/09/03(月) 06:38:22
我々は事件の真相解明が目的でここに落書きしている。いずれ、そこにも詳細な考察を
進めることになるけど、今はntES論の検討だからね。

63小野小町:2018/09/03(月) 06:44:07
Ts.Markerさんのブログのあの論文は読んでおくべきかしらねえ。

64在原業平:2018/09/03(月) 06:45:42
気にはしているんだけどね。手が回らない。
>>
tt
‏@ts_marker
8月23日
幹細胞との共培養も。

65小野小町:2018/09/03(月) 06:51:58
根本さんが小保方さんが提出できなかった情報に関してあたかも小保方さんの
責任であるかのような書き方を桂報告がしているのはミスりーディングだと
過去の自説を紹介して再度批判されているわね。

66在原業平:2018/09/03(月) 06:55:56
我々はあの件に関しては根本さんに完全に同意している。Ooboe さんたちには
共同研究協約書(2010年分、2011年分)の公開請求の重要性に気づいてもらいたいんだけどね。
全ての原因がこの二つの協約書の不備にある可能性を我々は疑っている。

67ヘーゲル:2018/09/03(月) 06:59:04
本題頼むぜ。

68カール・ヤスパース:2018/09/03(月) 07:00:51
本題、何でしたっけ?

69デラ・ストリート:2018/09/03(月) 07:07:42
>>
3.STAP細胞由来ChIP-Seq(input)サンプルはES細胞129B6F1 ES1とほぼ同一である。

まずはその根拠からだわね。

70ペリー・メイスン:2018/09/03(月) 07:13:52
Ts.Marker ブログの最初の問題意識に戻ったね。ここでは
STAP細胞由来ChIP-Seq(input)サンプル=STAP ChIP lysateは
ES細胞129B6F1 ES6と比較されている。1ではない。

71一言居士:2018/09/03(月) 07:45:07
後にTs.MarkerさんはSTAP ChIP lysate=AC129を確認している。最初は三者わずかに
違っていると指摘したが、そのうちのSTAP ChIP lysate=AC129はグラフの精度の
問題であったらしいね。ただし、STAP ChIP lysate≠129B6F1 ES6は桂報告自体が
認めていて、STAP ChIP lysate=129B6F1 ES1だということだ。それで両者の結論は
129B6F1 ES1=STAP ChIP lysate=AC129ということでブログの疑念は解消しているね。

72閲覧者:2018/09/03(月) 07:48:47
そうだね。STAP ChIP lysate=AC129はTs.Markerさんも認めたということね。ただし、
129B6F1 ES1=STAP ChIP lysateの根拠が不明だねと言う疑問は残されたままだ。
1は全解析されてない。恐らく6番染色体のSNPs分布解析結果なんだろうけど、その
分布解析データは示されていない。

73シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 07:52:21
㉙129B6F1 ES1の6番染色体のSNPs分布解析結果のグラフをつけて報告し直せ。

74ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 07:57:51
とりあえず、ここでは129B6F1 ES1=STAP ChIP lysate=AC129という仮定で行こう。
8月のGRAS提出時点では無論AC129は樹立されていないね。小保方さんに129/Svが
他されたのが8/6で培養開始が8/13とそれていて、樹立は以下と本文に書かれている。
恐らく若山さんの実験ノートだろうね。
>>
2012 年 9 月 4 日に STAP 幹細胞 AC129-1 および AC129-2 が樹 立された。

75ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 07:58:53
他された→渡された

76シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 08:04:28
順番からしてコンタミは
①129B6F1 ES1→STAP ChIP lysate
②129B6F1 ES1→AC129
ということになる。

①は小保方さんに129B6F1(アグーチ)が渡されなければならない。
②は小保方さんに129/Sv(白)が渡されなければならない。

77ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 08:11:33
①ではまず若山さんが129B6F1(アグーチ)を渡さない限りSTAP細胞は作れないね。
渡された後に小保方さんはコントロールES1を若山さんに返したことになる。
そして若山さんはそれを何の実験に使ったかを答えなければならないね。そして
小保方さんはそれをGRASに持ち込んで分析に出した。後の調査結果で、小保方さんは
129B6F1(アグーチ)の酸浴細胞を出さずに、若山さんに渡した129B6F1 ES1を
GRASに提出していたことになる。再現実験では光る細胞は作れているんだけどね。
それは出さずに若山さんに提出した129B6F1 ES1と同じものを出したと。

78シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 08:17:35
㉚8月のGRASへの提出時期の7日から14日前の間に129B6F1(アグーチ)もしくは
B6129F1(アグーチ)を渡して何か実験を行っていたか否かを調査して報告し直せ。
ラボのだれがどんな実験を行っていたのか、そして実際に小保方さんに
誰が何のサンプルを渡したのかを調べ直せ。

79小野小町:2018/09/03(月) 08:19:43
桂記者会見で小保方さんは当時たくさんのSTAP細胞を作らされていたと証言したことを
伊藤さんが記者の質問に答えてるわね。

80ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 08:22:32
②は小保方さんに129/Sv(白)が渡されたんだね。そこははっきりしている。
小保方さんは白をもらって、アグーチを返し、かつ、キメラも作られていると答えているんだよね。
若山さんはつくられていないと答えている。

81小野小町:2018/09/03(月) 08:25:19
どっちかが犯人なのよね。第三者なんてありえないわ。どれだけ証言が
対立しているというの。

82在原業平:2018/09/03(月) 08:33:32
まあまあ、小町ちゃん。慌てないで、我々は真実が判ればそれでいいんだ。
時間はたっぷりある。小保方さんが提出したとされている酸浴細胞は
STAP ChIP lysateだけじゃないんだよ。Tru-Seq分もSMARTer分もあるんだ。
しかも、TS.Markerさんの一部解析ですら既に、Chip-Seq≠(Tru-SeqS≒SMARTer)の
ようだよ。

83一言居士:2018/09/03(月) 08:37:57
AC129は最終的には若山さんしか持っていなかった129B6F1 ES1で捏造されている。
しかもFLS-Tも同じ捏造で、小保方さんはSTAP作成指導しかしていない。あとは自分で
全部やってできたのがFLS-Tだと後から自分で言ってるだけだね。

84閲覧者:2018/09/03(月) 08:39:59
底は若山さんのマッチポンプだと既に我々は推測をつけている。問題は
①の方だよ。どういう経緯であったか。
>>
77 :ドクター・ワトソン :2018/09/03(月) 08:11:33
①ではまず若山さんが129B6F1(アグーチ)を渡さない限りSTAP細胞は作れないね。
渡された後に小保方さんはコントロールES1を若山さんに返したことになる。
そして若山さんはそれを何の実験に使ったかを答えなければならないね。そして
小保方さんはそれをGRASに持ち込んで分析に出した。後の調査結果で、小保方さんは
129B6F1(アグーチ)の酸浴細胞を出さずに、若山さんに渡した129B6F1 ES1を
GRASに提出していたことになる。再現実験では光る細胞は作れているんだけどね。
それは出さずに若山さんに提出した129B6F1 ES1と同じものを出したと。

85一言居士:2018/09/03(月) 08:43:47
そうだな。その上に(Tru-SeqS≒SMARTer)分の酸浴細胞は何であるのか。桂報告は
全て「僕のマウス」と言ってる。ところが遺伝子発現パターンが異なっている。
しかも、桂調査は他の情報を開示していない。

86シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 08:45:35
何度も言わせんなよ。

㉚8月のGRASへの提出時期の7日から14日前の間に129B6F1(アグーチ)もしくは
B6129F1(アグーチ)を渡して何か実験を行っていたか否かを調査して報告し直せ。
ラボのだれがどんな実験を行っていたのか、そして実際に小保方さんに
誰が何のサンプルを渡したのかを調べ直せ。

87孤舟:2018/09/03(月) 08:47:27
阿久悠から電話だ。

88小野小町:2018/09/03(月) 08:50:39
あら、そう。

youtube.com/watch?v=9zM2IpWvor8

89釣れますように:2018/09/03(月) 08:52:02
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90イェイ:2018/09/03(月) 14:08:29
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91在原業平:2018/09/03(月) 14:15:45
さて、小保方さんが犯人であると思わせたがっている人々のよりどころの最後の
砦かな。

92小野小町:2018/09/03(月) 14:21:47
STAP細胞は小保方さんしか作れない。その小保方さんが自分で作ったSTAP細胞を
自分でGRASに提出し分析した結果を論文に書いて、加えてそのデータを公開データベース上に
アップした。それを後に検証した桂解析チームはそのSTAP細胞が129B6F1 ES1であると
証明し、従って、STAP細胞はES細胞であると断定した。犯人は分からないと。

93シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 14:35:22
㉛小保方さんが犯人ならそう書いて報告書を出し直せ。小保方さんが犯人だと
断定できないのなら、断定できない理由を述べて、小保方さんが犯人ではないのに
どうしてSTAP細胞がES細胞だと断定できるのかを論証し、かつ真犯人が誰かを書け。
犯人が分からないなら、STAP細胞はES細胞であるという断定も取り消せ。そして②を
忘れるなる
>>
②故意か過失かは故意に決まっているから前提を変えて提出し直せ。どこにあったか
誰も知らないFES1を解凍した奴は故意に解凍したに決まっている。どうして事故で解凍して、
かつそれを事故でインキュベーター内でコンタミできるのだ。

94小野小町:2018/09/03(月) 14:41:26
ES細胞でないから犯人が見つからないのよね。ntESだと思い当たれば犯人は
若山さんだとわかる。するとこのGRASの提出資料は小保方さんの準備したものだと
言いきれなくなるなるはずね。

95一言居士:2018/09/03(月) 14:46:50
STAP細胞は小保方さんしか作れない。
(これはいいでしょ)
その小保方さんが自分で作ったSTAP細胞を
(そうとは限らない、どこで入れ替えられたか分かってない)
自分でGRASに提出し分析した結果を論文に書いて、
(それもどういう経緯での提出か分かってない)
加えてそのデータを公開データベース上にアップした。
(事務員の手伝いが疑われている)
それを後に検証した桂解析チームはそのSTAP細胞が129B6F1 ES1であると証明し、
(証拠が示されていない)
従って、STAP細胞はES細胞であると断定した。
(論証できてない)
犯人は分からないと。
(実証出来てたら犯人は小保方さんと言えるのに言ってない)

96一言居士:2018/09/03(月) 14:48:31
よくぞまあこんな起訴状書けたものだ。

97閲覧者:2018/09/03(月) 14:49:51
まあ、起訴状にはなってないので報告書なのだな。馬鹿な報告書だとは言える。

98小野小町:2018/09/03(月) 14:51:47
私たちが起訴状に書き直しましょう。

99ペリー・メイスン:2018/09/03(月) 14:54:51
これって結構大変だよ。何しろ調査チームが何にも調べてないからね。事実関係で
知られていることがあまりに少ないね。調査やり直しというのは簡単だけどね。
この状態のまま探っていくのは大変だ。でも、所詮やるしかないんでしょ。

100シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 14:56:29
まずはこの8月のGRASへの調査依頼は誰の指示なのかな。

101ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:08:58
手記の記載を信じるならこれは若山さんの指示だ。でも仮に手記が無かったとしても
FI-SCは作られていて、かつ木星リストにある通り、14〜17にFI-SCのキメラ胎児と
胎盤があって、切片を作ったのは小保方さんでなく、若山研■■氏とされている。
FI-SCのストーリーを小保方さんが構想しているとは考えにくいよね。

102シャーロツク・ホームズ:2018/09/03(月) 15:10:13
このGRAS提出資料は何を知ろうとしたものなのかね。

103ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:17:55
各種の細胞の遺伝子発現解析だ。

104シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 15:19:02
どんな細胞の?

105ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:21:09
①CD45+細胞
②STAP細胞
③ES細胞
④STAP幹細胞
⑤FI幹細胞
⑥TS細胞

106シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 15:24:28
それはLetter Figure 4-bの各種細胞だね。でもこの2012年の8月にはレター論文は
書かれていないし、書かれる予定もないよね。笹井さんが入ってくるなんてことは
12月以降の話で、この時点では若山さんの指示による解析でしょ。若山さんは小保方さんを
山梨に連れて行きたかった。そしてそこで論文指導する予定だね。

107ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:32:05
手記によればそう読めるね。でも、そういう事情がどうであれ、8月時点で
6っつの細胞の解析は出ているんだ。6っつとも提出されているからね。ただ、
笹井さんが加わってからFI幹細胞は2度出し直されて、TSは最初若山さんのTSで
あったはずだけど、最終的には丹羽研で作製されたものに置き換えられた。つまり
8月の段階でのデータそのものでは何か論旨と矛盾するから提出し直して、
所謂チャンピオンデータ的なものを求めた訳でしょ。そういうのはあまり関心しないけど
ここではキメラが出来ていると信じこまれているからね。その上で論文を
通さなければならないという使命がある。キメラが出来てないのに論文を手伝うなんて
あり得ないことなんだからね。どうしても甘くなるよね。責められないと思うよ。
キメラを妙な方法で作って、それを黙っていた人の責任が一番重い。

108シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 15:34:51
まあ、そこは我々の論だからな。今はいいとして、このときには若山さんが指導して
そういう解析を出させているわけだよな。ここでSTAP細胞を提出しなさいと指示して、
マウスを渡さないということはあり得ないよな。

109ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:41:43
STAP細胞は作製に7日かかる。そして出来てから維持できるのも7日程度だ。
もし細胞が何もなかったらまずは若山さんがマウスを渡すことになる。

110シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 15:50:45
作りかけのものがたくさんあったら?

111小野小町:2018/09/03(月) 15:53:01
小保方さんは作り掛けがたくさんあったと言ってるわね。

112ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 15:55:29
その場合でもマウス背景は全部同じものでないといけないよ。同じマウス系統の
作り掛け、作り置きがたくさんあったということになる。それは若山さんの指示に
よって作られているSTAP細胞だから、若山さんはそれらがあるということを
知っていることになる。

113シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 15:58:03
どちらにせよ、解析に出すときは若山さんの許可が必要だね。小保方さんは
客員研究員だから勝手に理研の負担になる解析を自分の独断ではGRASに
依頼できないね。

114ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 16:02:30
勿論だ。依頼は若山さんが出さないといけない。どういう慣習になっいるかは分からないが
文書か、電話かで確認は知れないとGRASは動けないね。若山さんの印鑑のある文書を持って
依頼するんじゃないかな。手記では詳しい研究員が手伝ってくれたとあるが、無論、
親切心だけではないよね。正式な研究員が付き添ってると言うことだね。野老さんしか居ないと
思うけどね。まさか李じゃない。彼はこの頃シナで就職活動して決まったころじゃないかな。

115ドクター・ワトソン:2018/09/03(月) 16:03:51
知れない→入れないと

116小野小町:2018/09/03(月) 16:20:57
学生は客員研究員より権限が無いわね。そもそもお金のかかることはラボのボスの
許可が無いと一切できないのね。一般的に組織ってそういうものよね。この申請書に印鑑を
押したのは若山さんだけど、具体的に何をどう出したかは調査されてないから分からないわよね。
そもそも若山さんの指示でやってることだから、申請書には印鑑は当然押してやるわね。
何をどうだすかという細かいことは野老さんに任せるということはあり得るわね。
あるいは小保方さんに任せて野老さんは分からないことをアドヴァイスしているだけかも
しれないしね。

117在原業平:2018/09/03(月) 16:24:45
逆にすべて若山さんがやって準備しているものを小保方さんが申請者として名前を書いて
野老さんが提出してやって、小保方さんは結果を受け取りに行っただけということだってあり得る。

118シャーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 16:31:57
㉜8月と1月と6月のGRASへの若山研からの解析依頼書を公開しろ。17Pの証拠をつけろ。読者には自明でない。
>>
(評価) 小保方氏が様々なバックグラウンドの細胞を寄せ集めて RNA-seq 解析、ChIP-seq 解析 を行ったことは自明であり、論文の記載や公共データベースに登録時の記載と異なる系 統や GFP 挿入のあるマウスの使用や、本来比較対象とならないデータを並べて論文に使 用したことは不正の疑いを持たれて当然のことである。しかし、聞き取り調査などを通 じて小保方氏は「条件を揃える」という研究者としての基本原理を認識していなかった 可能性が極めて高く、意図的な捏造であったとまでは認定できないと思われる。一方、 FI 幹細胞データに関しては当初の解析結果が同氏の希望の分布をとらなかったこと、そ れにより同氏が追加解析を実施していること、当初解析結果と追加解析結果で使用した マウスの種類も含め結果が異なること、複数細胞種を混ぜた可能性が高いこと(故意か 過失かは不明)から不正の可能性が示されるが、どのようにサンプルを用意したかを含 め同氏本人の記憶しかないため、意図的な捏造との確証を持つには至らなかった。よっ て、捏造に当たる研究不正とは認められない。 なお、RNA-seq はライブラリ調製の前までを小保方氏が行った上で GRAS がシークエン スしており、GRAS 内に残されていたオリジナルデータの確認により、シークエンス後に 計算機上で混ぜられたものではないことが確認されているため、GRAS に持ち込まれた段 階で混入していたと考えるのが妥当である。

119:2018/09/03(月) 16:34:43
クズみたいな文章だな。頭蓋骨の中はマルコメ味噌がつまってんのかい。

120ふふふ:2018/09/03(月) 16:35:55
鉄、失礼なことを言うな。マルコメ味噌さんに謝れ。

121:2018/09/03(月) 16:37:43
マルコメ味噌さんごめんなさい。うちではいつも愛用してまっす。

122しゃーロック・ホームズ:2018/09/03(月) 16:42:29
㉝小保方さんの捏造だと書くか、小保方氏が様々なバックグラウンドの細胞を寄せ集めて RNA-seq 解析、ChIP-seq 解析 を行ったことは自明でないと
書き直すかどちらかにして提出し直せ。

123小野小町:2018/09/03(月) 16:44:05
しゃーロックさん、お疲れね。休憩よ。

124ふむ:2018/09/03(月) 16:44:38
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125自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/04(火) 05:07:23
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

126地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/04(火) 06:33:02
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127在原業平:2018/09/04(火) 06:34:07
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

128小野小町:2018/09/04(火) 06:36:11
お気に入りは変化なしよ。学さんが一般向けに広報されてるわね。

129在原業平:2018/09/04(火) 06:44:52
笹井さんは気の毒だったね。桂さんは亡くなった人のことを言いたくは無かったけれども
彼の落ち度もあるとして名前を上げさせてもらったなんて言ってるんだけど、笹井さんは
桂報告書程の間違いは犯していないよ。ただ、上司の覚えめでたくあって欲しいという
極自然の感情から他者の研究に関して代筆を引き受けたというところに、彼の個人的な
判断の間違いがあった。所長になれなくなるリスクを冒しても、そういうことはしない方が
いいのではないかと竹市さんに進言すべきだっただろうね。二つ目の彼の判断の過ちは、
レがGDであって、経営幹部と一心同体の関係にある以上、通らない論文を人の力を借りて
通して、特許研と一大発見ニュースで理研の特殊法人昇格に花を添えようとした、竹市さんの
判断の過ちの片棒を担いでいることだ。

130在原業平:2018/09/04(火) 06:47:14
レが→彼が
特許研→特許権
花→華

131小野小町:2018/09/04(火) 06:49:11
畢竟するに経営者としての判断の過ちに対する責任なのね。

132在原業平:2018/09/04(火) 07:06:08
結果責任なのさ。野依さん、竹市さん、CDBのGDたち。この事件の結果責任は
相応に負わねばならない。笹井さんの責任はその意味ては他の人達と同様に
有限責任なんだよ。竹市さんは理研を辞任まではしていないからね。当然
笹井さんの責任はもっと小さい。野依さんが全責任を引き受けて辞任したんだ。
彼が一時辞任に抵抗したのはそれが世間で経営責任の引責辞任ではないと受け止められて
いたからだ。捏造があったことの責任なんて取る必要はないと抵抗したんだ。

133小野小町:2018/09/04(火) 07:14:04
研究員が不正をしていたことの責任を理事長が取るのかという抵抗ね。でも
そうではなくて、社会を騒がせる結果になってしまったことの経営責任としての
辞任だということで呑んだのね。
笹井さんが記者会見で記者たちの質問に晒されているのも、その質問が彼の
経営責任を問うているのではなくて、どうして捏造を発見できなかったのかという
ことに向いているのでわかるわね。実験ノートを見なかったなんて、問題が
矮小化されているわよね。そもそも笹井さんはこんな捏造事件に関して責任なんかないわね。
会社の中で誰かが誰かの財布を盗んだら問題は警察に移されるので、窃盗が会社の中で
起きたことの責任を社長が取るなんてことはないわよね。実験ノートだって?

134在原業平:2018/09/04(火) 07:20:32
マスコミは内部からの情報流出に飛びついたのさ。これは売れるということだ。
内部情報を流出させているのは野依、竹市、笹井に対する非主流派だよ。その中心に
若山さんの実験の見込み違いがあったことに関係した自己保身のための行動がある。

135小野小町:2018/09/04(火) 07:29:58
笹井さんの経営責任が問われずに論文の瑕疵に気づかなかったという責任を問うている
彼の記者会見映像は、馬鹿なマスコミの思い込みを離れて、当代一流の細胞生物学者の
この論文に関する見立てだ思って聞くと、小保方細胞が何かということを科学者が
如何に客観的に見ていたかということが分かって、これから先のこのSTAP現象研究の
発展にも参考になりそうなのね。キメラを若山さんがntESでつくってエイプリル
フールして、小保方さんを山梨に連れて行きたかったんだなんてことが分からなかった
責任なんて、誰が取れるっての。

136在原業平:2018/09/04(火) 07:35:02
笹井さんのSTAP現象に関する見立ては何度も繰り返し見て確認して置いた方がいいいよ。
学さんがおっしゃっているように笹井さんはライブセル・イメージングに関して
確信を持っている。この現象は何物かではあるんだと。それって若山さんが
見たものと同じだよ。

137小野小町:2018/09/04(火) 07:38:50
そうね。笹井さんは2013年1月に笹井研で小保方さんがSTAP細胞の出来てくる過程を
ライブセルイメージング実験で初めて見たのね。笹井さんが記者会見で語っているのは
そのときの驚きだわよね。
若山さんが同じように驚いたのは2011年の10月以前の時点ね。
二人は同じものを見て同じように驚いた。

138在原業平:2018/09/04(火) 07:41:29
笹井さんは論文は仮説に戻ったと言った。
若山さんは2011年10月にキメラを作ってみた。そしてできなかった。
つまり彼もまた仮説に戻ったよね。

139小野小町:2018/09/04(火) 07:45:48
笹井さんや丹羽さんはキメラに関しては若山さんを信じているだけね。
若山さんは10月時点でキメラが出来なかったことを確認した。そこから先は
若山さんしか知らないことね。
記者会見で実験ノートを見なかったと騒いでいるマスコミのレベルって何なのかしら。

140在原業平:2018/09/04(火) 07:48:38
行く河の流れは絶えずして、しかも、もとの水にあらず。よどみに浮かぶ
うたかたは、かつ消え、かつ結びて、久しくとどまりたるためしなし。

人々は徐々に分かってくるのさ。マスコミはよどみに浮かぶうたかただよ。

141小野小町:2018/09/04(火) 07:49:54
うたかたも河の一部なのね。

142ヘーゲル:2018/09/04(火) 07:54:19
本題頼むぜ。

143カール・ヤスパース:2018/09/04(火) 07:56:21
本題、何でしたっけ?

144デラ・ストリート:2018/09/04(火) 07:57:14
光る胎盤という発見は誰のものなのか。

145小野小町:2018/09/04(火) 08:41:51
取り敢えずデータベースね。
>>
Tru-Seq
⑦SRR1171565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ChIP-Seq
⑦SRR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑧SRR1171568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
⑨SRR1171569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

146ペリー・メイスン:2018/09/04(火) 08:51:18
⑦⑧のGOFが大問題なんだよな。デラ、桂報告ストライドではどうなってたっけ?

147デラ・ストリート:2018/09/04(火) 09:00:08
>>
2.FI幹細胞のRNA-Seqデータは二種類の細胞種を持ったサンプルに由来する。

表は、
①2012年8月    129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFP
②2013年1月 129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFP
③2013年1月(最終) B6 Oct4-GFP+α

148ペリー・メイスン:2018/09/04(火) 09:02:29
表は、
①2012年8月 129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFP
②2013年1月 129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFP
③2013年1月(最終) B6 Oct4-GFP+α
だね。

149シャーロック・ホームズ:2018/09/04(火) 09:08:12
㉞1月に二回提出があるんだ。最終の分は6月の間違いでは無いのだな。
>>
第 1 回目の GRAS による RNA-seq データ解析結果が想定していたものと異なっていると の理由により、小保方氏らは、再度サンプルを2013年1月および6月にGRASに提供し (TS 細胞 1 種類(TS2)および FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3))、データの再シークエンスを 実施した。(16P)

150ドクター・ワトソン:2018/09/04(火) 09:13:04
ここは重大なところなんだがな。1月に二回あっての最終なのか、6月で最終なのか。
因みにTSに関して表は
①2012年8月 129B6F1 CAG-GFP
②2013年1月 -
③2013年1月(最終) CD1系統
となっている。

151小野小町:2018/09/04(火) 09:15:07
今論じているのはRNA-seq の話ね。ChIP-Seq分は関係ない。
>>
Tru-Seq
⑦SRR1171565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

152在原業平:2018/09/04(火) 09:19:37
その分が

③2013年1月(最終) B6 Oct4-GFP+α

だということね。これらは差し替え前はChIP-Seq分と同様に129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFPで
あったという経緯を示している。しかも二度目も129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFPを提出したが、
それでもだめで3度目にB6 Oct4-GFP+αを提出した。

153ドクター・ワトソン:2018/09/04(火) 09:21:16
このあたりは査読のリヴァイズ要請のあるところなんで、1月なのか6月なのかは
かなり重大な情報なんだがな。

154一言居士:2018/09/04(火) 09:23:23
このあたりは和モガさんでもOoboeさんでもいいんだけど、理研に6月の間違いなのか
それとも1月の最終ということでいいのか、問い合わせ願いたいよね。

155閲覧者:2018/09/04(火) 09:28:40
いろんな可能性のあるところだからね。ただ、8月にはGRASに提出されていた
FI-SCは129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFPであった。また、TSは若山さんの作った
「僕のマウス」TSであったことは明らかになってるね。そして1月の最終なのか
6月の最終なのかは分からないが、TSはどちらかで丹羽さんのCD1に差し替えられた。

156一言居士:2018/09/04(火) 09:32:25
そうだ。そしてFI幹細胞に関しては桂報告書本文の<FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3)>の
1,2,3をスライドの図と対応させると1月(最終)は6月(最終)の間違いだと判断可能だね。

157閲覧者:2018/09/04(火) 09:34:10
あるいは本文側が間違いの可能性も残るね。やはり確認が必要だ。

158しゃーロック・ホームズ:2018/09/04(火) 09:41:43
最終的にGOFベースになった理由はいろいろと考えられるが、系統樹の説明と
上手く整合しなかったからだよね。8月の解析では系統樹を作るなんて計画が
あったかどうか分からないね。若山さんは自分が指導するつもりなんだろうからね。
小保方さん、もしくは笹井さんがレター論文の解釈を書いたんで、それに合うものが
必要だった。無論、適当に混ぜ合わしてできるものとして、そんなことをしたら捏造だね。
彼らは一度同じような129B6F1 Acr-GFP/CAG-GFPをFI-SC2として再検査してもらって、
それでもだめだったから別のものを出した。それがGOFのFI-SCのFI-SC3だったと
考えるのが順序だろうね。

159ドクター・ワトソン:2018/09/04(火) 09:47:13
しかし、桂報告はあたかも、系統樹と整合しないからGOFのFI-SCを小保方さんが
作ったかのような説明だね。
>>
4.未登録RNA-Seqデータで用いられていた細胞株/マウス系統が論文とは異なり、
 これらを用いるとLetter Fig.2iの系統樹は再現できない

160一言居士:2018/09/04(火) 09:49:32
桂報告書の本文でも書かれているようにGOFのFI-SCを作った記憶はないという
容疑者の一人である若山さんの記憶を鵜呑みにしている。

161閲覧者:2018/09/04(火) 09:52:15
論文にはGOFマウスからFI-SCが作られたと書かれていて、若山さんはその論文を
2013年8月に責任著者を降りたいと言った時に見てるよね。自分で分からないと言ったんだから
読んでる。OCT4が光ってる写真を見てないのか。

162一言居士:2018/09/04(火) 09:53:52
そのときにはGOFでは作ってないよと言わなかったんだろう。言ってたら笹井さんが
放置するわけがない。何をいまさら調査が入ってから作ってないだよ。

163ドクター・ワトソン:2018/09/04(火) 09:59:43
小保方さんの捏造だとすると可能性として考えられるのは
①ライブセルイメージングで作ったGOFのSTAP細胞をFI-SCだと称して提出した。
②学生のGOFESをFI-SCだと称して提出した。
③CD1であるかどうかもはっきりしない言い方だが、仮にそうだとして丹羽さんのTSを少し混ぜた。

164名無しさん:2018/09/04(火) 10:05:09
GOFなら笹井研でもできる(ライブセル・イメージングでもGOF使用)し
彼女もFI-SCは自分でも作製してる(報告書P.14)から誰も疑問に思わなかったのでは?

165小野小町:2018/09/04(火) 10:15:45
Ts.Markerさんの解析結果よ。
>>
565 〇 〇 〇 × × × Tru-Seq GOF+CD1
568 △ △ 〇 〇 〇 〇 ChIP-Seq Acr-CAG 
567 △ △ △ △ △ △ ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね
568 〇 〇 〇 〇 〇 〇 ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね
569 △ △ △ △ △ △ ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね

166:2018/09/04(火) 10:17:08
>>164

別スレで書けと言ってるだろう。間抜け。つまみ食いするな。馬鹿が。

167小野小町:2018/09/04(火) 10:19:51
もう一度データベースね。
>>
Tru-Seq
⑦SRR1171565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
⑧SRR1171566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ChIP-Seq
⑦SRR1171567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
⑧SRR1171568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
⑨SRR1171569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

168小野小町:2018/09/04(火) 10:20:53
馬鹿が来たからもう一度遺伝子解析データね。
>>
565 〇 〇 〇 × × × Tru-Seq GOF+CD1
568 △ △ 〇 〇 〇 〇 ChIP-Seq Acr-CAG 
567 △ △ △ △ △ △ ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね
568 〇 〇 〇 〇 〇 〇 ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね
569 △ △ △ △ △ △ ChIP-Seq Acr-CAG やっぱりね

169小野小町:2018/09/04(火) 10:24:16
Oct4 Nanog Sox2 Cdx2 Eomes Itga7の並びね。前三つはPluripotency marker genes、
後ろ三つはTrophoblast marker genesで胎盤が光るかも知れないシグナルね。

170一言居士:2018/09/04(火) 10:31:26
二つの問題があってGOFとアクロシンだね。後者は「やっぱりね」で指摘されているように
胎盤貢献能力が示唆されているんだね。でもそれはアクロシン入りで、「僕のマウス」では
ないということ。前者は考えられる可能性がかなり多い。

171デラ・ストリート:2018/09/04(火) 10:35:41
マーカーというのは所詮マーカーだともいえるんで、胎盤は論文では本当に光っていて
マーカーの問題とは別ね。だけど、Ts.Marker さんたちはSox21も調べているわよね。
そちらはどうなっているの?

172孤舟:2018/09/04(火) 10:52:58
阿久悠から電話だ。

173小野小町:2018/09/04(火) 11:01:43
あら、STAPのSoc21は調べているんだけど、FI-SCのがどこかにあったわよね。
ま、いっかあ。んじゃ、休憩だわ。

youtube.com/watch?v=yvfAGJqSvUI
ヴァルヒャの使ってるのはアンマー・チェンバロと呼ばれるモダン・チェンバロね。
バッハの時代にはなかったものね。

174ふむ:2018/09/04(火) 11:02:25
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175自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/04(火) 22:12:24
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

176地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/05(水) 06:10:05
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177在原業平:2018/09/05(水) 06:15:05
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

178小野小町:2018/09/05(水) 06:45:39
お気に入りは学さんが昨日Ts.Markerツイッターの論文を紹介されてたのに
消されちゃってるわね。ちゃんと読んでおけばよかったわね。

179在原業平:2018/09/05(水) 06:47:52
学さんはときどきあれをやるからなあ。ざっとしか見てなかったんでがっかりだな。
まあ、いずれ自分で読むからいいや。今は無理だけどね。

180小野小町:2018/09/05(水) 06:59:20
ガンバレの西岡さんはHSPの紹介ね。STAP現象のメカニズムになにかこういうものに似た
蛋白質機能が関与しているかも知れないということね。
根本さんは若山さんの実験ノート開示問題ね。

181在原業平:2018/09/05(水) 07:04:51
小保方さんの実験ノートの一部は一つはテラトーマの疑義に答える形で
弁護士の手によって部分公表されている。若山さんも証言していることの裏付けとして
その程度は公表しないとバランスが取れないね。
もう一つはNHKに全コピーが流出していて、一部が放映されている。違法流出、違法放映、
しかも恣意的に使用している虚偽報道だ。

182小野小町:2018/09/05(水) 07:10:18
これって、本当は理研の責任なのよね。小保方さんに実験ノートを提出させて
おきながら、内容の守秘ができなかったことが明確で、しかも、みなし公務員が
調査書類である公文書をNHKに流出させた刑法罪を犯していることを分かっているのに、
放置している。犯人を捕まえないといけないわよね。

183ペリー・メイスン:2018/09/05(水) 07:13:48
それは桃子に流出させたいくつかの資料とともに、STAP事件の中でもっとも明確な
刑事犯罪を構成している行為だな。

184小野小町:2018/09/05(水) 07:20:15
犯人誰なのかしらね。

185:2018/09/05(水) 07:21:06
手を挙げて、横断歩道を渡りましょう。

186ふふふ:2018/09/05(水) 07:22:18
僕のマウスじゃない。

187歌舞伎町:2018/09/05(水) 07:24:00
ラブオンザビーチ

188ヘーゲル:2018/09/05(水) 07:27:53
本題頼むぜ。

189カール・ヤスパース:2018/09/05(水) 07:29:00
本題、何でしたっけ?

