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ペーパー一枚への道 その1

1地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/11(月) 00:00:59
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95小野小町:2019/03/14(木) 17:28:15
一滴垂らした説で、大きさの問題をごまかそうとしているわね。ミエミエね。

96一言居士:2019/03/14(木) 18:51:42
とりあえず以下を投稿しておこう。

>>hidetarouさん
細胞の大きさに関する上記の私の連投書き込みの相手はあなたの以下の書き込みに対するものです。私が不用意なことを書いたもので最初の投稿をアップしていただけないようです。学さんは今スピン屋さんたちと戦われている最中でもありますからね。誰がどこから頼まれているスピナ屋さんであるかに関してはたぶん私の方が学さんより詳しいでしょうね。はは。でも今はそんなことは後回しです。以上。
>>
楠本 英正さんがリンクをシェアしました。
3時間前
(4)Article Extended data Fig.8e について STAP 幹細胞と ES の写真の取違いが疑われる点
某所からコピーした画像は不鮮明。

97小野小町:2019/03/14(木) 18:56:59
今度の分はアップしていただけるでしょうね。そして、次は学さんの問いに対する答えね。

98一言居士:2019/03/14(木) 19:36:15
どうするかな。区切りつけて、送らないとまたくちゃくちゃになりそうだね。
ジムさんへの原稿送りもどうするか決まらないね。

99閲覧者:2019/03/14(木) 19:38:13
ジムさんは今呼ぶなよ。待ってもらえばいいい。こちらから直接送ると連絡してある。

100小野小町:2019/03/14(木) 20:53:50
明日にしましょ。

DORAさん、ヨハン・シュトラウスは俗っぽいんじゃないのよっ!素朴で清楚なの。

youtube.com/watch?v=Q-hpPh5bSqQ

101オウ、イェイ。:2019/03/14(木) 20:54:45
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102地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/15(金) 07:10:53
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103在原業平:2019/03/15(金) 07:11:42
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

104小野小町:2019/03/15(金) 07:29:00
お気に入りは楠本さんのところに変な人が来ているわね。学さんは77をアップしてくれたわね。

105在原業平:2019/03/15(金) 07:32:48
よし、では学さんへの変身を書いておこう。

106在原業平:2019/03/15(金) 07:33:24
変身→返信

107一言居士:2019/03/15(金) 07:34:59
[連投1]
>>学さん
ご疑念の件、以下でした。
2019/3/12(火) 午後 4:19
2019/3/12(火) 午後 4:40
①内部細胞塊ICMと接することにより、STAP細胞もICM様の動きをするようになる
②彼(若山さん)がESを渡されたと断定したとの事実は無い
③STAP細胞は酸性浴で一過性に小さくなり、幹細胞になる過程で元の大きさに回復した
④幹細胞は何の元細胞からできたのかわからないのだから、STAP幹細胞細胞の大きさは議論できない

108一言居士:2019/03/15(金) 08:16:08
[連投2]
①の件、まずSTAP細胞は刺激惹起という手法がメインです。STAP酸浴凝集塊を基本トリプシン処理して一個一個ES細胞移植の時のように拾って挿入してもできなかったし、まして、普通の体細胞をキメラ胚にインジェクトしてICMと接触させてもキメラはできません。ICMと接触させる共培養という概念ではそこまでの転換能力は無いようですね。ntESは徐核卵の細胞質の中に体細胞核を入れるんですから、インナーセルマスとの共培養概念とはまた違っています。
では、幹細胞の樹立の時はどうかというと、まず、STAP細胞はそのままで何もしないでもキメラができ、かつ胎盤にも貢献するというICM以上の能力を持っていることになっていますよね。ただ、自己増殖能がないだけですね。だから幹細胞の樹立に関しては<ICM様の動きをする>という言葉の意味は取り出して培養すると増殖をし始めるという意味に受け取っていいはずですね。共培養すると自己増殖能を得ると。

109一言居士:2019/03/15(金) 08:18:58
[連投3]
自己増殖能とは何かということになりますが、ESの場合はもともとのインナーセルマスが自然の幹細胞なんですから増殖能と分化能の両方を兼ね備えている。自然の発生では多能性細胞は増殖しながら分化し、また増殖し、更に分化してまた増殖するという過程を経て胎児形成して出産に至るわけです。
ES細胞はその自然の多能性細胞を試験管内に取り出して、分化抑制剤を添加した培地でもともと持っている増殖能だけを働かせるわけです。

