STAP問題の全解に向けて、その20 - 1520838176

409：ドクター・ワトソン：2018/03/19(月) 11:22:18: 表は129/GFPESは小保方さんのサンプル。
裏は129/GFPESは誰かが小保方さんのボックスに忍び込ませたサンプル。

こういう整理でいいのかな。
410：シャーロック・ホームズ：2018/03/19(月) 11:35:56: ①FLS3(アクロシン入り)→129/GFPES(小保方さん作業用)→FES1(若山さんがホモを渡したという嘘とともに太田ESの中身をFLSに入れ替えてこれを小保方さんの捏造用細胞としたもの)
①'FLS3(アクロシン入り)→129/GFPES(若山さんがホモを渡したという嘘とともに太田ESの中身をFLSに入れ替えてこれを小保方さんの捏造用細胞として小保方ボックスにも忍び込ませたもの)
③FES1(2005年作製)→129/GFPES(小保方さんが置忘れを入手してラベルを書き直して保存していたもの)→FLS3(若山さんは大田ESを渡されて騙されてFLS3を作った)

③の裏は無いでしょ。
411：Ooboe：2018/03/19(月) 12:49:59: 今、昼休み
いろいろ私の我がままに
いろいろご考察して下さりありがとう
私へのお尋ね、所用が多くすぐ出来ないので
2、3日お待ち下さいませ。
投げ掛けておきながらの失礼
ご免なさい🙇🙏
412：小野小町：2018/03/19(月) 21:05:25: あら、ドンマイよ。彼らは勝手に釣り場の視察に出かけてるだけだわ。もともと
身勝手な人たちなんだからOoboeさんから律義なご挨拶は無用よ。
413：在原業平：2018/03/19(月) 21:10:02: 小町ちゃん、ジンライムね。
冷え込んで駄目だ。ハタキは一旦納まってる。明日の雨後からだな。
414：ドクター・ワトソン：2018/03/19(月) 21:21:30: どこまでいったっけ?
野暮用を済ます間も気になって仕方ないね。
先週号まで小保方さん自身が129/GFPESに関して何か語るはずだと期待されてたんだけどな。
何しろこれは事実は分かっていて世間にそれが知らされていないだけのことだよね。
小保方さんが私はこの細胞のラベル自体を知らないとか、或いはこの細胞は
私のものだけど中身は若山さんの作ったFLSだと思ってたとか、何か言ったら
終わる話だったはずなんだけどな。
415：小野小町：2018/03/19(月) 21:26:13: 突然最終回になったのには理由があるはずね。
最終回って必ず前号で予告がある。
416：シャーロック・ホームズ：2018/03/19(月) 21:28:49: 何だと思う?
417：ペリー・メイスン：2018/03/19(月) 21:33:39: ①ネット議論の盛り上がったところで単行本の期待値を高めようと出版社が考えた。
②若山さんから泣きが入った。
③理研から仲裁が入った。
④警察から調査の口外は止めてくれと頼まれた。
⑤自分が犯人である小保方さんがネット反響に驚いて、これ以上やると藪蛇だと思って終わりにした。
418：ドクター・ワトソン：2018/03/19(月) 21:38:33: ⑤は無いよ。なぜなら太田ntESの雌雄は論文と違っていた。これだけではないよ。
若山さんの嫌疑が多すぎる。桂報告の論理に従って若山さんが無実ならこんなに
多くの疑義が若山さん周りに発生する必要性がない。
419：小野小町：2018/03/19(月) 21:49:27: もう一つ理由があるかもね。又明日よ。

youtube.com/watch?v=LIQzib8iCv0
420：ふむ：2018/03/19(月) 21:50:15: 😭　😃　😵　😒　😣　😝　😔　😳　😡　😱　🐝　🌅　👰　🙅　🙍
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421：自死の自由を！安楽死施設をつくりましょう！：2018/03/20(火) 01:31:16: 自死の自由を！

安楽死施設をつくりましょう！
422： 地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう：2018/03/20(火) 07:23:26: 😭　😃　😵　😒　😣　😝　😔　😳　😡　😱　🐝　🌅　👰　🙅　🙍
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423：在原業平：2018/03/20(火) 07:37:42: モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。
424：小野小町：2018/03/20(火) 07:38:47: お気に入りはTsさんが何かつぶやいてられるけど分かんない。
425：在原業平：2018/03/20(火) 07:59:13: ガンバレブログでも木星さんの昔の聞き取りが張り付けられてるね。今日は昨日の続きからだったよな。
426：小野小町：2018/03/20(火) 08:04:17: >>
皆様、以上の時系列の流れで129╱GFP.ESラベル容器がキ－の疑惑サンプルであることにお気付きのことと思います。

