私でよろしければお答えします。
JOY TO KEY はゲームパッドの各キーをキーボード上のボタンに対応させるもので、
まずはJOY TO KEYを起動させて「新規作成」をクリックします。
この時に対応の名前を付けられますが、私は「マッスルファイト」としています。
「マッスルファイト」と名前を付けると、左の欄に名前が入力され、右側の設定は全て「Disabled」になっているはずです。
そこで次は「簡易設定ウィザード」をクリックして、それぞれのジョイパッドボタンに対応させたいキーボードのボタンを押します。
この時、注意しなくてはならないのが半角入力にしておくと言うことです。
次に、マッスルファイトを起動しての「Option」でキーボードの方の操作も先ほど入力したボタンに対応させれば完成です。
この時、「Option」の「Game」の項目で「Joipad」と書かれたラジオボタンのチェックを消してください。
消さないとうまく動かないかもしれません。