110一言居士:2019/03/15(金) 08:21:28
[連投4]
キメラができているとされているSTAP細胞も同じ働きがあって、キメラ胚の中では最終的には胎児形成するのですから増殖能と分化能の両方を持っていることになります。ところがこれが酸浴でリプログラムされた状態のままでは増殖能が極度に弱くて1週間ほどで消滅してしまうとされている。この1週間で消滅するというのは丹羽さんの検証作成した酸浴細胞凝集塊の幹細胞化でも同じだったようです。系譜決定されてしまった体細胞もさらなる分化はもうできませんが体細胞分裂はできますから、培地が適正であれば増殖はします。でも長くは続かないということでしょうね。

111一言居士:2019/03/15(金) 08:22:03
[連投5]
参考
>while a small number aggregates gave rise to colonies containing small cells with large nuclei, resembling the morphology of embryonic stem cells. However, most of these cells ceased proliferation at day 7 and gradually regressed. <Investigation of the cellular reprogramming phenomenon referred to as stimulus-triggered acquisition of pluripotency (STAP) Hitoshi Niwa>

112一言居士:2019/03/15(金) 09:08:47
[連投6]
丹羽さんは最終的プロトコルによってSTAP幹細胞誘導しています。クムリナ書き込みから推定されているキメラ胚に入れてから取り出すというような作業は行っていません。論文の検証なんですから当然ですね。でも我々は若山さんがどうやって幹細胞化したのだろうかと推測する過程で、クムリナ書き込みから推定しようとして、キメラ胚に入れてインナーセルマスと接触させると増殖能が高まるのだという可能性を考えるわけです。それが学さんの<ICM様の動きをするようになる>という言葉の意味ですね。

113一言居士:2019/03/15(金) 09:09:48
[連投7]
そうかもしれない。でもそうでなく、若山さんはntES化させていることを隠したまま、<たとえば細胞の樹立がなかなかできず、STAP細胞を注入したキメラ胚を使って初めて樹立に成功したデータは、当初それだけで論文にするつもりでしっかりした表と解析を行っていたのですが、途中から直接簡単に樹立できるようになり、葬り去られました。>と、あたかも後にESを渡されていたのだというストーリーに説得性を与えるために、ただ伏線を張っているだけかもしれません。

114一言居士:2019/03/15(金) 09:10:36
[連投8]
そここそ<ある派>と<ntES派>である私との根本的違いです。私はそのやり方では増殖し始めることはないと思っているんです。学さんは増殖し始めると思われている。ここは所見の違いですから別に問題ありませんね。
対して、まず若山さんが何をされたのかは置いておいて、小保方さんは論文リヴァイズの最中から若山さんに伝えられた最終的プロトコルに従って自分の作ったSTAP細胞をSTAP幹細胞に転換できないと訴えていました。また、丹羽さんは検証実験で小保方さんのアドヴァイスも受けて、小保方さんと同じような細胞塊をたくさん作ることに成功し、それをプロトコルに従って幹細胞転換しようとしてできなかった。ということは彼ら二人が行ったことと、若山さんの行ったことが違うということです。

115一言居士:2019/03/15(金) 09:11:41
[連投9]
違いの原因の可能性は以下ですね。
1.若山さんは小保方さんに毎回ES細胞を渡されていた。(桂報告書結論)
2.若山さんは渡されたままのSTAP細胞を共培養等で幹細胞化に成功しているのにそれを黙っているから、小保方さんと丹羽さんが知らされているプロトコルではできない。(学さん、Ts.Marker さん、和モガさんたち仮説)
3.若山さんは後には渡されたままのSTAP細胞をプロトコル通りに培養誘導出来ているのに、何かプロトコルに嘘を書いているから二人にできない。
4.若山さんは後には渡されたままのSTAP細胞をプロトコル通りに培養誘導出来ているのに、何かプロトコルに個人手技の違いがあって二人にできない。(手記にある若山さんの説明)
5.若山さんは別途興味から行っていた小保方細胞核使用ntES実験でのキメラ作成をリクルート上の都合があって、小保方さんの細胞から直接できたと一時的のつもりの嘘をついた。また、ntESをそのまま幹細胞だと主張せず、キメラ作成時に作ったキメラ胚をキメラ用と幹細胞用に分けて同時樹立の形にした。従って若山さんにとってのSTAP細胞はSTAP細胞核使用ntESだということになる。(ntES仮説)