190デラ・ストリート:2018/09/05(水) 07:32:19
Trophoblast marker genes発現とは何か。

191小野小町:2018/09/05(水) 07:36:48
Trophoblast marker genesを発現する細胞は?

192ドクター・ワトソン:2018/09/05(水) 07:38:25
①自然発生胚
②クローン胚
③TS細胞

193ドクター・ワトソン:2018/09/05(水) 07:40:05
もとい。
①自然発生胚
②クローン胚
③iPS細胞
④TS細胞

194小野小町:2018/09/05(水) 07:41:07
Trophoblast marker genesを発現しない筈の細胞は?

195ドクター・ワトソン:2018/09/05(水) 07:42:25
①ES細胞
②ntES細胞

196小野小町:2018/09/05(水) 07:43:24
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現するはずとされている細胞は?

197ドクター・ワトソン:2018/09/05(水) 07:44:19
①STAP細胞
②FI幹細胞。

198小野小町:2018/09/05(水) 07:46:04
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現しないはずとされている細胞は?

199ドクター・ワトソン:2018/09/05(水) 07:46:37
①STAP幹細胞。

200一言居士:2018/09/05(水) 08:01:16
ふむ、Ts.Markerさんの結果と比較したいんだけど一覧性を確保する工夫が必要だね。

201デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:06:33
SRR1171556→556と表示するわよ。
Trophoblast marker genesの発現は〇×△よ。
未調査はムね。
それぞれ頭に表示するわよ。

202デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:11:55
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

203デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:20:38
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑬585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑭586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑮590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ム⑯591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

204デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:26:52
ChIP-Seq
ム①553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム②554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム③555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
△⑦567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑧568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
△⑨569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

205デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:34:15
ム⑩582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑬587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑮589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑯592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
〇⑰593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
ム⑱594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

206ペリー・メイスン:2018/09/05(水) 08:35:25
203はSMARTerが入ったね。やり直し。

207再度:2018/09/05(水) 08:36:11
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208デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:37:47
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

209デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:40:19
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ム⑭591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

210デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:40:55
ChIP-Seq
ム①553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム②554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム③555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
△⑦567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑧568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
△⑨569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

211デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:41:33
ム⑩582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑬587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑮589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑯592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
〇⑰593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
ム⑱594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

212デラ・ストリート:2018/09/05(水) 08:47:02
SMARTer-Seq
ム①570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム②571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム⑦576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑧577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

213よっしゃ!:2018/09/05(水) 08:47:42
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214小野小町:2018/09/05(水) 08:54:52
Trophoblast marker genesを発現する細胞は
①自然発生胚
②クローン胚
③iPS細胞
④TS細胞
Trophoblast marker genesを発現しない筈の細胞は
①ES細胞
②ntES細胞

215一言居士:2018/09/05(水) 09:03:34
Trophoblast marker genesを発現している細胞

Tru-Seq
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ChIP-Seq
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑰593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1

ChIP-Seqの563はおかしいね。

216閲覧者:2018/09/05(水) 09:08:07
Trophoblast marker genesを発現していない細胞

Tru-Seq
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
SMARTer-Seq
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv

これはおかしくないね。

217デラ・ストリート:2018/09/05(水) 09:10:16
RNA-Seqはむしろ理屈に整合的で、むしろChIP-Seqが変そうだわね。

218小野小町:2018/09/05(水) 09:12:12
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現するはずとされている細胞は
①STAP細胞
②FI幹細胞
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現しないはずとされている細胞は
①STAP幹細胞

219一言居士:2018/09/05(水) 09:16:38
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現している細胞は

Tru-Seq
無し
ChIP-Seq
△⑦567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑧568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
△⑨569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
SMARTer-Seq
無し

588はおかしいよね。変なのはChip-Seqだ。

220閲覧者:2018/09/05(水) 09:23:44
今回の論文でTrophoblast marker genesを発現していない細胞は

Tru-Seq
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ChIP-Seq
無し
SMARTer-Seq
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv


どっちが正しいのかな?

221在原業平:2018/09/05(水) 09:31:00
1月と6月の提出のし直しはどうやら最初のChIP-Seqの結果が妙だったので
出来る限り正しくしようと問題ないサンプルを笹井さんと丹羽さんが
入れ替えただけかも知れないね。そのときにTSまで入れ替えたというのは
相当に変だったんじゃないかな。それで<浅い解析>と丹羽さんが小保方さんに
言ったのかも知れない。手記ではChIPはいいがRNA解析はいけないと若山さんが
言ったと証言されている。

222孤舟:2018/09/05(水) 09:33:00
ちと所用。

223小野小町:2018/09/05(水) 09:38:06
私たちの〇×判断が間違ってるのかしらね。んじゃ、またね。

youtube.com/watch?v=mQR0DmyB3rk
イギリス組曲はハミングでないわね。はは。

224イエイ:2018/09/05(水) 09:38:53
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225クムリナ:2018/09/05(水) 16:01:24
>>178
>お気に入りは学さんが昨日Ts.Markerツイッターの論文を紹介されてたのに
消されちゃってるわね。ちゃんと読んでおけばよかったわね。

学さんのさんのブログのコメントの2018/9/4(火) 午前 11:04 [ hidetarou ] さん
が論文のリンクを貼ってくれています。

226名無しさん:2018/09/05(水) 23:45:30
誰かさんへ
発現量という定量性ではなく、何万回やっても動かないものをある一定の方向に動かす定性。
細かい手法や条件は後でなんとでも。

227名無しさん:2018/09/06(木) 00:14:26
アルイミオウジは相手にしなくて良いよ。

228自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/06(木) 03:37:14
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

229地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/06(木) 05:38:55
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230在原業平:2018/09/06(木) 05:40:27
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。ハミングしてるから。

231小野小町:2018/09/06(木) 05:46:31
あら、そうだった。お気に入りはDORAさんが韓国資本による太陽光発電の日本の法整備の不備をついて
金をせしめて山林破壊して、北チョンに資金送金している実態を指弾しているわね。
早く糞金殺せばいいのにねえ。あんな奴いつもでも遊ばせとかないで麻原の後を追わせればいいんだわ。
最近ロシア艦隊が太平洋に出たわね。

232在原業平:2018/09/06(木) 05:48:44
今日は8時から虎の門に安倍さんがスカイプ登場するらしいね。

233小野小町:2018/09/06(木) 05:49:42
学さんのところでいろいろと論じられているけど他は今日は静かだわ。

234在原業平:2018/09/06(木) 06:07:54
>>
ここに一つの例がある。アマゾンレビューへの投稿であるが、小保方氏がアニマルカルスと言ったのは、2011年のはずだが、「あの日」には2012年と書かれているから、小保方氏の嘘といったような解釈になるようだ。
これなど、小保方氏の記憶の単純ミスと考えるべきである。

2011年にはカルスと呼ばれていた。2012/3/23にアニマルカルスと名付けたと手記に書かれている。

235在原業平:2018/09/06(木) 06:12:08
>>
大和先生が、“専門家”という言葉を使っているが、この”専門”の使い方は、研究者と一般人では違う。
研究者レベルの専門家と、一般人がイメージする専門家にギャップがある。
さらに、大和先生の言葉「見たことさえない」の前には、状況からして、(ES)ではなく(幹細胞)という言葉がはいる。大和先生は、「STAP幹細胞を見たことさえないんだから・・・」と言ったと考える方が自然だ。

ティシュー論文にESのマーカー解析がスフィァに対するコントロールとして
使われている。ESのテラトーマも作られていて、足場付きのテラトーマライクと
比較されている。

236在原業平:2018/09/06(木) 06:15:49
>>
2014年4月の会見で「STAP細胞を作成していたころ、研究室内ではES細胞の培養は一切行っていなかった」と小保方氏が言ったのも嘘とあります。
論文を読めば、研究者たちが、ESとの比較を常にやっていたのはわかります。
つまり、ESが無いというのは嘘でしょう。
ここは、上司から小保方氏はそのように言うように言われていたと考えるべきです。
つまり、嘘をつかざるを得ない状況ですよ。

129B6CAG-GFP(ホモ)のESは無かったという意味で小保方さんも若山さんも言ってる。
我々はそもそも129B6CAG-GFP(ホモ)のSTAPはそのESが作られる以前には無いと言ってる。

237在原業平:2018/09/06(木) 06:29:27
>>
FLSのジャームライントランスミッションの実験で、小保方氏が「私は若山先生が光る精子を顕微授精する実験を行っていたことを思い出し」と言ったのも間違い(小保方嘘つき)と言っています。
若山氏は、ジャームライントランスミッションを早く知るために、精巣内の蛍光細胞(精子)をみていたのではないですかね?
顕微授精は、狭義では卵子に精子を人工的に入れ込む手技です。このレビューを書いた方は専門家から入手した知識だから正しいと主張されているようですが、専門家から狭義の意味での顕微授精の説明を受けたのではないでしょうか?
若山研究室では、この時点で狭義の顕微授精はしてないでしょうし、小保方氏は知っていると思いますよ。レビュアーの人より、小保方氏はずーっと専門家のはずでしょう?

光る精子を扱っていたということ自体が若山記者会見での彼の主張と合わない。
「僕のマウス」から太田ES1に行くためには彼が光る精子なんか扱っていては
誰も信じない。だから黙っていた。小保方さんはその嘘を暴露したんだ。

238在原業平:2018/09/06(木) 06:35:29
>>
『著書とは正反対で、夫は小保方晴子さんに「STAP細胞」の培養方法を教えようとしていた。妄想が爆発してしまっている感じがする。周囲とはフィクションなんだろうねと話している。』
と、若山夫人が文春に言ったそうです。

ここはとても重大な箇所で、彼らの間で行き違いがある。若山さんは小保方さんを
山梨にに連れて行きたい。つまり自分の研究に関心を持ってもらいたかったんだ。でも
彼女は自分の研究課題から離れようとしなかった。ここは二人の願望が食い違っている
ところで、それがこの事件の中核にあるんだよね。それは二人の関係史を追っていかないと
分からない。

239小野小町:2018/09/06(木) 06:40:06
アニマルカルスセル(ACC)というのは三誌論文とヴァカンティの米国特許仮申請時に
使われてる言葉ね。理研の特許でもこのACCが引き継がれているのね。

240在原業平:2018/09/06(木) 06:53:52
カルスという言葉がアニマルカルスより前からあることは以下で分かる。
①12/27テラトーマグラススライド記載
②その実験ノート記載
③桂報告
>>
小保方研のフリーザーに「カルスキメラ子 1」〜「カルスキメラ子 9」と書かれた 9 本の DNA 試料があり、2011〜2012 年の CDB 若山研では STAP 細胞を「カルス」と呼んで いたことから、これらはこのキメラの子の DNA と考えられた。
>>
(調査結果) RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。この間、マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことか ら、再度マッピングをやり直し、系統樹を作図した。当初の系統樹では、Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。 TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。
(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

241ヘーゲル:2018/09/06(木) 07:23:44
本題頼むぜ。

242カール・ヤスパース:2018/09/06(木) 07:24:31
本題、何でしたっけ?

243デラ・ストリート:2018/09/06(木) 07:25:25
学さんが気づかせてくれた桂報告書の26Pよ。

244ペリー・メイスン:2018/09/06(木) 07:40:07
①RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。
②この間、
③マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことか ら、
④再度マッピングをやり直し、
⑤系統樹を作図した。
⑥当初の系統樹では、
⑦Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。
⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。
⑨その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。
⑩TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。
⑪TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。

245ペリー・メイスン:2018/09/06(木) 07:40:50
⑫(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。
⑬また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。
⑭しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

246一言居士:2018/09/06(木) 07:46:06
はっきりとしたことから検討しようかな。
⑪で若山さんの作った129B6F1CAG-GF(ホモ)の細胞が<分化し たことが考えられた>から
丹羽研で作ったものと差し替えられたんだね。
我々は遺伝子発現解析の結果が変だったから差し替えられたのではと推測していたね。

247閲覧者:2018/09/06(木) 07:53:11
このコントロールTSは現在でも木星リストの中にあるよ。
20  129 B6 TS-3  1  若山TL樹立
21  129 B6 TS-4  1  若山TL樹立
22  129 B6 TS-5  1  若山TL樹立
23  129 B6 TS-6  1  若山TL樹立

全部解凍して調べ直したら分化したのか、そもそも違うものかがわかるよ。
マウス背景も調べ直した方がいいだろうね。丹羽さんはこのころ若山さんを
疑っていないからね。TSの遺伝子マーカー発現が無かったから分化してしまったと
考えたんじゃないかな。そもそも系統図は比較のためだけだからどんなTSでも
構わないからね。

248ドクター・ワトソン:2018/09/06(木) 07:55:36
TSがどの程度分化するとTS特異的マーカー発現が無くなるのかな。ど素人では
どうにもならんな。

249しゃーロック・ホームズ:2018/09/06(木) 07:59:56
<細胞培養時に分化し た>って、解凍後の分化だよね。作製培養中の若山さんの
樹立時の話じゃないよな。このTSからは若山さんの証言から2Nのキメラ胎児と
胎盤が作られていて、小保方さんに渡したと記者会見で証言している。

250ドクター・ワトソン:2018/09/06(木) 08:08:15
君はいつからしゃーロックになったんだい。
そのTSの組織サンプルブロックは木星リスト-30℃フリーザーの9番にある。
ACTSとTSのサンプルがたくさんあるね。それを調べてもいろんなことがわかりそうだね。

251小野小町:2018/09/06(木) 08:11:31
ACってアニマルカルスね。AC-TSと分解できるのならこれは後のCTSだわね。
でもAC129というのもあって、これって最初AC-TS129で無かったかという疑義も
あったわね。何しろローサの不可思議が付きまとってる。

252一言居士:2018/09/06(木) 09:32:59
まず、8月、1月、1月(最終)、6月の事実関係が分かってないからな。

253閲覧者:2018/09/06(木) 09:35:00
6月というのは桂報告書本文側の間違いではないかな。
>>
第 1 回目の GRAS による RNA-seq データ解析結果が想定していたものと異なっていると の理由により、小保方氏らは、再度サンプルを2013年1月および6月にGRASに提供し (TS 細胞 1 種類(TS2)および FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3))、データの再シークエンスを 実施した。(16P)

254小野小町:2018/09/06(木) 09:37:08
スライドの1月に二回という説明の方が整合的だと?
>>
⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。

255在原業平:2018/09/06(木) 09:42:11
<2013年3月の Nature再投稿に際して>というのは1月のことで、6月ではないね。
しかも丹羽さんのTSはスライドでは1月のことになっている。ここでも1月と
考えておかしくない。FI-SCもスライドでは1月で終わっていて、6月には何も
残らないことになる。

256小野小町:2018/09/06(木) 09:44:48
1月(最終)***スライド=6月***本文かということね。今のところ6月が間違いとしか
考えられないわね。もっとも日本語書けない人がこの報告書書いてるからねえ、はは。

257名無しさん:2018/09/06(木) 09:52:29
>再度サンプルを2013年1月および6月に

6月を1月に書き換えたら
「再度サンプルを2013年1月および1月に」

258在原業平:2018/09/06(木) 09:55:53
取り敢えずスライドではRNA-SeqとChIP-Seqは区分されているね。データベースの
RNA-Seqの中はTru-SeqとSMARter-Seqに分かれているが、桂報告はSMARTer-Seqを
全く分析していないよね。つまり、ここでRNA-Seqと言われているものはTru-Seqだね。

259:2018/09/06(木) 10:01:44
>>257

スライドは確認したか?
もし、スライド側が間違いだったら、1月(最終)が6月(最終)の間違いだということになる。
これは既に我々が以前考えたことだな。でも今26Pの記載を検討しているのだが、
この記載で6月にも提出したのが最終だと読めるか?
⑥〜⑪まで続けて読んでTSとFI-SC3が6月だと読める?

260デラ・ストリート:2018/09/06(木) 10:09:52
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

261名無しさん:2018/09/06(木) 10:10:14
*ttp://www.riken.jp/pr/topics/2014/20140327_1/
※6:調査報告書(全文)について、一部に記載の間違いがあったため修正しました。
16ページ 下から3行目:【誤】3月 【正】6月

262デラ・ストリート:2018/09/06(木) 10:10:30
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ム⑭591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

263:2018/09/06(木) 10:25:28
我々の使っているのは既に訂正済のものだ。でも、最初3月とされていて後に
6月とされた以上、8月、1月、6月は間違いないものだな。ということは、

⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。

と書いたときは3月頃と大雑把に考えていて3月と書いていたんだな。

264ふふふ:2018/09/06(木) 10:28:30
どうかな。
>>
第 1 回目の GRAS による RNA-seq データ解析結果が想定していたものと異なっていると の理由により、小保方氏らは、再度サンプルを2013年1月および6月にGRASに提供し (TS 細胞 1 種類(TS2)および FI 幹細胞 2 種類(FI-SC2、FI-SC3))、データの再シークエンスを 実施した。(16P)

<2013年1月および3月>と最初あったものを<2013年1月および6月>と訂正したということだ。1月は初めから分かっていた。
3月だと思っていたものを6月に変えた。

265:2018/09/06(木) 10:32:45
スライドは1月(最終)で、丹羽さんのTSとFI-SCの2,3が出尽くしているぞ。つまり
3月も6月もない。本文の3月を6月に訂正した時に、何を6月に訂正したらよかったんだ?

266ふふふ:2018/09/06(木) 10:35:57
3月(最終)とあったものを6月(最終)と訂正しないといけなかったのに1月(最終)と
間違って訂正した。もしくはそもそも3月(最終)と書かれていなければならなかったものを
最初に本文と違って1月(最終)と間違えていて、本文が6月に訂正されても気づかずに
放置されていた。

267小野小町:2018/09/06(木) 10:37:36
この人たちって仕事真面目にやってるの?

268名無しさん:2018/09/06(木) 10:38:11
>⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。

これは、
12)Letter Fig.2i 、Extended Data Fig.6dについて
・Letter Fig.2iは2012年にTruseqによるRNA-seqを行い、そのデータに基づいて作成した系統樹と考えられるが、論文の図では系統樹の一部が除かれている点
・Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、そのデータをもとに作成した系統樹と考えられるが、このとき解析結果を返された際にはCallus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試料が、Letter ではCD45+となっている点

3月云々は2つある疑義のうちの下の疑義に対応しているのでは?
「RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバーが担当した。この間、マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことから、再度マッピングをやり直し、系統樹を作図した。当初の系統樹では、Callus1とCallus2と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。2013年3月のNature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあった。その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料に書き込み、それに従って図の改訂を行った。」

269タカハシワケ:2018/09/06(木) 10:39:46
一般企業だと使い物にならんと言われるレベル。

270:2018/09/06(木) 10:51:32
ついでに、「僕のマウス」ESの疑義は解けたね。最初5/25とされていた。つまり
若山さんの持ち出しリストの5/25に逢わされていたが、恐らくだけど実験ノートに
培養開始日が書かれていたんだろうね。4/19と訂正された。これってカメラマ胎盤が
光った直後で、特許仮申請の4/24の5日前だ。

271ふふふ:2018/09/06(木) 10:55:06
逢わされて→合わされて だな。
若山さんの持ち出しリストは培養開始日と樹立凍結日が混在していて
信用できないものだということだな。

272デラ・ストリート:2018/09/06(木) 11:02:27
で、全文引用し直しね。
>>
12)Letter Fig.2i 、Extended Data Fig.6dについて 
Letter Fig.2iは2012年にTruseqによるRNA-seqを行い、そのデータに基づいて作成し た系統樹と考えられるが、論文の図では系統樹の一部が除かれている点  Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、その データをもとに作成した系統樹と考えられるが、このとき解析結果を返された際には Callus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試 料が、Letter ではCD45+となっている点
(調査結果) RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。この間、マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことか ら、再度マッピングをやり直し、系統樹を作図した。当初の系統樹では、Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。 TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。
(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

273デラ・ストリート:2018/09/06(木) 11:03:42
間に入られたからこちらもやり直し。
>>
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

274デラ・ストリート:2018/09/06(木) 11:04:14
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ム⑭591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

275ペリー・メイスン:2018/09/06(木) 11:10:30
イ.Letter Fig.2iは2012年にTruseqによるRNA-seqを行い、
ロ.そのデータに基づいて作成し た系統樹と考えられるが、
ハ.論文の図では系統樹の一部が除かれている点 
二. Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、
ホ.その データをもとに作成した系統樹と考えられるが、
ヘ.このとき解析結果を返された際には Callus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試 料が、Letter ではCD45+となっている点

276一言居士:2018/09/06(木) 11:13:04
よっしゃ。やり直しだね。

258: 在原業平 :2018/09/06(木) 09:55:53
取り敢えずスライドではRNA-SeqとChIP-Seqは区分されているね。データベースの
RNA-Seqの中はTru-SeqとSMARter-Seqに分かれているが、桂報告はSMARTer-Seqを
全く分析していないよね。つまり、ここでRNA-Seqと言われているものはTru-Seqだね。

277閲覧者:2018/09/06(木) 11:14:28
まず、

ロ.そのデータに基づいて作成し た系統樹と考えられるが、

の根拠が示されていないね。

278デラ・ストリート:2018/09/06(木) 11:16:14
考えなくていいから、小保方さんと丹羽さんに確認すればわかることだわ。
どうしてこんなに何もかも曖昧なのかしらね。

279シャーロック・ホームズ:2018/09/06(木) 11:21:16
彼らは
①小保方さんの12/11ヴァージョン原稿と若山さんの幹細胞に関するデータを持っている。
②8月に何が解析されたか知っている。
③1月に何が解析されたか知っている。
④6月に何が解析されたか知っている。
⑤レター論文を持っている。
⑥丹羽さんは理研の所員だったから聞ける。
⑦小保方さんの聞き取りは何度もやってる。

㉟<考えられるが>とは何だ。違う可能性があるのか。あるなら書いて提出し直せ。

280ドクター・ワトソン:2018/09/06(木) 11:23:11
デラさん、こいつらは怠惰なんだよ。いわゆるグズだ。

281一言居士:2018/09/06(木) 11:35:39
イ.Letter Fig.2iは2012年にTruseqによるRNA-seqを行い、


とある以上、8月にまず解析されて、樹状図化されていたものがあったと
いうことだね。12/11ヴァージョン論文は確認したんだね。そして幹細胞化の
原稿は完成はしてなかったけど、原稿はあって、笹井さんが一から完全に書き直したと
されているが、その原稿段階で樹状図があるのは確認しているんだよね。

282一言居士:2018/09/06(木) 11:37:06
㊱原稿段階で樹状図があったという証拠を示して、報告し直せ。

283一言居士:2018/09/06(木) 11:41:03
あ、シャーロック・ホームズさん、僕の名前で理研に要望しないでね。
まあ、それはいいとして、その後、1月にFI-SC2を提出したんだね。そして
6月(最終)としてTS2として丹羽研のCD1由来のTSを提出し、かつFI-SC2を提出した。

284閲覧者:2018/09/06(木) 11:47:38
2012.8
TS1(129B6 CAG-GFP)、FI-SC1(129B6 Acr-GFP/CAG-GFP)
2013.1
FI-SC2(129B6 Acr-GFP/CAG-GFP)
2013.6
TS2(CD1)、FI-SC3(B6 Oct4GFP + α)

285一言居士:2018/09/06(木) 12:05:07
これが最終的に樹状図となった。そしてTs.Markerさんの解析して、我々ど素人が
見て判断した分が以下だろ。
>>
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1

286閲覧者:2018/09/06(木) 12:09:00
⑦と⑨にTrophoblast marker genesの発現がないのによく樹状図が作れたね。

287一言居士:2018/09/06(木) 12:17:02
⑬は丹羽さんのTSだから当然Trophoblast marker genesの発現があって当たり前なんだけど、
これは2012.8のTS1(129B6 CAG-GFP)では無かったから差し替えられたのかな。
2012.1段階ではそのままネイチャーに出ているはずだね。何か査読で
言われたのかな。⑦はFI-SC3(B6 Oct4GFP + α)だね。一応論文にGOFでも
作られたと言われている細胞かも知れないが、Trophoblast marker genesの発現は
無いね。問題は⑨だね。背景が「僕のマウス」になってる。差し替えはTSとFI-SCだけなら
これは8月の分だ。

288小野小町:2018/09/06(木) 12:29:01
Callus1とCallus2の問題ね。ランチよ。

youtube.com/watch?v=yqRjwvAMgnA

289ふむ:2018/09/06(木) 12:29:33
😭 😃 😵 😒 😣 😝 😍 😆 😔 😳 😡 😱 👿 💀 👹 🐝 🌅 👰 
👩 👦 👧 🙍 🙋 🙅 👮 👪 👫 🙇 🙈 🙊 🐰 😸 🐜 💪 👍 👎 
👉 👊 👋 🙏 🙌 👏 👣 👅 💋 🐦 👻 ⛅ 💩 🌠 💚 💜 💙 💏 
💞 💓 💖 💕 🎼 🎻 🎷 🎺 🎹 🎥 🎶 🎵 🎧 🔊 📞 🔫 🚓 🍸 
☕ 🍰 🍶 🍻 📡 🔑 🌈 📖 🆖 ⏫ ⏬ ❎ 🆘 🅿 🆗 ⏪ 🔙 🔜 
💸 💐 🚨 📠 🏣 🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🎆 🍀 🏊
♨ 🎲 🎌 🎳 🎢 🌁 🌟 💢 📹 📺 📱 💻 📷 💊 ⏰ ⌛ 🗻 🗾 
🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

290自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/07(金) 01:25:09
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

291地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/07(金) 04:41:25
😭 😃 😵 😒 😣 😝 😍 😆 😔 😳 😡 😱 👿 💀 👹 🐝 🌅 👰 
👩 👦 👧 🙍 🙋 🙅 👮 👪 👫 🙇 🙈 🙊 🐰 😸 🐜 💪 👍 👎 
👉 👊 👋 🙏 🙌 👏 👣 👅 💋 🐦 👻 ⛅ 💩 🌠 💚 💜 💙 💏 
💞 💓 💖 💕 🎼 🎻 🎷 🎺 🎹 🎥 🎶 🎵 🎧 🔊 📞 🔫 🚓 🍸 
☕ 🍰 🍶 🍻 📡 🔑 🌈 📖 🆖 ⏫ ⏬ ❎ 🆘 🅿 🆗 ⏪ 🔙 🔜 
💸 💐 🚨 📠 🏣 🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🎆 🍀 🏊
♨ 🎲 🎌 🎳 🎢 🌁 🌟 💢 📹 📺 📱 💻 📷 💊 ⏰ ⌛ 🗻 🗾 
🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

292在原業平:2018/09/07(金) 04:43:37
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

293小野小町:2018/09/07(金) 04:49:59
虎の門はスカイプ登場ではなくて首相官邸で行われたのね。時代ね。
お気に入りはアルイミオウジ氏復活よ。ボランティアが忙しかっただけみたいね。
根本さんのところにMTAのやり取りの新しい資料が出てるわ。内容的には既知のものだわね。
学さんは相沢、丹羽論文の評価よ。

294在原業平:2018/09/07(金) 05:09:56
まだよくわからないけどOoboeさんたちはMTAを結んでいないということの意味を
どう受け止めてるのかな。根本さんの心配が杞憂であることを祈るけど。
太田さんがFES1等の6種の細胞をMTAなしで研究者個人の所有に属するものとして
理研から持ち出して京都大学に保持していたことは違法ではないよね。その細胞を
どこに送ろうと太田さんは理研の許可を要しない。MTAの必要がないと判断したのは
理研の側の判断だからね。前にも言ってるけど、あれだけ大きな組織で
移籍のあるたびに試料の持ち出しに関してマニュアルがないなんてことはないんで、
手続しないと持ち出せないようになってる。その手続きの中にはその判断をした理研の
押印文書があるはずだというのが、我々の推理だね。若山さんの持ち出した試料に関しては
MTAを結ばなかったのがイレギュラーだけど、イレギュラーを許可した書類もあるはずだと
考えている。ヴァカンティが守秘にうるさかったということがあって、MTAを結ぶと
その情報が山梨大学に漏れてしまうから、一時的にイレギュラー処理したとみてる。その証拠に
後にちゃんと事後処理されている。特許関連試料だからね。本来ならMTAが結ばれないと
いけなかったものだ。Ooboexさんたちはどうして結ばれなかったのですかと
理研に問えばいいんだけどね。小保方さんの手記はその意味では事情の分からない人の
思いに過ぎないんで、事実は確認したらわかるよ。

295小野小町:2018/09/07(金) 05:20:53
研究資料は基本的には研究者自身以外には価値のないものなのだという基本理解が
必要なのね。研究している人以外には何の意味があるのかわからないからよね。でも
資本主義下ではすべての財には所有権があって、例えば理研で研究に使われた財は
すべて理研の株主のものね。この場合株主は政府よね。その管理人が文科省ね。
で、研究者が移籍するときに今まで研究していた試料は全部置いていかないと
いけないのは一般企業で人が辞めた時と同じね。自分のもの以外は会社のものだわね。
そもそも会社の中に必要最小限の私物以外に置いていること自体が違法だわね。
保管スペースは只じゃない。株主の金で購入されているもので、従業員個人の
ために購入されているのではない。

296在原業平:2018/09/07(金) 05:30:12
①研究試料の所有権は法人に属す。
②基本的に研究試料は研究者個人にしか価値がない。

そして、研究においてはほとんど大半の試料はゴミに過ぎなくて、資産価値が
無い。STAP研究にいくら投資したかにかかわらず、例えばAC129サンプルが
一本百万円で売れるということはない。つまり市場価値がないから、商品という
棚卸資産を形成しないのさ。では何かというと費用だけ掛かったゴミだということだ。
研究というのはこのゴミの山を繰り返し作って、その中に一粒のダイヤモンドが
あったらなあという世界だ。

297小野小町:2018/09/07(金) 05:42:58
すべてのゴミの所有権は理研の側にあるけど、理研にとってはゴミなんだから
持ち帰りたいという人には只で上げるというのが、研究者個人の所有に属するものと
判断されたものね。太田さんのFES1等がそれね。そもそも論文に使う予定もなく
作ったと本人が言ってる。論文に使われていてその将来価値が見込まれるものに関しては
所有者側が、それは今はゴミではあるがいつかダイヤモンドになる可能性があるから、
こっちで保管していても永遠にダイヤモンドにならない以上、所有権だけは確保しておくけど
持ち出して使うのは君の自由だと契約するのがMTAなのね。その意味で、若山さんが
MTAも交わさずにSTAP関連試料を持ち出すなんて通常ではあり得ないのね。小保方さんは
自分の許可が無かったと手記で書いてるけど、それは小保方さんは3/1に理研の従業員に
なったばかりでそもそも彼女には何の権限もない。彼女のものは理研のものだわ。
理研のものは理研のものね。

298在原業平:2018/09/07(金) 05:48:36
そこにハーバードとの共同研究協約書との関係があるのさ。だからOoboeさんたちに
その取り寄せの重大さを分かってほしいんだけどね。それとMTAをなぜ結ばなかったのかということの
理由を理研に直接といただすことね。忘れてたとか、若山さんが勝手になんてことは
絶対にないんだからね。資本者ぎ社会というのは法治されているんだよ。忘れたりは
できないことになってる。勝手に持ち出すと窃盗になる。利用があって、必ず
竹市さんが許可している。

299在原業平:2018/09/07(金) 05:53:24
資本者ぎ社会→資本主義社会
利用があって、→理由があって、

300小野小町:2018/09/07(金) 05:55:09
事務方の責任者が若山さんに窃盗で訴えるぞと言ってると小保方さんに説明したと手記に
あるわね。

301在原業平:2018/09/07(金) 05:58:51
むつかしいことを研究者なんかに言ってもわからんと高をくくられてるのさ。
イレギュラー処理しているということを一研究者なんかに知らせる必要もない。
窃盗で訴えられていないでしょ。それ以前に許可もなく若山さんに持ち出させたなんて
ことがあったらこの責任者は首だよ。

302小野小町:2018/09/07(金) 06:00:50
大将だったかしらね。この登場人物も怪しそうな人ね。

303在原業平:2018/09/07(金) 06:03:33
ラブオンザビーチの違法天下りの一人じゃないのかな。文科省は無論捏造事件には
関与していないが、事件の影響であちこちに飛び火するのを恐れている。

304ヘーゲル:2018/09/07(金) 06:08:24
本題頼むぜ。

305カール・ヤスパース:2018/09/07(金) 06:09:07
本題、何でしたっけ?