これが疑惑サンプルだと思わせたがっているのは記者会見からの若山さんの既存ESコンタミ疑義提出の
流れから桂報告、そして石川告発へと繋がっていく、所謂アンチ小保方派たちなのね。Ooboeさんはどういう意味で
これを疑惑と言っているのかという検討をしている途中ね。129/GFPES自体が疑惑なのか、そう言い募っている
人々自体が疑惑なのかしら。
427：ヘーゲル：2018/03/20(火) 08:07:08: 今日はいきなり本題なのかい。僕らの役割をスポイルしようとしているな。
けしからん、ヤスパース君。
428：カール・ヤスパース：2018/03/20(火) 08:09:18: へい、へい。自らしゃしゃり出ないと出番は作れない。芸人は大変です。
>>
更に、この疑惑サンプルが12月末、桂調査報告の最新分析機器の科学的解析で、同じく出所が文書で証明出来ない疑惑調査サンプル、大田氏作成ES細胞のFES1という細胞とほぼ一致、STAP幹細胞FLS3ともほぼ一致と結論されたのです。
429：在原業平：2018/03/20(火) 08:12:06: <出所が文書で証明出来ない疑惑調査サンプル、大田氏作成ES細胞のFES1>なんだね。
Ooboeさんの疑惑の意味はFES1の出所だと書いてある。
430：小野小町：2018/03/20(火) 08:17:09: そうね。ここが彼女とパートナー氏の関心の在処よね。ただ、Ooboeさん自身にも
整理のついていない混乱があるのね。彼女は疑惑のサンプルは最初129/GFPESだと
書いているのに、その一行下で疑惑されているのはFES1ね。そしてその後ろでFLS3には
疑惑と言う言葉が使われていない。
431：ドクター・ワトソン：2018/03/20(火) 08:22:11: 桂報告の結論は
FES1=129/GFPES=FLS3もしくは
FES1≒129GFPES≒FLS3だからね。
一つを疑惑としたら３つとも疑惑ということになる。
432：シャーロック・ホームズ：2018/03/20(火) 08:28:40: この等式はラベルの三つの区別に対して中身は三つの区別が無かったということで、
ラベル自体の示している概念は
①FES1---太田さんが2005年に作成した受精卵ES細胞
②FLS3---若山さんが小保方さんに渡されたスフィアを幹細胞化した細胞
と定義されているから、定義通りなら中身は違ってないといけない。
そういう疑惑だということでしょ。
433：小野小町：2018/03/20(火) 08:38:22: 私たちの解釈では小保方さんは129/GFOESはFLSだと答えているのよね。
FLS3=129/GFPESだわね。ところが若山さん経由で提出されたFES1を桂チームが
解析したら中身はFLSと一致したということね。そしてここにFES1に対して
いくつかの疑義がある。
①FES1の母系は129Terという太田さんの記憶に対して調査結果の中身は129X1だった。
②太田さんと若山さんの間でFES1の授受があったという双方の証言があるがその運送に関する証拠提出はされていない。
③若山さんを経由しているので若山さんが太田さんのチューブの中身をFLSに入れ替えた可能性に関して何の検討もされていない。
④太田ESに関して同時提出されていたntESは中身の雌雄が論文、ラベルと違っていた。
434：在原業平：2018/03/20(火) 08:57:27: 小保方捏造説だと、まずFES1を彼女がどこかから手に入れた。そしてラベルをはがして
129/GFPESと書いた別のラベルにしておいた。これを若山さんが知らずに幹細胞化したのが
FLS3だということになる。桂報告の主旨もそういうことになっている。犯人は分からないと
しながらも、既存ES捏造なら小保方さんしか該当者がいないと暗示されているね。
個々にもいくつかの疑義がある。
①太田さんはFES1をすべて持ち出して残していないと証言した。
②後に置き忘れの可能性に触れたが、小保方さんがどうやってその置忘れを見つけたのかの検討は行われていない。
③正式な保存サンプルには129B6GFP1 FES♂と書かれていたというが置忘れは作業用の可能性もあってラベル表記が同じであったか否かも検討されていない。
④正式な保存サンプルの置忘れは考えにくいがそれがあったとして、かつそれを小保方さんが見つけたとしてGFPが何であるかは確信できない。
⑤小保方さん自身はナイフ切り分けは事ぜ通告受けていないので、その時の細胞は前回失敗した細胞をいつも通り持って行ったと言っているが、その件に関して桂報告が何か調査したような結果は存在していない。
⑥木星リストにあるとおり129/GFPESに関係したようなラベル名のサンプルが他にたくさんあるが、それらと129/GFPESとの関係に関して桂報告が調査したこともない。
⑦小保方さんは所謂斜め巻ラベル等に関して由来不明と明確に答えているのに129/GFPESに関しては何も言ってないどころか、FLSであるらしい証言をしている。
435：在原業平：2018/03/20(火) 09:00:04: 事ぜ通告→事前通告
436：小野小町：2018/03/20(火) 09:08:23: 小保方さんのリスト内容聞き取りは実験当初から2年後に行われているのよね。
①記憶が定かでないことを思い出しながらの曖昧さがある。
②彼女が犯人でない場合でも、誰が犯人で何が行われたかが自身で分かっていない状況で他者の行ったことに関して迂闊なことの言えない曖昧さがある。
③実験ノート、米国との間で交わされた日報報告を公表できないヴァカンティからの縛りがあって、確認できない曖昧さがある。
④彼女が犯人であった場合、木星リストに無い方が彼女のためにはいいであろうサンプルがそのまま残されている。
⑤リストの最初のページは若山さんがMTA時に戻して来た細胞である可能性に関して何も説明がない。
437：在原業平：2018/03/20(火) 09:10:52: そのあたりはもうすでに我々の検討しつくしたところだね。Ooboeさんは何と言っているの?
438：カール・ヤスパース：2018/03/20(火) 09:15:06: へい、へい。自らしゃしゃり出ないと出番は作れない。芸人は大変です。
>>
この疑惑調査サンプルの大田FES1解析から「STAPはES細胞に由来する」との解析結論を導びかれたのですが、これとほぼ一致した129╱GFP.ESラベルサンプルがなぜか小保方冷凍庫から「6月」に「発見」されたと、NHkにリ－クされていたのです。
439：ヘーゲル：2018/03/20(火) 09:18:05: これはまた別の問題だね。リークしたのは小保方さんではないよ。ははははは。
440：カール・ヤスパース：2018/03/20(火) 09:20:29: ええ、小保方さんではありませんよ、師匠。それは間違いない。
>>
この調査サンプルを解析担当した研究者達はすでに、3月保全作業、4月リスト撮影作業でES細胞が冷凍庫に沢山残存していたのを確認していたにもかかわらず、なぜ6月になって初めて発見されたがごとくNHKにリ－クしたのか？？？！
441：在原業平：2018/03/20(火) 09:29:55: その回答は佐藤貴彦『STAP細胞事件の真相』80,81Pにあるね。
>>
そして、驚くべきことに、『捏造の科学者』では、ES細胞は調べられなかった
ことになっているが、六月十日付の竹市センター長の報告書によれば、小保方研
冷凍庫にある「ES」とラベルされた次の六種類の試料が調べられているのである。
442：小野小町：2018/03/20(火) 09:47:09: そうね。それって以下ね。
①TSA ntES-9<所謂窃盗されたと言われている李の細胞だが、リストには8までしかない。>
②ES129 GFP+/-<木星リストには1と2と二つあって109番と111番だが、どちらかは不明、かつ頭にESという文字は無い。>
③GFP ES<木星リスト134番。{若山さん由来}と小保方さんの答えているもの。>
④129/GFP ES<木星リスト95番。件の細胞。>
⑤ES+/-<木星リスト103番。{+/-:FLSがheteroだと判明していたので+/-と書いた可能性あり}と小保方さんの答えているもの。>
⑥129B6F1GFP ES6<木星リスト115番。{由来不明}と小保方さんの答えているもの。>
443：在原業平：2018/03/20(火) 09:49:59: その後に以下のようにある。
>>
このうち、「129/GFP ES」の一五番染色体にGFPが挿入されていることがわかったという。
444：ドクター・ワトソン：2018/03/20(火) 09:54:43: ははははは。これが放医研に続いてCDBでも同じ結果が出たという摩訶不思議な
調査だったね。
CAG-GFPは15番には無いよ。そもそもGFPが15番にはない。どう間違ったら
二人して同じ間違いができるのかを今検討している途中だよね。
なかなかそこに戻れてないけど。
445：シャーロック・ホームズ：2018/03/20(火) 10:08:13: 佐藤本によると放医研の調査結果は既に5月末には竹市さんに伝えられていて、
CDBの検証も6/2には終わった。そして6/5に会議があって、6/10には竹市さんの報告書がでた。
このときにFLS3=129/GFPESが決定した。ただし、GFPの位置は無論どちらも間違っていて
15番番だと誤認されていることになっている。実際には3番だと後に分かっている。
そして、ここではまだアクロシンだと言う話は出てないんだね。GFPはあくまでもCAG-GFPだ。
446：小野小町：2018/03/20(火) 10:10:35: ふーーーん。アクロシンだと気づいてないのに、15番のアクロシン構造遺伝子の
あるところにGFPがあると誤認したのね。しかも二人で別々にやって。どんだけ
間抜けなの?
447：在原業平：2018/03/20(火) 10:11:56: あ、小町ちゃん、生身の人間を忘れて気持ち良おおおおおく罵倒しているねえ。
448：小野小町：2018/03/20(火) 10:13:53: こんな便所の落書きを覗いている暇人なんてそんなにはいないわよ。
平気、平気、なんでもあり。
449：デラ・ストノリート：2018/03/20(火) 10:30:47: そういうことなのね。