116一言居士:2019/03/15(金) 09:12:58
[連投10]
2は私が以前からお尋ねしているように、なぜできているのに隠したり、論文を取り下げたりしたのかの説明が必要ですね。5はここでは論じません。
で、次が<②彼(若山さん)がESを渡されたと断定したとの事実は無い>というご意見です。桂報告書はFIは太田ES、GOFマウスは学生のntES、AC129とFLS-Tシリーズは若山さんの作ったコントロールESだと言ってますね。太田ESを解析のために理研に提出したのは他の誰でもない若山さんです。今入手経路を問うてもパートナー氏に返事がなく、理研側からも明確な回答がない。しかもAC129で使われたコントロールESは個別にどのラインかも識別されて、129B6F1ES-6だと割り出された。それが保持されていたのは理研側の小保方フリーザーの中でなく、山梨大の若山さんがそれを持っていたんです。ここはご承知のようにOoboe さんとパートナー氏の追求されてる方向です。若山さんは断定しているのではなく誘導しています。

117一言居士:2019/03/15(金) 09:15:45
129B6F1ES-6→129B6F1ES-1

118一言居士:2019/03/15(金) 09:16:25
[連投11]
そして、<③STAP細胞は酸性浴で一過性に小さくなり、幹細胞になる過程で元の大きさに回復した>ということですが、CD45+細胞→酸浴でやせたSTAP細胞→培地回復したSTAP細胞ということですね。STAP細胞とSTAP幹細胞はCD45+細胞より大きくはならないと思っています。そして前回Hidetarouさん宛に回答した連絡にも書きましたが、あのeの写真は中間で曖昧ですね。認めます。何とも言えない。ただし、桂調査チームはその問題を調べて結論を出すことはできたんですけどやっていません。意図的にやらなかったとみています。

119一言居士:2019/03/15(金) 09:17:27
[連投12]
最後に、<④幹細胞は何の元細胞からできたのかわからないのだから、STAP幹細胞の大きさは議論できない>は誤解ではないでしょうか。小保方さんは論文では主にリンパ球で酸浴細胞を作っています。脾臓のミンチから始まります。もともとある細胞は前回書いたように<B細胞:60%、T細胞:30%、マクロファージ:5%、その他、5%です。>ね。延伸分離の後にそれをCD45抗体でFACS選別していますから一番強く反応するリンパ球であるB細胞とT細胞が選別されます。そもそももともとそれ以外は10%しかないものをFACSで取り除いているのですから、いくらFACSが厳密な選別でないといっても10%からほとんどがふるい落とされると考えると99%に近くリンパ球だけになっていませんか。

120一言居士:2019/03/15(金) 09:18:38
延伸分離→遠心分離

121一言居士:2019/03/15(金) 09:19:11
[連投13]
ただし酸浴後に何が生き残るか、そして何がより強くてコロニーを増殖支配するのかは別問題ですね。ライブセル・イメージングで蛍光細胞が動いているのはマクロファージの動きですよね。他の細胞はあんなに大きく動く機能を備えていません。ですから学さんの所見にも一理あると思います。でも根本に戻って、白血球の大きさはマクロファージも含めて5から10マイクロメーターの大きさなんです。それに対してES細胞の大きさ、もしくはインナーセルマスの大きさはそもそも一回り大きいのだというのが私の主張です。私の感覚では白血球7マイクロメーターに対してES細胞は10マイクロメーター以上で体積にして倍以上という感覚でいます。

122一言居士:2019/03/15(金) 09:21:33
[連投13]
一応ここで残されている問題はあのねさんの非リンパ球説と、桂報告書擁護者のES細胞をポトリと一滴垂らしたという説ですかね。後者は間違いですが、それを論じるとたぶん私のntES論の根本である、桂報告書の主張する事故コンタミの可能性は太田ESを解凍したという行為によって否定されているというところから順番に押さえ直して説明しなければならなくなるでしょうから、ここで論じないと約束している以上、述べません。以上です。