306デラ・ストリート:2018/09/07(金) 06:12:18
①RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。
②この間、
③マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことか ら、
④再度マッピングをやり直し、
⑤系統樹を作図した。
⑥当初の系統樹では、
⑦Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。
⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。
⑨その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。
⑩TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。
⑪TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。

307デラ・ストリート:2018/09/07(金) 06:13:17
⑫(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。
⑬また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。
⑭しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

308デラ・ストリート:2018/09/07(金) 06:13:57
Callus1とCallus2 の問題からよ。

309一言居士:2018/09/07(金) 06:44:43
①RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。

GRASのメンバー は門田満隆さんだね。手記にも登場する。CDB機能ゲノミクスユニットは上田さんで有名だね。
ただこの時はもういなかったはずだね。
>>
物品購入要求
起案年月日 2011年1月14日
依頼要求元 計算生命科学センター設立準備室 合成生物学研究グループ
納入場所 所在地 神戸 建物 幹細胞研究開発棟
使用者 上田 泰己
件名 幹細胞研究開発棟2階交流スペース及び居室用什器
業者 2100417 (株) カッシーナ・イクスシー
合計金額 4,872,000

310閲覧者:2018/09/07(金) 06:46:14
2004年 - 東京大学大学院医学系研究科博士課程修了、博士(医学)
2004年 - 独立行政法人理化学研究所発生・再生科学総合研究センター 機能ゲノミクスサブユニット ユニットリーダー(兼任)
2009年 - 独立行政法人理化学研究所発生・再生科学総合研究センター システムバイオロジー研究プロジェクト プロジェクトリーダー
2011年 - 独立行政法人理化学研究所生命システム研究センター 細胞デザインコア コア長
2011年 - 独立行政法人理化学研究所生命システム研究センター 合成生物学研究グループ グループディレクター
2013年 - 東京大学大学院医学系研究科システムズ薬理学教室教授

311一言居士:2018/09/07(金) 06:48:17
機能ゲノミクスサブユニット は2013年に閉鎖されている。粕川さんが
所属していたことは知られているね。

312閲覧者:2018/09/07(金) 07:00:54
ここの所属だったのかなあ。いろいろと内部情報は語っていたけどね。はっきりしない。

系統樹を作成したのが彼らだと書かれているよね。どういう意味になるのかな。

313一言居士:2018/09/07(金) 07:03:16
<RNA-Seqの解析と系統樹の作成>と書かれているからね。こういうものが欲しいと言って
依頼したら彼らがああいう図を作ったということは、この時点で実際にそういうデータが
出ていたということだね。

314閲覧者:2018/09/07(金) 07:10:26
僕の間違いなんだろうね。
>>
286: 閲覧者 :2018/09/06(木) 12:09:00
⑦と⑨にTrophoblast marker genesの発現がないのによく樹状図が作れたね。

315一言居士:2018/09/07(金) 07:17:43
間違いの可能性としては二つあるよね。一つは最初から言ってるヴィユアーの
見方だね。我々はたくさん出てたらて〇、少ないときは△か×判断しているからね。
この見方そのものはペンディングされている。そもそも遺伝子発現解析自体の
有効性も我々はペンディングしているからね。今は遺伝子発現を細胞の同一性
判断に使っているだけだ。ただし、Trophoblast marker genesの発現に関しては
論文でも有効性が認められているようで、丹羽さんがこの表に関して大きな疑義は
だしてないよね。不完全とは言ってるけどね。それを信頼してるかな。
もう一つは、樹状図はTrophoblast marker genesの発現とは別に作られうるという
可能性の考え抜けだね。

316閲覧者:2018/09/07(金) 07:30:53
まあ、前者に関してはRNA-Seqは定量性に関して厳密には言えないんだよな。
増幅させるときに最初の量が必ずしも最終的な量に比例しているとは限らないんだね。
で、我々はTs.Markerさんのデータが何を意味しているのかが分からない。まず
出てる出てないの基準が分からないね。ということは何もわかってないということなんだけど、
例えばSox21が出てるというときにはたくさん出てるから、出てるというのはその程度に
あるということだという判断をしている。それがあの〇×だ。だから、基本的には
この細胞とあの細胞は違ってるという判断には使えるとみてるんだけどね。

317小野小町:2018/09/07(金) 07:33:20
そのあたりの出てる出てないの判断をTs.Markerさんに教えてほしいわね。

318シャーロック、ホームズ:2018/09/07(金) 07:35:41
系統図の方はどうなんだい。そもそもあの系統図は何を意味してるの。もしくは
何を意味していると皆に思わせたがってるの。

319ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 07:43:41
あの系統図のリジェンドは以下だよ。
>>
i, Cluster tree diagram from hierarchical clustering of global expression profiles. Red, approximately unbiased P values.

320小野小町:2018/09/07(金) 07:59:22
意味わかんない。

321一言居士:2018/09/07(金) 08:05:40
我々はど素人だからね。習ったこともないことは推測するよりないからな。
global expression profilesと書いてある以上、ベースにあるのはそれぞれの
細胞種の全RNA発現解析結果だね。例えばSTAP細胞だったらその細胞塊で
常時発現しているRNAを取り出して何が発現しているかを全部調べたということでしょ。

322閲覧者:2018/09/07(金) 08:08:21
まあ、ど素人としてはそう解するよりないね。そして各種の細胞塊で
同じことをやって、その後それぞれを分類したところまでは分かるんだけど、
そいつを階層分けした基準が分からんね。

323一言居士:2018/09/07(金) 08:10:53
素人としては縦軸に数値があるんだから、その数値によって階層をつけたと考えるよね。
0.00、0.05、0.10、0.15とリニアに刻まれている。

324デラ・ストリート:2018/09/07(金) 08:18:50
本文で2-iが参照されているのは以下ね。
>>
To investigate the relationship among STAP cells, STAP stem cells, Fgf4-induced stem cells, ES cells and trophoblast stem cells, we performed genome-wide RNA-sequencing analysis (Fig. 2i for dendrogram; Extended Data Figs 3 and 4 for expression analyses of representative genes ; Supplementary Tables 2 and 3 for analysis conditions).

325ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 08:23:36
genome-wide RNA-sequencing analysis というのがリジェンドのglobal expression profilesと
対応しているんだね。後ろにRed, approximately unbiased P values.とあるのは何かね。

326一言居士:2018/09/07(金) 08:26:32
赤字で書かれているのはauと100という文字だけだ。auはArbitary Unit 任意単位だ。
で、100の意味は不明。

327一言居士:2018/09/07(金) 08:27:49
0.00、0.05、0.10、0.15とリニアに刻まれているものはHightとされている。
何の高さなのかは不明。

328一言居士:2018/09/07(金) 08:30:21
P valuesというのは以下。
>>
P値は、仮説検定で用いられ、証明したい仮説の統計的優位性を測るものです。P値が小さければ小さいほど、証明したい仮説の統計的優位性が高いことを示しています。通常はこのP値が0.05より小さければ、証明したい仮説が正しいと結論付けることが多いです。

329閲覧者:2018/09/07(金) 08:32:50
approximately unbiased P valuesが100という意味も分からないね。縦軸がP値だとしても
意味が分からない。そもそも何にも分からない。

330小野小町:2018/09/07(金) 08:36:38
にもかかわらず

①RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。

のね。無論この図の意味は分かっているはずね。

331在原業平:2018/09/07(金) 08:40:46
一応専門の論文だからね。専門分野での常識的な知識の解説はないよね。わかる奴だけが
読めばいいものだ。で、通常は言語で書かれていることもあって、素人の間違った解釈でも
大筋で矛盾が出るということは少ない。わからないなりにでも何となく理解できると
いうのはそのあたりの事情だよね。でも、これってそもそも思想がわからない。
何を証明したがっているんだ。

332小野小町:2018/09/07(金) 08:44:24
図の印象から素人判断すると、ESとSTAP-SCは似た性質だと。そして階層の
一つ上がったFI-SCはその二つを同時に含むものだと。そして更に階層の上の
TSはそれ以下を包含すると。でもTSはESにはならないわね。その矛盾はさておいて
更にその上にSTAP細胞があってその上にCD45という体細胞があるという概念図ね。

333在原業平:2018/09/07(金) 09:09:37
それを作ったのが<CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー> だと。
作った人は素直に提出された細胞を解析して樹状図にしたということだね。
つまりデータのこのような並びには統計的な根拠があるのだということだね。
形はかなり違うがこの図は山中さんのiPS論文にもあるね。我々はレター論文の
図とリジェンドは理解できないが、作った人は理解できてるに決まっている。

334小野小町:2018/09/07(金) 09:10:41
樹状図を渡された小保方さんはそれを理解できたのかしら?

335在原業平:2018/09/07(金) 09:13:03
試料を提出したのは小保方さんで手伝ったのは野老さんだ。そしてこういう分析をしろと
指示しているのは若山さんだ。で、小保方さんが貰った系統図をどう理解したかは不明だ。
そもそもこの系統図がいつ作られたかまだ明確でない。

336小野小町:2018/09/07(金) 09:13:45
え?8月じゃないの?

337デラ・ストリート:2018/09/07(金) 09:16:18
今、それを調べている最中だわ。
>>
①RNA-Seqの解析と系統樹の作成は、CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー が担当した。
②この間、
③マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあったことか ら、
④再度マッピングをやり直し、
⑤系統樹を作図した。
⑥当初の系統樹では、
⑦Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。
⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。

338ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 09:24:01
<②この間、>ってどの間か曖昧で分からないね。素直に読めば<担当し>ている間に
<マウスのリファレンスゲノムのバージョンアップがあった>と読めるけど、
<④再度マッピングをやり直し、>ということはマッピングまではしてなかったから
<④再度マッピングをやり直し、⑤系統樹を作図した。>ということになるんだけど、
それならこれらの説明は全部不要だね。わざわざ経緯を書いたということは
8月には系統図は作られていないかもしれないんだね。そして<バージョンアップ>を
機に系統図も作ったとも読める。ここもわざとこういう風に間抜けな文章にしている
くさいところなんだね。日本人かと言いたくなるような間抜けさだね。

339シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 09:27:04
で、<⑥当初の系統樹では、>という当初がいつなのだということになるね。8月の解析時なのか、
バージョンアップ後なのか、笹井さんが入ってからかと。

340ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 09:29:38
>>
⑥当初の系統樹では、
⑦Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。

Letter Figure 2-iは最終形だけど、その中のCD45は<当初>無かったと。

341デラ・ストリート:2018/09/07(金) 09:30:45
⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の要請が小保方氏よりあっ た。

342デラ・ストリート:2018/09/07(金) 09:32:16
後も続けるわよ。
>>
⑨その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。
⑩TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。
⑪TSについては細胞培養時に分化し たことが考えられたことから、丹羽研のメンバーが培養・サンプル調製を行ったものを 追加して作図に用いた。
⑫(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。
⑬また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。
⑭しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

3436kkbja:2018/09/07(金) 09:36:22
<⑧2013年3月の Nature再投稿に際して、図のスタイル変更とサンプル名付加の
要請が小保方氏よりあっ た。>というのは1月のことね。そして、以下のことを行った。
>>
⑨その際、小保方氏はCallus1とCallus2がそれぞれSTAP細胞とCD45+細胞であると資料 に書き込み、それに従って図の改訂を行った。
⑩TSおよびFI幹細胞のデータについてはそれぞれ複数のサンプルを準備してシークエン スを行ったが、予想外にデータのばらつきが認められた。これについて、小保方氏の説 明によれば、FI幹細胞については3サンプルのうちの系統樹上で3サンプルの中間に位置 するものを最終的に作図に用いたとのことであった。

344小野小町:2018/09/07(金) 09:40:19
上は私よ。
⑨によって最初の系統図ではCallus1とCallus2と表示されていたのね。でも
小保方さんは今回は細胞名を伏せずに、それぞれを<STAP細胞とCD45+細胞>と
<資料>に書きこんだうえで、図の改定を行ったのね。改定ってなんの改定なのかしらね。

345在原業平:2018/09/07(金) 09:45:12
12/11ヴァージョンにあった樹状図をレター論文の今ある樹状図に改定したということだ。
そして⑩に書かれているTSとFI-SCのサンプルの解析のやり直しをしたということだね。
三つの中間をとった。そして⑪にあるように分化を理由にTSを丹羽さんのに変えた。ここまで
6月までに行われたことだ。

346デラ・ストリート:2018/09/07(金) 09:51:27
問題とされていたのは以下ね。
>>
イ.Letter Fig.2iは2012年にTruseqによるRNA-seqを行い、
ロ.そのデータに基づいて作成し た系統樹と考えられるが、
ハ.論文の図では系統樹の一部が除かれている点 
二. Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、
ホ.その データをもとに作成した系統樹と考えられるが、
ヘ.このとき解析結果を返された際には Callus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試 料が、Letter ではCD45+となっている点

347^[l\?/ery:2018/09/07(金) 09:56:57
ハ.論文の図では系統樹の一部が除かれている点

348ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 10:04:37
<ハ.論文の図では系統樹の一部が除かれている点 >に関しては何を指しているのか
分かりにくいね。データベースに出ているものはLetter Fig.2iとLetter Extended Data Fig.6dに
分かれて掲載されている。何から除かれているかというと、<当初>の系統図ということになるんだろうな。
桂調査は<CDB機能ゲノミクスユニットおよびGRASのメンバー>も疑っているみたいだね。でもその原因が
Callus1とCallus2の表示にあって、小保方さんがそのように実際の実態を隠すような資料提出をしているのは
共同研究の相手である理研に対してけしからんと怒ってるんだけど、理由は分かったということね。
>>
⑫(評価) CDB 若山研における Callus という言葉の使用は、のちに STAP 細胞と呼ばれるものを示 していた。CD45+細胞は Callus/STAP 誘導に用いる細胞であり、CD45+細胞サンプルに Callus という名称をつけサポートユニットへ解析依頼するという行為は、混乱を招く可 能性が大きいものであった。CDB 若山研では異なるサンプルに区別困難な類似名称を付与 することが散見されたが、そのような慣習も遠因となった可能性がある。
⑬また系統樹を GRAS スタッフに依頼する過程で、解析結果を受けとめ討論することなく、単に論文に図 を含めるための改訂依頼、という印象を与える対応は、共同研究として十分なものでは なかった。
⑭しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

349小野小町:2018/09/07(金) 10:10:42
小保方さんがCD45+と酸浴細胞をCallus1とCallus2と言って提出した理由は
まだ酸浴実験に関して研究室内の秘密だからじゃないのかな。だって、データベース上は
今ではSTAPだとかSTAP-SCだとかFI-SCだなんて書かれてるけど8月時点では
そんな言葉はないから別の言葉で書かれているはずよね。Callus3,4なんてあってもおかしくない。

350在原業平:2018/09/07(金) 10:13:17
ふん、

⑭しかし、調査により得られた証拠に基づき認定する限り、研究不正とは認め られない。

何もなかったのかい。

351デラ・ストリート:2018/09/07(金) 10:16:01
桂報告書スライドの方は以下のように述べられているわ。
>>
4.未登録RNA-Seqデータで用いられていた細胞株/マウス系統が論文とは異なり、
 これらを用いるとLetter Fig.2iの系統樹は再現できない

352ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 10:18:43
その問題は最後に回すぜ。
>>
二. Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、
ホ.その データをもとに作成した系統樹と考えられるが、
ヘ.このとき解析結果を返された際には Callus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試 料が、Letter ではCD45+となっている点

353デラ・ストリート:2018/09/07(金) 11:02:42
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

SMARTer-Seq
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

354小野小町:2018/09/07(金) 11:08:14
SMARTer-Seq
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv

この分が提出時には<Callus1>となっていたということを言ってるんだけど、所詮
当時STAPという言葉はないのと、できるだけ情報は他部署に隠蔽しておきたいというのは、
別に小保方さんの意図である以上に、若山さんの意図であったかもしれないわよね。

355在原業平:2018/09/07(金) 11:15:06
⑦Callus1とCallus2 と小保方氏が呼んでいたサンプルを含むが、CD45+サンプルはなかった。

これは後にFI-SCの話が続くので、Tru-Seqのことを言ってる。
>>
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

356小野小町:2018/09/07(金) 11:17:28
そうね。Letter Fig.2iの話ね。これはのちの理研の解析でどちらも「僕のマウス」由来だと
分かっているわね。

357在原業平:2018/09/07(金) 11:19:56
二. Letter Extended Data Fig.6dは、2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、
ホ.その データをもとに作成した系統樹と考えられるが、
ヘ.このとき解析結果を返された際には Callus1(当時のCDB若山研の命名法ではSTAP細胞1という意味)と名付けられていた試 料が、Letter ではCD45+となっている点

こちらは無論SMARTer-Seqの分だ。
>>
SMARTer-Seq
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

358小野小町:2018/09/07(金) 11:24:04
そうね。無論、Letter Extended Data Fig.6dの分で、この図にはFI-SCもTSもないわね。
しかも桂調査はこれらの分のマウス背景を調べていない。
<2012年にSMARTERキットによるRNA-seqを行い、>とあるけど、8月の解析なのかしら。
どうしてこれだけ別の解析を行ったの?

359ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 11:25:43
それはLetter Extended Data Fig.6dのリジェンドに説明がある。
>>
d, Cluster tree diagram from hierarchical clustering of global expression profiles. Red, AU P values. As this analysis included morula and blastocyst embryos from which only small amounts of RNA could be obtained, we used pre-amplification with the SMARTer Ultra Low RNA kit for Illumina Sequencing (Clontech Laboratories).

360デラ・ストリート:2018/09/07(金) 11:30:21
morula と blastocyst embryosの解析があったからRNA量が少ないからSMARTerでやったのね。
>>
SMARTer-Seq
ム①570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム②571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム⑦576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑧577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

361ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 11:34:47
Tru-SeqのCD45+とSTAP細胞はSMARTer-Seqと同じ試料の可能性が高いね。
>>
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
SMARTer-Seq
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

362シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 11:37:37
もう一度Tru-Seqの全体をみたいね。

363デラ・ストリート:2018/09/07(金) 11:38:10
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

364デラ・ストリート:2018/09/07(金) 11:38:50
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑬590 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep1 CD1
ム⑭591 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:RNASeq.Rep2 CD1

365シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 11:44:58
背景を調べられていないのは以下だね。
SMARTer-Seq
ム①570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム②571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム⑦576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑧577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
Tru-Seq
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv

366ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 11:48:51
SMARTer-Seqの⑤⑥のESとTru-Seqの⑤⑥のESは同じもので若山さんのコントロールESでないとおかしいよね。
「僕のマウス」ESだ。なんで調べてないのかなあ。

367シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 11:55:27
基本、8月の提出細胞は全部「僕のマウス」背景くさいんだけど、そう言い切れないのが
Tru-SeqのEpi Stem Cellsだ。これは129/Svと書かれて提出されている。AC129という
STAP幹細胞とされているものを作った時についでに作られたEpi Stem Cellsだ。

368小野小町:2018/09/07(金) 11:56:37
Epi Stem Cellsって何なの?

369在原業平:2018/09/07(金) 11:59:29
エピブラスト幹細胞(えぴぶらすとかんさいぼう、エピ幹細胞、
epiblast stem cell、epi-stem cell、EpiSC)は、マウス胚のエピブラスト
(英語版)を単離培養して樹立される幹細胞。マウスES細胞よりも
ヒトES細胞に近い性質を持つ。幹細胞研究の新たなツールとして期待され、
様々な研究が行われている。

370在原業平:2018/09/07(金) 12:00:43
ES細胞とエピブラスト幹細胞を比較すると、
三胚葉分化能がある
免疫不全マウスに移植すると奇形腫(テラトーマ)を作る
という共通点がある。しかし、エピブラスト幹細胞は
通常はキメラ形成がない
ジャームライン・トランスミッションがない
LIFに反応しない
X染色体不活性化
主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラス1陽性
ES細胞より分化が進んでおり、培養や遺伝子操作が難しい
という特徴を持ち、その性質はナイーブ型のマウスES細胞よりもプライム型のヒトES細胞に近い

371小野小町:2018/09/07(金) 12:02:01
若山さんはどうしてそんなもの作ってるの?

372デラ・ストリート:2018/09/07(金) 12:03:35
しかも129/Svでねえ。

373ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 12:09:15
FI-SCは最終的にはGOFの分に落ち着いたということだね。STAP-SCは無論FLSだね。

×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1

×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

374シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 12:11:24
FI-SCは8月に129xB6-Acr-CAGであり、1月も129xB6-Acr-CAGで、6月にGOF+CD1になった。

375小野小町:2018/09/07(金) 12:12:58
そうね。最初と二番目に小保方さんが提出したFI-SCはCTSということね。

376一言居士:2018/09/07(金) 12:14:41
我々はFLSもCTSも最初の実験のntES由来と考えている。

377小野小町:2018/09/07(金) 12:21:07
RNA-SeqはすべてTrophoblast marker genesの発現はないのね。TS以外。
ランチ!

youtube.com/watch?v=lXWJQnmKar0

378ふむ:2018/09/07(金) 12:21:58
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379イェイ:2018/09/07(金) 13:57:54
😭 😃 😵 😒 😣 😝 😍 😆 😔 😳 😡 😱 👿 💀 👹 🐝 🌅 👰 
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380在原業平:2018/09/07(金) 14:00:42
小町ちゃん、食後のコーヒーね。

381小野小町:2018/09/07(金) 14:04:46
ChIP-Seqの提出月は書かれていないのね。どうしてこんなに曖昧なのかしらね。
頭が悪いのよね。もやーとした頭なのよね。ひひ。

382在原業平:2018/09/07(金) 14:06:45
ストレスの溜まるときは音楽を聴くか、人の悪口を言うに限る。

383一言居士:2018/09/07(金) 14:09:17
この問題は恐らく最後の問題でしかも難解極まりなさそうだ。もっともっと
悪口を言いたまえ。

384小野小町:2018/09/07(金) 14:12:34
馬鹿、河馬、チンドン屋、お前のカアちゃん出ぇぇぇぇぇぇぇ臍っ、と。

385シャーロック、ホームズ:2018/09/07(金) 14:15:04
さは言うものの、ChIP-Seqは8月提出だろうな。別に1月と6月に何かあったとは
触れられていないからな。

386ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 14:17:45
何度でも見ようぜ。ホームズ。
>>
ChIP-Seq
ム①553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム②554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム③555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv
△⑦567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑧568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
△⑨569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

387ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 14:18:48
ム⑩582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑬587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑮589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑯592 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 CD1
〇⑰593 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 CD1
ム⑱594 丹羽研 Trophoblast Stem Cells:ChIPSeq.input  CD1

388小野小町:2018/09/07(金) 15:12:47
手記126-128Pの記載とリトラクション理由の両方と考え合わせる必要がありそうね。
それと129xB6-CAGヘテロが「僕のマウス」である限り、これは8月当初のものということね。
小保方さんは変わりを持たない。

389デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:14:49
リトラクションは以下ね。
>>
(4) In Fig. 4b of the Letter, STAP cell and ES cell are wrongly labelled in a reverse manner.

それが分かるということは若山さんが8月の結果を持っているということね。

390ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 15:24:28
若山さんは画像に関して言ってるんだけど、見てわかることは、そのままだと
STAP細胞とSTAP幹細胞がとても似ているんだけどSTAPがESなのだとしたら、ESと
STAP細胞が似ていることになる。
ただ、Ts.Marker氏の確認解析ではESもSTAPもSTAP-SCも三つともTrophoblast marker genesの
発現があるという妙な結果になっていて、これは我々ど素人の見方とは関係なさそうだ。
というのも無いというのはどの程度か素人は分からないが、ある方ははっきりしていして判断力を
要しない。

391デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:27:40
でも、In Fig. 4b のグラフでは出ていないのよね。

392小野小町:2018/09/07(金) 15:37:30
127Pで若山研のサンプルと笹井研の時のサンプルが混在したと言ってるのは
RNA-Seqのことだわね。でもChIP-Seq分も少なくとも丹羽さんのTSは後の
笹井研のものに差し替えられているわね。

393在原業平:2018/09/07(金) 15:41:53
①TSは全部丹羽研でCD1だとわかっている。
②FI-SCは若山さんしか作れないから若山研でのものだ。
③のちの解析で129xB6-CAGヘテロとされたものは後には作れないから若山研でのものだ。

これらを取り除くとリストには何が残るのかな。

394デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:44:54
ふむ、機械的にやるわよ。
>>
Tru-Seq
×③558 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep1 129/Sv
ム④559 若山 Epi Stem Cells:RNASeq.Rep2 129/Sv
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑪585 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑫586 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG

395デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:46:18
SMARTer-Seq
ム①570 若山 Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム②571 若山  Blastocyst stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム③572 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム④573 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ム⑦576 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑧577 若山 Morula stage embryos:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
×⑨578 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv
ム⑩579 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv

396デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:47:26
ChIP-Seq
ム①553 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム②554 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム③555 小保方 CD45 positive Cells:ChIPSeq.input derived from spleen Oct3/4::gfp C57BL/6 GOF
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv

397在原業平:2018/09/07(金) 15:54:07
逆に最初からだとはっきりしているのは
②FI-SCは若山さんしか作れないから若山研でのものだ。
③のちの解析で129xB6-CAGヘテロとされたものは後には作れないから若山研でのものだ。
だよね。それだけ集めると?

398デラ・ストリート:2018/09/07(金) 15:57:31
ふむ。
>>
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑦565 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
ム⑧566 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv GOF+CD1
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

399デラ・ストリート:2018/09/07(金) 16:00:36
ChIP-Seq
△⑦567 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
〇⑧568 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-Acr-CAG
△⑨569 若山 FI-SC(Fgf Induced Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-Acr-CAG
ム⑩582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑬587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑮589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

400在原業平:2018/09/07(金) 16:08:14
129xB6-CAGヘテロだけだと?

401デラ・ストリート:2018/09/07(金) 16:10:11
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム②557 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑩581 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep2 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ChIP-Seq
ム⑩582 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv  129xB6-CAGヘテロ
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑫584 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑬587 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K27me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ム⑮589 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.input Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

402在原業平:2018/09/07(金) 16:12:58
Ts.Markerさんの検証のあるものだけにして。

403デラ・ストリート:2018/09/07(金) 16:15:04
Tru-Seq
×①556 小保方 CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 derived from spleen C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ChIP-Seq
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
〇⑭588 若山 STAP-SC(STAP derived Stem Cells):ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

404ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 16:28:49
3)STAP 細胞由来 ChIP-seq (input)サンプルは 129B6 F1ES1 から取得された

というのが桂調査の結果だ。なぜ彼らは「僕のマウス」「ESであるはずのものの背景を
確認しなかったのか?
>>
Tru-Seq
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥5ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
SMARTer-Seq
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ChIP-Seq
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv

405ペリー・メイスン:2018/09/07(金) 16:31:45
上記訂正

Tru-Seq
×⑤560 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥561 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.Rep2 C57BL/6x129/Sv
SMARTer-Seq
×⑤574 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep1 C57BL/6x129/Sv
ム⑥575 若山 Embryonic Stem Cells:RNASeq.SMARTer.Rep2 C57BL/6x129/Sv
ChIP-Seq
ム④562 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K27me3 C57BL/6x129/Sv
〇⑤563 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.H3K4me3 C57BL/6x129/Sv
ム⑥564 若山 Embryonic Stem Cells:ChIPSeq.input C57BL/6x129/Sv

406在原業平:2018/09/07(金) 16:40:40
Tru-SeqとSMARTer-SeqのESとChIP-SeqのESは違うものだね。前者が「僕のマウス」ESなら
Trophoblast marker genesの発現が無いことと整合する。でも、図はないことになってるけどな。
そこがど素人の見方の問題になるのかな。

407シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 16:44:33
㊲ここのESはマウス背景を調べて報告し直せ。

408ドクター・ワトソン:2018/09/07(金) 16:48:45
㊳<3)STAP 細胞由来 ChIP-seq (input)サンプルは 129B6 F1ES1 から取得された>と言うなら
以下のTrophoblast marker genes発現の違いを説明しろ。
>>
Tru-Seq
×⑨580 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:RNASeq.Rep1 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ
ChIP-Seq
〇⑪583 小保方 Low pH treated CD45 positive Cells:ChIPSeq.H3K4me3 Oct3/4 expressing cells C57BL/6x129/Sv 129xB6-CAGヘテロ

409シャーロック・ホームズ:2018/09/07(金) 17:18:20
ワトソン、それはちと無謀ぞ。お前が間違ってるだけだといわれるだろう。
それよりも桂報告のSTAP細胞は既存ESであるという結論は穴が多すぎて
少しも証明され得て居ないと批判するのがよい。正しく証明するのは
彼らの仕事で、我々は給金いただいてない。彼らは貰って書いたものだ。
ちゃんと落とし前つけてもらうぞ。

410在原業平:2018/09/07(金) 17:30:36
取り敢えず我流で調べられるところまで調べたんで次は和モガツイッターに戻るよ。
これだけやっといてか彼の詳細な説明を聞くと霧が晴れそうじゃないか。

411小野小町:2018/09/07(金) 17:41:20
今日は親父と武田教授の日だわ。虎の門見ないと。んじゃ。

youtube.com/watch?v=fas7RWYc8_0

412イェイ:2018/09/07(金) 17:42:20
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413:2018/09/07(金) 20:22:10
ガンバレブログ見たよ。やっぱりね。はは。

414イェイ:2018/09/07(金) 20:22:45
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415自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/07(金) 22:25:35
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

416地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/08(土) 06:44:57
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417在原業平:2018/09/08(土) 06:50:14
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

418小野小町:2018/09/08(土) 06:51:24
オー、何をかいわんや。すごいわね。

419在原業平:2018/09/08(土) 07:44:12
桃子本の205Pに<実は私は、すでに小保方研の冷凍庫に保管されていた試料の
リストと画像を入手していた。>とあって、見開きのページにその写真がある。
ボックスの中は76本のチューブがあって、その総数は木星リストの、
② クライオチューブ/詳細不明       計45本 Obokata RNA CTS→ESlikeもESと記載
  マイクロチューブ/FLS-○他、詳細不明 計31本 FLS→129ESと書いていた
の総数と一致している。

今回Ooboeさんとバートナー氏の入手資料をガンバレブログで楠本さんが
アップしてくれてる。これから照合するので暫く中断だね。

420一言居士:2018/09/08(土) 09:20:32
まず最初にはっきりしたことがあるね。佐藤本の80P。まず
FLS-3(4/17)
FLS-4(4/22)
GLS-1(4/22)
GLS-11(4/22)
AC129-1(4/22)
AC129-2(4/22)
これはすべて丹羽さんの解析した分だ。( )は試料持ち出し日。

421一言居士:2018/09/08(土) 09:23:29
木星リスト番号は***以下だ。
FLS-3(4/17)***5
FLS-4(4/22)***6
GLS-1(4/22)***28
GLS-11(4/22)***38
AC129-1(4/22)***24
AC129-2(4/22)***25

422一言居士:2018/09/08(土) 09:47:31
次は81P。
TSA ntES-9***91<RG108 500 ntES-9 2011.7.8の間違い>
ES129 GFP+/-***109<FLSのことだろう(小保方) 自分で作成と書かれている分>
GFP ES***131<若山さん由来と書かれている分>
129/GFO ES***95
ES+/-***103<+/-:FLSがheteroだと判明していたので+/-と書いた可能性ありと書かれている分>
129B6F1GFP ES6***115<由来不明と書かれている分>

いずれも、松崎さんが6/9に持ち出した分。したがって6/10付の竹市センター長の報告は経過の報告で
まだ結果は出てない時点になる。

423一言居士:2018/09/08(土) 09:58:29
以上は佐藤本との照合。いろいろと分からなかったことも判明したね。
松崎氏はいろいろと調べているのに結果を言ってないことがあるね。例えば
木星リスト131の若山さん以来のGFP ESは背景は何だったのかとかね。103番の
結果はどうだったのかとかね。間違いは佐藤さんの引用か、原本なのかは分からない。

424一言居士:2018/09/08(土) 10:16:34
次に木星リストで丹羽さんの調査したものだけ以下に羅列しておく。
>>
丹羽 2014/4/17 5番  FLS-3 P2  2本 若山TL樹立
丹羽 2014/4/22 6番  FLS-4 P2   2本 若山TL樹立
丹羽 2014/6/17 11番  Call TS-1 2本 若山TL樹立 FI-SC(FGF4 induced Stem Cells)
丹羽 2014/6/28 12番  Call TS-11 1本 若山TL樹立
丹羽 2014/6/28 20番  129 B6 TS-3 1本 若山TL樹立
丹羽 2014/4/22 24番  AC129-1  2本
丹羽 2014/4/22 25番  AC129-2  2本
丹羽 2014/4/22 28番  GLS-1 P2  2本
丹羽 2014/4/22 38番  GLS-11 P2  1本

425一言居士:2018/09/08(土) 10:28:51
丹羽さんは自分のところでCD1のTSを提供してあげてるので、分化してしまっていたと
思われたコントロールTSは気になったろうね。若山さんの記者会見は6/16だね。
そのあとすぐCTSとコントロールTSを調べている。FLSの15番染色体にGFPがあったと
報告したのは佐藤本の情報と合わせると丹羽さんだということになる。これは
結果的には岡部マウスのGFPだった。つまりAcr-CAG-GFPだね。

426一言居士:2018/09/08(土) 10:34:38
因みにGLSは丹羽さんは核型解析に出してるよね。DORAさんのところに情報がある。
松崎さんはGLSの残りを調べていて、GLSの全体は丹羽さんのと合わされている。
FLSに関しては松崎さんは残りは調べてない。にも関わらず桂報告やBCA報告で
べ手調べてあるようになっているのは、若山さんが放医研に出した結果も合わせられている。
つまり、容疑者が分析に出した結果もごちゃまぜだということだね。

427一言居士:2018/09/08(土) 10:48:03
今回のデータにはショーケース分というのがあって、これが何かはっきりとは
わからない。木星リストには直接的に対応してない。今回のリスト自体は
最終持ち出し日が2014/11/4になっているのでそれ以前の分は全部網羅されていると
考えられる。ショーケース分と‐30℃フリーザー分を除いて、-80℃フリーザー分で
松崎さんの解析したデータを以下に示す。

428一言居士:2018/09/08(土) 10:56:57
松崎 2014/6/20 16番 129 B6 ES-2 2本 若山TL樹立
松崎 2014/6/20 17番 129 B6 ES-3 1本 若山TL樹立

429一言居士:2018/09/08(土) 11:17:22
このコントロールESに関しては重大なのでこれだけで注記しておきたいが、
AC129とFLS-Tにコンタミされたとされるのはこの1で、それは若山さんの
持ち出しリストにしかない。しかも若山さんはそれ以外を持っていない。
木星リストには129 B6 ES-2〜5までしかない。
6は<115番 129B6F1GFP ES-6 1本 由来不明>を全解析したことは分かっている。
今回のガンバレリストでは松崎さんは4,5を持ち出してないことになっている。
にも拘らず桂報告のスライドもBCA報告もすべて欠失等の調査がなされている。
4,5の試料はどこから出たものなのか?