6/2　 CDBの検証終了
6/5　会議
6/10　竹市さんの報告書がでてFLS3=129/GFPESが決定した。
6/16　若山さん記者会見で129/GFPESに触れず。
　　　同日夜NHKニュース
450：ペリー・メイスン：2018/03/20(火) 10:35:00: Ooboeさんの疑念はこの芝居がかった暴露順序にあるんだね。
>>
この調査サンプルを解析担当した研究者達はすでに、3月保全作業、4月リスト撮影作業でES細胞が冷凍庫に沢山残存していたのを確認していたにもかかわらず、なぜ6月になって初めて発見されたがごとくNHKにリ－クしたのか？？？！
こんな行為をしていた事象から画策の存在が疑念されます。
この怪しいリ－クの仕方にこの129╱GFP.ES調査サンプルそのものが疑惑として浮上してくるのです。
451：シャーロック・ホームズ：2018/03/20(火) 10:43:36: ESコンタミだあと騒いでいる首謀者は若山さんだね。彼って共著者でかつシニアじゃないのかね。
小保方さんのESコンタミならまずは彼女を自分のところに呼びつけて、何をやったんだと
叱りつけなきゃいけないでしょ。そして不正を笹井さんや丹羽さんを含めた中で、小保方さんを
問い詰めて不正の実態を明らかにしなければならない。そしてもしそうであったら、間違いが
あったと世間に謝れば済むことだ。内内で終わらせなければならない事件だね。でも、彼は
そうしなかった。
452：ドクター・ワトソン：2018/03/20(火) 10:50:48: 彼は自分自身でES捏造を疑った3月の時点で、理研に出かけてきて笹井さん、
丹羽さん、竹市さん、他のGDの傍聴している中でなぜ小保方さんと話し
合わなかったのか。正々堂々とやるべきことじゃないのかな。
453：井伏鱒二：2018/03/20(火) 10:55:59: 小保方さんはその頃石井調査を受けていて弁護士もそばについていた。若山さんに
何の疚しいことも無いんだったらまずは小保方さんと話し合わなければならないよ。
その時に笹井さんと丹羽さんと弁護士はついていていいじゃないか。理研も竹市さんと
何人かのGDくらい出席させればいい。笹井さんじゃないがディスカッションテーブルの上で
事をひとつづつ検証して行ったらよかったんでしょ。それをしなかつたのは
若山さんに正々堂々とやれない事情があったんでしょ。
454：開高健：2018/03/20(火) 10:57:38: NHKや毎日新聞や日経サイエンスにリークする意味は何もないね。これは文科省にもない。
455：山村聰：2018/03/20(火) 10:59:58: 文科省は世間に説明がつけばいいことだ。そして自分たちの問題に触ってくれなければ
それで満足なんだから、内々でディスカッションして、実態がはっきりしたら、その上で
処置を考えればいいことだね。
456：佐藤垢石：2018/03/20(火) 11:02:52: 誰が何のためにリークしているか。
①若山さんが逃げようとして不正暴露サイトや学界やマスコミにリークしている。
②理研内外の他の利害関係者がライバルに対する攻撃材料としてリークしている。
457：在原業平：2018/03/20(火) 11:38:04: >>
この怪しいリ－クの仕方にこの129╱GFP.ES調査サンプルそのものが疑惑として浮上してくるのです。