123小野小町:2019/03/15(金) 09:22:43
まあ、その程度でいいんじゃないの。あまり深入り説明していくと
本線の問題に戻れなくなっちゃうわね。

124一言居士:2019/03/15(金) 09:43:08
貼ってきたけど500字制限に引っかかって連番が一つ増えた。それと>>122
[連投13]→[連投14] ね。

125孤舟:2019/03/15(金) 09:44:02
阿久悠から電話だ。

126ふむ:2019/03/15(金) 09:44:33
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127地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/16(土) 07:41:17
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128在原業平:2019/03/16(土) 07:42:14
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

129小野小町:2019/03/16(土) 07:52:45
お気に入りは変化なしよ。学さんのところに珍しくTs.Markerさんが見えてるわ。

130在原業平:2019/03/16(土) 07:55:33
せっかくあそこで出会えたんで話し合ってみたいけど彼はあまり語らないからね。
話法がほのめかしなのは、彼のブログとトゥイッターで分かってるし、昔したらばに
見えてた時もそうだったからね。

131一言居士:2019/03/16(土) 07:56:37
李の使っているTSAが使われてのではいう可能性指摘だね。

132閲覧者:2019/03/16(土) 08:05:42
ああいうのはどれもそうかもしれないしそうでないかもしれないんで、実際に
実験を行って確かめることのできないど素人門外漢にとってはいつまでもただ
議論しているだけになっちゃうんだよな。どうしたって、ど素人は搦め手からの
決め手と併用して、総合的な把握に至る道しかないよ。その意味ではこれを裁判の
公判だと思って自分が裁判官になったつもりで判断していると想定すると、
のと同じ作業をしていると分かるはずだな。裁判官はSTAP細胞に関してど素人だからね。
でも判断は一分野の専門家が行うことはできない。総合的であるとみなされている
人格が裁くんだよな。

133小野小町:2019/03/16(土) 08:07:39
総合的人格が法に則って判断するというのも裁判官って大変ね。

134在原業平:2019/03/16(土) 08:15:26
道徳的には人が人を裁くことはできないよ。大昔は無知による勘違いが多かったけど、
近代法では法のルールに従って決められたとおりに処理するんで、疑いが強いときは
無罪だ。総合的人格と言ってもしょせん人だからね。神様じゃない。でも。ルール通りに
処理するのだって裁判官が精神病だったら困るでしょ。だから、一応は試験も試問もして
まともな人という建前にしとかないと、法治というルールの根幹が揺らぐよ。

135小野小町:2019/03/16(土) 08:17:58
STAP問題は専門家が判断すると思い込んでる人がいるわね。

136在原業平:2019/03/16(土) 08:26:54
STAP細胞の科学的な探求に関しては専門家以外に参加することは不可能だし、
そもそも一般人は参加する気もない。でもSTAP事件は社会問題だからね。逆に
この分野の科学者たちこそど素人である分野だ。小保方さんの博士号剥奪の
法的正当性に関して細胞生物学者としての立場でど素人判断聞かされても
誰も聞かないやね。

137小野小町:2019/03/16(土) 08:27:49
あら、Lさんのことね。ふふ。

138在原業平:2019/03/16(土) 08:33:43
早稲田の法律の専門家が調査して博士号の取り消しはできないと学長に報告した。
鎌田は何をしたかというと、まず小保方さんが草稿を間違えて提出した落ち度と
それをチェックもせずに受け取った自分たちの落ち度をバーターにかけて、小保方さんに
再試験を了解させたんだ。つまり、小保方さんは自ら博士号を返上した。このことは
早稲田の調査報告の結論の想定していないことだ。

139小野小町:2019/03/16(土) 08:41:08
小保方さんの落ち度と自分たちの落ち度はバーターにはできないわよね。早稲田は草稿を
受け取っていてかつ博士号を与えている。これを勝手に根拠なく取り消すと詐欺罪になるわね。
小保方さんはお金を払って教育を受けているのよね。お金を返すだけじゃなくて、
人生の時間の浪費と名誉棄損の両方で損害賠償請求できるわね。小保方さんは訴訟してたら
勝ってるわよね。なにしろ母校の法学部卒業の先輩たちが皆、取り消しはできないと
法的判断を下しているのよね。