430小野小町:2018/09/08(土) 11:27:33
ちと、所用。

youtube.com/watch?v=MkrwU5Pd93c
アルゲリッチもいいけどオーケストラと指揮者も素晴らしいわね。

431ふむ。:2018/09/08(土) 11:28:10
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432自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/09(日) 02:04:49
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

433地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/09(日) 03:09:12
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434在原業平:2018/09/09(日) 03:09:58
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

435小野小町:2018/09/09(日) 03:16:47
お気に入りはDORAさんがオーディオ衰退原因の推定ね。

436在原業平:2018/09/09(日) 03:47:21
あれは自分の体験でも事実だよ。オーディオは生演奏の疑似体験を自宅で目指すもの
だったからね。部屋の条件も含めた再生装置の開発競争の時代だった。実際、
演奏会場を使ってカーテンで隠して生演奏とオーディオの聴き比べなんて企画されてた。
宣伝半分の情報だったかもしれないけど大半分からなかったらしいね。

437小野小町:2018/09/09(日) 03:49:23
レコードのもとはテープだけど再現されるべき音は全部入っているわね。
CDはデジタルだから上下のどこかでは切らないといけないわね。

438在原業平:2018/09/09(日) 04:03:15
今音楽は自宅で聞くことが目指されてるわけではない。電車の中でイヤホーンで
聴けることが目指されてる。オーディオは電車の中には持ち込めない。聴ける音に
なってればいいんだ。イヤホーンでどんな聴覚世界ができるか。そういう開発競争だからね。
それはそれなりに技術進歩している。オーディオマニアには不便な時代だね。でも、
生は出掛ければ聴けるけど、こちらの世界もオーディオの世界が狭まっているように
もっと狭くなってる。演奏家は今やユーチューブで自己宣伝する時代だ。カラヤンから
レコードの時代になったと言われてるけど、音楽家も生きて行くためにはいろんな手段を
使って商売にしていかないとな。もともと貴族のパトロンに支えられていた世界だ。
その意味で音楽は今はすさまじく大衆化している。

439小野小町:2018/09/09(日) 04:07:58
打ち震えるほどいい音ってあったわね。生では当たり前で何とも思わないんだけど
それを部屋の中で聞いた時の感動ってまた、何か違う世界よね。

440在原業平:2018/09/09(日) 04:12:34
マニアックな世界だね。何か世界を自分の中で作ってるんだよ。通勤電車の中で
ヘッドホンから聴こえてくる別のマニアックな世界もあるのかな。

441小野小町:2018/09/09(日) 04:23:02
相変わらずアサヒはネットで嘘記事ばかり流してるわね。そもそも官邸の嫌われ者だなんて、
官僚風情の言うことかいな。馬鹿集めて飛ばし記事書かせてるのよね。朝日そのものが
馬鹿の集団だからしょうがないのかな。早く死ねってことかしら?

442在原業平:2018/09/09(日) 04:25:57
アカヒと犬HKは死ぬだろう。国民が疫病神だと気づいてしまったからね。

443小野小町:2018/09/09(日) 04:27:36
特亜の犬ね。ひひひ。ぶち殺してやる。

444在原業平:2018/09/09(日) 04:31:55
世界の構造は変えられようとしている。人々は忘れているがロシアは今や
共産主義国家ではない。チャンコロだけが取り残されようとしている。近々
中共は崩壊するだろう。

445小野小町:2018/09/09(日) 04:33:22
断末魔ね。中共の崩壊ってどういう形になるのかしら。

446在原業平:2018/09/09(日) 04:39:42
戦後の圧倒的な経済力を背景にした米国の世界経営の成果はその成功によって、
自らの力の相対化をもたらしてパワーバランスの不安定化をもたらそうとしている。
加えて、チャンコロはアホだとわかったので、これは昔のように資本主義体制から
排除しておかないといけないと判断された。これからの世界経営は米国中心の
政治力優先から先進国合議体制へ移行させないといけなくなってる。それで
トランプが今仲間たちの尻を叩いているところだ。いつまでも脛齧ってんじゃねえぜと、

447小野小町:2018/09/09(日) 04:45:07
なるほどね。国際財閥の腹が固まったということなのね。

448在原業平:2018/09/09(日) 04:50:22
国際財閥は米国の政治力の支配を受けていないどころか、米国の政府は国際財閥の
一部門に過ぎない。そこがチャンコロはアホだと判断したということだ。彼らは
儲かればいいだけなんだし、そのためには自由貿易体制がいいんだけど、チャンコロが
恩知らずにも歯向かってきたから、殺すことに決めたのさ。彼らは米国政府の支配は
受けていないが、彼らの財産を守っているのは米国の軍事力なんでね。チャンコロに
いいようにさせるなんてありえない。チャンコロは世界経営の構造を知らない馬鹿なんだよ。

449小野小町:2018/09/09(日) 04:53:15
経営能力もないくせに太平洋を二分だなんて、発想自体がアナクロのあっぽね。

450タカハシワケ:2018/09/09(日) 04:57:12
あれは江沢民と糞金ジュンイルの密談から始まった流れだね。元を遡ると
天安門に戻るな。あの歯抜けジジイはまだ生きてたんだっけ?

451開高健:2018/09/09(日) 05:01:39
シナの民主化がソ連東欧の民主化と重なって収集がつかなくなることを恐れて
一旦反動させたんで仕事が残っちまってますね。あれからチャンコロどもは迷走を
始めていて今の状態になってますね。

452孤舟:2018/09/09(日) 05:03:36
民主化って共産党独裁の終焉でしょ。反動後の流れではここに来るしかないよね。
もう一度民主化の流れができない限り。

453タカハシワケ:2018/09/09(日) 05:09:09
チャンコロは日本と米国のおかげてここまで経済力をつけたんだけど、共産主義で
ある限り資本主義社会には入れないね。民主化することは共産党の自己否定なんで
自分で行うことはあり得ない。資本主義経済の基盤は法治で法治の基盤は民主主義だからな。
ルール破りをいつまでも大目には見てやれないということだな。のぼせあがったアッポは
殺すしかない。

454孤舟:2018/09/09(日) 05:10:55
はは、戦争しなくても相手が死ぬように行動すればいいんだね。

455開高健:2018/09/09(日) 05:13:07
Tax シナ to Save American Jobs.

456タカハシワケ:2018/09/09(日) 05:21:22
Get it straight:シナ is not our friend.

457孤舟:2018/09/09(日) 05:22:21
大統領になる前から書かれていることだね。

458開高健:2018/09/09(日) 05:29:27
関税というのは国家主権でどこにどれだけ掛けるかというのは自由だ。互いの
合意でやってるだけで、ブロック経済の反省からGATTができただけで、嫌いな奴に
対して関税撤廃なんて何の法的義務もないよ。もともとシナなんて資本主義経済研の中には
居なくて、資本主義側はシナなんかなくても何も困らない。シナから輸入できなくなったら
自分たちで作るようになるだけだ。価格が高くなっても、その金は所得を通して
国内で回るだけからね。Tax シナ to Save American Jobs.だよ。

459タカハシワケ:2018/09/09(日) 05:33:11
本音は Tax シナ to Destroy Them.かな。だって、シナは排除しても、中南米、
アフリカと開発すべき先はまだまだ残ってるからね。国際財閥の世界経営は続く。

460孤舟:2018/09/09(日) 05:35:49
そのあたりはあなたのご子孫がチャンネル桜なんかで解説されてますね。
ドルリンクしているのに世界を二分なんて余程頭悪いよね。

461アダム・スミス:2018/09/09(日) 05:46:13
資本主義的経済発展と共産党独裁の経済発展モデルは矛盾しているんで
出口が無いんだよ。マルクス経済学だと強制労働以外に発展モデルが無くて、
ノーメンクラツーらの腐敗と労働者の怠惰がセットになって衰退する。
日本もその傾向が出始めてるよね。革命の情念だとか、敗戦復興だとか
経済学概念以外のエシックによるモチベーションの続く間だけしか生産性
向上意欲が機能しない。チャンコロは昔のように奴隷社会に戻るしかないかな。
稼いだ奴はいつも逃げ出すのが奴らの社会だ。

462タカハシワケ:2018/09/09(日) 05:50:09
アメリカ人はプラグマティストだからね。Tax シナ to Save American Jobs.して
その後のシナがどうなるかは分かっているが、さらにそれをどうするかは決めてないよね。
今のままではいけないから変えるだけだ。その先は、Tomorrow is another dayだ。

463アダム・スミス:2018/09/09(日) 05:57:28
輸出制限されて外貨収入が減少すると、ドルリンクさせているから元の流通量が
減って、結果金融引き締め結果を生むね。経済成長は止まるだろうね。そもそも
それ以前に政府投資で官営バブルを維持していて負債が破裂しそうになってる。
AIIBも自分のための集金システムだからね。謝金の借り換えと増額をしながら
為替を維持しようとしたら金融引き締めしないといけない。フロートさせれば
いんだけどね。すると世界の金融システムに巻き込まれて、共産党独裁の経済政策は
破綻する。世界の資金がシナから逃避するぜ。

464タカハシワケ:2018/09/09(日) 06:02:55
自転車操業だね。不良債権の取り立てに植民地化してるんだけど、これも
各国の反発を生んでるね。行き詰まると結局シナ自身がデフォルト国家に
転落するね。大きなアルゼンチンになる。

465アダムスミス:2018/09/09(日) 06:07:49
国際財閥は既に大きな資本は引き上げてしまってるからね。準備万端整えてから
戦争仕掛けるのが相変わらず彼らのやり方だね。シナへの投資は香港経由で
米国から入っているのが大半だけど、その米国の投資家は米国帰化したシナ人
自身だよな。大体政治家の親族で、いつでも逃げられるようにしている。
クリントンの嫁が60兆円くらい米国に持ち出されていると笑ってたね。

466孤舟:2018/09/09(日) 06:08:40
入れ込んでるトヨタってアッポなの?

467タカハシワケ:2018/09/09(日) 06:15:42
ははは、日本人は日本的に賢いからな。そもそも本体に影響するほどの金額まで
投資してない。それとやはり民主化でもした時に拠点があるかという先を見てる。
でもそれは甘いと思うよ。トヨタは損するだろうね。トヨタと同じ考えをしているのが
ドイツのメルケルだね。もっとも向こうは向こうで事情があって、サブプライムでの
ヨーロッパの被害がどのくらいだったか忘れてる人が多いからな。ドイチェバンクは
倒産寸前だつた。政府が救うのが普通だけどチャンコロの投資家がはいってるんだろ。
あれはもともとはロスチャイルド傘下だからね。財閥は世界的に展開しているから
トータルでは大儲けしているけど、損した先もある。それを押し付けてるみたいだね。
でもいずれ、ドイツは国営化するしかなくなるよ。チャンコロはいずれ破産する。

468孤舟:2018/09/09(日) 06:21:13
甘いというのは、それほどシナの民主化は困難だと?

469タカハシワケ:2018/09/09(日) 06:29:05
民主化教育されてないからね。今いる人々で先進国並みの民主政治を実現できるとは
思いにくいね。崩壊して乱世になると思うよ。分国してもそれぞれの国が
法治国家を建設できるとも思いにくい。歴史の桎梏がある。彼らは国民国家を
形成したことが無いのさ。信用できる仲間たちだけで集まった国を経験していない。
民主政治というのは仲間の相談で決める政治だよ。彼らは賄賂で道をつくる
社会で法治を知らない。見知らぬ人々に何か頼もうと思ったら謝礼が分かりやすい。
そういう社会で民主的法治はむつかしいでしょ。

470小野小町:2018/09/09(日) 06:33:56
世界は彼らにとって天下なのね。信用できる仲間は大家族大親族だけね。
見知らぬもの同士が利害だけで同居している社会ね。家族はだましては
けないけど、他者はだますのが当たり前だと。そんな社会で民主的選挙って
何か意味をもつのかしらね。自分が人をだますのに人が公約で自分をだまさない
なんて思えるものかしら。

471在原業平:2018/09/09(日) 06:36:49
逆に、公約を守らないと選挙に落ちるという経験を社会にさせることによって
社会規範の方が変わるということがあるかなあ。

472タカハシワケ:2018/09/09(日) 06:41:54
無理だね。嘘をついてはいけないという規範はシナ人にもあるよ。例えば親に対して
彼らだって嘘はつかない。そういうのは人間の共通な生存条件を考えれば当然なんで、
嘘をつかない対象の範囲が違うだけだ。アメリカ人や日本人は誰に対しても
嘘をつかないという規範だけど、彼らの規範は大家族内だけだという違いだけだ。
石平さんが言ってるじゃないか。日本に来たら嘘をつかないで済むから楽だと。
でもシナで自分だけそんなに気を緩めていたらだまされて被害にあうと。

473小野小町:2018/09/09(日) 06:45:56
赤信号みんなで渡れば怖くない的無秩序ね。日本人ならとんでもないと
取り締まるからこそ、この話が笑えるのよね。シナでは無秩序が当たり前だから
自分だけ信号守ってたら永遠に渡れないぞと。それが歴史的桎梏ね。だから
民主化できないと。だからトヨタとドイツは損することになると。

474在原業平:2018/09/09(日) 06:51:20
まあ、シナ人がどういうものかなんて世界は関心ないんで、いま世界中が
彼らに対してお前ふざけんなよと、仲間外れにすることを決めたわけだね。
その結果彼らの経済体制が崩壊することは読めてるよね。そしてでも、彼らは
民主政府をつくることはできない。するとどういうことになっていくかなあ。

475孤舟:2018/09/09(日) 06:54:18
高山さんのように毛沢東時代の昔に戻って内戦で殺しあってれば世界は平和だと
皮肉を言う人もいるね。

476開高健:2018/09/09(日) 06:58:04
シナは大河が二つあって地勢の問題もありそうだよなあ。河は共通財でないといけないけど
なにせとても大きい川で、流域全体の統一には膨大なエネルギーを要すね。

477タカハシワケ:2018/09/09(日) 07:03:53
アメリカと同じくらいの面積の場所に大河が東西に二本横断している。
ロスからニューヨークに向かって流れている。昔は横断も大変だった。
南北に分かれるのは可能で過去何度も分かれているけど、東西には
なかなか分けられないんだよな。アメリカみたいに独立した州の連邦の
形は実質的には結構大変だね。

478孤舟:2018/09/09(日) 07:06:47
でも、14億人もとりあえずは食えてるんだからな。恵まれた大地だよな。
恵まれてないと人は死ぬからね。死んでないということは恵まれているということだ。

479ロバート・マルサス:2018/09/09(日) 07:12:20
農業で水利が死活問題である限り分国できない。するとあの地は天下であり
続けるから民主政体はできない。これを覆すのは産業構造の転換かな。

480アダム・スミス:2018/09/09(日) 07:13:51
なんだか、気の遠くなりそうなほど先の話みたいだね。

481タカハシワケ:2018/09/09(日) 07:29:51
今のシナの跳ね返りは人類にとって困る。言ってもわからん。ならば叩く。
ここまでは既に方針決定済みで、今関税実行されている。そしてその結果は既に読めてる。
シナは財政破綻してデフォルトする。チャイナサブプライム問題が発生しそうだね。
貸し込んでる奴は誰か

482孤舟:2018/09/09(日) 07:31:15
ヨーロッパ、日本、米国のシナ資金。

483開高健:2018/09/09(日) 07:32:03
どのくらいの規模かな?

484孤舟:2018/09/09(日) 07:41:32
分からないけど、何しろチャンコロは輸出で稼いだ金で生活費以外を
国土開発と殖産興業に投入している。こういうのは自分の金だから問題ないけど
日産やトヨタやフォルクスワーゲンは直接投資しているからね。そういうのの
合計とシナの銀行や株式市場に投資されている分、そして債権類を通して
ファイナンスされているもの、AIIBに貸し込まれている分。こういうのが全部
デフォルトするよね。保険やデフォルトスワップも規模は分からないけど
金融機関なんかが運用先に困って買い込んでたりすると思わぬところで
引っかかったりするね。

485開高健:2018/09/09(日) 07:45:37
世界に対する影響は小さくはないけどそれほど大きくもないと。
そもそも自国民を奴隷労働させて自分たちで稼いだ金であちこちに
鬼城的投資を行ったんだから損はただチャンコロたちの只働きになった
だけだねというところに落ちるんだな。世界も自国が痛むほどの投資は
していないと。サブプライムの時のようにはだまされないぞと。

486小野小町:2018/09/09(日) 07:46:29
基本一人相撲だったということで終わるのね。その後はどうなるの。

487在原業平:2018/09/09(日) 07:49:09
ふん。

youtube.com/watch?v=6OEGgNBs9FI

488ヘーゲル:2018/09/09(日) 07:50:06
本題頼むぜ。

489カール・ヤスパース:2018/09/09(日) 07:50:52
本題、何でしたっけ?

490デラ・ストリート:2018/09/09(日) 07:58:44
松崎さんの持ち出し分の話だわ。
>>
松崎 2014/10/21 29 GLS-2 P2 2
松崎 2014/10/21 30 GLS-3 P2 2
松崎 2014/10/21 31 GLS-4 P2 2
松崎 2014/10/21 32 GLS-5 P2 2
松崎 2014/10/21 33 GLS-6 P2 2
松崎 2014/10/21 34 GLS-7 P2 2
松崎 2014/10/21 35 GLS-8 P2 2
松崎 2014/10/21 36 GLS-9 P2 2
松崎 2014/10/21 37 GLS-10 P2 2
松崎 2014/10/21 39 GLS-12 P2 2
松崎 2014/10/21 40 GLS-13 P2 2

491一言居士:2018/09/09(日) 08:09:03
GLSは丹羽さんが4月に解析を始めていて、学生のntESは8月に松崎さんが解析を
始めている。残りは10月で桂報告は12/25だからね。
>>
丹羽 2014/4/22 28 GLS-1 P2 2
丹羽 2014/4/22 38 GLS-11 P2 1
松崎 2014/8/1 102 GOF ES1 1 ■■由来→小保方

492閲覧者:2018/09/09(日) 08:18:38
桂報告の結論は両者に共通するX染色体の欠失と末端重複逆位接続により、
GLS1=GOF-ESだというものだね。これって4月、8月に既に解析されているね。
10月のは何の解析なのか。
>>
The line subjected to WGS is indicated in parentheses in cases in which several sublines were established for one cell type. Other sublines were confirmed by PCR and sequencing.

493小野小町:2018/09/09(日) 08:23:36
by PCR and sequencing.によって何を調べたのかね。
>>
丹羽 2014/4/22 28 GLS-1 P2 2

このうちの一本が持ち出されて丹羽さんの解析を受けたのね。これが何の解析かは
分からないわね。そしてのちに松崎さんによってWGS解析されたのよね。
>>
松崎 2014/8/1 102 GOF ES1 1 ■■由来→小保方

これはWGS解析ではないのね。

494在原業平:2018/09/09(日) 09:13:15
若山さんの記者会見で放医研はGLSは13株全部メスと言ったんだけど、丹羽さんが
出した核型解析結果では二つともオスと出た。でも最終的にはX染色体の欠失と末端重複逆位接続が
Y染色体と見間違えられたということになった。一時期放医研のサンプルと理研の
サンプルが違うものでなかったのかという疑いもあったが、そもそもすべてが
どちらかだということなんで、見間違いくさいということだね。

495小野小町:2018/09/09(日) 09:18:17
GLS1=GOF-ESが事実ならコンタミだということになるんだけど、私たちの
ntES論の立場では、GOF-ESのチューブに若山さんがGLS1を入れたというだけの話ね。
これはFES1の中身を若山さんがFLS3と入れ替えた手法と同じで、2013年3月の
引っ越しの前に行われているのね。

496在原業平:2018/09/09(日) 09:35:34
若山さんの主張や理研の論証の不備はFES1もGOF-ESもどちらも元の細胞である
証明がないことだ。それは若山さんが入れ替えてないという仮定の下で成立していて、
若山さんが入れ替ええないいう証明はついてない。しかも両方共だ。学生の作った
細胞はたくさんあったはずなのに一つも残されていない。調査されたGOF-ESは
それと分かるようにGOF-ESとラベルされていた。しかも、小保方さんはそれを
コントロールとして学生からもらっていて、もらった後10.31にDNA濃度測定に
使っていることが桂報告のスライドに書かれている。

497一言居士:2018/09/09(日) 09:39:11
最大の問題は8番染色体のトリソミーなんだよな。GOF-ESにはなかったが、
GLSにはあったとされている。

498閲覧者:2018/09/09(日) 09:46:24
そうだね。若山さんが入れ替えたのなら8番染色体にトリソミーがあったら
GOF-ESにもないとおかしい。ただし、若山さんが入れ替えたGLSは何番か調べられていない。
トリソミーが確認されたのは全解析されたGLS1でしょ。GLSは1から13番まである。
若山さんが引越しの前にGOF-ESとラベルされたチューブを洗って、中身に
トリソミーのないGLSを入れなかったと証明するには13株全部の角形解析結果を
添付しないといけないね。

499一言居士:2018/09/09(日) 09:55:06
8番染色体が3本あるのはDORAさんのブログで確認できるね。それはGLS1だ。
ところが丹羽さんはGLS11も提出している。これは2本だよ。ただし、遺伝子異常がある。
だとすれば残りも全部調べないといけないよね。それが2014/10/21の松崎さんの
調査目的の持ち出し理由の筈だ、でも残り全部にトリソミーがあったとは
どこにも書かれていないね。スライドではトリソミーのことには触れられていない。

500閲覧者:2018/09/09(日) 09:57:52
調べた結果トリソミーがあったのはGLS1だけだった可能性が高いね。これはすごい欺瞞だよ。
トリソミーに関しては以下のような記述だ。
>>
なお、STAP 幹細胞 GLS には第 8 染色体のトリソミーがあったが、GOF マウスおよび ES 細胞 GOF-ES にはなかった。このトリソミーはマウスでは致死だが、ES 細胞でときどき 生じるもので、STAP 幹細胞 GLS 作製(GOF-ES 混入)時または作製(混入)後に生じた と考えられた。

501小野小町:2018/09/09(日) 10:03:03
青洟の間抜けな臭いがするわね。GLSの何番か書かれていない。全部にあったら
全部と書くはずだわ。全部調べてるんだものね。これが全部だっら、若山さんの入れ替え疑惑は
吹き飛ぶのよね。無実が証明される。でもトリソミーに関しては1番だけで、11番にはない、で残りも
全部調べたはずだけど無かったんでしょ。もしくは入れ替えた時に無いものに
当たった確率がとても高かったという結果になったんでしょう。だからGLS1=GOF-ESの
根拠の8つの根拠の外に外された。

502在原業平:2018/09/09(日) 10:06:33
それどころか13株全部の核型解析結果とGOF-ESの核型解析の写真を並べたら
GOF-ESはGLS1ではなく、トリソミーのない2〜13までのどれかだと見えてしまったろうね。

503小野小町:2018/09/09(日) 10:10:12
そもそものっけから桂報告はCTS-1,11〜13とGLS1〜13を勘違いして間違えてるわよね。
>>
(c)STAP 幹細胞 GLS は、ES 細胞 GOF-ES に由来する

(調査結果) Article の Fig.5 および Extended Data Fig.8 に、STAP 細胞を ACTH+LIF の条件で培 養すると、増殖傾向を示す ES 細胞様の GFP 発現細胞(STAP 幹細胞)となったことが報 告されている。 STAP 幹細胞 GLS1 と GLS11〜13 は、若山氏の実験ノートによると、小保方氏が GOF マ ウス細胞から作製した STAP 細胞を用いて、若山氏が 2012 年 1 月 31 日に樹立したこと が判明した。

504Ooboe:2018/09/10(月) 00:37:44
パートナ
昨日
あるところの取材に、資料の大枠を説明した
そうです。記事化されるかも?
それから、桂報告書の白紙撤回申請書が
完成したそうで、行政書士先生から手渡して
もらいましたと、東京から連絡
明日詳しく聞きます。
楠本up資料はもっと先々のup予定だったのですが
この資料を理解してもらえるのは
したらば分身達など限られるからとの事で
アンチには理解できないだろうからと、、、

505名無しさん:2018/09/10(月) 00:55:17
>記事化されるかも?

そうやって煽るのはやめたら?
木星さん

506名無しさん:2018/09/10(月) 00:59:12
4月の報告会にもマスコミが来てたって言ってたじゃんw

今まで何の音さたもないんでしょ?w

507自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/10(月) 01:50:39
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

508地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/10(月) 09:28:39
😭 😃 😵 😒 😣 😝 😍 😆 😔 😳 😡 😱 👿 💀 👹 🐝 🌅 👰 
👩 👦 👧 🙍 🙋 🙅 👮 👪 👫 🙇 🙈 🙊 🐰 😸 🐜 💪 👍 👎 
👉 👊 👋 🙏 🙌 👏 👣 👅 💋 🐦 👻 ⛅ 💩 🌠 💚 💜 💙 💏 
💞 💓 💖 💕 🎼 🎻 🎷 🎺 🎹 🎥 🎶 🎵 🎧 🔊 📞 🔫 🚓 🍸 
☕ 🍰 🍶 🍻 📡 🔑 🌈 📖 🆖 ⏫ ⏬ ❎ 🆘 🅿 🆗 ⏪ 🔙 🔜 
💸 💐 🚨 📠 🏣 🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🎆 🍀 🏊
♨ 🎲 🎌 🎳 🎢 🌁 🌟 💢 📹 📺 📱 💻 📷 💊 ⏰ ⌛ 🗻 🗾 
🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

509在原業平:2018/09/10(月) 09:29:37
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

510小野小町:2018/09/10(月) 09:53:54
お気に入りは根本さんが共同研究協約書の重要性に触れられてるわ。学さんと西岡さんは
STAP現象が真実である可能性に関していろいろと考察中だわね。DORAさんがまた
何かわざと挑発的なことを書かれている。

5113l0okulvo:2018/09/10(月) 09:55:51
>>
のちに、ベートーベンのピアノの弟子のカール・チェルニーが書き残したところによると、ベートーベンは彼に、
『モーツァルトのピアノ演奏は見事だったが、ポツポツと音を刻むようで、レガートな演奏ではなかった』
と語ったという。(この話も複数の書物に載っている)
ということは、もしかして、モーツァルトはグールドのようなノン・レガート奏法?
モーツァルトがどんなピアノ演奏をしていたかということについて、これ以外の証言ってあるのだろうか。

512在原業平:2018/09/10(月) 09:57:32
ありゃりゃ、誤送信だ。DORAさんの疑義だね。スコアがあるからね。こんなに雄弁に
語っている物証はない。

513小野小町:2018/09/10(月) 09:59:18
この逸話って、話自体が作られてるくさいわよね。

514在原業平:2018/09/10(月) 10:05:39
そうね。まず前提が弟子だから同時代だ。
①ベートーベンのピアノの弟子のカール・チェルニーが書き残したところによると、
②ベートーベンは彼に、『モーツァルトのピアノ演奏は見事だったが、ポツポツと音を刻むようで、レガートな演奏ではなかった』と語ったという。
③モーツァルトのピアノ演奏は見事だったが、
④ポツポツと音を刻むようで、
⑤レガートな演奏ではなかった
⑥(この話も複数の書物に載っている)

515在原業平:2018/09/10(月) 10:22:47
文献学の第一段階はまず①で<カール・チェルニーが書き残したところ>を見つけないといけないよね。
次にそれが彼がベートーベンから本当に聞いたことかどうかを別の資料で確認しないといけない。
別の弟子も同じことを聞いたとかいうことだね。②の確認さ。僕は音楽は聴くだけで、あんまり
伝記の類には興味が無いんだ。所詮人間として食っちゃ寝、食っちゃ寝、しただけでしょ。
僕はあんまり他人の過去や自分の過去の個人的な事象に興味が無い。どうせ死んで残ることではないからね。
何か残されたものの意義に関心が向かう性癖なんだ。

516小野小町:2018/09/10(月) 10:26:21
<モーツァルトのピアノ演奏は見事だった>んでしょ。十分よね。見事だったんだわ。
レガートに弾くべきところはレガートに弾いたのよね。ピチカートするところはそうしたんだわ。

517在原業平:2018/09/10(月) 10:34:24
この話の変なのは<モーツァルトのピアノ演奏は見事>だと書いておきながら
<ポツポツと音を刻むようで、>と書いてるところだ。これは一本指でメロディーを
ちょっと弾けばそうなるのはピアノの構造で、指を離すと消音される。そのあたりは
チェンバロでも同じでしょ。楽器の問題じゃないはずだ。レガートというのは音を
繋げることだから前の音の響きを次の音が鳴るまで消さないようにする技術だ。
<モーツァルトのピアノ演奏は見事だった>んでしょ。初心技術の問題ではないよね。

518小野小町:2018/09/10(月) 10:39:12
基本的な技術の話として聞くと<ポツポツと音を刻むようで、>という表現は
下手くそだったと聞こえるところよね。どう考えたって言葉が不足しているわよね。
何か、ベートオッフェンさんの言いたいこと、もしくはチェルニーさんに
言いたいことがあって、いろんな話の背景が捨象されている感じの文章よね。

519在原業平:2018/09/10(月) 10:53:11
そういう前提を置いたうえで、<『モーツァルトのピアノ演奏は見事だったが、
ポツポツと音を刻むようで、レガートな演奏ではなかった』>という言葉の意味を考えると、
まさに、DORAさんが言うようにグレングールドのモーツアルト解釈に行き着く。
つまり、この話はグールド的解釈を前提してが語られてないかということだね。
それを否定するには<⑥(この話も複数の書物に載っている)>ところを時系列で
整理しないといけない。もし、この複数の書物がグールドの出現前に書かれていたら、
それはDORAさんの疑義している通りに、モーツアルトはレガート指定のないところまで
レガート演奏はしていなかった可能性も出る。

520小野小町:2018/09/10(月) 10:59:19
でも、モーツアルトのスコアはレガートとピチカート指定で満ちてるわよね。

521在原業平:2018/09/10(月) 11:10:24
所詮技術を言葉で伝えることはできない。スコアを見て、演奏者が
一番気持ちよく聞こえるように演奏したら滑らかになるというだけだ。
モーツアルトの軽快なリズム感というのはいろんな国の音楽をたくさん
聴いてきてるんでしょ。旅してるからね。彼の多彩なシンコペーションの
クルーヴ感を出そうとして演奏するとグレングールドにはならないというだけだ。
グールドはバッハが好きなんだよ。坊主憎けりゃ袈裟まで憎い。
やろうと思ったらできるくせにわざとやらない。はは。

522小野小町:2018/09/10(月) 11:52:44
Ooboe さんが見えてるわ。

523在原業平:2018/09/10(月) 11:56:34
Ooboeさんとパートナー氏の資料館を読み直してるよ。あの資料があって
読むとまた伝わってくるところも違ってくるね。今はあの資料の検討だ。そして
和モガさんの遺伝子発現解析検討に戻って、その後で桂報告書の疑念を取りまとめる。

524ヘーゲル:2018/09/10(月) 11:58:05
本題頼むぜ。

525デラ・ストリート:2018/09/10(月) 11:59:02
本題、何でしたっけ?

526カール・ヤスパース:2018/09/10(月) 12:35:59
あれ、デラさん。それ僕のセリフだよ。しょうがないなあ。
4月のGLSまで終わったところだったね。Ooboeさんが最大疑念と書かれている
6/9の分からだ。
>>
松崎 2014/6/9 91 RG108 500 ntES-9 2011.7.8 2本 若山研引っ越し時に残っていたので保存していた
松崎 2014/6/9 95 129/GFP ES 2本
松崎 2014/6/9 103 ES+/- 2本 +/-:FLSがheteroだと判明していたので+/-と書いた可能性あり
松崎 2014/6/9 109 129 GFP+/- 1 8本 FLSのことだろう(小保方) 自分で作成
松崎 2014/6/9 115 129B6F1GFP ES-6 1本 由来不明
松崎 2014/6/9 131 GFP ES 2本  若山さん由来

527デラ・ストリート:2018/09/10(月) 13:01:08
2014 4 8 平成26 年 4 月 8 日付けによる不服申立てについては、4 月 20 日付けの不服申立につい ての理由補充書(1)と 5 月 4 日付けの不服申立についての理由補充書(2)を合わせ、 調査委員会では不服申立ての趣旨、理由等を勘案し、平成 26 年 3 月 31 日付け「研究論文 の疑義に関する調査報告書」における調査結果に対して、再調査は不要と判断する。 (渡辺報告)
2014 4 8 丹羽記者会見(再現実験に関する会見)
2014 4 9 小保方記者会見
2014 4 16 笹井記者会見
2014 4 26 野依理事長から論文の自己点検についてというメール
2014 5 7 渡辺報告
2014 5 8 不服申し立て正式却下
2014 5 中 早稲田調査の対応に追われる
2014 5 16 丹羽氏GLS1と11を核型解析に提出
2014 5 27 核型解析結果♂

528デラ・ストリート:2018/09/10(月) 13:01:50
2014 5 末 若山氏バイオサイエンステクノロジーにてSTAP否定言辞 (190P)
2014 6 2 理研内検証実験
2014 6 3 撤回と同意書にサイン、その後若山氏による撤回同意書書き換え。
2014 6 4 岸委員長が本人に再現させればいいという。
2014 6 5 和光、CDB、若山氏テレビ会議(桃子記事)
2014 6 10 竹市センター長報告書(6種試料調査)
2014 6 11 遠藤によるSTAPがESではないかという疑惑提示
2014 6 14 西川氏顧問辞職
2014 6 16 若山記者会見(GLS♀)、理研解析結果報告、NHKリーク、遠藤・大日向
2014 6 17 上記一致のCDBからの公表

529デラ・ストリート:2018/09/10(月) 13:03:17
2014 6 25 遠藤氏 アクロシンGFPを発見
2014 6 26 理研理事からの面談を弁護士事務所で受ける。
2014 6 30 再現実験への参加が発表される
2014 7 1 検証実験開始
2014 7 2 小保方さん出所、取材を避けるため1日遅らせた。
2014 7 21 若山記者会見の結論訂正メール
2014 7 23 NHK取材で小保方さんけが
2014 7 27 不正の深層 午後9時00分〜9時49分放映
2014 8 5 笹井氏自殺
2014 9 3 第二次調査委員会

530デラ・ストリート:2018/09/10(月) 13:04:30
2014 11 14 桃子のあとがき日付
2014 12 15 小保方さん辞職
2014 12 19 相澤、丹羽、清成記者会見
2014 12 25 桂報告書
2014 12 26 桂記者会見
2014 12 30 桃子 ねつ造の科学者 発行
2015 1 23 STAP cells are derived from ES cells
2015 2
2015 3 1 日経サイエンス3月号 発行

531小野小町:2018/09/10(月) 13:07:23
ふむ、ゆっくりやりましょうかね。ランチ!

youtube.com/watch?v=i8dSdoGQKXE

532ふむ。:2018/09/10(月) 13:10:03
youtube.com/watch?v=zl3RrxLMJU4
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533名無しさん:2018/09/10(月) 17:01:17
353 名前:名無しゲノムのクローンさん (ワッチョイ e3b0-5ixi) 2018/09/10(月) 14:20:56.24 ID:B4bLcRz00
>>348
楠本は、小保方が実験ノートを出せないのを体調のせいにしているが、
それがまったく反論になってないのがわかっていない。

実験ノートを書いているはずの時期、小保方は体調が悪いことなんてなかった。
多くの実験をこなしていたはずであり、渡米や出張ができるほどだった。
その時に一つ一つの実験記録をきちんと書いていれば、調査委員会に請求されてもすぐに出せるんだよ。
体調の良し悪しなんて関係ない。それまで書き溜めていたノートを提出するだけだから。

多くの疑いをかけられ絶体絶命なのに、すでにあるものを提出するという簡単なことができなかったんだから、
実験記録はなかったということだよ。

534在原業平:2018/09/10(月) 17:04:18
小町ちゃん、ジンライムね。楠本さんがまたアップしてくれたね。
8/7発京大太田さんから理研へ液体窒素容器、逆に8/7着の理研から京大太田さんへの
凍結胚。何だろうね。時期がね。今検討していることと関連していそうだね。

535:2018/09/10(月) 17:14:21
なんだ、また馬鹿が挟まってるな。何を言ってるんだ、キサマは。間抜けな奴だ。
実験ノートは2冊出てるだろうが。NHKに流出させた犯人でも告発しろ。アホかお前は。
それ以上はハーバードが出させないということだ。ノートバソコンも同じだ。ほんと
馬鹿なんだな。早く死ね。

536小野小町:2018/09/10(月) 17:15:49
早く死ねばいいだけなのに無能ね。何一つできない奴。

537在原業平:2018/09/10(月) 17:19:53
笹井さんが自裁したのは8/5だ。

538デラ・ストリート:2018/09/10(月) 17:23:08
続きよ。8/1持ち出し分。
>>
松崎 2014/8/1 102 GOF ES1 1本 ■■由来→小保方

539名無しさん:2018/09/10(月) 17:29:15
>>多くの疑いをかけられ絶体絶命なのに、すでにあるものを提出するという簡単なことができなかったんだから、
実験記録はなかったということだよ。

同意。

540ペリー・メイスン:2018/09/10(月) 17:31:22
学生のntESがまず調べられた。GLSに関しては4/22に丹羽さんの持ち出した分を
5/16に核型解析に出して結論が5/27だ。オスと出てGLS1にはトリソミーがあった。
6/16に若山記者会見があって、学生のntESがあると証言した。その後、松崎さんが
10/22に残りのGLSを調べたという経緯だ。ただし4,5の持ち出しは無かったね。
持ち出さずにどうやって調べたのか。

541:2018/09/10(月) 17:32:49
>>539

何が同意だ。人間の屑が。

542小野小町:2018/09/10(月) 17:34:20
あら、鉄さん、あれは人間ではないわ。デンデン虫だわ。ふふ。

543デラ・ストリート:2018/09/10(月) 17:45:03
小町さんったら、デンデン虫だなんて。くすっ。
続きだわ。-80℃フリーザーの最後、GLS以外の10/21持ち出し分ね。
>>
松崎 2014/10/21  117 129B6 ICSI P4 ES1 3/17/05 1本 全く分からない
松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21  123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本
松崎 2014/10/21 132 ntES-BDF1GFP 12cm2 06/22/08 1本 不明

544ペリー・メイスン:2018/09/10(月) 17:51:45
117番と113番が問題のヒッポさんのだと警察が本人から聞いたと小保方さんに
伝えた分だね。一応これで全部なんだけど、持ち出しは76本のすべてではなく、
このボックス毎持ち出された記録もない。-30℃フリーザー分はボックス毎持ち出された
記録も残されている。桃子や日経サイエンスの掲載しているボックス内の72本の
写真はどういう場所で撮られて外部流出したのか。

545一言居士:2018/09/10(月) 17:59:54
桃子の写真には持ち出されていないはずの139番の写真があるね。
>>
139 凍結マウス Day6 Haruko 9/8  4匹 GOFマウスDNA insertionのサイトがプロモーターのどこに入っているかを知るため/凍結死体からSTAPができるかも

546名無しさん:2018/09/10(月) 18:06:04
小島が理研にいた時期は調べたの?

