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STAP問題の全解に向けて、その18

403：デラ・ストリート：2018/02/14(水) 11:49:15: >>
129B6F1ES1のＢ６ホモ領域について(補足)

前の説明では不十分だったので、補足します。
まず全ゲノム解析によると、AC129と129B6F1ES6のＢ６ホモ領域は、88.6Mから94Mにかけてズレています。つまり、この領域でAC129はホモ。129B6F1ES6はヘテロです。
次に、調べているところは次の箇所です。
８９Ｍ　９箇所
９１Ｍ　９箇所
９２Ｍ　５箇所
９５Ｍ　５箇所
で、８９Ｍから９２Ｍの２３箇所にかけて、AC129と129B6F1ES1はホモです。そして、９５Ｍ、すなわちホモ領域のすぐ外では、AC129も129B6F1ES1もヘテロになっています。普通に考えれば、これで十分「ホモ領域は一致している」と言えるかもしれません。ただ、129B6F1ES1の全ゲノム解析をしていなかったというのは、やはり引っかかるところです。AC129も129B6F1ES1も完全に一致していると結論するためには、やはり全ゲノムで比較する必要はあったと思います。予算の問題があるからといって、ここは手を抜くところではないでしょう。「二つの欠失」「一つの重複」「Ｂ６ホモ領域」のところだけをポイントチェックしたのかもしれませんが、この場合、すべての変異はマウスに元からあったもので、樹立時に伴う変異は皆無であったことが前提になると思われます。

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