Ooboeさん、我々は怪しいリークに関してあなたに同意します。しかし、もしあなたの疑義に
129/GFPESが若山さん側から小保方ボックスに入れられたという事実があるとお考えなら、その部分に
関しては同意できない。しかし、石川さんが129/GFPESを曖昧に指さしながら
盗まれたと言っている事実が、小保方さんが太田ESのFES1を129/GFPESにラベル張り替えして
これを使って若山さんを騙したのだと言うことを意味していて、このことを怪しいとおっしゃることを
否定するつもりはありません。石川さんは仮に太田さんが置き忘れていたとしても、それを
小保方さんがラベル貼り替えして持っているのだという証拠を何も示していないことと、
ヒッポさんが盗まれたと言っている斜め巻とこの細胞とは無関係であることを
知って指さしているこの悪質な糞野郎の精神を見間違えているか、わざと知らぬ顔の半兵衛を
決め込まれているかを問わず、我々はあなた方に同意していません。
458：ふふふ：2018/03/20(火) 11:41:07: 俺たちは、でも、石井さんが妙ではあっても、告発をしたこと自体は歓迎したよ。
なぜならやっと警察が入って調べてくれると期待したからだ。
459：鉄：2018/03/20(火) 11:46:10: 検察は事件が民事案件だと知って撤収したんだな。それと文科省の不正にメスを
入れるつもりはそもそも無かった。李の件があって外国の工作を特に心配して
被疑者不詳という妙な案件に直して告発受理した上で捜査した。結果はしょうもない
内部紛争だと分かったんで、民事不介入を決め込んだということだろ。
460：在原業平：2018/03/20(火) 11:49:04: この事件が他の国内外ニュースとの比較でショウモナイ問題だと言うことは
鉄さんに同意致します。
461：小野小町：2018/03/20(火) 12:00:58: では、Ooboeさんの緊急動議に関する検討は一旦置いて置いて、このショウモナイ事件の
小さな謎の一つである15番になぜGFPを見つけたつもりになったのかという問題に戻りましょう。
462：孤舟：2018/03/20(火) 12:03:22: 残念だが阿久悠から電話だ。釣りも忙しい時期なんだよ。スマンノ。
463：小野小町：2018/03/20(火) 12:13:03: この15番の問題はちっとも先にすすまないわね。あはははは。なんか識域下で
拒絶しているものがあるのかな。ランチ!