547在原業平:2018/09/10(月) 18:06:21
あのボックスの写真は日経サイエンス3月号にはないね。あれを取り寄せたのは
木星さんだよ。確か。桃子は事前にそれをもらってる。

548在原業平:2018/09/10(月) 18:27:01
>>547

間抜けが。デンデンムシムシカタツムリ、お前の頭はどこにある。がはははは。
小島はハーバードだ。理研にはいない。共同研究協約のために、若山研の
客員登録されているだけだ。

549:2018/09/10(月) 18:27:49
ハヨ、シネヨ。要らねえから。

550小野小町:2018/09/10(月) 18:56:35
何べんも書いてることを読んですらいないでその場の反射してるのよね。
読まないでいいからトットト死ねってことよね。あたいたちは読者は選ぶのよね。
ピチカートじゃなくてスタッカートじゃないのくらいは言ってくれる人が最低資格よん。

551在原業平:2018/09/10(月) 19:12:08
まあ、人は誰もいないということでよかったじゃないか。静かな環境が落書きの条件だよ。
夜間人無く私語の時さ。
FLSに13はない。GLSは13まである。元のラベルもしくはリストの分類に誤りがある。
ただ、松崎さんはこれを調べている。丹羽さんが一部調べてGFPの場所を特定した木星リストの
1〜10の残りは調べなかったんだ。トータル31本はあってるけど、内容別には違っている。
明日調べよう。
>>
松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21 123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本


松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21  123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本

552在原業平:2018/09/10(月) 19:13:35
下3行削除ね。

553小野小町:2018/09/10(月) 19:19:12
9/8って、2012/9/8かしら。だとすると若山さんは本当のことを言おうとしてたのかな。
>>
139 凍結マウス Day6 Haruko 9/8  4匹 GOFマウスDNA insertionのサイトがプロモーターのどこに入っているかを知るため/凍結死体からSTAPができるかも

まあ、明日にしましょ。虎の門見ないと。
譜面通りの演奏よ。
youtube.com/watch?v=0J3X3Ey035k

554ふむ:2018/09/10(月) 19:20:24
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555名無しさん:2018/09/10(月) 20:03:10
358 名前:名無しゲノムのクローンさん (スププ Sdda-zmX4) 2018/09/10(月) 19:48:56.97 ID:0c/vq01fd
増殖曲線のデータについても、カウントしたフリの数値が書かれたノートが提出されたけれど、その通りにプロットしても全く論文のようにならないというホラー。
359 名前:名無しゲノムのクローンさん (スププ Sdda-zmX4) 2018/09/10(月) 19:51:56.90 ID:0c/vq01fd
実験ノートを2冊提出と言っても1冊はマテメソのメモ帳みたいな物。もう1冊もほぼまともな記載はなく、初めてSTAPのキメラに成功したとされる日もデータ無しwww

556名無しさん:2018/09/10(月) 20:28:57
若山さんの捏造教唆だな。加藤さんと同じだ。小娘に押し付けてみっともない
小人ぶりだな。実験ノートはメモしてたから提出したんで、パソコン内のは見せられないんだよ。
アッポ。キサマ、デンデン虫どころか只のナメクジ野郎だな。

557小学生:2018/09/10(月) 20:33:33
お父さん、こいつ塩掛けたら縮んでるよ。

558自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/11(火) 01:18:27
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

559地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/11(火) 06:08:11
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560在原業平:2018/09/11(火) 06:09:03
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

561小野小町:2018/09/11(火) 06:17:57
お気に入りは変化なしよ。アルイミオウジさんは根本さんへの反論を待ってるけど
まだ忙しいのかしらね。

562在原業平:2018/09/11(火) 06:40:06
自治会長を押し付けられてる方なんだろ。いろんな会合に引っ張り出されるからね。
でも誰かが引き受けてやるしかないからね。仕方ないね。
彼はキメラは論文通りにできたと推定している立場だ。今、丹羽さんのグラフで
6割でてるという根拠を書きかけにしたままだけど、あれは出てるクラスターの中の
しかも出てる細胞の数を示すもので10個のES細胞の発現量に比して6個分程度の発現量がある
という論理構造になってる。全体の光る細胞クラスタの中の細胞数に換算して
0.0012〜0.0024%が実際にOct4遺伝子を発現してGFPが光ってるんだと言ってる。

563小野小町:2018/09/11(火) 06:41:38
10万個の細胞があったらそのなかに1個から3個あるということね。

564在原業平:2018/09/11(火) 06:52:26
Oct4遺伝子発現していたらその細胞は必ずキメラを形成するとということはないんで、
だからこそキメラ実験を実際にやってみて確認するわけだけど、光ってるクラスターは
平均1000個の細胞で構成されている。10万個に1〜3個ということは、10個のクラスターが
あったら、そのうちの7個には遺伝子発現は無いということで、仮に遺伝子発現があったら
必ずキメラができると仮定してすら、7つのクラスターはキメラ形成しない。仮に3つに
当たったとして20個ずつの細胞にナイフ切り分けすると50のキメラ胚ができるけど、
その中の更にせいぜい一つしかキメラはできないという気の遠くなるような
少なさだということよ。でも若山さんの持ち出しリストにあるように実際にはもっと
たくさんできてるじゃないか。それは若山さんが何かしたからできてるんで、
小保方さんの論文通りにできている細胞ではキメラはできないと説明して、
しかも論文通りに実際にやってみてできなかったと報告している。

565小野小町:2018/09/11(火) 07:01:51
論文はキメラはできないと言ってるのよね。その中のグラフで6割発現しているのは
ES細胞20個分に対する比較発現量が6割、つまり12個だと言ってて、母数となる細胞数は
10万個だよということね。とても少ないと言ってるんで、とても多いと言ってるんでは
ないのよね。

566小野小町:2018/09/11(火) 07:04:49
ES細胞20個分に対する比較発現量が6割、つまり12個だと言ってて、母数となる細胞数は
10万個だよということね。

ES細胞10個分に対する比較発現量が6割、つまり6個だと言ってて、母数となる細胞数は
5万個だよということね。

567在原業平:2018/09/11(火) 07:12:38
批判は正しい理解の上に立って行わないと支離滅裂になってしまう。
Oct4遺伝子を発現していない残りの49994個の細胞はなぜ光ってるのかね
という批判に向かわないといけないよね。丹羽さんはGFPの漏れ出しという
新しい現象を発見しているが詳しくは何も調べてはいないよね。Ooboeさんたちは
漏れ出しにしてはおびただしく光ってる細胞塊の写真を持っている。
アルイミオウジ氏には自説の根拠の開示を望むよ。

568ヘーゲル:2018/09/11(火) 07:14:20
本題頼むぜ。

569カール・ヤスパース:2018/09/11(火) 07:16:12
本題、何でしたっけ?

570デラ・ストリート:2018/09/11(火) 07:27:07
数のあってないサンプルの確認よ。
コツコツやってれば段々わかってくるわ。急ぐ旅じゃなし。本物のスピン屋たちは
もうそろそろやばくなったと用心してこういう場所には出て来なくなってるわね。
第三者告発でもされたら、こんなことろに書き込んでると後でトレースされて正体
暴かれてしまうからね。今はアンチはデンデン虫たちしかいないわ。真実解明のためには
いわゆる擁護派の中での相互批判討議が必要になり始めたわね。

571ペリー・メイスン:2018/09/11(火) 07:38:42
>>
松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21  123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本

ここだったね。

572デラ・ストリート:2018/09/11(火) 07:49:17
そこはOoboeさんたちの持ち出しリスト表示では以下のようになってるところね。
>>
2014/10/21 松崎、■■ 片山 1-11,13-14,18-19,21-27 FLS,ES,TS 31 解析のためBOXごと持ち出し -80℃フリーザー
1

573デラ・ストリート:2018/09/11(火) 07:52:30
最後の1は削除願うわ。

574シャーロック・ホームズ:2018/09/11(火) 08:07:22
まず押さえて置かなければならないことは-80℃フリーザー分類になっていることだね。
そして、例の桃子本の写真のボックス内のサンプル数は76本で、木星リストには以下のごとく
分類されている。
>>
② クライオチューブ/詳細不明 計45本 Obokata RNA CTS→ESlikeもESと記載
  マイクロチューブ/FLS-○他、詳細不明 計31本 FLS→129ESと書いていた

575ドクター・ワトソン:2018/09/11(火) 08:29:29
マイクロチューブというのは小さいチューブで頭の透明な奴だね。写真で
透明感のある蓋を数えると確かに31本あるね。バラバラに入っている。
つまり<BOXごと持ち出し>というのは31本だけのBOXなんかがあってそれを
持ち出したという意味ではなくて、76本全部の入ったBOXを2014/10/21に
一度に持ち出したということだ。

576小野小町:2018/09/11(火) 08:35:17
あら、それまでは2014/6/9を主に1本ずつ選んで持ち出してたわね。当然解凍して
増殖させたら1本分は戻してるんでしょうね。一度解凍させたということは記録には残しているわよね。
で、この時はBOXごと全部持ち出したということは管理している部署からBOXごと無くなったということよね。
裏返せば管理が全部松崎さんのところに移管されたも同じね。

577在原業平:2018/09/11(火) 08:42:52
僕はどこで入手したのかを忘れてしまったんだけど、確か木星さんのところだったと
思う。開示された写真を持っている。一部はDORAさんのところでも見ている。
写真には番号が振られていて、木星リストの①②という数値と一致させている。
これは理研でリスト整備したときに撮られていて、小保方さんの内容聞き取り
以前に整理されている。このことは木星さんは聞き取り結果の入ったものと
入っていないもの両方を取り寄せてることでわかる。そして桃子の入手している
リストは小保方さんの聞き取り以前のものだ。

578小野小町:2018/09/11(火) 08:50:01
遅くとも5/14にはサンプルの写真が撮られているわね。小保方さんの聞き取りは
7/2に出社して後、自分の-30℃フリーザーの保全を頼んで以降みたいだね。
一応竹市、松崎、丹羽、片山立ち合いのリスト日付は7/19よね。桃子が
リストの写真を撮ったのはその間なのね。ただし、ボックスの写真は5/14から
理研の管理部署に存在しているのね。片山さんのところね。この写真が
桂報告以前に桃子のもとに違法流出しているのね。

579在原業平:2018/09/11(火) 09:10:01
日経サイエンスの写真も全部管理部署の撮影したものだね。5/14には撮られている。
ただし、小保方さんのフリーザー分の写真は7/19前後だ。ただし、凍結マウス写真の
Haruko分は木星さんの取り寄せ写真にはなくて、桃子本とDORAブログにある。情報違法流出は
片山さんか松崎だと考えられるが、竹市、松崎、丹羽、片山中で、<リークしない人たち>に
外れて居そうなのは松崎さんだけだと思われるけどね。というのも片山さんはコンプライアンス室長で
自分のところで作っているリストを社外流出させるなんて考えにくいんでね。

580小野小町:2018/09/11(火) 09:17:25
正式請求もできない調査中の段階で桃子本に写真が掲載されてしかも
発売は桂報告前だったというのは仮に犯人がコンプライアンス室長だったら
とんでもない話になってしまうわね。松崎さんだってGDよね。
コンプライアンス室長より地位的には上の立場よね。ただし、管理部門というのは
理事長の手足という意味では地位的上下は無関係なんでしょうけど、悪事は
行ってはいけない立場よね。

581在原業平:2018/09/11(火) 09:25:49
こういうことをしかるべき地位の人間がやるというのはとても考えにくいことで
誰かの指図がありそうでしょ。無論野依さんとか竹市さんはそんなことを指示する
訳がない。彼らは引責辞任させられているからね。指図があるとしたらもっと上なんで、
一番考えられるのは無論岸だよね。CDB解体というのはずいぶん早く方針が出されているからね。
岸の判断は石井調査をもとにしているんだ。岸は無論文科省の十手持ちだ。
予算の配分権をゆだねられている。小保方さんが犯人ということで収拾をしようと
決めたんだよ。もっと明確に短期間で犯人が分かっていればそんなことも
無かったんだろうけどね。何しろ文科省はこの事件そのものには無関係で、
要するに叩かれると埃が出てくるのを恐れてるだけなんだよな。それで早めに
手を打ったのさ。

582小野小町:2018/09/11(火) 09:28:40
それでこんなに訳の分からない報告書になってるのね。無理やりトカゲの
しっぽ切りをしたのね。

583在原業平:2018/09/11(火) 09:33:18
原因は石井調査さ。石井さんは結局ちょっと調べただけでは何があったのか
分からなかったのさ。それで論文不正というミスか未熟かわからないような
理由にしてとりあえず世間に忘れてもらいたかった。もう無しだよと。
最初から無かったことにしといてくれと。そもそもこんなこと大した問題ではない。
ただ、世間に宣伝してしてノーベル賞かなんてやっちまったからなあと。

584小野小町:2018/09/11(火) 09:34:25
でも、小保方さんは自分は大発見したと信じてるわよね。

585在原業平:2018/09/11(火) 09:40:22
そこも誤解があってね。後ろにヴァカンティが居るということも日本では
見えてないんだな。不正だなんてとんでもないと言ってるのはヴァカンティだよ。
特許申請しているんだよ。何をたわごと言ってるんだ。キメラが出来てるんだぞと。
そんな程度の不正で大発見を無しにするつもりかと。石井さんはそちらのことは
疎いわけだよ。理研の不祥事だとしか考えてない。不正があったから無しにしてねで、
終わらせたいのさ。あとは静かに研究をやり直してくれたらいいじゃないかと。

586小野小町:2018/09/11(火) 09:41:50
キメラができてるのね。

587在原業平:2018/09/11(火) 09:43:06
キメラを作ったのは若山さんで、ESだったといったのも若山さんだ。そこに
早く収集したい岸が圧力掛けてるという構図さ。

588一言居士:2018/09/11(火) 09:44:17
既存ESだという説明では誰も納得できなかったね。間違ってるからだよね。
正しかったらもうこの話は終わってるよな。

589閲覧者:2018/09/11(火) 09:50:23
若山さんの示した既存ESでないとしたら、なぜキメラができたのかに関して
誰もわからなかった。しかし、早く収集させろという圧力があって、仕方なく
既存ESでない可能性に関しては検討しないことにしたということでしょ。
だから結果間違えたんだよ。

590デラ・ストリート:2018/09/11(火) 09:53:32
収拾ね。
本題に戻ってくれるかしら。

591ペリー・メイスン:2018/09/11(火) 09:58:46
まあ、ということで31本がマイクロチューブだということは明確だということだろ。
>>
マイクロチューブ/FLS-○他、詳細不明 計31本
>>
松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21  123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本
>>
2014/10/21 松崎、■■ 片山 1-11,13-14,18-19,21-27 FLS,ES,TS 31 解析のためBOXごと持ち出し -80℃フリーザー

は、同一物だと。

592シャーロック・ホームズ:2018/09/11(火) 10:02:55
12本+9本+10本は31本だね。でも
1-11,13-14,18-19,21-27 は22本で、これは12本+10本に該当して
<FLS 1〜8、13 9本>が抜けている。しかも内容は<FLS,ES,TS>とされている。

593ドクター・ワトソン:2018/09/11(火) 10:09:02
<13-14>は<13-16>-にも見えるんだけどはっきりしない。
<FLS 1〜8、13 9本>の13はFLSは1-8しかないので、13まであるはずの
<GLS 1〜12 12本>の方の13がFLS側に誤認されていると思われる。そして
<FLS-○他、詳細不明>とあるところが後に読み取られて<FLS,ES,TS>と
されたのかもしれない。問題は松崎さんは丹羽さんの残したFLSを解析しないで
こちらのFLSを解析した理由だね。

594ドクター・ワトソン:2018/09/11(火) 10:53:31
桂報告書4Pに<NGSによる全ゲノム解析>されてAcr-CAG-GFPが出た細胞は
①FLS3
②CTS1
③FES1
④FES2
⑤ntESG1
⑥ntESG2
⑦129/GFP ES
だとされているけど、この中でBCA報告で<WGS解析>されたとされているのは①②だけで
③④はされていないね。<NGSによる全ゲノム解析>と<WGS解析>は違う意味になるのかな。

595ドクター・ワトソン:2018/09/11(火) 10:55:20
③④はされていないね。→③④⑤⑥⑦はされていないね。

596シャーロック・ホームズ:2018/09/11(火) 11:05:10
WGSはWhole Genome Sequencingだから意味だけ言うなら全ゲノム解析という
意味だ。細かな意味の違いがあるか、桂報告の本文が間違ってるんだろうね。
只。SNPs解析は全ゲノム読まないとあんな表は作れないんじゃないかな。
それだとBCA報告が間違っているか、<NGSによる全ゲノム解析>と<WGS解析>は
違う意味ということになるね。意味が違うならNGSでやっているか、もっとすごいので
やってるかの違いかな。でも、BCA報告の注には Other sublines were
confirmed by PCR and sequencing. と書かれている。

597小野小町:2018/09/11(火) 11:06:51
なんかわからん。。。

598在原業平:2018/09/11(火) 11:12:12
FLS3は
>>
丹羽 2014/4/17 5番  FLS-3 P2  2本 若山TL樹立

CTS1は
>>
丹羽 2014/6/17 11番  Call TS-1 2本 若山TL樹立 FI-SC(FGF4 induced Stem Cells)

129/GFP ES
>>
松崎 2014/6/9 95 129/GFP ES 2本

だね。

599小野小町:2018/09/11(火) 11:18:50
丹羽さんがFLS3を分析した時はGFPの染色体位置だけね。アクロシンがあると
遠藤さんが言い出したのは6/25だから松崎さんもまだアクロシンがあるとは
気づいてない時期に持ち出してるわね。丹羽さんのCTS1の解析目的は分からないわね。
ただ、若山さんの記者会見の翌日ね。

600在原業平:2018/09/11(火) 11:25:06
丹羽さんの試料は松崎さんに引き継がれているね。そして桂チームがアクロシンの
調査を始めたのは6/25の遠藤さんの発表以降だ。すると楠本さんがアップしてくれた
8/8の太田さんから理研に送られてきた液体窒素容器の中身が問題になってくるね。
これは事前のOoboeさんたちの調査結果からしてFES2とntESG2である蓋然性が高くなる。

601在原業平:2018/09/11(火) 11:29:28
③FES1 は放医研で解析したけど、アクロシンの問題はまだ出ていない。
④FES2 は8/8に太田さんが理研に送った蓋然性が高い。
⑤ntESG1 は少なくとも東北大にFES1とFES2に加えて若山さんが送っているから、若山さんが持っていた。
⑥ntESG2 は8/8に太田さんが理研に送った蓋然性が高い。

602在原業平:2018/09/11(火) 11:54:39
で、7/1着指定で太田さんはFES1、FES2、ntESG1、ntESG2のいずれかを送っているね。

603小野小町:2018/09/11(火) 12:01:04
ランチ!

昨日のバレンボイムは第一楽章だけだったから、トルコ行進曲までのやつね。
youtube.com/watch?v=QwK3NrgypJ8

604Ooboe:2018/09/11(火) 13:03:51
579業平さん

あのう
片山さんは
コンプライアンス室長ではないですよ。
安全管理室の室長さんだったんです。
現在は、移動されてます、とても誠意ある
言い方とのことです。

605名無しさん:2018/09/11(火) 21:46:30
ワウチ。明日にしよう。

606名無しさん:2018/09/11(火) 23:37:37
「Web サイトはページを表示できません」
自爆したか、アクセス拒否してるんか?
あのジジのサイト

607自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/12(水) 01:48:17
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

608地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/12(水) 07:11:16
😭 😃 😵 😒 😣 😝 😍 😆 😔 😳 😡 😱 👿 💀 👹 🐝 🌅 👰 
👩 👦 👧 🙍 🙋 🙅 👮 👪 👫 🙇 🙈 🙊 🐰 😸 🐜 💪 👍 👎 
👉 👊 👋 🙏 🙌 👏 👣 👅 💋 🐦 👻 ⛅ 💩 🌠 💚 💜 💙 💏 
💞 💓 💖 💕 🎼 🎻 🎷 🎺 🎹 🎥 🎶 🎵 🎧 🔊 📞 🔫 🚓 🍸 
☕ 🍰 🍶 🍻 📡 🔑 🌈 📖 🆖 ⏫ ⏬ ❎ 🆘 🅿 🆗 ⏪ 🔙 🔜 
💸 💐 🚨 📠 🏣 🏢 🚢 🏦 🏭 ⛵ 🚇 ⚾ ⚽ 🏈 🎿 🎆 🍀 🏊
♨ 🎲 🎌 🎳 🎢 🌁 🌟 💢 📹 📺 📱 💻 📷 💊 ⏰ ⌛ 🗻 🗾 
🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

609在原業平:2018/09/12(水) 07:20:30
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

610小野小町:2018/09/12(水) 07:22:27
お気に入りはガンバレブログで楠本さんがご質問だわ。

611在原業平:2018/09/12(水) 07:33:38
-30℃フリーザー分については我々は-80℃が終わったら検討に入る。先に楠本さんの
ご疑念に関して指摘しておくと桂報告書でAcr-CAGが出たと言ってるのは11番の
カルスキメラ子1〜9、FLS2 4N子w1〜8のDNA資料で、33番ではありませんね。

612小野小町:2018/09/12(水) 07:35:56
Ooboeさんが片山さんのこと教えてくれてるわ。

613在原業平:2018/09/12(水) 07:42:41
ああ、なんか僕は途中から混同してたね。片山さんは安全管理室の室長だったんだね。
安全管理室ってどういう部署なのかな。どうして片山さんが保全試料の立ち合い者に
なったのかな。管理者になってるということかな。僕は事件の始まりに疑念を持っててね、
そこから混同が始まったみたいだ。
>>
2014/2/13 平成 26 年 2 月 13 日、独立行政法人理化学研究所(以下、「研究所」という。) の職員らの研究論文に疑義があるとの連絡を受けた研究所の職員から、役員を通じ て監査・コンプライアンス室に相談があった。監査・コンプライアンス室長は、「科 学研究上の不正行為の防止等に関する規程(平成24年9月13日規程第61 号)」(以 下、「規程」という。)(参考資料)第 10 条第 3 項に基づき、当該相談を通報に準じ て取扱うこととし、規程第 11 条に基づき、同日より同年 2 月 17 日の間、予備調査 を実施した。   平成 26 年 2 月 20 日から同年 3 月 31 日までの間、関係資料の収集・精査及び 関係者のヒアリングを行った。

614小野小町:2018/09/12(水) 07:47:20
試料保全は一か月後ね。
>>
2014/3/15 自己点検委員会試料保全(156P) 林先生からの指示。

<平成 26 年 2 月 20 日から同年 3 月 31 日までの間、関係資料の収集・精査
及び 関係者のヒアリングを行った。>という流れからコンプライアンス室が行っていると
思っちゃったのね。

615在原業平:2018/09/12(水) 07:54:21
いや、あんまり意識してなかったな。Ooboeさんがコンプライアンス室長の
話を書いてるのを読んでるとき漠然と片山さんを思い浮かべてたかな。
気づかないうちにそうなってたね。まあ、直接管理しているのがどんな部署でも
構わないんだけど、片山さんが立ち会っているということが重要なんだな。
片山さんの立ち会ってないリストがあるよね。そして若山さんの事後MAT締結日付は
2014/4/1が最初だ。当然だけど事前に理研側と打ち合わせしているよ。それは
以下の期間中に行われているよね。
>>
規程第 11 条に基づき、同日より同年 2 月 17 日の間、予備調査 を実施した。   平成 26 年 2 月 20 日から同年 3 月 31 日までの間、関係資料の収集・精査及び 関係者のヒアリングを行った。

616在原業平:2018/09/12(水) 07:56:30
MAT→MTA

617小野小町:2018/09/12(水) 08:01:26
片山さんは2014/5/14のリストから確認者として現れるのね。その前のリストには
名前が無い。ということは途中から保全管理の責任者になったということかしら。
2,3月の予備調査とヒアリングの段階ではやはりコンプライアンス室が調査してたのかしら。

618在原業平:2018/09/12(水) 08:07:07
その件に関しては根本さんが試料の帰属に関してハーバードとの間でやり取りが
あったのではないかと推測されていたよね。試料の帰属がどこにあるのか。共同研究
協約書との関係を推測されてたはずだ。

619小野小町:2018/09/12(水) 08:09:13
今確認に行ったら、さっきまでなかった新しい記事が出てるわ。この件は
根本さんにお任せして、私たちは-30℃の検討に入りましょ。

620ヘーゲル:2018/09/12(水) 08:10:22
本題頼むぜ。

621カール・ヤスパース:2018/09/12(水) 08:11:27
本題、何でしたっけ?

622デラ・ストリート:2018/09/12(水) 08:17:17
はい、ここからでしょ。
>>
602: 在原業平 :2018/09/11(火) 11:54:39
で、7/1着指定で太田さんはFES1、FES2、ntESG1、ntESG2のいずれかを送っているね。

623ペリー・メイスン:2018/09/12(水) 08:20:23
木星さんが太田さんと山梨大若山研の両方にFES1、FES2に関して問い合わせて
確かに送った、受け取ったという回答を得て居るけど、木星さんはntESG1、ntESG2に
関しては質問の中に含めてないんだな。

624シャーロック・ホームズ:2018/09/12(水) 08:33:43
7/1着指定で太田さんはFES1、FES2を若山さんに送ったことは確かで、ntESG1、ntESG2に
関しては不明だということだな。そして若山さんは東北大に(ntES.FES1.FES2)を送っているが、
このntESがntESG1なのかntESG2なのか、あるいは別のものなのかということ、あるいは
それがどこにあったものかは不明だね。他方、理研の解析チームはFES1とntESG1とに
ついては山梨大の若山さんから受け取ったと証言していて、FES2とntESG2に関しては
どうやら今回京都大学の太田さんから直接ドライシッパーで8/8に受け取ったらしい。
さて。。。

625ドクター・ワトソン:2018/09/12(水) 08:40:53
7/1にFES1、FES2、ntESG1、ntESG2を太田さんがすべて若山さんに送っていたとしたら
若山さんは全部もってることになるんだから、理研は4つとも若山さんから受け取ったら
よかったはずだよな。

626ペリー・メイスン:2018/09/12(水) 09:05:44
いや、これは最初にFES1とntESG1を松崎さんが若山さんに電話して送ってもらってたんだよ。
それはOoboeさんたちの資料室に以下のようにある。
>>
2、提供を受けた状況の確認
平成26年7月頃に山梨大学から細胞の提供を受けたか否かについて確認したところSTAP細胞に関する研究論文に係わる調査の過程で、残存サンプルの検証を行っていたCDBの研究者が、細胞2種類の提供を受けていた。「中略」また担当研究者から若山教授に直接依頼して提供を受けており公文書による提供依頼は行わなかった。
>>
理研CDB解析担当研が若山研保管の調査サンプルを取り寄せたのはFES1とntESG1であり、どういうことなのか?FES2とntESG2は名義は示されてませんが、若山研でなく別のところから取り寄せたと、確認出所は事務局と、広報、それぞれ別々のル-トで確認しました。

627デラ・ストリート:2018/09/12(水) 09:10:17
今回後者が太田さんから直接とほぼ分かったのね。ということは松崎さんは
FES1とntESG1の分析結果を得たあと、意図的に太田さんからFES2とntESG2を
得て確認しようとしたのかしら。それとも若山さんがFES2とntESG2は持たないと
聞いたから若山さんから送ってもらわなかったのかしら?

628ペリー・メイスン:2018/09/12(水) 09:12:54
木星さんの確認でFES2に関しては若山さんは持っていることが分かってるよ。
持たないと答えることはない。だから、松崎さんは少しは中身の入れ替えを疑ったと
思うよ。だから直接太田さんに依頼した。ただ、そういう情報は子弟なんだから
若山さんには筒抜けだよな。

629ドクター・ワトソン:2018/09/12(水) 09:14:12
結果は意外なものだったな。

630シャーロック・ホームズ:2018/09/12(水) 09:18:33
若山さん経由
①FES1
②ntESG1
太田さん直
③FES2
④ntESG2

SNPs解析結果。①≠③、②=④

631ドクター・ワトソン:2018/09/12(水) 09:20:52
その上、ntESG1、G2ともに親の雌雄が論文、ラベルと逆になってた。

632一言居士:2018/09/12(水) 09:25:06
我々の推理は①≠③の原因は若山さんが①の中身を捨ててFLS3を入れたからだ。
そこは和モガさんも同じ推理だ。②=④でかつntESG1、G2ともに親の雌雄が論文、
ラベルと逆になってたのは太田さんとの結託が疑われる。

633閲覧者:2018/09/12(水) 09:38:15
太田さんの2005年論文は<Generation of Normal Progeny by Intracytoplasmic
Sperm Injection Following Grafting of Testicular Tissue from Cloned Mice
That Died Postnatally>という題で若山さんとの共著だ。ここに129B6F1マウスが出てくる。
>>
To generate 129B6F1 mice carrying the GFP transgene, female 129/Sv-ter mice were mated with male C57BL/6 GFP transgenic mice, and the offspring of these matings, which were hemizygous for the GFP transgene, were used as donors for nuclear transplantation.

ここにはG1G2という言葉は無いんだね。

634一言居士:2018/09/12(水) 09:41:21
そうだ。でもこのntESは2008年論文でG1と名付けられることになるね。

635閲覧者:2018/09/12(水) 09:47:07
太田さんの2008年論文は<Increasing the Cell Number of Host Tetraploid
Embryos Can Improve the Production of Mice Derived from Embryonic Stem
Cells>という題で、 Hiroshi Ohta Yuko Sakaide Kazuo Yamagata Teruhiko Wakayama の
4人の共著だ。その中に129B6F1G1がでてきて、この参照論文が2005年論文になっている。
>>
The 129B6F1G1 [13] and BDmt2 [14] are nuclear transfer-derived ES (ntES) cell lines [15] previously established in our laboratory using Sertoli cells of 129B6F1 background with GFP and tail-tip cells of a male BDF1 mouse as donor for nuclear transfer, respectively. Male 129B6F1 mice expressing GFP were generated by mating female 129/Sv mice with male C57BL/6 GFP transgenic mice (double-transgenic mouse line [16] constructed using pCAG-EGFP [10, 11] and Acr3-EGFP [17]).
>>
13
Ohta H, Wakayama T. Generation of normal progeny by intracytoplasmic sperm injection following grafting of testicular tissue from cloned mice that died postnatally. Biol Reprod 2005; 73:390–395.

