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電符「東方シリーズ総合スレッド 4956/4956」
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同人弾幕シューティング「東方紅魔郷」「東方妖々夢」を中心に
一連の東方シリーズについて語らったり、攻略したり、褒め讃えたり、
情報交換したり、創作したり、考察したり、糸電話したりしながら、
ラジオを飛び交うツートントンが聞き取れないスレッドです。
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でもCD1抗原のほとんどはLP1（省略した言い方）に入らないでしょ
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いや、MHCクラス１だから、両端が開いていて、
ちょっとはみ出てもいいよ
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HLA-B-Baseっていうのもあるはずで、
MR1みたいに核酸化合物が入る
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アタリとして函を設置することはできるんですが、
どこが論文として当たるかは運を天に任せ
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教授の再雇用制度のご活用をお早めに
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ヒトじゃないのにHLAってついてていいんですか？
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じゃあ、mHLA
あ、ダメだな。マウスとモンキーがこんがらがっちゃう
だから、もうHLAはHLAと言うんだよで通すしかないです
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最初にコケかけた、トランスジェニックなのに動いた・・・？！
というのは、アカゲザルとマウスの高度な相同性により、１７０ぐらい
動いたのだということにしましょう
HLA分子は多型が多いので、これぐらいは吸収してくれるのでしょう
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KEGGのBLAST解析は、天井が177ぐらいなので、
ほぼ満額回答です
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マイコバクテリウムとコリネバクテリウムの間に天井が現れ
Rv0001でコリネで検索したらそれぐらいでした
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>>526
高度な相同性があって、何かの回避機構に引っ掛かって抗原にならない場合
トランスジェニックは成立します。
MACの酒耐性形質転換もそれです
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確かにアルデヒドデヒドロゲナーゼの相同性は、配列上は低いんですが、
アルデヒド一個飛ばしたら、吐き気が消えるというのは
これは「代謝経路の高度な相同性」なのです
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経路自体が元々無いとダメだって教授に言っておいてほしかった〜
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何がマズかったのかすらわからない
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いつもそう・・・
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じゃあ、漸近して行こう。目標mCD1だ！！
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肯定的に考えたら
CD1d1とCD1d2があるから、経路自体はあるはずだ
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じゃあ、β2mをどうするんですかという指し手になる
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いつもの定石手
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それも問題ない。
beta-2-microglobulinは１つだ。
お前はすぐに複数コピーがあって〜と言う
そうではない。そうではないぞ
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相同性は、マウスから見てヒトに対して53です
長さはどちらも119aa
全長で
MARSVTLVFLVLVSLTGLYAIQKTPQIQVYSRHPPENGKPNILNCYVTQFHPPHIEIQMLKNGKKIPKVEMSDMSFSKDWSFYILAHTEFTPTETDTYACRVKHASMAEPKTVYWDRDM （マウス）
MSRSVALAVLALLSLSGLEAIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM （ヒト）
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ズレてるのは文字の左右幅が違うからです。ちなみに
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際どいという指し手か。そうだな・・・
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両方入れたらいいじゃないですか！！
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一個でやらないとデータが崩れる気がするというのがあって
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じゃあ何を入れる？
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抗原の汎用性からＣＤ１ｂだと思います
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マイコバクチンもポリケチドもＴＬＣ上で大きなスポットとして見たことが無い
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なんでＣＤ１aにしたんだったか・・・
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そのときたまたま話が来たからでは
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例えば、ＣＤ１ｂが動いたとして、どうなる？
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BCGで感作されます
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その結果？
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ああ、一つ階段が抜けてました
ＴＣＲ側の多型でＭＨＣクラス２もＭＨＣクラス１もＣＤ１も収まります。ＣＤ１ｄまであるならば、
多型によりＣＤ１ｂの配列の違いが吸収される