youtube.com/watch?v=CXcTJmnhupA&list=PLK9_dokDNIOipM5wQUy4mccgCWaOPBVKz
464：イェイ：2018/03/20(火) 12:14:23: 😭　😃　😵　😒　😣　😝　😔　😳　😡　😱　🐝　🌅　👰　🙅　🙍
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465：名無しさん：2018/03/20(火) 13:26:04: >>417

1～4までの考察が述べられていません。
ご考察を楽しみにしているので、随時評論されるようにお願いします。
466：元祖無責任男：2018/03/20(火) 20:50:58: ＞考察が述べられていません。

おほほー、質問のしかたに社会性が身についていませんね。
467：谷啓：2018/03/20(火) 20:52:44: ママが横について、試験勉強ばかりやってたんだからしょうがねえだろう？
468：元祖無責任男：2018/03/20(火) 20:53:22: たぶん学生さんだろうよ。
469：トーマスパー：2018/03/20(火) 20:58:31: いや、スタップ批判のネット書き込みは、こういうの多いね。

そういう社会なんだろう。
470：トーマスパー：2018/03/20(火) 20:59:02: 脱皮しない蛇は死ぬ。
471：ニーチェ：2018/03/20(火) 20:59:38: トマースさん、私のセリフとらないでね。
472：元祖無責任男：2018/03/20(火) 21:01:40: じゃあさ、脱皮しないエビはどうなの？
473：アキ：2018/03/20(火) 21:03:53: そういえば、よくエビデンス出せとかよくどなたかがお題目唱えてるわね。
474：谷啓：2018/03/20(火) 21:08:34: アキさん、「よく」がダブってるよ。
475：名無しさん：2018/03/20(火) 21:09:59: どんだけ偉そうなんだ
476：アキ：2018/03/20(火) 21:10:16: あらやだわ。そろそろお店にもどりましょ。
477：元祖無責任男：2018/03/20(火) 21:18:05: なんでも風の噂ではさ、
チャールズったら、デートのときもお風呂のときも、四六時中、彼女の言動が気にかかるらしいよ。

じゃこれにて失敬。
478：アキ：2018/03/20(火) 21:21:55: うふ、チャールズさんったら、彼女にくびったけなのね。

鉄さんに絡んでるのはそういうわけなのね。じゃ、お店にもどりましょ。
479：💩：2018/03/21(水) 01:10:36: 小保方のエロ本変えよ、オッサンども
480：自死の自由を！安楽死施設をつくりましょう！：2018/03/21(水) 02:19:32: 自死の自由を！