140在原業平:2019/03/16(土) 08:46:16
だからこそ早稲田は小保方さんの愛校心という情に訴えたんだよ。こんなケチのついた手続き上の
ミスで与えられて、かつ事実草稿であるようなものに対して与えられている形ではあなたも不本意でしょう、
もう一度提出時点からやり直しましょうと誘いかけた。これによって彼女からの訴訟を避けているんだよ。

141小野小町:2019/03/16(土) 08:47:54
間違ってるわ。草稿を本稿に差し替えるだけで済むことだわ。

142在原業平:2019/03/16(土) 08:49:33
早稲田は草稿であることに自部で気づかねばならなかった。その時点でそのまま
落とすか、差し替えを指示するかのどちらかだった。

143在原業平:2019/03/16(土) 08:50:13
自部→自分

144小野小町:2019/03/16(土) 08:51:40
バカタレがと怒って差し替えさせるに決まってるわよね。この時点ではSTAP事件なんて
起きていないわね。

145在原業平:2019/03/16(土) 08:53:31
ところが気づかないままに事務処理されて博士号授与された。早稲田の落ち度だ。

146小野小町:2019/03/16(土) 08:54:51
授与後にそれに気づいたら、本稿と差し替えて終わりでしょ。

147在原業平:2019/03/16(土) 08:56:16
小保方さんは本稿を提出し直している。にも拘わらず早稲田は差し替え処理をしなかつた。

148小野小町:2019/03/16(土) 08:56:50
どうしてなの?

149在原業平:2019/03/16(土) 08:59:35
鎌田がバカだからだよ。もしくは鎌田に圧力をかけた文科省の役人がバカだからだ。
この草稿提出の発覚がSTAP事件と絡んでいて文科省と鎌田は世論の動向に右往左往した。

150小野小町:2019/03/16(土) 09:01:31
理研での出来事と博士号授与手続きは無関係ね。11次元の指摘からこうなったんだけど、
そのことと博論とは関係ないわ。

151在原業平:2019/03/16(土) 09:05:33
博論に不正があったら早稲田は堂々と剥奪できるよ。でも自分たちで
行った調査結果で不正はないと結論して、しかも手続き上においても剥奪は
できないと鎌田に進言しているんだよ。それなのに鎌田は差し替え判断を留保した。
それはSTAP事件の解明を待つためなんだ。そちらからまた新たな真実が出るのではないかと
思っているんだよ。

152小野小町:2019/03/16(土) 09:11:02
差し替え処理して草稿か、本稿かの問題はそれはそれで終わらせて置いたらよかったんでしょ。
その後博論自体に捏造があったと分かったのならその時に剥奪すればいい。そもそも審査して
通しているんだから捏造なんかあるわけがないのよね。STAP事件が仮に小保方さんの
捏造だったとしても、博士論文とは無関係よね。そんなこと言ってたら他の不正事件でも
博士号剥奪されないといけない人たちがたくさんいることになってしまうわね。そんな人って
法律で裁判が開かれて判決の元で剥奪されたシェーンくらいしか知らないわ。

153在原業平:2019/03/16(土) 09:12:59
だから鎌田は馬鹿なんだよ。頭悪いんだよ。

154小野小町:2019/03/16(土) 09:15:05
頭悪いんだから仕方無いと言われちゃうと、お前は頭いいのかと反論されても
困る身では、閉口しちゃうわね。

155在原業平:2019/03/16(土) 09:18:08
ま、そういうことなんだよ。神ならぬ身なんで後から間違いだと分かることは多いよ。
でもわかったらその時はちゃんと過ちは正さないとな。

156ヘーゲル:2019/03/16(土) 09:19:00
本題頼むぜ。

157カール・ヤスパース:2019/03/16(土) 09:20:31
本題、何でしたっけ?

158デラ・ストリート:2019/03/16(土) 09:25:37
JAKインヒビターよ。

159孤舟:2019/03/16(土) 09:26:34
今日は今から昼過ぎまでヴォランティアだぜ。

160ふむ:2019/03/16(土) 09:27:11
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161地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/17(日) 08:37:34
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162在原業平:2019/03/17(日) 08:38:19
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

163小野小町:2019/03/17(日) 08:42:53
お気に入りは変化なしよ。学さんはスピン屋の話にに夢中ね。

164在原業平:2019/03/17(日) 08:51:02
ため息さんは女性なのか。知らなかったな。この人はSTAP事件に関しては
全く勉強不足の人だよね。最初ちら見したときに論じる意味もない相手だと思った。
それに歴史的にもSTAP事件以前からのブロガーだしな。ここにたむろしている奴らは
一研究者時代からよく知ってる相手だけどな。梁山泊にされちまって、
母屋取られている間に盗賊の仲間になったということみたいね。はは。