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なので、かなり強引ですが、ミコール酸つきCD1ｂがＴＣＲに押し付けられるはずです。ぐりぐり
これで、増えるでしょう
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このときにTCRに何かついたということのシグナル伝達は、
たぶんTCR(-CD1)複合体の横についている何かの分子クラスタXでしょう
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ヒトでCD1ｂとＣＤ１ｄの相同性はＣＤ１ｂから見て111
ちょっと厳しいかなと言う印象はあるけれども、まあそれほど立体障害は起こさないだろう
複合体の横についている分子クラスタＸの邪魔をしなければそれで動くはず
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TCRもＣＤ１もそれ自体は棒切れなので、分子クラスタＸが無ければ、くっ付くことすらできないと思う
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なので、あ〜、β２ｍと分子クラスタＸの結合が問題と
そうですね・・・
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ちょっとハードルが高かったので、今の段階では凍結です
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あ〜、厳しいなＣＤ８がβ２ｍにくっ付いている
これは丸ごと変えないと互換性が無い。えーと
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水道屋さんの気持ちで、
あ、無理だ
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それだ。だから、マウス側のβ２ｍでなければ・・・
ぐちゃぐちゃだよ！！！！！！！！！
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復旧しておくように。以上だ
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じゃあこういうのはいかがですか？
マウス側のβ２ｍに、ヒト側のβ２ｍを繋いだ融合タンパクを作って
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そういうあやしな実験はダメだよ
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結晶に無茶苦茶詳しくないとダメですね
ＣＤ１の結晶を出したラボに丸投げするしかない
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とかこういうの。
マウスβ２ｍにくっ付いた抗体と言うのを作って、これの尻尾にヒトβ２ｍにくっ付いた抗体を
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SFじゃないですか！やだー
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うちではできないけれど
免疫共沈法で、ＣＤ１にくっ付いている抗体を引っ張って来てこれを増やす
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免疫共沈法は学部の卒論でやったことがあって
結構はっきりくっ付いてきますよ
だから、β２ｍに抗体をくっつけて、それにＣＤ１がくっ付いているものを選択するというアイデアが
わたしはできないけれど！
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抗体には機嫌があって、何でもはくっ付かない
今日はここまで
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CD1テトラマーを模した実験系ですが
どこまで融通が利くかというところですね。
じゃあまた今度
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側鎖同士を波動函数でくっ付けるのに、
ある程度近ければいいという話だと思っていて
テトラマーの距離が通るなら、↑の抗体で異種β２ｍ同士をくっつけるというアイデアも行ける可能性はある
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こういうのドイツ生化学のやり方で、
ケミカルバイオロジーという技術体系です。
繋がって動いたというだけで成果になるので、
なにかもうちょっと簡単なのを
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まあ、うちの仕事ではありませんねｗｗｗ
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>>572
マウスへのトランスジェニックは無理そうだね・・・
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あれ？そういえばそうですね。じゃあ没案に・・・
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じゃあ、ＧＦＰで繋ぐ
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だから結晶構造に詳しくないと崩れちゃってできないんです
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ＧＦＰなのは、なんか歪んだ時のエネルギーを、蛍光として発散してくれそうだからです
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Ｎ末端かＣ末端かしかできないんじゃないかな
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ああ、そうか。グルタミン酸末端とかで行けると思っていた
では、行けるか、行けないかですね
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組み合わせで４パターン。一番エライザの活性が高いものを報告するみたいな
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もしもの話だけど、これ結核感受性が上がったらどうする？
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そうですねｗｗｗ
ＭＡＣワクチンを流行らせるいい機会ではｗｗｗ
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そういえば、ミクロッティがハタネズミ (Alexandromys montebelli)を宿主としている話
同じ属のAlexandromys fortisでは、CD1dが二つなんですよね。
マウスと一緒
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記号はmfotです
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この段階では、必ずしもCD1ｄしかないということが
抗酸菌感受性ゼロ。と言う話にはつながらない
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まああまり変わらないと思いますね
マウスでもやはりミクロッティが優先的に座っているのでしょう