安楽死施設をつくりましょう！
481： 地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう：2018/03/21(水) 07:54:41: 😭　😃　😵　😒　😣　😝　😔　😳　😡　😱　🐝　🌅　👰　🙅　🙍
🙋　👩　👮　👪　🙇　🙈　🙊　💪　👍　👎　👉　👊　👋　🙏　🙌　
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482：在原業平：2018/03/21(水) 07:56:20: モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。
483：小野小町：2018/03/21(水) 07:57:15: お気に入りはガンバレブログだわ。
484：在原業平：2018/03/21(水) 08:03:50: >>465さんの
1～4までの考察が述べられていません。
ご考察を楽しみにしているので、随時評論されるようにお願いします。

に対する返事は不要になったね。
婦人公論の日記は2016年3月24日で終了した。しかし、頑張れブログに
単行本小保方日記の目次を張り付けてくれた人が465さんに回答してくれている。
日記は2016年10月で終わる。
485：小野小町：2018/03/21(水) 08:05:09: 正解は1だったんだ。あはは。
486：ヘーゲル：2018/03/21(水) 08:08:24: 本題頼むぜ。
487：カール・ヤスパース：2018/03/21(水) 08:16:53: 本題、何でしたっけ?
488：デラ・ストリート：2018/03/21(水) 08:22:55: FLSのプライマーはどうやって知られたのか?
489：小野小町：2018/03/21(水) 09:02:38: まずはこんなのはどうかしら?

blog.goo.ne.jp/yamanekohotaru/e/a1b587fe5773bb44d85f3a3387e0650f
490：在原業平：2018/03/21(水) 09:04:04: 文章貼り付けてよ。
491：小野小町：2018/03/21(水) 09:05:22: >>
無知の知
ほたるぶくろの日記