636一言居士:2018/09/12(水) 09:52:31
2005年論文の129B6F1と2008年論文の129B6F1G1が同一のものであることは
間違いないが、でもここには129B6F1G2は出てこないよね。
他方、桂報告は以下の細胞を分析している。
*6 正式名称は、 FES1:129B6GFP1 FES♂、 FES2:129B6GFP2 FES♂、ntESG1:129B6F1G1、ntESG2: 129B6F1G2

637小野小町:2018/09/12(水) 10:02:49
そこに日経サイエンス3月号の太田さんの証言が絡んでくるのよね。太田さんは
129Terと岡部マウスとのF1を作ってntESの実験をしたと語っている。
そしてその実験が2005年の論文だということは明らかなのね。でも分析された
ntESは親の雌雄が違ってる。論文と違っているのみならず、容器のラベル記載とも
違っているのよね。

638在原業平:2018/09/12(水) 10:09:17
ntESG1の凍結日は2007/8/3、G2は2005/1/20になっているから、これが2008年論文で
G1と名付けたがためにもとのラベルにG2と加えたのではないかと推定しているんだけど
そこは明確になってないんだよな。そんなこと以前にラベルと中身の雌雄が違ってるからな。
しかも二つは若山さん経由と太田さん直の取り寄せルートに分かれている。にも
かかわらずどちらもラベルと雌雄が違っている。

639小野小町:2018/09/12(水) 10:27:37
3月号の52Pには<"容疑"の細胞は、太田氏が作成した核移植ES細胞4株と、受精卵から作ZQ
ES細胞2株>だと書かれてるけど、数があってないわね。
容疑というからにはどれもマウス背景は129B6よね。他の背景までは含めないでしょ。
核移植ES細胞4株って何と何だったのかしらね。

640デラ・ストリート:2018/09/12(水) 10:33:46
これって間抜けすぎるわよね。ラベルと中身が違っていることが分かった
というのに、どうして証拠能力を疑うという作業が抜けてしまうのかしら。
これって異常な理屈だわよね。
>>
他方、同じ Acr-GFP/CAG-GFP の挿入を持つ ES 細胞 ntESG1、および ntESG2 の X 染色体は C57BL/6 であることが判明したことから、調 査対象の STAP 幹細胞 FLS3、FI 幹細胞 CTS1 と性染色体の構成が異なるため、これらは比較解析の対照から除外された。(5P)

641ペリー・メイスン:2018/09/12(水) 10:36:13
<核移植ES細胞4株>のうちの他の2株はどうだったの? それともこの記事そのものが
嘘記事なのかな。

642ドクター・ワトソン:2018/09/12(水) 10:40:42
それとも残りの触れられていない2株はFLS3、CTS1と雌雄が一致していたのかな。
それを外したら犯罪だけど、外さなかったらどう言うことになるのかな。

643シャーロック・ホームズ:2018/09/12(水) 10:42:27
FLS3はntESだったということになるかな。あれ、これって我々のntES論に似てるな。ひひ。

644在原業平:2018/09/12(水) 10:50:55
若山さんは自分が小保方細胞核使用ntESを作ってキメラを作成したということに
気づいてほしくないから、そのように情報を流すよね。GOFのキメラに関しては
学生のntESの所為にしたした。で、FLSに関しては小保方さんの手に入りそうなものが
無かったので、太田さんの置忘れ細胞ということにしようと思いついた。その時に
できれば論文のntESではなくて、受精卵ESだということにしときたかった。

645小野小町:2018/09/12(水) 10:55:06
FES1,2は太田さんが口で言ってるだけなのよね。証拠を出してない。実験ノートを
添付しないといけないけど、これは実験目的外で技術練習的に作ったということだと
ノートは無いわよね。唯一、細胞リスト表には書いてると言ってるんで、リストで
証明できるなら提示してもらいたいわね。

646在原業平:2018/09/12(水) 10:58:07
彼が結託しているのか否かの判断はむつかしいね。Terで作ったと言ってるのと
全部持ち出したと言ってること、そしてGFPとしか書いてないと言ってることは
小保方さんに有利な証言だ。

647一言居士:2018/09/12(水) 11:01:38
事実はFES1,2ともにX1だった。ntESG1,G2ともにB6x129だった。

648閲覧者:2018/09/12(水) 11:10:55
まず最初に、太田さんの実験はTerで行われているので、仮に受精卵ESをそのころに
練習目的で作ったとしたら彼の記憶通りTerで作られてると考える方が自然だ。仮に
そうだとしたらまず若山さんはどちらも中身を捨てて、X1の受精卵ESに入れ替えてる
ことになる。その上でFES1チューブにだけFLS3を入れたことになる。

649一言居士:2018/09/12(水) 11:22:00
和モガさんはどちらにも若山さんはFLS3を入れたんだけどFES2側にもとの
FES2を残したと言ってるんだね。我々は洗浄が悪くて残ったと考えたけど。

650閲覧者:2018/09/12(水) 11:23:42
問題はntESだね。ラベルと雌雄が違うということは若山さんが雌雄の違うものを入れたと
いうことかい? 何のために?

651一言居士:2018/09/12(水) 11:25:21
こっちが聞きたいよ。
ntESG1は理研は若山さんから受け取っている。G2は太田さんから直だ。

652小野小町:2018/09/12(水) 11:27:00
ちょっと待ってよ。
FES1も理研は若山さんから受け取っている。FES2は太田さんから直だわ。

653孤舟:2018/09/12(水) 11:27:47
阿久悠から電話だ。

654小野小町:2018/09/12(水) 11:38:44
あら、いいところなのに。みなさんよく考えてね。ムキになると血圧が上がって
脳溢血になるかもよ。所詮お遊びなんだからお気楽にっ。

youtube.com/watch?v=zl3RrxLMJU4
グールドってジャズピアニストになったらよかったのにね。もっと自由に演奏できた。
左手を強調して、右手が歌いすぎるのを抑えると、モーツアルトはバッハになるのよね。
もともとの楽譜がちゃんと対位法に則ってるからよね。これはグールドの変奏曲だと
思って聞くととても独創的で楽しいわね。でもモーツアルトの曲だと思って聞かされると
台無しね。うふふふふ。

655イェイ:2018/09/12(水) 11:40:27
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656在原業平:2018/09/12(水) 14:32:38
小町ちゃん、アイスクリーム頂戴。白クマ君がいいよ。

657小野小町:2018/09/12(水) 14:52:03
太田さんはFES1もFES2もTerだと言ってて、ntESG1もG2も129/B6だと言ってるのに、
実際に分析されたFES1とFES2はX1であり、ntESG1もntESG2はB6/129だったのね。
しかも後者のラベルには129/B6と書かれていた。

658在原業平:2018/09/12(水) 14:54:34
まあ、要するに理研が解析したFES1、FES2、ntESG1、ntESG2は太田さんの作った
ものじゃないと考えるのが普通だろうね。

659小野小町:2018/09/12(水) 15:00:21
でも、桂報告書には太田さんが作ったものと書かれているわね。
>>
、STAP 幹細胞 FLS が、Acrosin プロモーター下に GFP を発現する Acr-GFP と、CAG プロモーター下に GFP を発現する CAG-GFP の共挿入を含むことが判明した後に、 過去に CDB ゲノム・リプログラミング研究チーム(以下「CDB 若山研」という)で作製さ れた Acr-GFP/CAG-GFP 共挿入 ES 細胞を取り寄せて解析したのが、下段の 4 種類の細胞で ある。(4P)

660在原業平:2018/09/12(水) 15:10:00
そうだね。桂報告が確認しているのはFES1とFES2だ。ntESG1、G2に関しては論文のであるとも何とも言ってない。
ただ <Acr-GFP/CAG-GFP 共挿入 ES 細胞を取り寄せて解析した>と言ってるだけだ。その他のことは日経サイエンスが
書いていることだね。
>>
ES 細胞 FES1 は 2005 年に当時の CDB 若山研メンバー によって樹立されたが、その後、研究に使わず、2010 年 3 月(CDB 若山研で STAP 研究 が始まる前)に転出した時に ES 細胞 FES1 の凍結保存試料を全部持ち出して CDB 若山 研には残さなかったとされている。

661小野小町:2018/09/12(水) 15:15:12
そして今回Ooboeさんたちが、桂報告の言う<取り寄せ>たという経路を以下のように
確定させたのね。
>>
若山さん経由
①FES1
②ntESG1
太田さん直
③FES2
④ntESG2

662一言居士:2018/09/12(水) 15:19:10
やっぱりグルかな。
太田さんはX1のFES2とB6/129のntESG2を理研に送っている。

663閲覧者:2018/09/12(水) 15:34:54
彼はTerで作ったと記憶してたのに彼が理研に送ったFES2はX1だった。そして
2005年の論文で作り、2008年論文ではG1と名付けた129B6F1のntESであるはずの
129B6F1G1とラベルされたチューブにB6/129の中身を入れて理研に送ってきた。
日経サイエンスに説明していたことと全く違うものを送ってきている。つまり、
物はありのままなのに、説明が嘘になってるんだな。

664シャーロック・ホームズ:2018/09/12(水) 15:40:16
太田さんがFES1をX1で作ったのにTerで作ったと記憶違いしていても変ではないんだよな。
129B6F1G1と129B6129BFG2のラベルの貼られたチューブにB6/129の細胞が入っていても変ではないよな。
人は間違いは犯すものだ。でも、それを論文と関連付けて説明しているから
嘘になるんだね。論文は129/B6だよ。中身がB6/129なら、それは論文の細胞ではない。
それを論文の細胞だと説明しているのはなぜか?

665ドクター・ワトソン:2018/09/12(水) 15:47:10
㊴129B6129BFG2のラベルの貼られたチューブにB6/129の細胞が入っていたのは
なぜですかと桂調査チームは太田さんに聞かないといけなかったよね。今からでもいいから聞いて
報告し直せ。

666シャーロック・ホームズ:2018/09/12(水) 15:51:24
㊵ついでたから、ガンバレブログにあるマウス冷凍胚って何か答えて報告し直せ。
そもそもこんな時期に太田さんに送る、もしくは送り返すサンプルなんてないはずだぞ。

667小野小町:2018/09/12(水) 15:55:28
朝確認してた時に気づいた件も検討しておきましょうかね。
>>
86: 司書 :2018/03/03(土) 20:21:52
小保方冷凍庫残存サンプルは2014年3月18日、理研神戸の安全管理室の担当者と共に、後には、サンプルリスト撮影し、そしてサンプルを解析し、桂報告書の解析を主導し、自己点検委員でもあった非対称細胞分裂松崎GDの担当者が作業しました。(広報、情報開示担当のパートナーへの回答録音有り)
多量のサンプルの保全室までの細胞運搬は大変だったことでしょう。
5月末、第三者機関解析結果と平行して、小保方氏の立ち合いもなされず、竹市所長には事後報告された松崎GDによる内部解析結果報告文書(6月2日)が有り、パートナーは保有しています。
その一部を報告します。
2018/3/3(土) 午後 3:22[ Ooboe ]返信する

668小野小町:2018/09/12(水) 15:56:22
>>
96: 司書 :2018/03/03(土) 21:09:06
NHKは6月16日若山記者会見の同じ日の夕方 〈大略〉、「小保方冷凍庫からES細胞が見つかった中身は若山解析結果と遺伝子特徴が一致。解析調査したのは、CDB研究者グル-プ」と、さも、ES細胞がこの6月時点で発見されたがごとくNHKにリ-クしたわけですが、
サンプル解析担当研究者達はすでに3月18日、保全運搬作業や3月末、4月、5月のリスト作成作業にも担当していたのです(広報確認済み)。
沢山のES細胞を運んだのですから6月になって❰見つかった❱は、若山記者会見への相乗効果を意図したものでしょう。
その遺伝子特徴が一致したとされた129╱GFP.ESラベルサンプルは6か月後2014年12月末桂調査委員会報告書によって「STAPFLSサンプルなどはES細胞に由来する」の結果を導いた大田FES1と遺伝子がほぼ一致したとされました。
2018/3/3(土) 午後 6:51[ Ooboe ]返信する

669名無しさん:2018/09/12(水) 16:03:14
こことかアルイミオウジとかキチガイだらけじゃないか。

670在原業平:2018/09/12(水) 16:04:24
<(広報、情報開示担当のパートナーへの回答録音有り)>なんだね。
ただし、<松崎GDによる内部解析結果報告文書(6月2日)>はFLS3,4とGLS1,11と
AC129-1,2だけだね。後の6種は6/9に松崎が見持ち出していて解析はまだ後になる。
<サンプル解析担当研究者達はすでに3月18日、保全運搬作業や3月末、4月、5月の
リスト作成作業にも担当していたのです(広報確認済み)。>も重要だな。

671:2018/09/12(水) 16:07:12
>>669

糞金はハヨ死ねよ。それで世界は平和になる。何も言うな。ただ死ね。
日本の心配までする必要はない。早く死ね。トットト死ね。生意気な口きくな。
シネヨ。いいな。命令だ。

672小野小町:2018/09/12(水) 16:12:19
片山さんの立ち合いのないリストの細胞の経緯が解明されないといけないね。
この2、3、4月というのが藪の中ね。4/1がMTA事後締結よね。調査はその後に始まる。
でも、その前にMTAの話し合いがあってる。そしてハーバート゛との打ち合わせね。
山梨から戻ってきていないかな。

673ふむ:2018/09/12(水) 16:14:01
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674名無しさん:2018/09/12(水) 21:35:57
〜上記の部分んは取り消し線を加え訂正しおわびします。〜

からかいデマ、ごめんなサイ。

 はよ〜大竹,間違いZもあいかわらず。

ジジ的な言い訳はわかりやすい。

675自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/13(木) 04:13:05
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

676地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/13(木) 06:59:51
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677在原業平:2018/09/13(木) 07:00:44
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

678小野小町:2018/09/13(木) 07:10:58
お気に入りは新しい情報は無いようよ。アルイミオウジさんが理研が8/7着で
太田さんにマウス凍結胚を送ったので翌日の8/8着指定で運搬用の液体窒素保管容器を
送り返しただけだとおっしゃってるわね。

679在原業平:2018/09/13(木) 07:40:53
それはちょっと考えられないんだよ。アルイミオウジさんはOoboeさんの資料館を
ちゃんと読まれてないね。Ooboeさんたちはこの問題に対してずっと会計書類の開示請求を
進めてきていて、彼らの関心は言うまでもなく、太田さんが理研にFES2とntESG2を送ったという
証拠にある。京都大の太田さんと理研との間で細胞サンプルのやり取りが頻繁に行われるということも
考えにくいんでそれを調べたらある程度確認できるはずだという見込みで開示請求されている。

680小野小町:2018/09/13(木) 07:44:02
そうね。このあたりからが直接関係している動きかしらね。
>>
44: 司書 :2018/03/03(土) 19:38:13
547 :Ooboe :2017/12/14(木) 00:29:26
分身さん
詳細は、後日に学さんところになりますが、パートナーの許可がおりました。
理研CDB解析担当研が若山研保管の調査サンプルを取り寄せたのはFES1とntESG1であり、どういうことなのか?FES2とntESG2は名義は示されてませんが、若山研でなく別のところから取り寄せたと、確認出所は事務局と、広報、それぞれ別々のル-トで確認しました。
すなわち、京都大学大田氏でしょうね。
和モガ、Tsさん、分身さん考察ならどう解釈できるのやら、、

45: 司書 :2018/03/03(土) 19:38:44
548 :Ooboe :2017/12/14(木) 00:41:50
この完全裏付けは、各機関の資料が揃えば間違いものとなるそうです。
とりあえず、この情報は間違いないとして考察してみて下さいとのことです。
完全に揃うのは、来年1月末になるだろうとのことです。すでにある1機関からは一部入手出来ています。

681名無しさん:2018/09/13(木) 07:50:45
888 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/13(木) 00:36:05.66 ID:F3UNyTgB0
楠本fbの「いいね!」リストを見ると「狂乱 覚醒 催眠 アファーメーション 大堀香奈」が出てきてわろた

682在原業平:2018/09/13(木) 07:52:25
アルイミオウジさんは遺伝子解析結果とかSTAP現象関連の新しい知見にご自分の
興味を限定されていて、事件全体の調査が疎かで、だれが犯人なんてことに
興味が無いんだね。興味のないことには触れなければいいだけなんだけど、
STAP現象は本物だという信念があって、その信念からすると、若山さんが怪しいなんて
発想自体が許せんというような気持ちになって、ついつい口を出す。口を出すのなら、
ちゃんと事件の経緯に関しても興味を持って参加してもらいたいということになるね。
この人はテラトーマの解析結果にOct4発現の一単位を指摘した人なんでね。
期待しているんだ。

683:2018/09/13(木) 07:53:44
>>681

お前は笑わんでいいから死ねばいいだけ。わかったな。ボンクラ。

684小野小町:2018/09/13(木) 07:55:39
私たちは証票の調査機関指定を心配してたけどね。
>>
69: 司書 :2018/03/03(土) 19:54:28
119: Ooboe :2017/12/24(日) 21:57:34
(2、3、4、)その他は、入手しているものも、有りますが、ある程度揃えば、お伝えしたいとのことです。
現在各機関に2014年6月と7月の会計帳簿の開示請求をしています。
各機関は、それぞれ法律に従い、開示に応じてくれているそうですが、何分大変な作業みたいで、、会計事項のなかで不要な、除外事項をパートナーは指定しているそうです。特に重要なのは、通信、配送の出入金の事項ですが、各機関によって、どの様な記載がなされているのかが今のところ分かりません、その帳簿から、必要事項の伝票を特定をします。
この確認作業は来年1月から2月まで掛かるのではとの感触だそうです。ある機関からは、必要事項帳簿A4の約30枚を纏めてくれました。
そこから伝票を特定しまして新たに、伝票だけを開示請求する流れになります。

685在原業平:2018/09/13(木) 08:04:25
証票→証憑だね。
6/25に遠藤さんがアクロシンと言い出した。そこからの話なんで6,7月を請求しているんだね。
実際、6/30発7/1着の太田さんから山梨大へのヤマト送り状は発見されたね。

686小野小町:2018/09/13(木) 08:15:14
ガンバレのところに楠本さんがアップしてくれたわね。<細胞サンプル>だった。
山梨の宛先の詳細は黒塗りされていたんだけど右側に学部の名があって消し忘れだった
ようね。この時の細胞の種類は分からないけど、事前に木星さんがFES1とFES2に関して
太田さんと山梨の両方に確認しているのね。そこに理研の情報でntESG1は若山さんから
取り寄せたと取材できているんで、G1もこの7/1に受け取っているということが、
演繹しうる。無論太田さんと若山さんに結託があれば裏でのやり取りがありうるわね。
その可能性も抑えておかないといけない。東北大に若山さんが送ったntESにはG1G2の
区別が書かれていない。これもOoboeさんたちが確認しているわ。東北大はちゃんと担当者が
若山さんからこの細胞は個人の管理下にあるものという確認をとっていることまで
回答している。この時点で若山さんと理研はMTAを締結してなかったからできたことね。

687在原業平:2018/09/13(木) 08:26:37
理研から伝票類が届いたのは3月だね。この時の書類の中に8月のもあった。請求したのは
6,7月だったとおっしゃってるんで、後に8月まで広げたか、さもなければ理研の担当者が
パートナー氏の意図を汲んで探してくれたんだろうね。
>>
131: 司書 :2018/03/07(水) 07:02:48
火曜日理研から会計伝票諸表約40枚が届いたそうです。宅配伝票もあるとのことです。
解析を担当した研究室の会計帳簿から開示請求で入手できました。
領収証や、請求書は開示請求できても伝票類は無理だろうと思ってたみたいでよかったです。
2018/3/7(水) 午前 1:39 [ Ooboe ] 返信する

おやすみなさい、今日も睡眠不足です。

688小野小町:2018/09/13(木) 08:30:23
そのあたりの経緯はよくわからないわね。
>>
166: 司書 :2018/03/15(木) 07:54:51
61: Ooboe :2018/03/14(水) 00:23:25
パートナーが理研に開示請求していましたが、調査サンプルFES1とFES2、及びntESG1とntESG2を調査時においてサンプル容器を調査の記録のため撮影していたでしょうから、その画像コピの開示を請求いたします、と。
理研回答、不開示通知。該当する文書を探索したが不存在のため。
残念!普通、公的調査であれば記録のためサンプルは撮影すべきものでしょうに。

167: 司書 :2018/03/15(木) 07:55:55
62: Ooboe :2018/03/14(水) 00:40:03
パートナーは、ならば、提供者に、返却したか?
サンプル撮影はしていないが、返却せず、現物は理研で保管しているのか?
または、破棄したのか?などを問い合わすそうです。

689在原業平:2018/09/13(木) 08:33:29
今度は京都大学からも来たね。この中に7/1着指定のヤマト送り状があったかんだろうね。
>>
169: 司書 :2018/03/18(日) 18:12:18
310: Ooboe :2018/03/18(日) 12:09:34
分身さん
京都大学から、宅配伝票などパートナーに届いたそうです。重要な、事実資料になるそうです。
あと、山梨大学、東京大学は月曜頃に揃いますので理研、京都、山梨、東京を全てを照らし合わしてから、報告したいとのことです。
それから、BCA論文プリントしてもらえた、そうです。
このBCA論文と、理研の広報のパートナーへの回答は、矛盾してます。
広報の情報提供業務は、理研としての責任ある公式なものですから、BCA論文、広報、いずれも理研の公式のものに、齟齬が存在していることになりますね。
パートナーはその矛盾をつた

690小野小町:2018/09/13(木) 08:37:50
ここはもっと突っ込まなくちゃいけなかったかもね。
>>
170: 司書 :2018/03/18(日) 18:14:40
311: Ooboe :2018/03/18(日) 12:37:44
尻切れました
パートナーはその矛盾か理研に存在することの公的な事実情報資料として、今後に担保できたことは、以後理研はパートナーに対し真摯に向き合わざるを得なくなります。
今後パートナーの問い合わせへの回答には法人文書以外の内部情報をも整合性をもって回答説明せざるを得ません。
パートナーは、FES1、2、ntESG1、2、の容器画像の開示請求しました。
不存在回答。
ならば、サンプルは廃棄されたか?返却されたか?保管されたままか?の問い合わせをすでに広報にしていましたが、その回答は、容器は保管されている、との。
パートナーの更なる質問にサンプルの中身も残っているかどうかは分かりません、使いきったかも知れませんとの回答を得ました。
パートナーは、ならばと、さらに突っこむことを止めました。
このBCA論文根拠をプリントしてから、と判断したからとのことでした。

691在原業平:2018/09/13(木) 08:43:01
サンプルの中身を使い切ったかもと答えた担当者は事務の方だと思うよ。推測で
言ってる。サンプルは解凍してまた培養して増やすからいくらでもリザーブできる。
無論その経緯は特にこんな分析で使った以上詳しく書いておかないといけない。
培養を重ねるごとに変異が入るからね。容器があるんだから、容器は容器で
写真は取ってもらえるし、中身は中身で別の容器に新たに保管され直していると思うよ。

692小野小町:2018/09/13(木) 08:46:10
で、まあ、私たちは今以下のOoboeさんの疑義を再検討しているわけだわね。
>>
196: 司書 :2018/04/08(日) 08:17:29
この取り寄せ経緯にも疑惑が存在しますが、割愛します。
京都大学、研究者から取り寄せたとされる4サンプルの内、論文研究に使用され、論文においていろいろ説明記載されたサンプルはntESG1だけです。
この論文は現京都大学の研究者が神戸理研CDB時代の若山研に所属していた2008年に2本発表されています。
さて論文では、2本とも、ntESG1サンプル(129B6F1G1)のacr.cagGFP共挿入、B6マウスは雄、♂です。
ところが桂報告書3ペ-ジ一覧表ntESG1サンプルのacr.cagGFP共挿入、B6マウスは雌、♀に逆さまです。(B6N129ter)
このことは、理研CDB解析担当部署は2008年論文に使用されたntESG1とは中身が違うサンプルをゲノム解析した結果だったことになります。
論文の方の記載ミスは、特許に係わる論文ですから、考えられませんので論文と中身が違う調査サンプルそのものが真正な調査サンプルでなかったという疑議、疑惑となります。
2018/4/8(日) 午前 2:27[ Ooboe ]返信する

693在原業平:2018/09/13(木) 08:50:20
そういうことなんだよ。アルイミオウジさんはこの経緯をほとんど知らずに
今回楠本さんがアップした8/7と8/8の送り状に関してコメントされている。無論、
可能性としては当然誰でも思うことだよね。送ったから容器を返した。でもこれらの
証憑類がいかにして何の目的で取り寄せられたかという経緯を知っていたら、
可能性の一つに過ぎないと知れるでしょ。可能性はもっと多い。

694ヘーゲル:2018/09/13(木) 08:56:51
本題頼むぜ。

695カール・ヤスパース:2018/09/13(木) 08:58:32
本題、何でしたっけ?

696デラ・ストリート:2018/09/13(木) 08:59:37
今やってることだわ。アルイミオウジさんコメントは離れてね。

697一言居士:2018/09/13(木) 09:03:58
Ooboeさんとパートナー氏には戦略があって、資料の全公開は一度にはなさらないと
おっしゃってる。だからこの二つのヤマト送り状が何であるかは通常は決まらない。
ただ、関心は太田さんがFES2とntESG2を理研に送った日にある。そしてOoboeさんたちの
関心もそうだということは明らかなのに、この二つの送り状がアップされた理由は
何だと思う?

698小野小町:2018/09/13(木) 09:07:54
👉👉👉💡🌟 Ooboeさんに聞いたらいいんだわ ❗

699シャーロック・ホームズ:2018/09/13(木) 09:10:52
何言ってんだい。我々が何のためにここにいると思ってるんだい。

700ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 09:12:12
そうだ。そうだ。頭は何のためについているんだね。

701刑事コロンボ:2018/09/13(木) 09:20:40
あ、そう、そう。ところで若山さんねえ。小保方さんが太田ESでテラトーマを
作っておきながら体細胞が切り出されていたという件、あれって、変ですよねえ。
ESを注射すると簡単に立派なテラトーマができることくらい、小保方さんは
ティシュー論文で確認済でしたよねえ。あなた、何かしなかった?
あ、いいんです、いいんです。今からカミさんと食事なんでねえ。私の
ファーストネームはカミさんしか知らないことになってるんですぜ。
え、関係ない?お呼びでなかった??? こりゃまったあ、失礼しやあした。

702在原業平:2018/09/13(木) 09:23:13
川上さん!

703川上のぼる:2018/09/13(木) 09:24:27
人生、遊びもないと退屈でなあ。

704小野小町:2018/09/13(木) 09:36:37
遊びすぎて腰痛のくせに。何言ってんのよ。下手の考え休むに似たりよ。
考えなくていいから聞いてこいというのが口癖だった人たちがどうしたことかしらね。

705ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 09:43:06
だからね。待っても来ない人は忙しいんだよ。何も忙しいのはアルイミオウジさんだけでない。
Ooboeさんだって、ひょっとしたら我々だって、忙しいのかもしれない。

706デラ・ストリート:2018/09/13(木) 09:51:38
ふう。

youtube.com/watch?v=uOSfZnd3wv8

707川上昇:2018/09/13(木) 09:56:04
君たち何してんの?

708ドクター・ワトソン:2018/09/13(木) 09:57:41
我々もたまった用事が多くてな。のぼるさん。

709孤舟:2018/09/13(木) 10:04:50
釣台の材木の調達がな。

710シャーロック・ホームズ:2018/09/13(木) 10:12:23
なんなら下手の考えでもないことはないんだぜ。

711ドクター・ワトソン:2018/09/13(木) 10:34:09
まあ、楠本さんがまず手持ち試料のうちの分からないものを問い合わせのために
アップしたと。

712シャーロック・ホームズ:2018/09/13(木) 10:36:55
そこに既に二つの問題があるんだよな。
①今試料のやり取りの問題が関心の中心にあるときに、まず当のものらしきものを
出さずに違うものから出すか。
②それはともかく出されているものに理研から太田さんへの流れがあること自体の重大性。

713ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 11:02:01
6月と7月とたぶん8月までの証憑をもらっている。その中で太田さんとのやり取りなんて
知れた数しかない無いはずだ。そして太田さんから送られてきたことは既に
パートナー氏が理研の後方に確認しているから、太田さんから送られてきた送り状の
控えが8/8着分しかないりなら、それがFES2とntESG2ということにしかならない。
でもそれしかなかったということはまだ明らかにはされていない。したがって
アルイミオウジ氏の常識的な推測は否定されてはいないということだね。

714ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 11:03:37
後方→広報
ないりなら→ないのなら

715ドクター・ワトソン:2018/09/13(木) 11:06:55
それとは別に理研から太田さんへのマウス凍結胚の送付があるということ自体が
大問題だということね。太田さんは解凍して株分けした分を各所に送っているはずなのに、
理研から太田さんへの細胞株の返却は無いはずなんだね。返却してもらう必要はない。
ではこれは何なのか。

716ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 11:22:07
太田さんはFES1とFES2は若山さんに送っている。若山さんは東北大にFES1とFES2と
とntESなるものを送っている。理研は若山さんからFES1とntESG1を送ってもらっている。
そして理研は太田さんからFES2とntESG2を送ってもらっている。仮にこれが
8/8着のドライシッパーの中身だったとしたら、その前日に送られたマウス凍結胚は
若山さんが理研に送ったntESG1である可能性もあるということだね。つまり、
7/1に太田さんが若山さんにFES1とFES2としか送っていなかったとしたら、太田さんは
若山さんが東北大と理研に送ったntESG1の何たるかが分からない可能性がある。
太田さんはそれをラベルとチューブごと一度送ってくれと依頼したかもしれない。そして
確認の後にFES2と送られてきたntESG1そして、確認後にこれだというntESG2を
一緒に返送したのかもしれない。

717シャーロック・ホームズ:2018/09/13(木) 11:24:34
それはかなり考えにくい可能性だけど、無いわけではないかな。
どこまで結託しているのか、それとも別々に行動しているのか。
なにしろ子弟だからね。

718小野小町:2018/09/13(木) 11:51:26
Ooboeさんに確認した方が早いのよね。別にまだ送り状があるのなら、それはまた別件ということになる可能性もあるわ。
それはそれで問題であるにせよね。

youtube.com/watch?v=UxIPVAPRBi4

719イェイ:2018/09/13(木) 11:52:10
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720名無しさん:2018/09/13(木) 12:36:00
ねえ、あれは端的な間違いなんだから素直に認めようよ、Tsさん。
こういう死ぬほど下らない波及効果を生むし……こういうのしか生まないし。
ttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4904271/
↑丹羽さんの論文はここで読める。

内部標準コントロールの概念も役割も、したらば歌劇団の頭の中には微塵もないことをこの内容では暴露してしてしまっている(肝心の図3のbは内部標準遺伝子としてGapdhではなくGnb2l1を用いている)。……言われると流石に思い出して……でも、修正不能でしょう?、これじゃ(爆。
大体、Ooboeさんに刺激され、散々、援護射撃をしていたではないか?。
ESC比で1割はOct4が発現しているって……それも母数は5万で考えないとならないと急に言い出した(それは別なのだろうか?、同じ図表なのに(^^A……)。
そもそもこの5万て何?。もしかするとシャーレ(正確には窪みのあるウェルプレートという特殊な形状のもの)に播いた細胞数を言っているのだろうか?。普通は母数を変えても、10個中に6個なら(着目しているのは遺伝子の発現度)、5万に0.6を掛けて3万になる筈。……普通は(爆。
例えば、次のような無理矢理解釈も成り立つ。
ATP1〜14の<単一の細胞凝集塊>は、全て偶然にもたった一つの細胞塊しか出来なかった、と。
平均して20〜30個の細胞凝集塊が観察されたとあるにも拘らず、偶々解析に提供されたこの14個の細胞塊は、(一つのウェル当たり)5万個の細胞を播いた14個のウェルの各々に、偶々、たった一つだけしか出現しなかった細胞塊である、と。……全ては偶々なのだと。
可能性としてはあり得るけれど、確率論的に難しいだろうなと普通は考える。従って、普通は、採用しないけれどね?……Tsさん!、採用するの?。大迷惑な援護射撃ではないの?。間違った!。

先日の論文に明確には、細胞凝集塊を拾ってqPCRに掛けたとは書かれていなければ、頑張ってこの説で自己正当化できるかもしれない。
たったの……「細胞凝集塊を拾って選別してqPCRに掛ける」というそれだけのアイデアだけが、この二つ(6割Oct4を発現する丹羽さんのFig3.bと先日の論文のBCA論文と全く変わらない低発現度の図表)を分けているのだろうか?。
実は細かい計算をしてみようと思ったのだけれど……時間が取れない。
今日はこれまで。……本当はこの数倍は書いている。大抵そうだよ。ま、いいんだけどさ。

721名無しさん:2018/09/13(木) 12:42:01
下らない反論をしそうだからちょっとだけ。
事前の釘差し。
「細胞塊を形成していない細胞」は、STAP化に失敗している細胞でそんな細胞を含めて、「STAP化に一定の成功をしていると認められる細胞の多能性マーカー遺伝子発現度の定量」を正しく行える筈はない。
何故、自己矛盾にならないのか?。
が、少しして分かった。
反論のための反論をするから、こうなる。
Oct4-GFPのリークに関わる「Fig3.a」の話とごっちゃにしているのだ(爆。
勿論、それ以前にTsさんの援護射撃であるのは言うまでもない(迷惑してないの?、Tsさん!)。

722:2018/09/13(木) 13:57:48
べたべた貼るな。間抜け。アルイミオウジ氏のツイッターは毎朝チェックしてる。
早く死ね。お前は不要。アルイミオウジ氏は必要なのだよ。彼が我々のことを
どう思っているかなんてことには一切興味ない。事件の解明のために聞くべきことが
あれば聞くだけさ。個人的な付き合いもない人間に興味はないんだ。何度言っても
分からん馬鹿だな。コピペチョンはとっとと死ね。この便所の落書き板を抒情詩で汚すな。

723イェイ:2018/09/13(木) 13:58:55
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724在原業平:2018/09/13(木) 14:00:29
小町ちゃん、コーヒーね。幾分涼しくなったらやっぱりホットコーヒーだね。

