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雑談スレッド
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>>240
AMDのSSEが弱いのはある程度は分かっていることなんですが、SIMAPにおける現象は
その度合いを超えているんですよね。
問題は、Windows上でX2やXPがP4やCeleDに大きく劣ってしまうことで、Linuxでは同等くらいで
あるという点です。
（Core2DuoのSSEの爆速っぷりはすさまじいですが、置いといて…）
いかにもコンパイラオプションによるP4最適化あたりが怪しそうな感じではありますが。
フォーラムに、テスト用WUを解析したときの所要時間が出ています。
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/forum/viewtopic.php?t=507&postdays=0&postorder=asc&start=30
これによると、Windows版では
P4 641? 3.2GHz - 1分16秒
Celeron 335 2,8GHz - 1分40秒
Athlon64 X2 4600+ 2.4GHz - 2分03秒
Athlon64 X2 3800+ 2.0GHz - 2分14秒
などとなっていますが、一番下のX2 3800+ でLinux版では
Athlon64 X2 3800+ 2.0GHz - 1分11秒 (SuSE 10.1)
と報告されています。
解析時間に2倍近く差があるようでは、何かあるのでは？とも思いたくなるところです。
手元のマシンで試してみたい方は、テスト用WUが以下のURLでダウンロードできます。
ZIP形式で保存して、展開した作業フォルダにBOINCフォルダ下からhmmer_5.08_windows_intelx86.exeを
探してコピーして、コマンドラインから
hmmer_5.08_windows_intelx86.exe -w testwu -n -r test
と入力すると、実行時間が確認できます。
バッチファイルを作って、実行前後に echo %time% で時刻を出力すると分かりやすいでしょう。
手元のAthlont64 X2 4200+ 2.2GHzで実行したところ、2分7秒かかりました。
ちなみにSSE非対応版も落として試しましたが、2分11秒と微差ながら遅くなりました。
また、CoreDuo T2500 2.0GHzでは1分7秒くらい。Core2Duoならもっと速いはず…。
>>234氏
私も元はといえばUDとcellをTeam2chでやってた人ですので、
気軽にレスしてください。
医療・生物科学関連の非営利プロジェクトは、いまひとつ盛り上がりに欠けているのが現状ですが
所属チームに関わらずここで参加者同士情報交換できればいいなと思っています。
私もAMDの4コア製品にﾜｸﾃｶ状態で、しばらく様子見です。
でもエンコ用につなぎでE6600に手を出すかも…。
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