STAP幹細胞ゲノムの解析結果について
2014-07-12 16:20:46 | 生命科学
しばらくO氏の細胞（FLS-3, 4）の遺伝子解析の結果について情報が混乱していました。とくにW氏のラボにあったES細胞株等と一致するのかどうかについて情報が二転三転していたことが、事態をより不透明なものにしていました。私も情報が出揃うまで、少し事態の推移を見守っていました。今週になって、やっと色々な解析結果の詳細がネット上に出て来ており、起こっていることが見えて来たように思います。
492：小野小町：2018/03/21(水) 09:06:30: >>
遺伝子、特にゲノムの解析は複雑なものです。ほ乳類細胞のゲノム解析はウイルスや細菌のゲノム解析とは比較にならない難しさがあります。今や、問題の細胞株群のゲノム解析は専門家が担当するべき事態のようです。初期の解析は「ゲノム解析」といいつつ、単に「PCRによってある配列があるかどうかをチェックする」だけであったようです。しかし事態はより深刻にみえます。今回の件では、GFPカセット周辺の配列をかなり広範囲に読む必要があるでしょう。大まかに染色体のin situ hybridizationでGFP配列の挿入された染色体を確定し、その周辺のゲノム解析をサザンブロット、ゲノムウォーキングなどの手法を用いておこなうべきかもしれません。そして混入されたと疑われるES細胞などの目星がついたら、その細胞ゲノムとの詳細な比較が必要でしょう。これは結構大変な仕事です。とはいえ数ヶ月で結論は出るはず。しかし、当然かなりの費用もかかります。
今回どうしてW氏は解析結果の解釈を誤ったのでしょうか？W氏が予想していなかったGFPカセットが件の細胞のゲノムに挿入されていた。そのことが、PCR解析を誤らせた原因でしょう。これはW氏が想像もしていなかった事態が起きていた、ということなのでしょうか。
この辺りの事情をもう少し分かりやすく書きます。
493：小野小町：2018/03/21(水) 09:08:11: >>
今回の論文で使用されているマウスに導入されていたはずのGFP遺伝子とは、oct4-GFPとcag-GFPでした。oct4-GFPカセットは、oct4遺伝子の発現を調節しているプロモーター領域に、緑色の蛍光を発するGFP遺伝子を人工的に融合させた遺伝子カセットで、OCT4が発現するべき状態のときにGFPを発現するような装置です。
それをゲノムのどこかに組み込み、細胞やマウスでOCT4の発現している条件や場所を特定するために作られた遺伝子カセットです。その後、逆にOCT４を発現する条件になった細胞を同定するためにも使われるようになりました。つまり「細胞の初期化」の遺伝子マーカーとして使われるようになったのです。
494：小野小町：2018/03/21(水) 09:08:51: >>
それに対しcag-GFP遺伝子カセットとはCytomegalovirus enhancerとChicken β-actin promoterにGFP遺伝子を繋ぎ、さらにウサギのβ-グロビン遺伝子のpolyA signalサイトを接続したものです。サイトメガロウイルスのエンハンサーとトリβアクチンプロモーターによって全身性、すなわち身体中どの細胞にもGFPが発現するようになっている遺伝子カセットです。これを組み込まれた細胞は、ほぼどんな細胞でもGFPを発現するようになります。こちらはともかく光る細胞を作る目的で作られています。この遺伝子カセットをもった細胞はどこにいるのか、すぐに見つけられるためのマーカーとして使われています。
495：小野小町：2018/03/21(水) 09:09:38: >>
ところが、当初１５番染色体に挿入されていたと発表されたcag-GFPは、実は上記の市販されているカセットではなく、それに改変を加え１５番染色体に存在する遺伝子の断片も接続されたcag-GFPカセットだったそうです。そのため、PCRでGFPあるいはcagエンハンサープロモーター周辺の遺伝子配列を増幅した断片の中にその遺伝子配列があり、挿入部位は１５番染色体と誤った判断をしたのです。その後の解析により、実際は3番染色体であったとの情報があります。
上記のような事情から、当初FLS-3, 4細胞株では１５番染色体にcag-GFPが挿入されていたとされたため、そのようなマウスも細胞はW研にはないと公表されたのでした。しかし、cag-GFPカセットの事実がわかり、そのゲノム構成に合致するマウスと細胞がW研にあることが明らかになったのでした。
496：小野小町：2018/03/21(水) 09:10:13: >>
それにしても、上記のような結果が出て来たとき、W氏はなぜそんなに簡単に１５番染色体への挿入、と発表してしまったのでしょうか？自分のラボにはあったが、コントロール実験のみに使用していたため、まさかそれから「STAP幹細胞」なるものが作製されたことになっているとは思わなかった、ということなのでしょうか。当初のゲノム検証の際に、W氏はこの細胞のゲノム解析をやっておらず、市販のcag-GFPが組み込まれた細胞の解析のみやっていたようですが、実験にも使っていたならば、ゲノム解析をするべきでした。
ともかくこの細胞が今のところ疑惑を解明する手がかりとなりそうです。今後は誰がどのような意図をもってこのES細胞をSTAP幹細胞としたのか、が焦点になってきます。関係者は早いうちに名乗り出るべきでしょう。その他のSTAP幹細胞株群のゲノム構成にも、GFP遺伝子構成や挿入場所は一致していてもマウスの系統が異なっているものがあり、O氏、W氏の証言に合わないものがあります。今後もさらに詳細な解析が必要でしょう。
497：小野小町：2018/03/21(水) 09:10:43: >>
このような案件で、生命科学の技術を説明するなど、本当に気の重い作業です。しかし、起こってしまったこの事件をうやむやにせず、最後まで、全てが明らかになるまでフォローしていくつもりです。それとは別に、理研CDBのガバナンスの問題点も追求され、関係者の処分、新たな理研CDBの構築に向け議論がなされるべきと思います。こちらの成り行きについても最後までフォローし続けるつもりです。今後の日本のライフサイエンスの将来がかかっていると考えるからです。
何度も申し上げますが、理研CDBは膨大な公的資金をつぎ込まれて運営されている、使命をもった研究所なのです。曖昧なままの幕引きはあってはならないと考えます。
498：小野小町：2018/03/21(水) 09:11:20: >>
都道府県
東京都
自己紹介
生命科学を研究していました。森羅万象を虚心坦懐にみつめ、感謝を捧げる（そうありたい）日々の雑感などを書いております。
499：在原業平：2018/03/21(水) 09:36:42: 引退した専門家の方みたいだね。2014/7/12って、若山記者会見のほぼ１か月後だ。
遠藤さんが6/22にプライマーを受け取って、6/25にアクロシンプライマーだと気づいた。
この人はアクロシンという言葉をここに書いてないね。
500：小野小町：2018/03/21(水) 09:40:50: 以下の部分だわね。
>>
ところが、当初１５番染色体に挿入されていたと発表されたcag-GFPは、実は上記の市販されているカセットではなく、それに改変を加え１５番染色体に存在する遺伝子の断片も接続されたcag-GFPカセットだったそうです。そのため、PCRでGFPあるいはcagエンハンサープロモーター周辺の遺伝子配列を増幅した断片の中にその遺伝子配列があり、挿入部位は１５番染色体と誤った判断をしたのです。その後の解析により、実際は3番染色体であったとの情報があります。
501：在原業平：2018/03/21(水) 09:52:52: <１５番染色体に存在する遺伝子の断片>というのはアクロシン構造遺伝子と
その上流についているアクロシンプロモーター配列のことだね。この
アクロシン構造遺伝子というのは精子のアクロシン酵素を作るための設計図だね。
そしてアクロシンプロモーターというのはその設計図を開くスイッチで、
このプロモーターも又別のタンパク質シグナルを受けて働き始める。精子にアクロシンが
必用になった時にできているたんぱく質がこのプロモーターの鍵を外すんだね。
<遺伝子の断片>というのはこのプロモーター配列だけをGFP蛋白の発現構造遺伝子に
繋いだものだね。15番の内在性アクロシンプロモーターが働いてアクロシン蛋白を作るとき、
同時に3番の同じ配列のアクロシンプロモーターが働いて、こちらはGFPを発現させる
設計図を開くんだね。だから緑に光る。
502：小野小町：2018/03/21(水) 09:58:19: 通常のCAG-GFPカセットでは全身で光ると言っても精子では光らないのね。これが
研究目的によっては不便なので、精子も含めた全身で光るように改良したのが
岡部マウスのAcr-GFPとCAG-GFPの共挿入マウスなのね。そしてそれは3番染色体に
ホモで入っている。そして太田さんはそれと129Terの掛け合わせでヘテロのFIを
作ったわけね。
503：在原業平：2018/03/21(水) 10:04:01: 我々の疑義はホタルブクロ氏より多いよ。
>>
①放医研は15番にどうしてCAG-GFPがあると誤解したのか。
②15番にあるのは本物のアクロシンプロモーターなのでホモで存在していたはずなのにどうしてヘテロに4コピーと間違えたのか。
③この時のプライマーを使って同様の確認をしたCDBがまたなぜヘテロに４コピーを追認したのか。
504：名無しさん：2018/03/21(水) 10:07:49: >>484
ご意見ありがとうございます。
だだ、小野小町 2018/03/19(月) 21:26:13
突然最終回になったのには理由があるはずね。
最終回って必ず前号で予告がある。
のご発言の流れから質問させて頂きました。日記の連載当初から、オチは何処にあるのか関心を持っていました。私的には回答が1であることにはそう簡単に承服できかねますが、予約した書店からの連絡を心待ちにしています。ありがとうございます。
505：小野小町：2018/03/21(水) 10:15:20: ほたるぶくろさんはまだこの時期なので全体像が見えてないのね。彼の疑念は以下ね。
>>
それにしても、上記のような結果が出て来たとき、W氏はなぜそんなに簡単に１５番染色体への挿入、と発表してしまったのでしょうか？自分のラボにはあったが、コントロール実験のみに使用していたため、まさかそれから「STAP幹細胞」なるものが作製されたことになっているとは思わなかった、ということなのでしょうか。当初のゲノム検証の際に、W氏はこの細胞のゲノム解析をやっておらず、市販のcag-GFPが組み込まれた細胞の解析のみやっていたようですが、実験にも使っていたならば、ゲノム解析をするべきでした。
506：在原業平：2018/03/21(水) 10:23:50: 若山さんは我々の論では当然岡部マウスだと最初から分かっている。でも
知らない振りして徐々に解明されて行くという芝居のシナリオが必要だ。
そこがとても臭くて臭うんだね。ほたろぶくろさんはそこまでは分かっていないからね。
我々だってntES論に到達したのはこの３年後だよ。