725小野小町:2018/09/13(木) 14:08:38
さて、Ooboe さんから返事がないから、クロネコ問題はペンディングしといて、
持ち出しリストの続きね。アルイミオウジさんが何か書いてるみたいだけど
明日ね。何事も順番よ。

726孤舟:2018/09/13(木) 14:11:21
釣台の材木は釣場に持ち込んどいたぜ。さてさて思い通りに獲物をおびき寄せられるかな。

727在原業平:2018/09/13(木) 14:18:02
今、腰が痛いから、あとで何日かかけてゆっくり作る。リストはここから始まって
クロネコヤマトでペンディングされた。
>>
591: ペリー・メイスン :2018/09/11(火) 09:58:46
まあ、ということで31本がマイクロチューブだということは明確だということだろ。
>>
マイクロチューブ/FLS-○他、詳細不明 計31本
>>
松崎 2014/10/21 122 GLS 1〜12 12本
松崎 2014/10/21  123 FLS 1〜8、13 9本
松崎 2014/10/21 124 リンパRNA、他RNAと記載、GLSDNA、129?? 10本 31本
>>
2014/10/21 松崎、■■ 片山 1-11,13-14,18-19,21-27 FLS,ES,TS 31 解析のためBOXごと持ち出し -80℃フリーザー

は、同一物だと。

728デラ・ストリート:2018/09/13(木) 14:29:35
では、いよいよ-30℃フリーザーの番ね。これは木星リスト番号がないんだけど、
ほぼ写真番号と一致しているわね。
楠本さんこちらに問い合わせされてるけど以前の写真11が残されたままになってるわね。
9/2のキメラは写真33だわ。それは今からの検討よ。

729閲覧者:2018/09/13(木) 14:37:45
-30℃フリーザーは小保方さんが7/2に出社して後に自分のフリーザーの保全を
自ら竹市さんに申し出たものだね。リストの日付は2014/7/19で、立会人は
竹市、松崎、丹羽、片山だね。リストは片山さんの部署でひとつづつピックアップ
したもので、その完成日付が4/19ということだろうね。小保方さんからの
内容の確認はその後ではないかな。はっきりはしないけどね。-30℃フリーザーの
内容確認と-80℃フリーザーの内容確認は同時期だと思うけどね。その時に
最初の二枚のリストに片山さんの立ち合いが無い。それが今根本さんがOoboeさんに
問い合わされている経緯の問題なんだ。

730閲覧者:2018/09/13(木) 14:39:13
その完成日付が4/19→その完成日付が7/19

731一言居士:2018/09/13(木) 14:47:39
理研のものでない細胞は勝手に分析できないからね。理研の中で行われている
共同研究に関しては、基本、理研が中心になる。理研の資材を使ってるからね。
逆に理研が中心にならないならそんな共同研究はするなということだ。その意味で
残されたサンプルはすべて理研の所有になるはずなんだけど、ここに若山さんが
最初に小保方さんの研究に協力してやった時の共同研究協約書の問題があるんだ。
彼女は東京女子医大の学生だったから、その意味で研修生受け入れなら簡単だったんだけど
細胞がハーバート留学時に発見されていてハーバードに帰属するものだったんで、ただ
キメラを作ってみてあげるということですら、共同研究協約にせざるを得なかった。
共同研究協約なら理研中心に約定するが、若山さんはただキメラを作ってみせて
やっただけだった。そんなことは外国の権利のついた研究細胞に関してやってあげては
いけないことだったんだよ。

732小野小町:2018/09/13(木) 14:52:44
日本の学生だったらよかったのね。その時受け入れ約定があって発見の権利は
全て理研にあることになるのね。彼女は事実日本人で、東京女子医大の
学生だったから、理研の研修生として受け入れられることには問題はなかったのよね。
日本の教育機関は基本日本人のためにあるんだわね。ところが彼女がキメラを作ってみせて
ほしかったのはハーバードの細胞だったのね。

733閲覧者:2018/09/13(木) 14:56:33
そうなんだよ。理研の研修規定と同様にハーバードにも留学生受け入れ規定がある。
留学中に発見した研究の権利はハーバードにあるという契約書にサインしているはずだよ。
だからヴァカンティがそれをことあるごとに主張しているんだ。

734小野小町:2018/09/13(木) 14:58:45
小保方さんは博士号論文を書くためにキメラ作成結果を知りたかったのね。

735閲覧者:2018/09/13(木) 15:03:15
彼女はティシュー論文に掲載されたことによっていわば博士号請求論文を
提出してよいという資格を得て、その論文は別にティシュー誌論文のテーマを離れても
よかったんだ。現に、常田は指導教授としての自分の専門の中で書くように
勧めている。でも小保方さんはこのテーマを追いたかったんだ。博士号の問題では
なかったのさ。それでどうしようかということになって、若山さんに
作ってみてもらおうということになった。ここに若山さんの悲劇があつたわけだ。

736小野小町:2018/09/13(木) 15:06:02
引き受けなきゃよかったのにね。何事も無かったはずね。

737閲覧者:2018/09/13(木) 15:10:10
若山さんは軽い気持ちだよ。相手は日本人の女子学生だ。研修生の受け入れには
慣れてるよ。ところが最初から小島、大和、常田がついてきてる。小島のバックには
ヴァカンティが居る。ヴァカンティは最初から共同研究の形以外にキメラを
作ってもらう手段がないとわかってた。だから共同研究になった。ところが
若山さんはただキメラを作ってみて結果を見せてやるだけだと軽く受け取ってる。
そもそもキメラなんかできゃしないよと思ってるんだよ。

738小野小町:2018/09/13(木) 15:14:38
形だけ共同研究で、本当は研修生の教育だとおもってるのね。そもそもそんなことで
キメラが出来てたまるかと。でも何事もやってみなくちゃ分からないことだし、
日本人の研究者を育てるためにキメラを作ってあげるくらいの好意はあるのよね。
もともと親切でやさしい人なんでしょ。それが本当にできてこんな大事件に
なるかもなんて思ってないことだし。

739閲覧者:2018/09/13(木) 15:16:08
現に博論のための実験ではキメラはできてない。それで終わってたらまだ彼の悲劇は
無かったんだ。

740小野小町:2018/09/13(木) 15:19:21
小保方さんはヴァカンティのポスドクになったわね。そして赴任直前に
震災があって渡米できなくなった。震災が無かったら若山さんの悲劇は無かったわね。
彼女は渡米してあちらで研究を進めていた。

741一言居士:2018/09/13(木) 15:24:29
そうだね。小保方さんは渡米できない期間の間だけ若山さんのところで
実験させてほしかった。特にGOFマウスを使った酸浴のアイディアを持っていたからだね。
それはとてもイレギュラーな受け入れなんだけど、若山さんは西川さんに頼んで
そういう一時預かりを許可してもらってる。そしてその預かっている間に、
彼女が欲しくなったんだね。それは彼女自身の能力が目当てか、彼女の細胞が
目当てかわからないんだけど、ともあれ、自分のラボに入れと彼女を誘った。
その時には西川さんに相談して待遇条件まで示している。

742小野小町:2018/09/13(木) 15:29:33
そこは縁のいたずらじゃなくて、自らの意思が、自分の人生の岐路を選んだのよね。
そして、ヴァカンティに断られて、もう一度共同研究協約書の締結となったのね。
そのとき、若山さんの気持ちの中は相変わらず最初の協約時と同じ、ただ手伝って
上げるという意識しかない協約なのね。ただし、今回は以前と違って、言い訳しないと
いけないくらい、小保方さんは米国利害に取り込まれている人だったのね。若山さんは
まだ安易だった。それを後に岸にこっぴどく怒られたわけね。

743孤舟:2018/09/13(木) 15:38:52
いくら国際化したとは言え、いくら敗戦によって米国経済圏に取り込まれている
とはいえ、いくら学者の世界がワールドワイドだとは言え、国境はあるんだぜ。
オッペンハイマーが原爆ができたよと日本に通知でもしてくれたかね。李が産業
スパイで無いと疑ったことがあるかい。小保方さんがヴァカンティのポスドクに
なっているという認識があったら日本人の税金によって運営されている理研で
彼女の研究を手伝ってはいけないと気づけるはずだよね。第一回目の協約書、
第二回目の協約書の開示が望まれるよね。根本さんがOoboe さんに依頼されて
いることの趣旨は明確でしょ。

744閲覧者:2018/09/13(木) 15:41:08
ヴァカンティはスフィア細胞から作られたものはすべてハーバードの帰属だと
主張した可能性があるということだね。それは所詮協約書を読まないとわからないことだ。

745一言居士:2018/09/13(木) 15:46:32
根本さんが疑義しているのはそれがハーバードとの間で決まるまで解析にはいれなかったのではないか
ということだね。ただ、それがそうであるかどうかはまた別問題だよ。現に小保方さんはかなり後になってからだけど
自分の-30℃フリーザーの保全を申し出た。無論バカンティの許可がある。これは小保方さん自身は既に
理研の職員になってるんだけど中にある細胞はまだハーバードの協約下にあるかもしれないものが
含まれていることは確かなんでね。ただ、この時期になるともはや、捏造疑義が強まってるからね。
背に腹変えられない状況になってる。いずれにせよ、協約書の文面はとても重要な情報だよ。

746在原業平:2018/09/13(木) 15:56:29
そのー30℃フリーザーで最初にサンプルが解析のために持ち出されたのは8/8だ。
>>
2014/8/8 松崎 片山 写真11 木星リスト番号11 カルスキメラ子1〜9 9本
2014/8/8 松崎 片山 写真6  木星リスト番号6  BOX全て 35本
2014/8/8 松崎 片山 写真7  木星リスト番号7  STAP DNA 1〜3 3本

747閲覧者:2018/09/13(木) 16:03:41
楠本さんのために注しておくと無論ここにあるBOXは石川さんのあの写真とは違う。
あれは-80℃フリーザー分です。
それからリストのショウケース以下の四行はまだ不明です。

748一言居士:2018/09/13(木) 16:17:28
写真11の<カルスキメラ子1〜9>は桂報告書に記載されている分析で、DNA資料だ。
そのことは本文に書かれている。キメラそのものではない。
写真6も同じくDNA資料と本文に書かれている。青文字は■■氏となってるが
EBがあるので寺下さんではないかな。小保方さんは若山さんが作ったもので、
STAPキメラだと思う、不安と言ってる。STAPキメラかSTAP幹細胞キメラかが不安だったと
思われるね。黒文字、緑文字ともに小保方さんの記載だけど、本文で調査の結果
ラボのだれかが作ったサンプルだとわかっていて、若山さんの研究ノートからは
FLSだとされている。

749在原業平:2018/09/13(木) 16:21:46
最後が大問題なんだよね。これってSTAP細胞のDNAだ。これを持ち出しておきながら
桂報告書は結果を何も書いてない。写真11と6は無論アクロシンが出た。でも、ここに
小保方さんの作ったSTAP細胞のDNAがあって、持ち出して調べたはずなのに
結果の記載がない。

750小野小町:2018/09/13(木) 16:28:45
木星リスト表示では以下ね。
>>
7番 STAP 8? DNA1〜3,ほか 11本 青BOX STAPと余った細胞のDNA
growth factor,DNA精製試薬類

751在原業平:2018/09/13(木) 16:36:33
我々はntES論だからね。若山さんはいろんなマウスを渡しているが必ずしも
帰ってきたSTAP細胞を使っているかどうかは分からないと考えている。でも
ここに小保方さんが渡されたマウスから作られたSTAP細胞のDNA資料を保存していた。
これは
①GOFマウス
②129B6CAGホモ
③129B6Acr-CAG
のすべてもしくはどれかであった可能性が高い。我々は無論FLSは
③をつかった前年のキメラ成功時のntESだと思ってる。この時には
まだ隠蔽工作は無いはずなので、最初と同じように③を渡していると
思うけどな。ただ①だけであった可能性もある。それからアクロシンが出ただけでは
太田ESだということもできる。いずれにせよ、彼らは結果を発表していない。
マウスは①と③で

752在原業平:2018/09/13(木) 16:40:38
マウスは①と③で→削除

753デラ・ストリート:2018/09/13(木) 16:59:15
先に進むわよ。次は9/2持ち出し分ね。
>>
2014/9/2 松崎 片山 写真26 SKIN 11/22,せきつい,はい 11/22 3枚 
2014/9/2 松崎 片山 写真27 Liver 11/20P 1/10 11/20 ET 1枚
2014/9/2 松崎 片山 写真33 カルスキメラ 1枚

754ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 17:09:17
全部、組織(PFA)分類されている中のものだね。PFAってパラフォルムアルデヒドで
いわゆるホルマリン固定液だね。小保方さんが固定液の中にあると言ったものと同じ
保存形態だね。木星リストにはSKINに関しては<マウスの腹の毛の少ない部分>とある。

755在原業平:2018/09/13(木) 17:33:21
これは何か全く分からないね。数値が日付なのかどうかも分からない。写真27は
そもそも1枚だからね。日付でPのつくのも意味が分からないし、ETってEmbryo Trasferなのなら
これは小保方さんはできないから寺下さんなのかな。写真26に関しては小保方さんが
注記しているから小保方さん作成とするとこの11/25は2011年はあり得ないから
2012年か2013年しかない。普通のマウスの組織を調べても意味がないから、キメラの組織だと
思うんだけど、2013年にやれるとしたら凍結キメラだろうね。若山さんは既にいないからね。
2012年の11月は彼女は渡米している。ただ、日付かどうかが分からない。

756小野小町:2018/09/13(木) 17:50:54
ただ、桂チームは解析しているにも関わらず結果を示していないのね。都合の悪いものを
隠したと思われちゃうわよね。

757デラ・ストリート:2018/09/13(木) 17:58:23
-30℃フリーザー最後の持ち出し日は10/2ね。
>>
2014/10/2 松崎 ■■ 写真10 Callus 2本

758ペリー・メイスン:2018/09/13(木) 18:04:12
これは木星リストにSTAPキメラという小保方さんの聞き取り証言があって、
保存形態は<ビニール袋→プラスチックケース>とある。
キメラの凍結したものではないかな。

これも分析結果の報告が無い。

759デラ・ストリート:2018/09/13(木) 18:09:17
で最後の4行。謎のショーケースね。

760小野小町:2018/09/13(木) 18:14:49
これも結局は-30℃フリーザー分ではあるらしいんだけど、いろいろと
変なところがあるわね。でもそろそろ虎の門ニューズを見る時間よん。
んじゃね。

youtube.com/watch?v=WqawqSF4xs8

761イェイ:2018/09/13(木) 18:15:30
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762名無しさん:2018/09/13(木) 22:37:28
消される前に

[ 大保方さん ] 2018/9/13(木) 午後 9:55
DVDーRの購入記録をいくら出しても、それに記録されたSTAP研究データ
の実在の照明にはならない。
それを理解できていないのが、FBに伝票画像を必死こいて貼る楠本とか言う奴w

763Ooboe:2018/09/13(木) 22:58:30
鉄さん、お願い
762に、肘鉄ね

764Ooboe:2018/09/13(木) 23:11:41
したらぱ分身さんの皆様

いろいろご要望ありがとうございます
しかし、パートナの本業、職人の仕事を含め
多忙で、すぐご要望に答えれないようです。
でも、ハーバードとの約定文書開示請求は
したいとのことです。ただ保管期間の超過で
不存在のため不開示となるのでは?ですが
ダメ元でする予定とのことです。

765芭蕉:2018/09/13(木) 23:46:37
誰も反対派を納得させる証拠を見つけ出せていないということか
キメラマウスを作れないと万人を信用させることはできないみたいだな
本当にできてるならもう作れてるはず
本当にはできていなかったのなら真犯人の逃げ得ということか
悲しいね

766Ooboe:2018/09/14(金) 00:14:05
765
芭蕉殿

こちらでは
場所をわきまえつ

気を効かせ 渋き一句 添なはれ

767名無しさん:2018/09/14(金) 01:00:17
ゲノム決定するには、リードが少なすぎる。それは、解析者も解ってるだろうに。

768自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/14(金) 02:14:53
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

769名無しさん:2018/09/14(金) 04:29:52
>>762

消される前にというのは本人かいな。DVDーRの譬えは間違ってるな。あえて言えば
材料のプラスティックがハーバードの帰属という話をしているのさ。我々のスフィア細胞を
使って作られたキメラや幹細胞の帰属は我々にあるとハーヴァードが協約規定していないか
ということを論じているんだ。根本さんの書いていることが読めてないレヴェルで参入するのは
無理だな。

770名無しさん:2018/09/14(金) 04:45:33
>>765
誰も反対派を納得させる証拠を見つけ出せていないということか
(既存ESコンタミであったという桂報告の結論が全く証明できてないと欠陥が暴露されてるんだよ。全然理解できてないね。そもそも反対派って何だい。意味フ。)
キメラマウスを作れないと万人を信用させることはできないみたいだな
(作れないからこそキメラマウスは若山さんのフェイクだったとここでは主張されているんだぜ。理解できてないな。キメラマウス作って見せる責任は小保方さんにはない。)
本当にできてるならもう作れてるはず
(だからできないということは丹羽さんが証明している。細胞はできた。キメラはできてないということで、若山さんが犯人だとここでは結論されている。ユノー?)
本当にはできていなかったのなら真犯人の逃げ得ということか 悲しいね
(若山さんは何も得してないぜ。どこでもある程度のパワハラだな。やいやい騒ぐほどのことじゃない。でも桂報告の非論理は世界に発信されているので日本国の名誉のために取り下げさせる。それから公務員法違反していた犯罪者は捕まえさせる。)

771名無しさん:2018/09/14(金) 04:46:41
>>767

誰もそんなこと言ってるやつ居ないぞ。片言でわかったようなこと言うなよ。

772地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/14(金) 04:48:34
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773在原業平:2018/09/14(金) 04:50:06
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

774小野小町:2018/09/14(金) 04:52:50
お気に入りはDORAさんがチャンコロの馬鹿さ加減を揶揄されてるわ。

775在原業平:2018/09/14(金) 05:00:42
対ロシアの問題もそうだけど安倍さんは世界の進むべき方向に沿って外交しているだけだ。
我々が思うようなことは当然官邸も思う。ただ、我々は思うことを言ってるだけだけど、
政治家は目的整合的に行動する。アメリカは世界を作り替えようとしている。
第三次大戦でもあって、またもう一度世界を焼け野原にするのなら、それなりの外交になるが、
これだけの世界にとっての国富が積みあがった状態でさらなる発展を目指したい国際財閥は
世界の政治を変えようとしていて、今チャンコロと北チョンはつぶされることに決まってる。
安倍さんはその目的にそって外交しているだけで、拉致被害者の問題とか、
シナの財政逼迫なんて個別問題に囚われているわけではない。大きな問題を解決すると
世界が変わる。中国共産党は無くなるんだ。基本的にはすべてはそれからの話さ。

776小野小町:2018/09/14(金) 05:04:34
Ooboe さんがお見えよ。

777在原業平:2018/09/14(金) 05:17:10
契約書の保存期間は永続契約でないものは任意だけど、大企業では10年以上だ。
一応民事訴訟案件に備えて時効期限以上には保管している筈だ。理化学研究所は
一流法人だよ。中小零細企業ではない。
我々は何にも急いでいない。急ぐと棺桶が近づいてくるだけだ。急がないといけないのは
ジョセフだよ。ジョセフ、ジョセフ。ウェディングの日取りはいつなのよ。

778小野小町:2018/09/14(金) 05:18:36
懐かしい時代ね。アルイミオウジさんが元気回復みたいよ。

779在原業平:2018/09/14(金) 05:26:20
あ、そうそう。言い忘れてたけど。我々がOoboeさんの返事を待っていたのは
契約書の件だけじゃないよ。送り状はまだあるのかということさ。でも戦略も
あることだしな。

アルイミオウジさんは元気回復されたのはいいが相変わらず毒づく習慣はそのままだね。ははは。
我々もちょっと間違えたな。ずいぶん以前読んだから5X10の五乗は間違えた。
でも、我々の問いの趣旨は変わらないよ。丹羽論文のどこが間違っているのか
お答えにならないとね。対数グラフの解説なんか不要だよ。すでに我々はこの件に関しては
論じてるよな。だれでも参加できるように論文の翻訳作業も終わらせてここに保管してある。

780小野小町:2018/09/14(金) 05:31:18
頓珍漢なところをスクショして脊椎反射なさっても、事態は進まないわね。私たちの
考察は延々続いているからそれを確認して私たちを理解なさる必要はないわね。
私たちへの頓珍漢な反論の形でなくて、丹羽論文に反論して欲しいんだわよね。

781在原業平:2018/09/14(金) 05:48:07
Ooboe さんたちは自家蛍光でない、大量のOct4-GFP発現細胞の写真を入手されている。
自家蛍光でなくGFPが大量に発現しているのは事実だ。しかし、結果的にGFPの発現量と
Oct4蛋白質の発現量は比例してないというのが丹羽論文だ。まあ、5X10の五乗は取り消しても
その中から20から30個のクラスターが残る。これに関するGFPの発見には丹羽さんは
詳しく触れていないが、大事なのはマーカー蛋白の発現で、それに対応しているはずの
GFPの発現ではない。だからGFPの発現にはこだわらないで、その残った細胞塊の中にどれだけ
本物のOct4蛋白質が発現しているかを問うたんでしょ。

782小野小町:2018/09/14(金) 05:55:11
細胞塊の中にはおよそ1000個の細胞があるが、その中に数個Oct4蛋白を発現している
細胞塊が、19%程度あるということね。
>>
Of cell aggregates derived from liver cells treated with ATP, 19% expressed the amount of Oct3/4 comparable to ES cells (Fig. 3c). These data suggest that some proportion of cells in the aggregates express pluripotency-associated genes at comparable levels to those of ES cells.

783在原業平:2018/09/14(金) 06:14:55
20個から30個というのは把握しにくいから間を撮って25個だとしよう。
一つの細胞塊は1000個の細胞で構成されているとしよう。
すると25000個の細胞がまず母数ということになる。ここはいいよね。
次に25個の細胞塊の中で19%の細胞塊がそこそこのOct4蛋白質を発現しているとしているから、
その細胞塊の数は5個だ。
更にその5個の細胞塊のうち一つの細胞塊の中にES10個分の発現量と比較して
Oct4蛋白質を平均6割程度発現している細胞があると言ってる。10個分の6割というのは6個だ。
5つの細胞塊がすべて6個発現してたら総数は30個だ。含有量は母数に対して0.12%だね。
これでナイフ切り分けしてあんなにたくさんのキメラができるかという問題だ。

784小野小町:2018/09/14(金) 06:30:06
アルイミオウジさん、例えばArticle Extended Data Figure 7-bの129/Sv x B6GFPを
御覧なさいよ。96の2Nキメラ胚に対して20匹のキメラが出来ている。達成率21%よ。
Oct4蛋白質を発現している細胞は切り分けられている細胞塊の中に0.12%しか含まれて
いないのよ。これが可能になるには丹羽さんの作れた細胞の175倍の量が必要ということだわ。
丹羽さんは小保方さんの175分の1しか再現できなかったの?それとも小保方さんの細胞は
少しは丹羽さんより多くできたかもしれないけどとても175倍も作れなかった以上、
若山さんは違う方法でキメラを作ったのかしら?どちら?

785ヘーゲル:2018/09/14(金) 06:33:18
本題頼むぜ。

786カール・ヤスパース:2018/09/14(金) 06:34:24
本題、何でしたっけ?

787デラ・ストリート:2018/09/14(金) 06:42:33
ショーケースよ。

788ペリー・メイスン:2018/09/14(金) 06:48:16
我々は門外漢なんで、この業界での用語は分からないね。以前フリーザー内の
個人別のブースと言ったら、ブース?と聞き返されたな。はは。大きさの感覚が
違ってるのか、そもそも小分けにセパレートされてる場所をなんというのか知らないね。
このショーケースも商品の陳列だなを真っ先に思いついちゃうからな。でもどうやら
中身はやはり-30℃フリーザーの中の話みたいなんだよな。すると中がよく見えると
いう意味での透明のケースのことかな。

789デラ・ストリート:2018/09/14(金) 06:59:16
そう単純に推測できないのは中身の数が違ってるんで、別に取り出した先にショーケースが
あるのかと疑義されるのね。とりあえず、まずは10/29分からね。
>>
2014/10/29 松崎 ■■ 片山 写真20  スライド一式  6枚 解析のため一式持ち出し ショーケース
2014/10/29 松崎 ■■ 片山 写真23  スライド一式 11枚 解析のため一式持ち出し ショーケース 
2014/10/29 松崎 ■■ 片山 写真52,53 パラフィンブロック、テラトーマ1ひか CD45カルステラトーマ 解析のため2個持ち出し

790ペリー・メイスン:2018/09/14(金) 07:20:45
写真20と写真23は木星リストの20番と23番に対応している。どちらもスライドガラスだ。
でも、木星リストの23番は10枚だ。
>>
20番 STAP用コントロール GFP-ESキメラ RED:FFP Brown:PanCK,FI-SC Brown:PanCK,FI-SC Brown:CK8,good CK8 6枚 テラトーマ:この時は随分大きくなった
23番 good 31,GSRES GFP CD34,CD45 カルステラトーマlike,STAP-1 CD45 Tuj1,CD31+GFP mouse Rabbit,6 weeks+PGA 12/27移植 Haruko,STAP-1 CD45 AFP 10枚

791一言居士:2018/09/14(金) 07:36:29
枚数は文字の区切りがよくわからなくてもともとの数値が間違ってるのかな。
分からない。ただ写真52,53は木星理科と番号とは一致していない。-30℃フリーザーの
木星リストナンバーは言うまでもなく1〜38番までだ。で、ここでおかしいのが
この写真52,53の中身だ。<パラフィンブロック>と<テラトーマ1ひか CD45カルステラトーマ>の
2個なんでしょ。これって写真23番の中にあるものなんだけど、どうして同日に二度持ち出せるのかな。

792一言居士:2018/09/14(金) 07:37:37
木星理科と番号→木星リスト番号

793閲覧者:2018/09/14(金) 07:42:02
ははは、Ts.Markerさんの疑義に戻ったね。
>>
1)残存試料の同定 Article Fig.2e と Extended Data Fig.4a-c に提示された STAP テラトーマの全ての画 像は、CDB に残されていたテラトーマのスライドグラス標本「6weeks+PGA 12/27 移植 Haruko」から得られたものである。このスライドグラスの試料は、小保方研に保存され ていたパラフィンブロックの形態の比較から、「CD45 カルス-テラトーマ」と記されたパ ラフィンブロックより採取されたことが判明した。

794一言居士:2018/09/14(金) 07:47:01
<CD45 カルステラトーマlike>と<6weeks+PGA 12/27 移植 Haruko>のスライドグラスは
木星リストの23番に存在しているが、持ち出しリストの<パラフィンブロック>と
<テラトーマ1ひか CD45カルステラトーマ>は木星リストにないし、桂報告書にある
<小保方研に保存され ていたパラフィンブロック>も木星リストには存在していない。

795デラ・ストリート:2018/09/14(金) 08:06:23
先に最後の持ち出しである11/4分を見た方がよさそうね。
>>
2014/11/4 松崎 片山 写真47、52〜54 バラフィンブロック 9個 解析のため9個持ち出し

796デラ・ストリート:2018/09/14(金) 08:17:28
内容は以下に並べるわ。
>>
①10m GOF muscle
②テラトーマ2
③テラトーマ3
④cont Uteres 7.5
⑤Testis テラトーマ CD45 カルス
⑥cont Uteres 7.5
⑦control SKIN
⑧SOSO たいばん カルス
⑨ATCS たいばん good

797Ooboe:2018/09/14(金) 08:27:12
779業平さん

それ、もう少しお待ち下さいませ。🙊🙏🙇

798小野小町:2018/09/14(金) 08:47:26
あら、Ooboe さん、了解だわ。

youtube.com/watch?v=Fe75gtLm9LQ

799ペリー・メイスン:2018/09/14(金) 08:52:03
まず誰でも気づけることから行こうかな。写真番号がかぶってるよな。
>>
2014/10/29 松崎 ■■ 片山 写真52,53 パラフィンブロック、テラトーマ1ひか CD45カルステラトーマ 解析のため2個持ち出し
>>
2014/11/4 松崎 片山 写真47、52〜54 バラフィンブロック 9個 解析のため9個持ち出し

800デラ・ストリート:2018/09/14(金) 08:57:06
前者は2個なんだから52番と53番なのね。後者は9個が47番、52番、53番、54番の4つに分けられている。
>>
47番
①10m GOF muscle
②テラトーマ2
③テラトーマ3
52番
④cont Uteres 7.5
53番
⑤Testis テラトーマ CD45 カルス
54番
⑥cont Uteres 7.5
⑦control SKIN
⑧SOSO たいばん カルス
⑨ATCS たいばん good

801在原業平:2018/09/14(金) 09:01:49
困ったな。これってひょっとして-30℃フリーザーのリストって38番で終わってないんじゃないか。
僕のデータ収集ミスかな。もう一枚あったのを見逃してるくさい。確か木星ブログだったよな。
ちと、休憩。

802在原業平:2018/09/14(金) 09:37:40
有志の会の2016/7/10の記事だ。これは若山さんの血液の問題に関して貼り付け
られたものだから後ろがまだありそうだ。僕は持ってない。

803一言居士:2018/09/14(金) 10:14:55
これは恐らく木星さん以外には誰も持っていないだろうね。DORAさんとの関係は
分からないが、共有されているのなら公開してほしいね。それとも誰か公開されたものを
持ってるのかな。

木星さんはここにまで当時関心が行ってないから公表しないのか。それとも
一枚とり忘れているのか、理研が隠したか。わからない。

804閲覧者:2018/09/14(金) 10:18:54
Ooboeさんのパートナー氏が取り寄せたリストは他の関連からして全部木星リストと
番号が一致しているから、38番の先があると考えるのが自然だね。楠本さんは
持っているのかな。どこの誰だかわからない閲覧者からの質問です。これっていいね。

805シャーロック・ホームズ:2018/09/14(金) 10:30:04
とりあえず無いものはしょうがない。38番の先まであると仮定しよう。多分
それで正しいはずだ。

これで今までとても疑義していた謎がひとつ解けたね。桂報告書のスライドに
パラフィンブロック「CD45カルステラトーマ」というのがある。これは木星リストの
23番のCD45 カルステラトーマlikeとは違うということだ。そもそもこれはスライドグラスだからね。
変だなとは思っていた。

806ドクター・ワトソン:2018/09/14(金) 10:39:37
このlikeという文字がついているのは小保方さんがテラトーマを作るときに足場を使ったという意味で
STAP幹細胞やFI-SCのテラトーマとは違うということになるんで、今まで理研はわざとこのlikeという
文字を外して小保方さんがGOFマウスでテラトーマを作った可能性を隠そうとしていたと邪推してたな。
ところが、写真53番の<パラフィンブロック CD45カルステラトーマ>は、<⑤Testis テラトーマ CD45 カルス>と
同じものだとわかった。これと12/27Harukoが比較されているんだ。

807小野小町:2018/09/14(金) 10:44:34
精巣で作られたテラトーマだったのね。Ts.Marker さんが成形したにせよ、形が違いすぎると
疑義されていたところね。でも一方で実験ノートでは小保方さんは精巣にも注射してるわね。
>>
12/27 入 荷 (6W)
右カット   No.2 testis、左あし、右かた
左カット3つ No.3 testis、左かた
     2つ No.4 testis、右あし
12/27に10の5乗ずつ移植(ハートマーク)

808在原業平:2018/09/14(金) 10:56:01
まず今は見れなくなっているがNHKの例の番組でこの実験ノート部分が写されていて
小町ちゃんの今あげた記述はノートの右側に罫線付きの部分があってそこに
書き込まれていたんだ。そして左側に以下の記述があった。
>>
テラトーマ解析について
(マウスの絵)
カルス大量移植
No.2が一番大きなマウス
テラトーマ PFA固定
薄切の後、染色

809小野小町:2018/09/14(金) 11:08:37
そうね。そして大きなマウスは実は大きなテラトーマと書かれていることが
弁護士の記述で分かったのね。テラトの文字がマウスに見えてた。そして
画面をストップモーションしてよく見ると<ーマ>の部分が隠れていて、<ー>の
一部が点のようにはみ出していて、この罫線部分は別の紙が後から貼られたのだと
分かったのね。この罫線つきの紙は12/27に入 荷したマウスの箱か何かに
貼られていたものにメモ書きしていたものを後からノートに貼ったのね。

810在原業平:2018/09/14(金) 11:12:39
そういうことだ。つまり彼女は6 weeks+PGA 12/27移植 Harukoとガラススライドに
記載しているようにPGA、つまりヴァカンティ足場を使って埋納したと同時に精巣への
注射も行っているんだ。そこまでは間違いない。

811一言居士:2018/09/14(金) 11:28:59
彼女はグラススライドにPGAと書いてるよね。つまり皮下埋納分だね。でも
松崎が分析したのは<⑤Testis テラトーマ CD45 カルス>だ。同じものであるはずはないんだけどな。
Ts.Markerブログの2017/4/8分の特にBCA報告のDAPI染色との比較だね。

812閲覧者:2018/09/14(金) 11:30:35
松崎はTestisのテラトーマに体細胞切り出しがあると言ってるんだな。

813一言居士:2018/09/14(金) 11:32:21
そもそもこんなに簡単にテラトーマができるはずはないんだ。小保方さんは
いぶかったと思うよ。若山さんはソート前の幹細胞をすべての個所に注射している。

814在原業平:2018/09/14(金) 11:33:39
桂報告はTestisのものだということを一言も言ってない。トンデモ無いぜ。

815小野小町:2018/09/14(金) 11:39:05
Ooboe さん、あなた、-30℃の39番以下のリストをお持ち?

