ｄの注を引用したついでですからそれも検討しておくと、ここには F1 GFP mice (B6GFP and DBA/2 or 129/Sv).という
二種類の背景マウスがあって、その中のB6GFPはC57BL/6 mouse carrying cag-gfpだよという
注なんですね。字が小さいんでピリオドとコンマの位置に注意が必要だね。もっとも
区切りが違うと写真の意味がわからなくなるんで誰でも気づくだろうけど。念のため。
確かにｄ写真にはＥ9.5（embryonic day 9.5の意味）と書かれているんだけど
アーティクル本文には CD45+ cell-derived STAP cells (from F1 mice of
B6GFP × 129/Sv or DBA/2) generated all-GFP+ embryos on embryonic day (E)10.5
(Fig. 4f, Extended Data Fig. 7d and Supplementary Video 3)とされている。
細かいこと言うようだが、若山さん、笹井さん、ちゃんと見てたかな。
１）Article Fig.4とExtended Data Fig.7に129/Sv×B6(CAG-GFP) F1マウスから作られたSTAP細胞由来の2Nキメラができたこと、さらにgermline transmissionにより、このキメラの子ができたことが報告されている。小保方研のフリーザーに「カルスキメラ子1」〜「カルスキメラ子9」と書かれた9本のDNA試料があり、2011〜2012年のCDB若山研ではSTAP細胞を「カルス」と呼んでいたことから、これらはこのキメラの子のDNAと考えられた。実際に、小保方氏への聞き取り調査により、これらの試料はArticle Extended Data Fig.7に出てくるキメラの子から小保方氏が抽出したDNAであることを確認した。若山氏の実験ノートでは、このキメラの作製は2012年1月終りから2月はじめにかけて行なわれていた。
悪友から電話だ。
準備の為にデータだけ貼っておくよ。
まずはアーティクル本文だ。
>We next performed a blastocyst injection assay with STAP cells that were generated from CD45+ cells of neonatal mice constitutively expressing GFP (this C57BL/6 line with cag-gfp transgenes is referred to hereafter as B6GFP). We injected STAP cell clusters en bloc that were manually cut into small pieces using a microknife (Fig. 4a). A high-to-moderate contribution of GFP-expressing cells was seen in the chimaeric embryos (Fig. 4b and Extended Data Fig. 7a). These chimaeric mice were born at a substantial rate and all developed normally (Fig. 4c and Extended Data Fig. 7b).
Letterの記載は、「Surprisingly, injected STAP cells contributed not only to the embryo but also to the placenta and fetalmembranes (Fig. 1b and Extended Data Fig. 1a–c) in 60% of the chimaeric embryos (Fig. 1c).」ですね。
で、Extended Data Fig. 1a–cは、「Chimaeric mouse with STAP cells derived from CD45+ cells of B6GFP/129/Sv mice (B6GFP, C57BL/6 line with cag-gfp transgene).」
とありますから、僕のマウス(129/B6/F1のcaf-GFP)で特に矛盾が無かったので、記載しなかったと言うことでは？
Extended Data Fig. 1a–cの画像も同じフォルダーにあったのかは知りませんが。
Quality control method for RNA-seq using single nucleotide polymorphism allele frequency
Fig.4A
Examination of incorporated mRNAs in FI-SCs.(A) Expression of TSC marker genes…
遠藤論文は１割のＴＳコンタミという推測ですね。
>Therefore, the claim in the Obokata et al. paper that FI-SCs contribute to the placenta might have been based in error on contamination by TSCs, which are known to be organ stem cells (Tanaka et al. 1998).
でもこれは、胎盤が光ったかどうかとは無関係かもしれませんよ。というのも
そもそも光ってなければ光るべき何を持って行きようもありません。彼女は
樹形図に都合の良い実験結果が欲しかっただけで、ＦＩ幹細胞を持っていっても
笹井先生の求めるデータは得られないことくらい知っていたでしょうよ。
光ったか否かと、ｍＲＮＡ解析データ提出の動機は分けて考えた方がよさそうです。
>>361
>Letterの記載は、「Surprisingly, injected STAP cells contributed not only to the embryo but also to the placenta and fetalmembranes (Fig. 1b and Extended Data Fig. 1a–c) in 60% of the chimaeric embryos (Fig. 1c).」ですね。
STAP cells contributed not only to the embryo but also to the placenta and fetalmembranes (Fig. 1b and Extended Data Fig. 1a–c) in 60% of the chimaeric embryos (Fig. 1c).と
書いたのは笹井さんよ。not only to the embryo but also to the placenta and fetalmembranesと小保方さんの原稿にあったとしてもand fetal membranes と続いたときに気づくでしょ。
彼は気づかなかったのよ。なぜ？
>These results support the view that the RNA-seq data contained transcripts from two major cell populations, with approximately 90% B6 cells having an ESC-like expression pattern and approximately 10% CD1-like cells having a TSC-like pattern. Therefore, the claim in the Obokata et al. paper that FI-SCs contribute to the placenta might have been based in error on contamination by TSCs, which are known to be organ stem cells (Tanaka et al. 1998).
１１次元のところに答えがあるようですね。Ｐｕｂｐｅｅｒの記事の紹介があるんで
そこに入り込んでかなり下の方まで読み進むと、専門家らしい人の意見があって
"Mouse phenotypes: a Handbook of mutation analysis"を参照しろと
あって、ＥＳで胎膜が光ると書いてある。
The authors claim that "Surprisingly, injected STAP cells contributed not only to the embryo but also to the placenta and fetal membranes (Fig. 1b and Extended Data Fig. 1a??"c) in 60% of the chimaeric embryos (Fig. 1c)." and they show the analysis of chimaeric embryos with placentas at E12.5. I'm sorry to say but that is normal in E12.5 chimaeric embryos produced by injection of wt ES cells into blastocyst, since the placental FETAL blood vessels and yolk sac mesoderm cells are derived from the ES-cell derived epiblast.