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ミクロッティとＢＣＧを共培養して、
ＢＣＧが居なくなっちゃうとかデータが出たら、ｗｗｗ
まあそういう話で固まって行くかもしれません
ＢＣＧも結核菌群ですからほぼ互換でしょう
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ミクロッティは結構病原性が高いからダメだよ
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たぶんね、抗酸菌が互いに排斥するという話は
in vivoでしか出ないように思いますね
in vitroで出たら、抗生物質探索で引っ掛かったはずです
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たとえば、レプラとBCGがよく知られています
BCGの対レプラワクチンは最高８０％です。場合によってとても高い値になる
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BCGもそう。
オリジナルのbovisでは、たぶん今のBCG Tokyo株よりもmtbに対する排斥効果が高かった
だからワクチン化しようとしたんです
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>>590
じゃあ、マウスに居たらやってもいいということで
嚙まれたことあるからね
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ミクロッティというか結核菌群のプライマーで、何か出ますかね
BCGは感染していないはずだから・・・
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わたし噛まれたことないです。研究室に居た頃はBCG大量だったと思う
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＞イギリスでハタネズミの病原体として初めて記載されました。[1]
＞イノシシはMycobacterium microtiを環境中で維持する上で重要な役割を果たしていますが、野ネズミ（Microtus agrestis）、アカネズミ（Apodemus sylvaticus）、ハタネズミ（Cletherinomys glareolus）、トガリネズミ（Sorex araneus）など、他の哺乳類からも分離されています。また、ラマ、ネコ、ブタ、ウシ、イヌなどの家畜にも見られます。[2][3][4][5]
何で実験用マウスって書かないんだろう？
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＞市販の核酸ハイブリダイゼーション法は、M. tuberculosis群の菌株を同定するために広く用いられている。
あ、市販のプライマーとかがあるみたいです
それ使ってください
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野ネズミとハツカネズミってどれぐらい違うんでしょう？
意外と違う？
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アカネズミ属と？
ハツカネズミ属・・・
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ネズミの獣医
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>>598
こういうのね。自分に当たらないように、巧妙に避けたプライマーを設計することがあるよ
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＞DNAジャイレースとIS6110ですって
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こちら
https://www.pmda.go.jp/PmdaSearch/ivdDetail/ResultDataSetPDF/170005_22300AMX00538000_A_01_05
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あ、そういえば、
アシルついてないマイコバクチン
普通のＭＨＣクラス１で抗原応答があるかもしれませんね。
探す手段は無いけれど
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七員環、五員環という亜立体環が付いていて（特に七員環）
大きいので端が開いてるクラス１で
なんとなく素朴な炭素が多い気がするから、
案外、先ほどのHLA-B-Acylのグループかもしれませんね？
非定型な病原性化合物は大体ここに突っ込むなどするのかもしれない
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gyrB (Rv0005)
わ〜これは厳しいな。
同じところ歩いてたな
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デモは恐いものと言う印象操作ですが、
デモを国家ではなく個人に向けるようになったのは左派の責任です
こちらは反撃として「デモは恐いもの」と言う印象操作をガンガンしなければならなくなった
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つまり、「民衆のデモの権利」と言うものを剥奪する動きが出て来たわけです
デモは暴動だ
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デモを個人に向けるのが悪い
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まろゆきが左派だから、勝ちようが無いのであって
普通にやってたら問題ありません。勝てます
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岡田氏が今回の日中対立を演出したのであって
それで自分関係ありませんみたいな言論が罷り通る国会は健全ではない。民主党は猛省すべき
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ドイツが反日親中で固まって来たな
まあいつものことだ。ドイツは大陸国家、「東洋の不思議な国、中国」に無限の憧れがある
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>>611
自分の線積分と、国の線積分がごっちゃになっているときの表現で
自分のことを語っているわけ
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>>611
しかし、相当な武闘派で鳴らしたまろゆきだが、
左派の立場からは勝ちようが無いのかこの状況
ほ〜ん・・・
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>>611
しかし、相当な武闘派で鳴らしたまろゆきだが、
左派の立場からは勝ちようが無いのかこの状況
ほ〜ん・・・
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まあ、北京には「国内の民主派勢力の弾圧が目的でやってます。言葉だけだよ」と言っておきますかなｗｗｗ
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ドイツの反日感情の高まりは、まあ放置しておきましょう
日本に関わろうとしてくるのは、どうせＳＰＤだ。
場が煮詰まってくれば衝突する
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