165小野小町:2019/03/17(日) 08:54:41
学さんもなんでこんな相手たちと絡みあってるのかしらね。自分のブログなんだから
排除しちまって、ご自分の意見だけ書いてればいいのに。スピン屋というのは
お金もらってやってるんだから、なんでもしてくるんで、いちいち相手してたら
時間の無駄だわよね。

166在原業平:2019/03/17(日) 08:56:43
Ooboe さんが根本さんから自分のブログを作りなさいとアドヴァイスされているね。

167小野小町:2019/03/17(日) 08:59:20
木星さん、アトモス部屋さん、Ooboeさん、学さん、バ感想、ため息さんと女性なのね。

168ヘーゲル:2019/03/17(日) 09:02:26
本題頼むぜ

169カール・ヤスパース:2019/03/17(日) 09:03:24
本題、何でしたっけ?

170デラ・ストリート:2019/03/17(日) 09:04:26
JAKi検証は誰が何のために行ったのか?

171一言居士:2019/03/17(日) 09:10:22
結構、むつかしいんだよな。当時の若山ラボで行われた実験ではない。ただ、きっかけが
系統樹で、このベースにあるデータの最初が若山研でのものだ。

172地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/18(月) 09:28:55
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173在原業平:2019/03/18(月) 09:30:18
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

174小野小町:2019/03/18(月) 09:31:22
お気に入りは変化なしよ。あのねさんも自説展開が止まってる。

175在原業平:2019/03/18(月) 09:32:25
我々も止まってるよな。ジムさんに送る原稿ができない。

176孤舟:2019/03/18(月) 09:33:33
釣りとヴォランティアが忙しいからなあ。

177一言居士:2019/03/18(月) 09:34:38
いや、分かったことを書くのにそんなに時間はいらない。問題自体がむつかしい。

178閲覧者:2019/03/18(月) 09:35:26
考えるための糸口が見つからないんだろ。

179開高健:2019/03/18(月) 09:37:31
僕は釣りをしながら考えたんだけどな。JAKiの検証実験が無かったら、
若山さんの渡したデータと論文の論旨はどういうものだったかと考えたら
いいんじゃないかと。

180孤舟:2019/03/18(月) 09:43:59
JAKiの検証が無かったら、
①STAP細胞は胎児、胎盤に貢献する。
②STAP幹細胞は増殖能を獲得するとき胎盤貢献能を失う。
③FI幹細胞はFGF4培地の中で胎児貢献能を失うが、LIF培地で誘導すると胎盤貢献能を失って胎児貢献能を回復する。

181小野小町:2019/03/18(月) 09:45:37
本当なの?
誰がそんなこと言ったのかしら?

182在原業平:2019/03/18(月) 10:03:59
①は若山さんが胎児胎盤の試料を渡して胎盤が光っているようだから確認してと指示して、
小保方さんはその免染写真をExtended Data Figure 1-b,cとして図表添付した。
②は若山さんが作ってキメラも作られているが、なぜかキメラ胎盤が光っていないという証拠写真が無い。
③はFI化幹細胞由来キメラが作られFigure 2-gにしょうこしゃしんがあるが、上下が同じ区画の比較に
なってないので胎児が光っていないという証拠がない。また、LIF培地でES様に戻された細胞由来の
キメラ実験結果は無いので胎児胎盤写真の証拠がない。しかし、テラトーマ実験は行われている。

183在原業平:2019/03/18(月) 10:05:41
FI化幹細胞由来キメラ→FI幹細胞由来キメラ
しょうこしゃしん→証拠写真

184デラ・ストリート:2019/03/18(月) 10:07:39
最後のテラトーマに関する記述は以下ね。
>>
Notably, when cultured in LIF+FBS-containing medium for 4 days, Fgf4-induced stem cells underwent substantial changes in morphology and started to form ES-cell-like compact colonies with strong GFP signals (Fig. 3a). These cells showed expression of pluripotency makers, but not trophoblast markers (Fig. 3b and Extended Data Fig. 6a), and formed teratomas in mice (Extended Data Fig. 6b). These ES-like cells were generated from Fgf4-induced stem cells sorted for strong expression of the trophoblast marker Itga7, but rarely from Itga7-dim cells (Fig. 3c, d).