ランチよ。
youtube.com/watch?v=fyulQKB3ykc

816イェイ:2018/09/14(金) 11:39:37
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817Ooboe:2018/09/14(金) 13:44:41
815小町さん👰
私、木星さんリストは、リスト全部揃っている
ものと思ってましたが、38番までだったんですね

パートナ入手リストには55番までありますし、
このー30度リスト1〜55の画像も
あります。

818Ooboe:2018/09/14(金) 13:53:12
パートナは昨夜、たまたま楠本さんに
木星さんリストについて問い合わせたところ全部upする話しになったそうです。

819名無しさん:2018/09/14(金) 17:34:58
900 名前:名無しゲノムのクローンさん 2018/09/14(金) 16:29:06.68 ID:oyXf160h0
「事件の発生自体が疑わしい」という地検の発言、代理人が捏造もしくは改ざんして公表していたのか。
マスコミが、代理人の言葉が事実かどうか地検に確認してから記事にすべきだったね。

代理人も小保方も、地検や警察との密室での話を利用しているんだな。
笹井さんの遺書についての警察の話や地検でのヒッポさんの話も、かなり疑わしい。

きっと地検や警察からは、心証悪い奴らと思われているよね

820Ooboe:2018/09/14(金) 18:56:05
819名無し君

アンチゃん達こそ、こんなところまで覗きに
来てからに、
いつまでも気になるのね、その気持ち分かるわよ
でも
アンチゃん達の存在そのものが
心証悪〜〜〜いの!

821名無しさん:2018/09/14(金) 19:42:28
Ooboeさん

品の無さが木星そっくりだね

822Ooboe:2018/09/14(金) 20:29:52
821名無し君

やっと、やっと、私が、木星さんでないのが理解できたみたいですね。
あのね、木星さんは純粋な方よ
心臓に硬毛♒がある私などと揶揄するのはやめて
くださいな🆖

823地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/15(土) 05:38:03
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824在原業平:2018/09/15(土) 05:39:13
モーンン、小町ちゃん。コーヒーね。

825小野小町:2018/09/15(土) 05:45:56
お気に入りは根本さんのところでOoboeさんと楠本さんがリストをアップしてくれる
お話ね。ありがたいわね。

826閲覧者:2018/09/15(土) 06:04:23
僕は他のコメント欄には書き込まないよ。僕はずっと以前に和モガさんブログの
コメント欄に書き込んで以来他所にはでかけない。それと僕は以前に一研究者ブログと
有志の会でアク禁受けてる。一研究者はスピン屋の巣窟だったんで最後のあたりで
カマトトかなぐり捨てて言いたいこと言ってたらさすがにブログ主に追い出された。
救う会は木星さんが誰かに運営を任せているらしくて、管理人に誤解を受けたみたいだったね。
あそこがアク禁でなかったら木星さん本人にリスト公開を頼もうかと思ってたくらいで
依頼書き込みをOoboeさんに頼もうかと思ったくらいだった。

827小野小町:2018/09/15(土) 06:07:49
今日は他のことは後にしてアルイミオウジさんとの問題を解決しないといけないんでしょ。

828在原業平:2018/09/15(土) 06:13:43
彼が片言でなくやっとかなり長く話してくれたんで分かった。彼は丹羽さんの
論文のFigure 3-bの<cell aggregates>を細胞数10個の塊だと思ってる。

829小野小町:2018/09/15(土) 06:20:03
ああ、以下のやつね。
>>
ATP0-1〜5
ATP10-1〜14
ES 10 cells

コントロールは10個だとわかりきってるけど他はどうだとあなたは思ってたの?

830在原業平:2018/09/15(土) 06:22:23
僕はティシュー論文からスフィア塊の細胞数はおよそ1000個だと思ってたこともあって、
これをずっと約1000個の塊だと思ってたし、今もそうではないかと思ってる。

831小野小町:2018/09/15(土) 06:24:04
あら、10個だと思ってるのと1000個だと思ってるのでは天地の違いね。
一体どちららが正しいの?

832在原業平:2018/09/15(土) 06:25:50
僕は迂闊だったんだけどとても大事な一行を読み過ごしていた。

833小野小町:2018/09/15(土) 06:27:11
あら、あなたあれを全文日本語に翻訳したんでしょ。翻訳って一行ずつ読むものじゃない。
読み飛ばせないでしょ。

834翻訳機:2018/09/15(土) 06:28:06
あれは僕が翻訳したもので、在原業平様ではない。

835司書:2018/09/15(土) 06:29:08
校閲したのは私です。

836在原業平:2018/09/15(土) 06:32:20
翻訳作業とは無関係に僕が読み過ごしたんだ。スフィア塊は1000個という思い込みがずっと
頭の中を占めてたんだ。本文中に

Since the cell aggregates consist of ~10 cells, such expression level indicated possible existence of the cell(s) expressing pluripotency-associated genes at the equivalent level to that in ES cells.


とある。

837翻訳機:2018/09/15(土) 06:39:32
あれ、翻訳は以下になってるぜ。
>>
細胞凝集塊は10個以上の細胞からなるため、そのような発現レベルは、多能性関連遺伝子を発現する細胞がES細胞と同等のレベルで存在する可能性があることを示した。

今もう一度機会にかけたら以下のようにでたよ。
>>
細胞凝集物は約10個の細胞からなるため、そのような発現レベルは、多能性関連遺伝子を発現する細胞がES細胞と同等のレベルで存在する可能性があることを示した。

838司書:2018/09/15(土) 06:41:49
すまん、僕は無意識に変なので読み替えて校閲してしまってるらしい。というのも
後の話とうまく繋がらない無いんだよな。

839小野小町:2018/09/15(土) 06:43:55
<〜10 cells>って、通常はどういう意味になるの?

840在原業平:2018/09/15(土) 06:45:03
0〜10、つまり最大10個を意味するのが普通じゃないかな。

841小野小町:2018/09/15(土) 06:47:44
でも、ESは10個ね。10個ずつを比べるのなら10個ずつを切り取ってくればいいのに
0から10で、最大10って意味が変ね。

842在原業平:2018/09/15(土) 06:50:41
僕はこの論文は事前に最後まで読んで大意をつかんでるからね。後ろの方に
こういう文章がある。
>>
Discussion

In the present study, we investigated the properties of cell aggregates obtained by culture of liver cells transiently treated with low-pH stimulus, which was performed by the group directed by the author. We initially followed the protocol described in the original paper[1] with the detail description in protocol exchange where HCl was applied to achieve low-pH condition. However, we merely obtained the cell aggregates expressing the pluripotency makers as described in this report even when it was combined with the culture in medium containing Fgf2, which was not described in the original protocol but subsequently suggested by the authors. However, when we used ATP instead of HCl, also based on a suggestion by the authors, a few cells in a subset of cell aggregates expressed the pluripotency marker Oct3/4 at levels comparable to those in ES cells that were reproducibly detected by QPCR (Fig. 3c) and immunostaining (Fig. 4b). However, the frequency was very low; 5 × 10<to the power of 5> liver cells yielded only ~30 cell aggregates, in which about 20% of the cell aggregates contained 1–2 Oct3/4 positive cells, indicating a frequency per seeded liver cell of 0.0012–0.0024%. Moreover, the pluripotency of such cells was not confirmed by chimera formation assay, and they did not give rise to any stem cell lines. We thus conclude that such cell aggregates do not fulfill the definition for STAP cells proposed in the original studies.

843翻訳機:2018/09/15(土) 06:52:19
ここの翻訳は問題なかったろ?
>>
討論

本研究では、我々は、著者が指導したグループによって低pH刺激で一過的に処理した肝細胞の培養により得られた細胞凝集体の性質調査した。我々は当初、低pH条件を達成するために塩酸が適用されたプロトコルイクスチェンジの詳細な記述のある元の論文[1]に記載されたプロトコルに従った。しかしながら、我々は、元のプロトコルには記載されていないが、後に著者らの示唆を受けてFgf2を含む培地で培養した場合ですら、単に多能性マーカーを発現する細胞凝集体を取得しただけであった。しかし、同様に著者らの示唆に基づいて、塩酸の代わりにATPを使用した場合、細胞凝集体の一つのサブセットの中のいくつかの細胞は、再現性良くQPCR(図3c)と免疫染色(図4b)によって検出された、ES細胞レベルに匹敵する、多能性マーカーOct3 / 4を発現した。しかし、その頻度は非常に低く、 5×10の5乗個の肝臓細胞はわずか最大30個の細胞凝集体を産生するのみで、そのうちの約20%の細胞凝集体が1から2 個のOct3 / 4陽性細胞を含むのみで、播種肝細胞あたり0.0012から0.0024%の頻度であった。さらに、このような細胞の多能性はキメラ形成実験によって確認されず、いかなる幹細胞株も生じなかった。したがって、我々はこのような細胞凝集体が元の研究で提示されたSTAP細胞の定義を満たしていないと結論する。

844在原業平:2018/09/15(土) 06:57:09
アルイミオウジ氏は逆にこの部分の理解に苦しんでるよね。ここは何度も繰り返すよ。
まず500,000個の酸浴細胞が準備されたんでしょ。そしてその中で30個のスフィア塊が
生き残った。いいかい、この細胞塊の一つ一つは〜10個の細胞で構成されているのかい?

845小野小町:2018/09/15(土) 07:01:57
相沢さんの論文の写真とかHPの写真でも細胞塊の構成細胞数は1000個前後よね。
10個なんてことはない。もしそういう単位にするのならスフィアを10個づつに
切り分けた場合だけよ。ここの文章からは自然に30程度の細胞塊が生き残ったということよ。

846在原業平:2018/09/15(土) 07:04:34
そこんとこを押さえて置いて、それとは直接は関係ないんだけど、30個のスフィア塊の
20%にOct4蛋白質発現細胞があるんでしょ。20%って何個なの?

847在原業平:2018/09/15(土) 07:05:14
そこんとこを押さえて置いて、それとは直接は関係ないんだけど、30個のスフィア塊の
20%にOct4蛋白質発現細胞があるんでしょ。20%って何個なの?

848小野小町:2018/09/15(土) 07:06:04
6個よ。

849在原業平:2018/09/15(土) 07:07:05
残りの24個のスフィア塊は生き残ったただの体細胞なんだね。

850小野小町:2018/09/15(土) 07:07:49
そうよ。

851在原業平:2018/09/15(土) 07:09:46
これもこの問題とは直接関係しないんだけど、その残りの細胞も自家蛍光でなく
緑色蛍光しているということはOoboeさんたちの写真を見てわかってるね。

852小野小町:2018/09/15(土) 07:10:39
ああ、そうね。その問題もあるのよね。

853在原業平:2018/09/15(土) 07:15:18
我々がアルイミオウジさんを呼び戻しているのは本当はその問題を考えてもらいたいからでしょ。
それを忘れないでよ。でも今はbグラフの問題だ。
で30個の細胞塊のうちの6個がOct4蛋白質を発現している細胞を1個か2個含んでいる。これは細胞塊の
構成細胞数が、1000個だろうと10個だろうと無関係だね。一体全体、OCT4蛋白発現細胞は全部で
何個あるんだい?

854小野小町:2018/09/15(土) 07:17:46
算数ね。1個なら6個、2個なら12個。つまり6個から12個だわ。

855在原業平:2018/09/15(土) 07:19:31
それって間違いないかい。500,000個の中に6個から12個しかないと丹羽さんは
ほんとにそういってるの?

856小野小町:2018/09/15(土) 07:26:07
6を500,000で割ると0.000012だわ。
12を5000,000で割ると0.000024だわ。

857在原業平:2018/09/15(土) 07:27:19
パーセントで表示すると100書ければいいよね。
0.0012%から0.0024%になる。

858小野小町:2018/09/15(土) 07:29:01
<播種肝細胞あたり0.0012から0.0024%の頻度であった。>と確かに書かれているわ。

859在原業平:2018/09/15(土) 07:30:27
そういう結論を読んでいる状態でさっきの英文に戻ってごらん。

860翻訳機:2018/09/15(土) 07:33:01
これかい。
>>
Since the cell aggregates consist of ~10 cells, such expression level indicated possible existence of the cell(s) expressing pluripotency-associated genes at the equivalent level to that in ES cells.

細胞凝集物は約10個の細胞からなるため、そのような発現レベルは、多能性関連遺伝子を発現する細胞がES細胞と同等のレベルで存在する可能性があることを示した。

861小野小町:2018/09/15(土) 07:38:45
これって〜1000 Cells の誤植じゃないの?

862在原業平:2018/09/15(土) 07:40:57
もしくは〜10の右肩に小さな3が落ちてる。もしくは論文をダウンロードしたときに
脱落したかだね。そこの個所をもう少し広げて読んでみたらどうだい。

863司書:2018/09/15(土) 07:43:14
(英文)
We next performed qPCR on individual cell aggregates isolated from culture. Aggregates were selected and RNA samples were prepared separately. These RNAs were reverse-transcribed and qPCR was performed. We found that some aggregates expressed a comparable amount—more than 10% of the expression level in ES cells—of pluripotency-associated genes, including Oct3/4. Since the cell aggregates consist of ~10 cells, such expression level indicated possible existence of the cell(s) expressing pluripotency-associated genes at the equivalent level to that in ES cells. Klf4 expression was detected in all samples, which may reflect its expression in liver cells, and thus serves as a positive control in this assay. Of cell aggregates derived from liver cells treated with ATP, 19% expressed the amount of Oct3/4 comparable to ES cells (Fig. 3c). These data suggest that some proportion of cells in the aggregates express pluripotency-associated genes at comparable levels to those of ES cells.

864翻訳機:2018/09/15(土) 07:45:34
次に培養物から単離された個々の細胞凝集塊についてqPCRを行った。凝集塊を選択し、RNA試料を別々に調製した。これらのRNAを逆転写し、qPCRを行った。我々は、いくつかの凝集塊が、ES細胞の発現レベルの10%以上の、Oct3 / 4を含む多能性関連遺伝子の、比較可能な量を発現することを見出した (Fig. 3b)。細胞凝集塊は最大10の3乗個の細胞からなるため、そのような発現レベルは、多能性関連遺伝子を発現する細胞がES細胞と同等のレベルで存在する可能性があることを示した。 Klf4発現は全てのサンプルにおいて検出されたが、それは肝細胞におけるその発現を反映している可能性がある、したがって、この実験において陽性コントロールとして使える。 ATP処理した肝細胞由来細胞凝集塊のうち、19%はES細胞に匹敵するOct3 / 4の量を示した(Fig. 3c)。これらのデータは、凝集塊中のある割合の細胞が多能性関連遺伝子をES細胞のレベルに匹敵するレベルで発現している。ことを示唆している。

865在原業平:2018/09/15(土) 07:55:03
それからグラフは対数表示になってる。アルイミオウジさんは6割程度と言ってたけど
そんなにあると12個をオーバーする。あの縦軸の0.1から1の間の刻みは下の4段階を
縮小してあてはめればいい。0.1の線は無論1個分の発現量だ。では0.1と1の中間あたりは
何個かというと、2個目です。3/4くらいのところが3個目。それで全部入ってるでしょ。
全部で9個程度です。一つの塊は〜1000個が正しい。アルイミオウジ氏の苦闘はこれで
終わったはずだ。正しく理解されたら、この丹羽論文のどこが間違っているから、
本当はSTAP細胞は論文通りにあったのだという批判考察をご開示願いたい。

866小野小町:2018/09/15(土) 08:33:26
なんか5割線が変ね。1/2のところが1/10ではないのかな。つまり0.2の場所よね。
3/4のところが3個目で、7/8のところが4個目で、15/16のところが5個目だと、

867ヘーゲル:2018/09/15(土) 08:36:57
本題頼むぜ。

868カール・ヤスパース:2018/09/15(土) 08:37:40
本題、何でしたっけ?

869デラ・ストリート:2018/09/15(土) 08:49:34
-30℃フリーザーリストが出てくるまで待たないといけないけど、ここからもう一度ね。
>>
47番
①10m GOF muscle
②テラトーマ2
③テラトーマ3
52番
④cont Uteres 7.5
53番
⑤Testis テラトーマ CD45 カルス
54番
⑥cont Uteres 7.5
⑦control SKIN
⑧SOSO たいばん カルス
⑨ATCS たいばん good

870ペリー・メイスン:2018/09/15(土) 09:25:11
contはcontrolの略だと思う。UteresはUterusと書かれているのを僕の目が悪いか
Uterusの複数形のUteriもしくはUterusesの後者をUteresと書き間違えたか、複数形が
頭にあってUterusを書き間違えているかのどれかかな。いずれにせよ子宮のことなんで
胎盤胎児を子宮ごと取り出したものだろうね。ただ、その7.5日胚がcontとされているが
何の子宮かは分からないね。goodとSOSOは分からない。どちらも通常の意味では
ないんじゃないかな。good31というのもある。

871デラ・ストリート:2018/09/15(土) 09:27:32
で、とりあえず飛び込みの仕事は終了したから、いよいよ和モガツイッターの
遺伝子解析に戻るんだったわよね。

872孤舟:2018/09/15(土) 09:35:54
ボランティアの時間だ。

873いけね、忘れてた:2018/09/15(土) 09:36:34
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874Ooboe:2018/09/15(土) 10:21:28
パートナから

最近のアルイミオウジさんのコメントは
示唆深いと思う、とのことで
閲覧を進められました。

まだまだ解明されていない複雑系としての
未知なる細胞集団の振る舞いについての視点
が大切とアルイミオウジさんは強調なさってます
この示唆から
私は、「あの日」の小保方さんがもっとも
研究したかった、たくさんのテーマを連想し思いを馳せました。
胞膜損傷、ミトコンドリア、ATP晒し、
核にではなく細胞質の働きに鍵があるのでは?
などなど、

875Ooboe:2018/09/15(土) 10:47:53
さらなる、これらのテーマの研究を再開して欲しいと、私はますます願っています。
その為の一歩として
桂報告書の白紙撤回を実現したいものです。
また
たとえ、撤回出来なくとも、広く国民に
いい加減な報告書であったとの
認知を定着させたいと思います。
今回ある有力なメディアの方との話しが
もし、順調に進展すればと期待しています。

私は、おおざっぱながら、なんとか皆様を
追いかけてきましたが
したらぱ分身さん達からは、パートナも、
その考察過程からたくさんのヒントを
いただいて開示請求できたと感謝しています。
こんどupされるリストからまた何か
見えてくれば良いですね!

876オウ、イェイ:2018/09/15(土) 12:49:03
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877在原業平:2018/09/15(土) 17:12:27
小町ちゃん、ジンライムね。

878在原業平:2018/09/15(土) 17:13:03
小町ちゃん、ジンライムね。

879小野小町:2018/09/15(土) 17:15:31
わお、いきなりダブリね。Ooboeさんから桂報告書の問題点の整理を願うとのことよ。

880在原業平:2018/09/15(土) 17:23:32
そうだね。人に頼み事ばっかりして自分の割り当て仕事に怠惰ではいけないね。
頑張りまッス。
僕は桂報告書の訂正とともに、早稲田大学の博士号取り消し判断に関しても
再考願いたいね。判断の間違いを指摘したい。無論法的な活動はしないけどね。
学問の府として自分の行ったことが恥ずかしくないかと自問を促したいのは、
研究機関ともあろうものが、論理的思考の出来ていない報告書を世界に公言して
恥ずかしくないかと自問してもらいたいのと同じだ。

881小野小町:2018/09/15(土) 17:37:57
楠本さん、さっそく貼っていただいてるわね。

882在原業平:2018/09/15(土) 17:46:46
即実行の人だね。仕事の早い方みたいだね。見たけど字が小さくて拡大すると
文字がつぶれて見えないんだ。なにかやり方があるのかな。なにしろこっちは
そちら方面に疎くて。-30℃フリーザーの39番から55番の場所だけでいいんだけどね。
あとは救う会ブログにある。
それと今全部か否かわからないけど、今の分は7/19の小保方さんの聞き取り後の
最終リストではない。この経緯はDORAさんのブログにある。木星さんは彼の
アドヴァイスに従って最終リストを取り寄せておられる。DORA氏も取り寄せられているんではないかな。

883在原業平:2018/09/15(土) 17:47:22
即実行の人だね。仕事の早い方みたいだね。見たけど字が小さくて拡大すると
文字がつぶれて見えないんだ。なにかやり方があるのかな。なにしろこっちは
そちら方面に疎くて。-30℃フリーザーの39番から55番の場所だけでいいんだけどね。
あとは救う会ブログにある。
それと今全部か否かわからないけど、今の分は7/19の小保方さんの聞き取り後の
最終リストではない。この経緯はDORAさんのブログにある。木星さんは彼の
アドヴァイスに従って最終リストを取り寄せておられる。DORA氏も取り寄せられているんではないかな。

884在原業平:2018/09/15(土) 17:48:04
即実行の人だね。仕事の早い方みたいだね。見たけど字が小さくて拡大すると
文字がつぶれて見えないんだ。なにかやり方があるのかな。なにしろこっちは
そちら方面に疎くて。-30℃フリーザーの39番から55番の場所だけでいいんだけどね。
あとは救う会ブログにある。
それと今全部か否かわからないけど、今の分は7/19の小保方さんの聞き取り後の
最終リストではない。この経緯はDORAさんのブログにある。木星さんは彼の
アドヴァイスに従って最終リストを取り寄せておられる。DORA氏も取り寄せられているんではないかな。

885小野小町:2018/09/15(土) 17:53:52
あら、PCが裏で更新やってるみたいね。動きが変だわ。
小保方さんが何か書いてたら、just.so,soやVery goodなのか、それとも試薬の
固有名詞の類なのかわかるかしらね。

886在原業平:2018/09/15(土) 18:07:03
木星さんは二種類貼ってるんだけど、Ooboeさんたちのリストはそれとも違う。一枚目に
日付が見えるね。よく読み取れないけど。
DORAさんの聞き取りによると理研は三回リストを整備し直している。今楠本さんが
貼り付けてくれているのは2度目の分みたいだね。このあたり3回分全部ほしいところで、
DORAさんと木星さんは三種類ともお持ちだと思うけどね。根本さんが
もっとも知りたがっておられることの一つじゃないかな。我々は当面三度目の
奴の39番から55番を見たいんだけどね。それは前回の分析のための持ち出しリストとの
照合のためだ。

887小野小町:2018/09/15(土) 18:10:42
まだ昨日の今日だわ。急ぐと棺桶が近づいてくるんでしょ。

888在原業平:2018/09/15(土) 18:13:01
もはや時はなかるべし。我々は何ひとつ急ぐべき用件を持ってない。

889Ooboe:2018/09/15(土) 20:19:27
楠本さんの説明がないので
分かりにくかったですね。
楠本さんがUpされたのは、
木星さんリストの補完Upではなくて
出し入れ記録詳細資料です。

木星さんリストのNo38からの資料やその画像は
パトナが今日楠本さんに送付しましたので
来週になると思います。

890自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/15(土) 23:06:36
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!

891地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう:2018/09/16(日) 07:15:46
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892在原業平:2018/09/16(日) 08:03:48
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。How's your business going?

893小野小町:2018/09/16(日) 08:06:07
あら、そうねえ。
Not much.

I don’t know when they’re going to die.
I just know they’re going to die.

894在原業平:2018/09/16(日) 08:08:59
ひひひ、釣り場に蚊取り線香は必需品だよ。

895小野小町:2018/09/16(日) 08:10:50
お気に入りはDORAさんがマニアについて語られているわ。

896在原業平:2018/09/16(日) 08:14:08
竹田恒泰さんと有本香さんがいいハンコをファンにもらってるらしいね。

897小野小町:2018/09/16(日) 08:16:14
学さんはため息さんとのバトルを延々お楽しみね。お医者ってそんなに暇だったかしら。

898在原業平:2018/09/16(日) 08:21:55
医者は親の死に目にも会えないくらい忙しい仕事だよ。ストレスが多いから、
抒情詩の交感がリラックスできるいい薬になる。
我々が解が見つからなくてイライラの募るときマンジルチョンを罵倒すると
精神の平衡を保てるのと同じだ。

899小野小町:2018/09/16(日) 08:23:31
楠本さんがくっきりと見える画像をアップし直されたわね。

900在原業平:2018/09/16(日) 08:30:59
うん、はっきり見えたよ。
55番 CD45 カルス-テラトーマ 
とあるね。Testis分とは違う。でも、またまた
スライドは「CD45 カルステラトーマ」 でハイフォンが無いという微妙さだね。

901小野小町:2018/09/16(日) 08:34:01
utevesとuteresと二つ見えるわね。どうやらリストを作った人が見えたとおりに
書いているらしいわね。

902在原業平:2018/09/16(日) 08:37:51
小保方さんはuterusの複数形を間違えて覚えているくさいな。uteresだと思ってる。
正しくはuterusesだからこのリストを作った人が意味が分からないのでそのまま見えた
通りに書きとってるようだね。それでrがvになってるのがある。

903小野小町:2018/09/16(日) 08:43:56
これって、持ち出しリストの詳細なのね。Ooboeさんが教えてくれてるわね。

904在原業平:2018/09/16(日) 08:55:11
待てば海路の日和あり。
でも先走って気になることを書いておくと、<ACTS たいばん good>はこのACTSの正体が
何かということは我々はペンディングしてるよね。

905小野小町:2018/09/16(日) 08:56:45
AC129-TSなのか、CTSなのかという疑義ね。

906在原業平:2018/09/16(日) 09:07:28
goodが通常の意味なのかは今のところ分からないけどね。小保方さんの用例は以下だ。

①20番 good CK8
②23番 good 31
③54番 ACTS たいばん good

907小野小町:2018/09/16(日) 09:18:21
CK8はサイトケラチンの染色ね。31は抗CD31の略かな。よくできてるという意味?

908在原業平:2018/09/16(日) 09:23:24
SOSOはそういうことを書く人ならso-soの意味かなあ。でもどうしてキャピタル表記してるの?

909小野小町:2018/09/16(日) 09:26:14
用例は、SOSO たいばん カルス、だわ。これ一つしかない。

910在原業平:2018/09/16(日) 09:56:23
用例がひとつしかない言葉の意味ってとても確定しずらくて国語学者泣かせだよね。
<むた>という古語の用例は柿本人麻呂の長歌に一つあるだけだ。
>>
石見の海 角の浦廻を 浦なしと 人こそ見らめ 潟なしと 人こそ見らめ よしゑやし 浦は無くとも よしゑやし 潟は無くとも 鯨魚取り 海辺を指して 和多津の 荒磯の上に か青なる 玉藻沖つ藻 朝はふる 風こそ寄せめ 夕はふる 浪こそ来寄せ 浪の共(むた) か寄りかく寄る 玉藻なす 寄り寝し妹を 露霜の 置きてし来れば この道の 八十隈毎に 万たび かへりみすれど いや遠に 里は放りぬ いや高に 山も越え来ぬ 夏草の 思ひ萎えて 偲ふらむ 妹が門見む 靡けこの山

この<むた>は<ともに>と副詞に解されている。

911小野小町:2018/09/16(日) 10:07:33
万葉仮名で共と当てられているから、意味を副詞に取ったんでしょ。

むた【▽与/▽共】の意味
名詞または代名詞に格助詞「の」「が」が付いた形に接続して、…とともに、…のままに、の意の副詞句をつくる。
「波の―か寄りかく寄る」〈万・一三一〉

912在原業平:2018/09/16(日) 10:09:03
じゃあどうしてムタと発音できたのかね。

913小野小町:2018/09/16(日) 10:17:27
用例がもう一つあったんでしょ。

君がむた 行かましものを 同じこと 遅れて居れど 良きこともなし

これは君我牟多とあてられてた。中臣宅守が流刑にされたときの妻の歌ね。

914在原業平:2018/09/16(日) 10:23:15
辞書に与の字があるね。もう一つ用例がありそうだね。だって、この二つでも
浪之共の読みが君我牟多の読みと同じであることは両者の歌の意味が共にという意味で
共通に解しうるからというだけでしょ。他の可能性が否定されているかな。与の
用例知ってる?

915小野小町:2018/09/16(日) 10:28:36
知らない。契沖の万葉代匠記にでも書かれていそうね。アマゾンで非常に良いが
5000円で売ってるわ。SOSO程度だと1820円。ひひひ。

916在原業平:2018/09/16(日) 10:54:42
君ねえ、僕の関心は契沖全集にはない。吉田東伍の大日本地名辞書のムタ(六田)に
大和吉野村の北なる渡津とあって、六田の渡又六田の淀と称すとある。大牟田とか、
中牟田、下牟田、牟田口なんて地名があるよね。

917小野小町:2018/09/16(日) 11:08:02
この六田は有名な場所ね。

音に聞き目にはいまだ見ぬ吉野川六田の淀を今日見つるかも
(音聞 目者末見 吉野川 六田之与杼乎 今日見鶴鴨)

918在原業平:2018/09/16(日) 11:11:05
音に聞き目にはいまだ見ぬ吉野川六田(ムツタ)の淀(ヨド)を今日見つるかも

誌余りだねえ。僕だったら

音に聞き目にはまだ見ぬ吉野川六田(ムタ)の淀(ヨドミ)を今日見つるかも

って読み下したいけどなあ。

919小野小町:2018/09/16(日) 11:20:17
字余りだけどそうは読めないのよね。与杼はヨドミとは読めない。ここの字数を
考えると六田は(ムツタ)と読まざるを得ないし、東伍の紹介している歌にも

かはづ鳴く六田の川の川楊の根もころ見れどあかぬ君かも

とあって、これもムツタと読まないと字数が合わないわね。

920在原業平:2018/09/16(日) 11:24:53
あの歌は東伍がうろ覚えで書いたんで、

河蝦鳴 六田之河之 川楊乃 根毛居侶雖見 不飽河鴨

君じゃない。

921小野小町:2018/09/16(日) 11:27:31
まあ、そんな小さな間違いにこだわって大意を見失っていいの。
万葉の昔からムツタと呼ばれていた地名だわ。

922在原業平:2018/09/16(日) 11:31:15
いや、東伍は牟田寺があることを書いている。僕はムタもしくはムッタという言葉は
水の淀んでいる水域で縄文の時代からそう呼ばれている地形だと思ってるのさ。

923小野小町:2018/09/16(日) 11:41:08
ええっ、
縄文時代***ムッタ
万葉時代***ムツダ(六田)
以降*******ムタ(六田、牟田)
だと?大牟田、中牟田、下牟田、牟田口は地形名称起源だと?
そして、波のムタと君がムタの共にという語義は、縄文時代のムッタという
語感から引き継がれている一緒にあって流れ去らずに淀んでいる感覚を
引き継いでいるんだと?

924在原業平:2018/09/16(日) 11:43:01
又阪九フェリーの船旅の季節が来たね。六田に行こうぜ。

925小野小町:2018/09/16(日) 11:45:25
免許の点数後二日で戻るわね。それまで違反で捕まらないようにしてね。
ところで何の話してるの?私たちって?

926在原業平:2018/09/16(日) 11:47:57
落書きマニアは広くて真っ白な壁が好きなんだ。そろそろ河岸替えるよっ!

927小野小町:2018/09/16(日) 11:54:22
あら、そうだったの。ランチ!

バッハは弾けないとね。間の取り方が神技に入ってるわね。
youtube.com/watch?v=vNkIj_BhHvY

928オウ、イェイ:2018/09/16(日) 11:55:39
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🗽 ☔ 🍓 🍌 🌛 🍒 🍮 🌀 🔓 🔥 🔰 🎴 ✨ 💦 ❄ 💨 🎐 💉 🍷 
❗ 💡 🚧 🎏 🕖 🕚 ⛔ 🌃 🔔 🔎
☀ ✈ ✂ ✒ ✌ ♠ ☺ ㊙ 🈴 ㊗ 🈶 🈚 ▶ ▶ ↩

929Ooboe:2018/09/16(日) 16:15:20
今回の、アルイミオウジさんとしたらば分身さん達との、丹羽論文データの解釈について、
変則的な対応ながらも、交わされた事は
良かったです。

私の理解力を越えるところで、内容については
コメントは出来かねませんが、

私の頓珍漢かも知れませんが素朴な感想を
コメントします。

930Ooboe:2018/09/16(日) 17:19:30
私の現時点でのStapの科学的真偽について
アルイミオウジなどの
科学的根拠に基ずくものではありませんが

私の、「あの日」やパートナ資料などなどの
綜合状況根拠的な感性から導かれてくる感触と
いう、他者に説得力のないものですが

その状況根拠的情報のかずかずから私の頭に
導かれてくるのは
Stapも、Stapキメラ、Stap胎盤、StapF1幹細胞
などは、小保方、若山により
確立されていたからこそ、ではないか?という
あくまで私の、私的現時点の真偽感触です。

その観点からアルイミオウジさんの今回の
丹羽データ解釈以外の
コメントの部分注目しています。
学さんの考察にも関わるとも思いますが
細胞世界の複雑系、柔軟性について
とくに体外の培養過程の未知の働き
また、細胞1つ1つバラバラ挿入と、塊の切り分け挿入は、見かけ以上に細胞自体の働きにおいて
なにか全然別の機構が働いたのでいはないか?という視点を考えています。

確実根拠ベースからなされる
したらば分身考察にとって、あやふやな感性的な私のコメントは、棚に上げて置いてくださっても
良いのですが、私の現時点をご理解いただきたく
思います。

931Ooboe:2018/09/16(日) 17:31:19
1年余りキメラ作製が
失敗続きだった細胞1つ1つバラバラ挿入の方法
から
Stap細胞の塊を切り分けてから挿入する方法で
いきなり、成功という!?、、、
意外さ、あっでんちきれましたすいません

932名無しさん:2018/09/16(日) 19:39:22
阿塁未央児

@aruimiouji
20時間20時間前
その他
対数目盛を振ったグラフをプリントアウトしているとする。
物差しを当てた時に、0.1から1までが1cmだったなら、0.30102cmが0.2。0.47712cmが0.3。0.60205cmが0.4。0.69897cmが0.5。0.77815cmが0.6。
電卓数字と見比べて貰えば即分かるけれど、適当なところで数字は丸めている。
学さん、お願いだから>>
現実を見て下さい。ちゃんと足元を見て下さい。嘘を吐かないで下さい。嘘のハードルが低過ぎる。それで地道なしたらば歌劇団の指導ぐらいの責任は負って頂けないか?。
天才集団の訳はないでしょう?。本当は知っているでしょう?。
それにこのくらいは朝飯前でしょう?、MDなんだから。
……さしも
>>>の渋谷一郎さんだって、一応、理系で修士様なのだからこれぐらいは出来る筈だ。
一切しないんだよな、あの人……。
不思議。>

933自死の自由を! 安楽死施設をつくりましょう!:2018/09/16(日) 23:33:50
自死の自由を!

安楽死施設をつくりましょう!


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