>>508
了解。そうですね。正解が1であったかどうかは言いきれていませんね。でも
正解は1の手記を読めばその中にありそうですね。僕は明日用事があって
街にでますからその時についでに受け取ります。明日中に分かるでしょう。
507：小野小町：2018/03/21(水) 10:30:25: >>
当初のゲノム検証の際に、W氏はこの細胞のゲノム解析をやっておらず、
市販のcag-GFPが組み込まれた細胞の解析のみやっていたようですが、
実験にも使っていたならば、ゲノム解析をするべきでした。

ここはこの方が記者会見を注意深くお聞きでないことを意味しているのよね。
若山さんは岡部マウスは３番にACR-CAG-GFPだと知ってるのよね。それを調べる必要はない。
それと放医研は誤認したにせよ、15番と３番の両方にあることに気づくはずだということにも
気づきが無く、かつ、CDBが同じ間違いをしていることにも気づきが無い。
これって根本的に嘘だという疑義が存在しているのよね。１５番だけ、そしてヘテロって
分かって言ってることよ。
508：在原業平：2018/03/21(水) 10:37:40: FLSは3番にヘテロだからね。

①「僕のマウス」ESは18番にホモでした。
②FLSの18番にはありませんでした。
③FLSの15番にヘテロでありました。
④FLSの15番にあったのはアクロシンプロモーターでした。
⑤3番にヘテロでした。
⑥放医研のプライマーをもらってCDBも同じ結論でした。

あり得ないシナリオだね。