特に4日間LIF+ FBS含有培地で培養すると、Fgf4誘導幹細胞は、形態学的に実質的な変化を受け、強いGFPシグナル(図3a)を有するES細胞様のコンパクトなコロニーを形成し始めた。これらの細胞は、多能性メーカーの発現を示したが、栄養膜マーカーは示さず(図3b及び拡張データ図6a)、かつマウスにおいてテラトーマを形成した(データ図。拡張図6b)。これらのES様細胞は栄養膜マーカーItga7の強発現しているFgf4誘導幹細胞から生成されたが、まれにItga7-DIM細胞からも生成された(図3c、d)。

185小野小町:2019/03/18(月) 10:21:07
Figure 3-aはGOF由来FI-SCがあるという証拠写真ね。対してExtended Data Figure 6-aは免染結果で、
Oct4は内在性Oct4ね。丹羽さんの検証結果によれば、酸浴STAP細胞の内在性Oct4発現はほんのわずかなので、
この免染結果は桂報告の言うように既存のES起源であるか、我々の論であるntES起源である可能性が
とてもた高いのね。そして小保方さんがこの細胞からテラトーマを作った。なぜか?

186在原業平:2019/03/18(月) 10:28:11
若山さんがキメラを作っていなかったからだろうね。ということは若山さんは
ここまで実験を進めていなかったんじゃないか。Figure 3-aからdまでだね。つまり、
LIF培地によるOct4-GFPの再発現確認とそのPCR結果までだ。FI-SCは凍結保存されているので
LIF培地による誘導は笹井研でもできるし、また、テラトーマ実験は小保方さんでもできる。
キメラ実験まで進んでいない段階で小保方さんはヴァカンティの元に帰ってしまったんだな。

187地球の上に朝が来た、その裏側は夜だろう。:2019/03/19(火) 07:40:50
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188在原業平:2019/03/19(火) 07:41:35
モーニン、小町ちゃん。コーヒーね。

189小野小町:2019/03/19(火) 07:45:57
お気に入りは変化なしよ。あのねさんは返事がないわね。Ts.Markerさんに
出した質問も案の定返事がないわ。

190在原業平:2019/03/19(火) 07:48:17
Ts.Markerさんの書き込みもここに記録しておこうかな。いずれヤフーブログは消えてしまうらしいから。
>>
> あのねさん

3因子で作製したiPS細胞(3F-iPS細胞)は、4因子の4F-iPS細胞に比べ分化多能性(キメラマウス作成効率など)が著しく低下しているらしいが、TSA処理(TSA treatment)によりキメラマウスの作成効率が上がり寄与率の高いキメラマウスが作成出来たとのこと。
(24770224 研究成果報告書(基金分) - KAKEN 参照)

あの研究室でTSA(トリコスタチンA)が、密かに使われたかどうかは定かではないが、キメラや幹細胞化に効果があるんではと思ってます。
2019/3/15(金) 午後 11:51[ Ts.Marker ]返信する

191小野小町:2019/03/19(火) 07:51:28
Ts.Markerさんはまだある派なのね。

192在原業平:2019/03/19(火) 07:58:56
STAP細胞培地にTSAを入れたら幹細胞化するかもと考えているんだから、まだ
STAP細胞が論文通りにある可能性を考え続けているということだね。
李はntESにTSA処理する実験をしているんで、使われた可能性はあるけど、結果は
無論我々の知り得ないことだからね。ただ、こういう科学的側面だけでは
この事件の真実は解明され得ない。仮にTSAでできていたのなら、どうして
できているはずの論文を取り下げたのかという問いに同時に答えを与えないといけない。
Ts.Markerさんはそちらに関心が無いんだね。

193小野小町:2019/03/19(火) 08:00:54
そういう議論に入ると人を論じなければならなくなるから嫌がってるのよね。
でも、そこを嫌がったら解はでないのね。

194在原業平:2019/03/19(火) 08:03:56
Ts.Markerさんは仄めかすだけだよと言ったとおりの対応だろ。我々はまだ
Ts.Markerブログの検証過程の中に居るんだよね。そういう意味の付き合い
長いからな。


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